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文章信息
- 卢海跃, 林平
- LU Hai-yue, LIN Ping
- 引起老年患者院内下呼吸道感染的肺炎克雷伯菌中质粒介导的AmpC酶基因型检测与分析
- Genotype of plasmid-mediated AmpC β-lactamases in Klebsiella pneumoniae causing noscomial lower respiratory tract infection in elder patients
- 疾病监测, 2015, 30(5): 372-375
- Disease Surveillance, 2015, 30(5): 372-375
- 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.05.008
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文章历史
- 收稿日期:2014-10-22
2. 台州学院医学院, 浙江 台州 318000
2. Taizhou University Medical School, Taizhou 318000, Zhejaing, China
下呼吸道感染是医院内外感染的一种重要类型,而老年下呼吸道感染病情严重,病死率高。目前,随着临床上广谱抗菌药物的广泛应用,尤其是第三代头孢菌素的滥用,其耐药问题日趋严重,其中常见的耐药机制是由质粒介导的C类头孢菌素β-内酰胺酶(AmpC酶),该酶几乎不被β-内酰胺酶所抑制,并能水解β-内酰胺类抗菌药物,尤其是头孢菌素,已引起国内外临床医师的广泛关注。为了解下呼吸道感染肺炎克雷伯菌质粒介导产AmpC酶的发生情况,对2013年1 12月临海市中医医院呼吸内科老年住院患者下呼吸道标本中分离的97株肺炎克雷伯菌进行了耐药基因定位和分型研究,现报道如下。
1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 菌株临床菌株分离自临海市中医医院呼吸内科2013年1 12月老年住院患者下呼吸道感染标本中分离的97株肺炎克雷伯菌(不包括同一患者多次分离的同种细菌)。标本采集方法;采用一次性吸痰管吸取下呼吸道痰标本,或晨起留取痰标本前2~6 h禁食,用生理盐水漱口3次后,以深咳痰或用无菌棉棒取咽分泌物标本于无菌器皿内。取得标本后立即送检。其中男性57例,女性42例,年龄60~89岁,平均72.7岁。质控菌株:肺炎克雷伯菌ATCC 700603为AmpC酶阴性对照,阴沟肠杆菌029M为产AmpC酶阳性对照。
1.1.2 主要试剂与仪器MH琼脂、MH肉汤、血培养基、麦康凯培养基等购自杭州天和微生物试剂公司,所有药敏纸片均为英国OXOID公司产品;UNIQ-10柱式质粒小量抽提试剂盒、聚合酶链反应(PCR)产物纯化试剂盒为上海生工生物技术有限公司产品;AmpC酶PCR 5对引物由上海生工生物工程技术有限公司合成;Marker (DL 500)为TaKaRa公司产品。VITEK-60型全自动细菌鉴定仪为法国生物梅里埃公司产品;HRSP 0520 PCR扩增仪为美国Thermo Hybaid公司产品,Puwer Pac 300型电泳仪为美国Bio-Rad公司产品,凝胶成像仪为上海天能公司产品。
1.2 方法 1.2.1 菌株鉴定细菌分离鉴定参照《全国临床检验操作规程》进行,并使用法国生物梅里埃公司VITEK-60型全自动细菌鉴定仪。
1.2.2 产AmpC酶菌株筛选试验按CLSI 2010推荐的K-B纸片扩散法标准[1]操作。将0.5麦氏单位待测菌株的菌液均匀涂布于M-H琼脂平板,中间贴上头孢西丁(30 μg/片)纸片,35 ℃培养过夜,诊断标准以抑菌圈≤18 mm表示待测菌株对头孢西丁耐药,疑为产AmpC酶菌株。阴性对照采用肺炎克雷伯菌ATCC 700603菌株,阳性对照采用阴沟肠杆菌029M菌株。
1.2.3 产AmpC酶菌株确证试验采用双纸片表型确证法[2],在空白的无菌纸片和头孢西丁纸片上各加入40 g/L的邻氯西林2.5 μl,风干备用,然后将疑产AmpC酶菌株转种于M-H肉汤中,35 ℃恒温摇床200 r/min振荡培养6~12 h,调整浓度为0.5麦氏单位,涂布于M-H平板上,贴上邻氯西林、头孢西丁和加有邻氯西林的头孢西丁纸片各1张,35 ℃恒温培养18 h后观察结果。若加入邻氯西林的头孢西丁纸片抑菌圈直径比其他2个纸片的抑菌圈都扩大5 mm以上者为阳性。
1.2.4 质粒介导AmpC酶基因的PCR扩增 1.2.4.1 质粒DNA提取对确证产AmpC酶的菌株严格按上海生工生物技术有限公司UNIQ-10柱式质粒小量抽提试剂盒说明书进行提取耐药质粒。质粒提取质量的检测用1%琼脂凝胶电泳鉴定。
1.2.4.2 AmpC酶检测PCR:根据质粒AmpC酶基因的分群设计群特异性的5对引物,采用PCR扩增其基因型。PCR引物设计参照Pérez-Pérez和Hanson[3]的方法。5对引物序列和目标长度见表 1。PCR反应体系及参数:PCR反应体系总体系50 μl。反应条件:10×缓冲液 5 μl,dNTPs混合液(2.5 mmol/L)4 μl,上下游引物(25 μmol/L)各1 μl,模板1 μl,Taq酶0.5 μl;反应条件:93 ℃预变性2 min,94 ℃变性60 s,55 ℃退火60 s,72 ℃延伸60 s,重复35个循环,最后一个72 ℃延长至5 min。取PCR产物5 μl在1%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色紫外灯下成像,观察分析结果。
目标基因类型 | 引物及序列(5′→3′) | 扩增片段长度(bp) | |
20150508MIR/ACT-1 | P1 | TCG GTA AAG CCG ATG TTG CGG | 302 |
P2 | CTT CCA CTG CGG CTG CCA GTT | ||
20150508 ACC | P1 | ACC AGC CTC AGC AGC CGG TTA | 346 |
P2 | TTC GCC GCA ATC ATC CCT AGC | ||
20150508 DHA-1、DHA-2 | P1 | AAC TTT CAC AGG TGT GCT GGG T | 405 |
P2 | CCG TAC GCA TAC TGG CTT TGC | ||
20150508 CIT | P1 | TGG CCA GAA CTG ACA GGC AAA | 462 |
P2 | TTT TCC TGA ACG TGG CTG GC | ||
20150508 MOX | P1 | GCT GCT CAA GGA GCA CAG GAT | 520 |
P2 | CAC ATT GAC ATA GGT GTG GTC C |
将PCR扩增后产物交上海生工生物技术有限公司进行纯化、测序,测序使用双脱氧末端终止法,在ABI PRISMTM377自动测序仪上进行,测序结果经DNAstar 7.1软件接拼,与GenBank中的BLAST程序进行比对分析,确定其基因型。
1.2.6 质粒接合试验扩增出质粒AmpC酶基因的菌株作为供体菌,耐药利福平的大肠埃希菌C 600为受体菌,将二菌分别培养至对数生长期后等量混匀,再接种到含100 μg/ml利福平、10 μg/ml头孢西丁的麦康凯培养基上,置35 ℃培养16~18 h后观察结果。不利用乳糖的菌落才是接合子,并对所有接合子用PCR确认是否含有质粒AmpC基因。
2 结果 2.1 产AmpC酶菌株初筛与确证试验结果老年住院患者下呼吸道感染标本中分离的97株肺炎克雷伯菌经头孢西丁敏感试验,筛选出可疑产AmpC酶菌株共21株,初筛阳性率为21.6%。对头孢西丁敏感试验筛选出疑产AmpC酶的菌株再经双纸片表型确证试验,结果有17株阳性,确证产AmpC酶菌株检出率为17.5%。
2.2 PCR产物电泳结果17株双纸片表型确证试验确证产AmpC酶阳性的肺炎克雷伯菌进行质粒DNA提取,PCR检测AmpC酶基因,琼脂糖电泳显示,17株均以DHA20150508组引物扩增后得到与预期片段大小一致的片段(405 bp),见图 1。
2.3 PCR产物测序结果17株肺炎克雷伯菌PCR阳性的菌株再经相应特异性引物进行全长基因扩增,其中以DHA20150508为引物的17株菌株全部与引物DHA20150508扩增出约405 bp的阳性条带,通过GenBank中对应序列比对,属DHA-120150508基因型。
2.4 接合试验结果17株双纸片表型确证法试验阳性菌株和受体菌(大肠埃希菌C600)混合生长选择出的菌落,用含利福平和头孢西丁的麦康凯培养基对接合子进行第一次筛选,17株AmpC筛选出阳性菌株均将头孢西丁的耐药基因传递给受体菌大肠埃希菌C600,共得到17株不同的接合子。再用含头孢他定、头孢噻肟、克拉维酸、利福平的麦康凯培养基对这17株接合子进行第二次筛选,同样得到17株接合子,表明接合成功。
3 讨论AmpC酶是目前被国内外微生物学专家关注的β-内酰胺酶之一,由于产持续高产AmpC酶菌株逐年增多,已造成临床抗感染治疗的困难。AmpC酶主要是由革兰阴性杆菌的染色体或质粒编码产生,主要作用于头孢菌素类抗菌药物,且不被克拉维酸抑制的“丝氨酸”头孢菌素酶,特点是对头霉烯类抗菌药物呈高水平耐药[4]。AmpC酶从基因表达来源可分为染色体介导和质粒介导2种,前者基因位于细菌染色体上,通常表现为低水平表达,诱导剂可诱导其表达,而质粒型AmpC酶的基因位于质粒上,不需要诱导即可产生大量AmpC酶[5]。克雷伯菌属是天然缺乏ampC20150508基因的菌株,因此,从肺炎克雷伯菌中检测到的AmpC酶,大多由其染色体外遗传物质质粒引入基因编码而产生AmpC酶,由于质粒DNA具有传递的特点,可通过转化、接合、转导、转座子等各种途径在细菌间传递,引起医院感染或流行[5, 6]。因此,从肺炎克雷伯菌中检测AmpC酶具有更为重要的临床意义。
从本次实验结果来看,97株实验菌株中经头孢西丁敏感试验筛选出可疑产AmpC酶菌株21株,初选阳性率为21.6%。可疑阳性菌株再经双纸片表型确证试验结果有17株确证产AmpC酶,阳性率为17.5%。17株确证产AmpC酶菌株通过质粒DNA提取,PCR检测,琼脂糖电泳显示,17株均与DHA20150508引物扩增后得到大小一致的片段(405 bp)。此结果与本地区报道的检出率15.56%和20.65%基本相同[6, 7],低于河南省报道的检出率57.68%[8]。可能与不同地区抗菌药物使用不一或与检测方法不同有关。本实验还对17株确证产AmpC酶的菌株进行质粒DNA提取,PCR扩增检测基因型,PCR结果显示:17株菌株均扩增出约405 bp的特异性条带,其扩增产物与美国GenBank基因库中的AmpC酶基因序列比对,与DHA-120150508型基因序列100%同源。表明临海市中医医院AmpC酶流行基因型主要为DHA-120150508型。分析DHA-120150508型在该院检出率较高的原因除了在本地区为主要流行型以外,另一原因与老年患者免疫力低下,且身患多种疾病住院频繁,住院时间长,抗菌药物大量使用,细菌易以飞沫或气溶胶的形式造成医院内交叉感染有关。由于质粒DNA具有可传递的特点,本研究还将从肺炎克雷伯菌质粒中检测的AmpC基因,经接合试验证实可通过接合方式传递至受体菌,提示该菌质粒携带的AmpC基因可能在临床菌株间的传递及导致耐药性播散中起重要作用。
本实验中,通过表型筛选得到耐头孢西丁耐药株为21株,通过产AmpC酶确证试验及引物PCR扩增确定产AmpC酶菌株为17株。由此表明,表型与基因型的结果有一定的关联但也同时存在差异,可能与肺炎克雷伯菌细胞对药物的通透性降低有关[9],也可能由于转入了ampR20150508基因,使ampC20150508基因呈诱导型表达,或由于所产生的AmpC酶量活力较低,或其他的耐药机制导致的耐药,将在以后的实验中进行深入研究。
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