疾病监测, 2014, 29(1): 66-70
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2014.01.018
Capsid protein antigen epitope prediction and monoclonal antibody preparation for Norovirus GⅡ
CHEN Li-ping, JI Lei, WU Xiao-fang, XU De-shun, HAN Jian-kang
Huzhou Center for Disease Control and Prevention, Huzhou 313000, Zhejiang, China
Abstract
Objective To express the noruvirus capsid protein(VP1), prepare monoclonal antibodies against it and understand the noruvirus capsid proteins epitope characteristics. Methods PCR amplification of VP1 gene of Norovirus GⅡ(Huzhou strains ) was conducted, the clone of target gene to the vector pET28a(+) and transferring into E. coli were conducted too. BALB/c mice were immunized with purified expression product. The spleen cells of successfully immunized mice were fused with myeloma cells SP2/0. Protein modeling was performed with program Modeller 9.9. The modeled 3D structures of capsid protein of norovirus were submitted to the SEPPA for predicting the possible spatial epitopes with the default threshold. Positive clones were screened to obtain monoclonal antibodies corresponding to these epitopes by predicted epitope sequence. Results The recombinant expression vector pET28a(+)-Noro-VP1 was successfully constructed and expressed in E. coli, the recombinant protein-immunized BALB/c mouse spleen cells were fused with SP2/0 cell. The predicted epitope region polypeptide screened ten Hybridoma. Indirect ELISA assay showed that 1E8, 1P10, 2C15 and 2L16 can react with recombinant protein strongly, the other 6 mAbs had weak reaction. Western blotting showed that only 2K10, 1K16, 1E8 can specifically recognized the Norovirus capsid protein expressed in E.coli. Conclusion The mAbs against G Ⅱ norovirus capsid protein was successfully prepared. Epitopes was in capsid protein P2 region. This can be used for the development of rapid immunodiagnostic kits and epitopes research of norovirus capside protein.
Keywords:    norovirus   capsid protein   monoclonal antibody   epitopes  

GⅡ型诺如病毒衣壳蛋白抗原表位预测及单克隆抗体的制备
陈莉萍, 纪蕾, 吴晓芳, 徐德顺, 韩建康
湖州市疾病预防控制中心, 浙江 湖州 313000
收稿日期:2013-1-10
作者简介:陈莉萍,女,浙江省富阳市人,主管技师,主要从事病原微生物检验工作
通讯作者:韩建康,Tel:0572-2760126,Email:hzcdcwsw@126.com
摘要
目的 原核表达诺如病毒衣壳蛋白VP1,制备抗诺如病毒衣壳蛋白VP1的单克隆抗体,并研究其抗原表位特性。方法 PCR扩增GⅡ型湖州株诺如病毒VP1蛋白基因,将目的基因克隆至载体pET28a(+),转化至大肠埃希菌原核表达。纯化表达产物免疫BALB/c小鼠,将成功免疫的小鼠脾细胞与骨髓瘤SP2/0细胞融合。用Modeller9.9为诺如病毒GⅡ型湖州株VP1蛋白构建三维模型,构建好的三维模型提交到SEPPA在线B-cell 空间表位预测软件,对GⅡ型湖州株VP1蛋白进行空间表位预测。用预测的表位序列来筛选阳性克隆,得到对应这些表位的单克隆抗体。结果 成功构建重组表达载体pET28a(+)-Noro-VP1并在大肠埃希菌中获得表达,重组蛋白免疫的BALB/c小鼠的脾细胞与SP2/0细胞融合,用预测的抗原表位多肽筛选,获得10株杂交瘤细胞株。与重组蛋白的ELISA结果显示1E8、1P10、2C15和2L16四株反应性最强,其他几株反应性较弱。Western blotting结果显示只有2K10、1K16、1E8三株能与重组蛋白很好的结合。结论 成功制备了抗GⅡ型湖州株诺如病毒VP1蛋白的单克隆抗体,抗原表位位于衣壳蛋白的P2区,为制备诺如病毒快速免疫诊断试剂盒及抗原表位的研究提供基础。
关键词:    诺如病毒   衣壳蛋白   单克隆抗体   抗原表位  

内容大纲
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1GⅡ型湖州株VP1蛋白空间表位预测
1.2.2免疫小鼠
1.2.3细胞融合及阳性杂交瘤细胞的筛选和克隆化
1.2.4腹水的制备及效价测定
1.2.5mAb特异性检测
2 结果
2.1 GⅡ型湖州株VP1蛋白空间表位预测结果
2.2 重组表达载体的鉴定及VP1蛋白的表达纯化与Western blotting鉴定
2.3 分泌抗NoV衣壳蛋白mAb的杂交瘤细胞株的建立
2.4 单克隆抗体特异性和敏感性测定
2.5 mAb初步应用
3 讨论

人类诺如病毒(Noroviruses,NoV)又称诺瓦克样病毒(Norwalk-like viruses),是杯状病毒家族主要成员,为单股正链RNA病毒。NoV是引起急性流行性胃肠炎的常见致病原[1]。有报道称,在美国超过42%的非细菌性胃肠炎暴发都是由NoV引起的[2]。由于NoV容易突变,存在多种抗原的类型和基因型,NoV抗原的多样性使其利于逃避机体免疫而适应生存。因为没有敏感细胞和动物模型,所以严重阻碍了对诺如病毒的研究。目前对NoV的诊断方法主要是免疫电镜法(IEM)、放射免疫法(RIA)、酶联免疫试验(ELISA法)、 实时荧光定量-聚合酶链反应(real time-PCR)等[3], 其中,用单克隆抗体(mono-clonal antibody,McAb)捕捉粪便中的病毒抗原是目前杯状病毒免疫学检测的主要方法。单克隆抗体具有交叉反应小,灵敏度高,特异性强的特点,在许多疾病的诊断中已得到广泛应用。目前我国对杯状病毒免疫检测方法的研究仅有少数报道[4-5] ,制约了NoV快速检测和疾病控制工作的开展。浙江省湖州地区由NoV引起的食物中毒经常发生,因此需建立一个快速检测NoV的方法。本研究以E. coli表达的GⅡ型湖州株NoV衣壳蛋白(VP1)作为免疫原,免疫BALB/c小鼠并制备单克隆抗体(mAb),用已知表位序列多肽筛选mAb,并与天然标本反应验证,为研制NoV快速检测试剂盒奠定基础。

1 材料与方法
1.1 材料  

NoV粪便标本为湖州市一次腹泻暴发疫情中采集到的,经real time-PCR检测为阳性的标本。BALB/c小鼠,雌性,8~12周龄,体重16~19 g,SPF环境饲养,由浙江省疾病预防控制中心提供。小鼠骨髓瘤细胞系SP2/0由本实验室保存培养。NoV VP1蛋白基因的克隆、表达和鉴定方法见文献报道[6],NoV VP1蛋白表达重组质粒pET28a(+)-Noro-VP1由本实验室制备及保存。PEG-MW3350购自Sigma公司,HAT、HT和RPMI 1640购自Gibco公司,新生牛血清购自杭州四季青公司,羊抗鼠IgG购自Abmart公司。其他试剂均为国产分析纯。

1.2 方法  
1.2.1 GⅡ型湖州株VP1蛋白空间表位预测 

用Modeller9.9(http://www.salilab.org/modeller/9.9/release.html [7])为NoV GⅡ型湖州株VP1蛋白构建三维模型,构建好的三维模型提交到SEPPA(Spatial Epitope Prediction of Protein Antigens)(http://lifecenter.sgst.cn/seppa/index.php)在线B-cell 空间表位预测软件,对GⅡ型湖州株VP1蛋白进行空间表位预测。

1.2.2 免疫小鼠 

用纯化后的NoV VP1蛋白作为免疫原免疫8~12周的雌性BALB/c健康小鼠9只,每次免疫剂量为100 μg/只,免疫途径为腹腔免疫,每次免疫间隔2周,首次免疫使用弗氏完全佐剂,抗原与弗氏完全佐剂按质量比1 ∶ 1混合乳化。后2次免疫采用抗原与弗氏不完全佐剂混合乳化;第3次免疫完成10 天后小鼠尾部取血检测免疫效果,血清效价达到104后可脾内注射进行加强免疫,3天后取脾融合。

1.2.3 细胞融合及阳性杂交瘤细胞的筛选和克隆化 

取免疫后小鼠脾细胞与Sp2/0细胞按常规融合方法融合。融合后细胞用含HAT的RPMI 1640培养液进行筛选。融合后的细胞经过适当稀释,分置于3×384孔培养板中培养,培养10~14天进行ELISA检测。用预测的表位序列来筛选阳性克隆,得到对应这些表位的单克隆抗体。挑选光密度(A)值高的孔中的细胞进行有限稀释法亚克隆。此过程重复数次,直至阳性孔比率为100%,我们即认为此为单克隆。将筛选得到的阳性单克隆扩大培养,细胞数按1~2×106 /管进行冻存。同时收集细胞进行腹水制备。

1.2.4 腹水的制备及效价测定 

每只BALB/c小鼠腹腔注射石蜡500 μl,4天后腹腔接种杂交瘤细胞1×106个/只,7~10 天后可产生腹水。收集腹水,3000×g离心10 min去除细胞碎片等沉淀。用重组蛋白(0.25 μg/ml)作为抗原包板,腹水从10-3起2倍稀释至1 ∶ 64 000作为一抗(连续梯度稀释),羊抗鼠IgG作为二抗,对培养7天的融合细胞上清进行间接ELISA检测。一抗倍比稀释后每孔100 μl,37 ℃孵育1 h;二抗为1 ∶ 2 000羊抗鼠IgG-HRP(1 mg/ml),5%PBS脱脂奶粉稀释,100 μl/孔,37 ℃孵育1 h;显色液为ABTS ,37 ℃避光反应15 min。检测每孔吸光度A450值,大于阴性对照两倍的吸光度值判为阳性。

1.2.5 mAb特异性检测 

用Western blot方法测定mAb对GⅡ型湖州株NoV VP1重组蛋白,及对天然GⅡ型NoV粪便标本的特异性反应情况。

2 结果
2.1 GⅡ型湖州株VP1蛋白空间表位预测结果

我们从PDB下载了NoV衣壳蛋白VP1的三维结构作为Modeller建模的模型,为GⅡ型湖州株VP1蛋白构建了三维模型,将构建好的三维模型提交到在线SEPPA预测后得到15段可能的表位序列,见表1。合成这些肽段用于单克隆抗体的筛选。

表1 预测得到的抗原表位序列及在VP1蛋白中的位置
Table 1 Selected region from norovirus VP1 protein
表位序号起始位置结束位置抗原表位序列
01019PSDGSTANLV
1110MKMASSDANP
2372381DNDFETNQNT
3129138PTEGLSPSQV
4527536LAPMGNGTGR
5219228TVESRTKPFS
61827LVPEVNNEVM
7390399QDGSTTPRNE
8287296RGDVTHIPGS
9227236FSVPVLTVEE
104554QNVIDPWIRN
11502511TGQHDLVIPP
126574TVSPRNAPGE
13307316NWSSYDPTEE
14354363GSADFSPKLG
2.2 重组表达载体的鉴定及VP1蛋白的表达纯化与Western blotting鉴定  

重组质粒pET28a(+)-Noro-VP1电泳后大小符合,测序正确(图1),成功构建获得重组表达载体。将诱导表达产物进行SDS-PAGE分析,结果显示在诱导6 h后有一明显条 带。可溶性分析显示此蛋白为包涵体,包涵体经尿素,Ni2+柱亲和纯化后,经SDS-PAGE检测(图2),表明目的蛋白得到纯化,目的表达蛋白占总蛋白的95%以上,其纯度可以满足动物免疫试验需要。

图1 重组质粒酶切鉴定
Figure 1 Identification of recombinant plasmid
图2 VP1蛋白的SDS-PAGE鉴定
Figure 2 SDS-PAGE analysis of VP1
2.3 分泌抗NoV衣壳蛋白mAb的杂交瘤细胞株的建立  

用15条已知表位序列多肽(0.25 μg/ml)分别包被酶标板来筛选单克隆抗体,PC孔包被His-BSA做阳性对照,检测孔和NC孔均包被多肽-BSA。Elisa Titer判断标准:大于NC(NC:免疫抗原包板,检测抗体为牛奶+细胞培养基)两倍且>0.25的A450值对应的稀释度值即为该抗体的效价。对抗体分泌能力强的培养孔用有限稀释法进行2次克隆化,共筛选出10株能稳定分泌抗NoV核衣壳蛋白抗体的细胞株,分别命名为2C15、1E8、1P10、2L16、1L22、2K10、1K16、8J12、6I2、8O10。这些筛选到的单克隆抗体对应两条多肽表位,1L22、1E8、1P10和1K16对应编号2的表位,2L16、2C15、2K10、8J12、6I2和8O10对应编号为5的表位。

2.4 单克隆抗体特异性和敏感性测定  

收集腹水,用间接ELISA方法测定,用重组蛋白(0.25 μg/ml)包被酶标板。结果显示1E8、1P10、2C15和2L16四株抗体最强,腹水稀释至10-6P/N值为0.5;2K10、1K16、8J12、6I2株抗体较弱,腹水稀释至10-4P/N值为0.4左右;1L22和8O10两株抗体最弱,腹水稀释至10-3P/N值为0.2左右(阴性对照P/N值为0.08)。同时对10株细胞株进行Western blotting验证,结果显示2K10,1K16,1E8与重组蛋白能很好的结合(图3)。综合以上结果,选择细胞株1E8进行扩大培养并初步应用。

  注:1.Marker; 2~11分别为2C15、8J12、6I2、8O10、1P10、1L22、2K10、1K16、1E8、2L16。
图3 mAb的Western blot验证
Figue 3 Western blot analysis of expression products in E. Coli with 10 mAbs
2.5 mAb初步应用  

mAb 1E8扩大培养后分别与表达重组蛋白和诺如粪便标本进行Western blotting检测,结果显示mAb不仅可以同表达重组蛋白进行特异性反应,并且可以同天然NoV核衣壳蛋白进行特异性反应(图4)。

  注:1:粪便标本;2:重组蛋白。
图4 1E8的Western blot验证
Figure 4 Western blot analysis of expression products in E. Coli and Native NV stool sample with 1E8

3 讨论

NoV最早发现于1972年,由Kapikian等[8]借助免疫电镜技术(IEM)观察到一种病毒颗粒,并根据发病地区将此病毒命名为Norwalk virus(NoV)。NoV作为流行性肠胃炎的主要病因之一,无论在发展中国家还是发达国家,从儿童到成年人都可以受到NoV的感染并造成暴发流行,成为影响人类健康不可忽视的问题。据统计,在美国,成人非细菌性胃肠炎的暴发中有42%由该类病毒所引起。人类NoV分为GⅠ和GⅡ两组[9-10] 。根据我国的调查结果[11-13] ,认为GⅡ组NoV为我国主要流行组,因而本实验也采用GⅡ组NoV作为研究对象。

NoV是单股正链RNA病毒,其基因组长度为7~7.5 kb,包括3个ORF,其中ORF2编码一个Mr为58~65×103的病毒核衣壳蛋白VP1[14]。VP1包括两个主要的结构域,外壳(S)域和突出(P)的结构域。在动物杯状病毒中,外壳(S)域是高度保守的,突出(P)的结构域可进一步分为3个子域:N-端P1,C-端P1和P2结构域。在3个结构域中,P2结构域是最突出在病毒表面的,并且在不同的病毒间变异最大[10]。因为P2结构域的特殊性,一般认为P2是最有可能的受体结合区域和免疫识别位点。

由于NoV在感染患者粪便中排毒量少,排毒时间短,并且没有敏感细胞及动物模型来进行培养分离鉴定[15],因此对NoV的研究,制备mAb,或研制疫苗等都只能依靠表达系统来完成。ORF2是NoV基因组中唯一编码结构蛋白的基因,一直都作为NoV免疫学研究的主要表达对象。Tomoko等[16]研究证实,用E.coli表达系统也可以表达出用于免疫研究的病毒核衣壳蛋白,并且重组蛋白具有良好的抗原性。单克隆抗体技术的出现,大大推动了对生物活性物质在分子水平上的研究,如对微生物的分子流行病学调查、快速诊断、抗原物质和致病因子的分析、以及对传染病的预防和治疗等方面,都提供了强有力的手段。

本研究利用在线软件SEPPA对NoV VP1蛋白的三维空间结构进行表位预测,利用预测得到的可能的空间表位来筛选单克隆抗体,然后用得到的单克隆抗体与重组蛋白反应,看其是否也能很好的与重组蛋白结合,达到快速检测的目的。实验结果表明,用已知表位来筛选单抗是可行的。最后选择的单抗1E8不仅能与重组蛋白很好的发生结合反应,而且对天然粪便标本的反应性也很强。单抗1E8对应表位序列372DNDFETNQNT381,位于P2结构域,也就是最突出在病毒表面的区域,与受体结合的机会是最大的。因此我们用SEPPA预测的空间表位成功筛选出了一株反应性很强的单抗,成功制备了针对我国主要流行遗传型NoV的单克隆抗体,这为我国NoV抗原检测技术的建立奠定了基础,同时也为NoV的基础研究工作提供了必要的材料。

参考文献
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