Drug resistance and genotype of β-lactamases-producing Klebsiella pneumoniae in ICU patients with nosocomial infection
LIU Li-xin1, ZHANG Hua-ping2
Taozhu Central Hospital, Linhai, Linhai 317013, Zhejiang, China
Abstract
Objective To explore the genotype and the drug resistance characteristics of ESBLs and AmpC-lactamase producing Klebsiella pneumoniae in ICU patients with nosocomial infection and provide evidence for the clinical medication. Methods The isolates were identified with VITEK 60 System; the ESBLs detection and drug sensitivity test (Kirby-Bauer method) were conducted according to the standards recommend by CLSI; the suspected AmpC-lactamase producing strains were screened with cefoxitin disk diffusion test. the genotypes were analyzed with cefoxitin three-dimensional test and PCR sequencing. Results Of the 97 isolates, 31.96% were ESBLs positive, 13.40% were AmpC-lactamase positive. Among them, only AmpC-lactamase producing isolates accounted for 7.22%; both AmpC-lactamase and ESBLs producing isolated accounted for 6.19%; only ESBLs producing isolates accounted for 25.77%. The drug resistant genes of all 13 AmpC-lactamase positive strains belonged to genotype DHA-1. ESBLs producing strains were resistant to more drugs than the non ESBLs producing strains. Both AmpC-lactamase and ESBLs producing isolates had more serious drug resistance. Conclusion The detection rates of AmpC-lactamase and ESBLs producing Klebsiella pneumoniae were high in ICU patients. All the AmpC-lactamase belonged to genotype DHA-1 and both AmpC-lactamase and ESBLs producing Klebsiella pneumoniae strains were multi-drug resistant.
Keywords:
intensive care unit
nosocomial infection
Klebsiella pneumoniae
AmpC-lactamase
genotype
ESBLs
drug resistance
重症监护病房患者医院感染产β-内酰胺酶和头孢菌素酶的肺炎克雷伯菌耐药性及基因型研究
刘立新1, 章华萍2
1. 临海市桃渚中心卫生院, 浙江 临海 317013;
2. 台州市中心医院
2. 台州市中心医院
摘要
目的 探讨重症监护病房(ICU)患者医院感染产β-内酰胺酶(ESBLs)和头孢菌素酶(AmpC酶)的肺炎克雷伯菌耐药基因型及对常用抗菌药物的耐药特性,为临床合理用药提供参考依据。 方法 细菌鉴定采用VITEK-60型全自动微生物鉴定仪鉴定;ESBLs和药敏试验K-B纸片法按CLSI推荐的方法;产AmpC酶菌株筛选采用头孢西丁纸片扩散法;产AmpC酶菌株确证试验采用三维试验;通过酶粗提物头孢西丁三维试验、PCR测序等实验分析该菌株的基因型。 结果 97株肺炎克雷伯菌ESBLs和AmpC酶总检出率分别为31.96%和13.40%,其中,单产AmpC酶、同产AmpC酶+ESBLs及单产ESBLs菌株检出率分别为7.22%、6.19%和25.77%;13株产AmpC酶阳性菌株的耐药基因型均为DHA-1;产酶菌株对抗菌药物耐药率明显高于非产酶株。同产AmpC酶+ESBLs菌株耐药现象更为严重。 结论 ICU患者肺炎克雷伯菌产AmpC酶和ESBLs菌株检出率较高,AmpC酶基因型均为DHA-1型,产AmpC酶和ESBLs菌株对多种抗菌药物呈耐药状态。
内容大纲
-
1 材料与方法
- 1.1 材料
- 1.2 方法
- 1.2.1 医院感染诊断标准
- 1.2.2 ESBLs确证试验
- 1.2.3 产AmpC酶菌株筛选
- 1.2.4 产AmpC酶确证试验
- 1.2.5 基因检测
- 1.2.6 DNA测序
- 1.2.7 药敏试验
- 2.1 ESBLs阳性菌株检出率
- 2.2 产AmpC酶菌株初筛结果
- 2.3 产AmpC酶菌株确证结果
- 2.4 产AmpC酶菌株多重PCR基因检测结果
- 2.5 PCR产物测序结果
- 2.6 药敏试验结果
1 材料与方法
1.1 材料 1.1.1 菌株来源
97株肺炎克雷伯菌分离自2010年7月至2012年6月台州市中心医院ICU患者痰液、血液、尿液、分泌物等标本。菌株系分离自每位独立患者的标本,并已排除同一患者的重复相同菌株。全部菌株均经常规生化方法及VITEK-60型全自动细菌鉴定仪鉴定确认。质控菌株:阴沟肠杆菌029M作产AmpC酶阳性对照,肺炎克雷伯菌ATCC700603作AmpC酶阴性对照,并作ESBLs阳性对照,大肠埃希菌ATCC25922作ESBLs和AmpC酶阴性对照。
1.1.2 试剂
所有药敏纸片均为英国Oxoid公司产品。MH肉汤、MH琼脂、血培养基、麦康凯等培养基均为杭州天和微生物试剂公司产品。
1.2 方法
1.2.1 医院感染诊断标准
按2001年中华人民共和国卫生部审定的医院感染诊断标准[1]。患者均为入院72 h后发病,有感染的临床表现或在原有感染的基础上出现新的感染,血、尿、痰、中心静脉导管尖及局部引流物病原学培养证实有感染者。
1.2.2 ESBLs确证试验
按照美国临床实验室标准化委员会(CLSI)2010年推荐的ESBLs确证试验标准[2]进行。用头孢他啶(30 μg/片)与头孢他啶/克拉维酸(CD02. 30 μg/10 μg/片)和头孢噻肟(30 μg/片)与头孢噻肟/克拉维酸(CD03. 30 μg/10 μg/片)对两组中任何一种药物,抑菌圈直径相比增大值≥5 mm时,判定为产ESBLs。用肺炎克雷伯菌ATCC700603菌株作质控。
1.2.3 产AmpC酶菌株筛选
根据2010年CLSI推荐的K-B纸片标准[2]。采用待测菌株用头孢西丁(30 μg/片)扩散法筛选耐药菌株,以抑菌圈≤18 mm作为疑产AmpC酶菌株。质控菌株:大肠埃希菌ATCC25922、作阴性对照,阴沟肠杆菌029M作阳性对照。
1.2.4 产AmpC酶确证试验
采用三维试验[3]。酶粗提物制备:将AmpC酶表型筛选呈阳性的肺炎克雷伯菌转种到麦康凯平板上,经35 ℃孵育18~24 h,然后挑取受试菌制成0.5麦氏单位菌液。取50 μl菌液,加入10 ml胰大豆蛋白胨肉汤中,35 ℃恒温摇床200 r/min振荡培养6 h,4000 r/min 4 ℃离心20 min,弃上清液,收集细菌于2 ml离心管,-80 ℃反复冻融5次,再用0.01 mol/L的磷酸盐缓冲液1.5 ml悬浮,旋涡混匀,1400 r/min 4 ℃离心1 h,取上清液(含酶粗提取物),无菌试验后-20 ℃保存待用。三维试验:将质控菌株大肠埃希菌ATCC 25922(3.0×108 cfu /ml)菌液均匀涂布于MH琼脂平板,将30 μg头孢西丁纸片置于平板中心,用无菌刀片在离纸片边缘5 mm处由里向外切割一道沟槽,将25 μl酶粗提物由里向外加入沟槽内,将MH平板置于35 ℃孵育16 ~18 h,观察抑菌圈的形状。头孢西丁纸片的抑菌圈有缺失者为阳性,无变化者为阴性。以阴沟肠杆菌029M的酶粗提物作阳性对照。
1.2.5 基因检测
对确证产AmpC菌株采用美国Thermo HYbaid公司生产的HRSPO520 PCR扩增。以阴沟肠杆菌029M菌株作为产AmpC酶阳性对照,大肠埃希菌ATCC25922为阴性对照进行多重PCR。引物设计参照Perez-Perez和Hanson[4]的方法,由上海生工生物技术有限公司合成。结合我国地区所报道的AmpC酶基因型情况 ,选择5对引物,5对引物及相应扩增片段的长度见表1。PCR体系(50 μl):10×缓冲液5 μl,dNTPs混合液(2.5 mmol/L)4 μl,引物(25 μmol/L)1 μl,模板各1 μl,Taq DNA聚合酶0.5 μl。反应条件:93 ℃预变性2 min,94 ℃变性60 s,55 ℃退火60 s(OprD2 57 ℃),72 ℃延伸60 s,重复35个循环,最后一个72 ℃延长至5 min。取PCR产物5 μl在1%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色紫外灯下成像,观察分析结果。
表1 AmpC酶基因PCR引物序列
Table 1 Primer sequence in PCR for AmpC-lactamase gene
基因名称 | 引物序列(5′→3′) | 产物长度 /bp | |
FOX | P1 | ACC ATG GGG TAT CAG GGA GAT G | 190 |
P2 | CAA AGC GTA ACC GGA TTG G | ||
MIR/ACT-1 | P1 | TCG GTA AAG CCG ATG TTG CGG | 303 |
P2 | CTT CCA CTG CGG CTG CCA GTT | ||
ACC | P1 | ACC AGC CTC AGC AGC CGG TTA | 346 |
P2 | TTC GCC GCA ATC ATC CCT AGC | ||
DHA-1、DHA-2 | P1 | AAC TTT CAC AGG TGT GCT GGG T | 405 |
P2 | CCG TAC GCA TAC TGG CTT TGC | ||
CIT | P1 | TGG CCA GAA CTG ACA GGC AAA | 462 |
P2 | TTT CTC CTG AAC GTG GCT GGC |
1.2.6 DNA测序
将聚合酶链反应(PCR)扩增后产物交上海生工生物技术有限公司进行纯化、测序。测序使用双脱氧末端终止法,在ABI PRISMTM377自动测序仪上进行。测序结果经DNAstar软件接拼,与GenBank中的BLAST程序进行比对分析,确定其基因型。
1.2.7 药敏试验
参照2010年CLSI推荐的标准[2],采用K-B纸片扩散法,并以大肠埃希菌ATCC25922作为质控菌株。
2 结果
2.1 ESBLs阳性菌株检出率 97株肺炎克雷伯菌经ESBLs酶确证试验共检出产ESBLs菌株共31株,阳性率为31.96%。
2.2 产AmpC酶菌株初筛结果
97株肺炎克雷伯菌经头孢西丁敏感试验对头孢西丁耐药的有17株,占17.53%。
2.3 产AmpC酶菌株确证结果
对筛选疑产AmpC酶阳性的菌株再经三维试验确证有13株阳性,产AmpC酶为13.40%。其中在检出31株产ESBLs菌株中,有6株经三维试验确证同时产AmpC酶(6.19%);25株均未检出产AmpC酶,为单产ESBLs菌株(25.77%);7株为单产AmpC酶菌株(7.22%)。
2.4 产AmpC酶菌株多重PCR基因检测结果
13株经三维试验确证产AmpC酶的菌株中,经多重PCR 13株均扩增出405 bp的特异性条带,为DHA基因阳性。DHA质粒AmpC酶的检出率为13.40%。
2.5 PCR产物测序结果
13株PCR阳性的菌株再经一步采用相应特异性引物进行全长基因扩增,结果与引物DNA均扩增出405 bp阳性条带。通过GenBank中对应序列比较,与美国GenBank基因库中的AmpC酶基因序列比对相同,属DHA-1型。
2.6 药敏试验结果
97株产β-内酰胺酶与非产酶株对20种常用抗菌药物的体外耐药率结果见表2。
表2 97株肺炎克雷伯菌产酶株与非产酶株对常用抗菌药物的耐药率
Table 2 Resistance to common antibiotics of 97 strains of β-lactamases-producing and non β-lactamases-producing Klebsiella pneumoniae
抗菌 药物 |
单产AmpC 酶菌株 (n=7) | 单产ESBLs 菌株 (n=25) | 产AmpC酶 +ESBLs菌株 (n=6) | 非产AmpC 和ESBLs 菌株(n=59) | 抗菌 药物 |
单产AmpC 酶菌株 (n=7) | 单产ESBLs 菌株 (n=25) | 产AmpC酶 +ESBLs菌株 (n=6) | 非产AmpC 和ESBLs 菌株(n=59) |
美洛培南 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 头孢呋辛 | 71.4 | 61.6 | 83.3 | 8.5 |
亚胺培南 | 0.0 | 0.0 | 16.7 | 0.0 | 头孢唑啉 | 71.4 | 60.0 | 83.3 | 13.6 |
头孢吡肟 | 14.3 | 12.0 | 16.7 | 8.5 | 头孢曲松 | 85.7 | 68.0 | 83.3 | 7.9 |
阿米卡星 | 28.6 | 24.0 | 38.3 | 11.9 | 头孢他啶 | 85.7 | 72.0 | 100.0 | 20.0 |
左氧氟沙星 | 28.6 | 20.0 | 33.3 | 13.6 | 头孢噻肟 | 71.4 | 64.0 | 83.3 | 5.1 |
环丙沙星 | 42.9 | 44.0 | 50.0 | 10.2 | 哌拉西林 | 85.7 | 72.0 | 83.3 | 10.2 |
哌拉西林/他唑巴坦 | 42.9 | 24.0 | 50.0 | 5.1 | 氨苄西林 | 85.7 | 72.0 | 100.0 | 10.2 |
氨苄西林/舒巴坦 | 57.4 | 52.0 | 66.7 | 11.9 | 替卡西林/克拉维酸 | 57.4 | 44.0 | 83.3 | 8.5 |
头孢他啶/克拉维酸 | 57.4 | 44.0 | 66.7 | 23.7 | 阿莫西林/克拉维酸 | 71.4 | 60.0 | 83.3 | 15.3 |
庆大霉素 | 42.9 | 40.0 | 83.3 | 15.3 | 氨曲南 | 85.7 | 80.0 | 100.0 | 18.6 |
3 讨论
肺炎克雷伯菌是医院感染重要的条件致病菌之一。近年来,随着β-内酰胺类抗生素,尤其是头孢菌素在临床的广泛应用,肺炎克雷伯菌对抗生素的耐药性呈明显上升趋势,成为当今全球临床感染治疗面临的棘手问题。ICU患者基础疾病严重、免疫力低下,加上机械通气、气管插管等各种侵入性操作频繁,成为医院感染最常见亦最为严重的科室。克雷伯菌属是天然缺乏AmpC酶基因的菌株,但可以通过质粒引入AmpC基因而持续高表达AmpC酶,因此,从肺炎克雷伯菌中检测到的AmpC酶绝大多由质粒携带的AmpC基因编码,并可通过转化、接合等方式在细菌间传递,造成传播和流行[5]。本研究采用AmpC酶可以水解头孢西丁,根据这一特点对ICU患者分离的肺炎克雷伯菌进行产AmpC酶菌株初筛,在此基础上进一步采用三维试验来确证产AmpC酶菌株。结果13株三维试验阳性,占13.4%,高于邱清芳[9]等报道的6.5%,与本地区林平[8]等报道的检出率15.56%基本相似,但明显低于陈燕等[10]报道的29.3%。分析其原因除了可能与所检测的菌株多重耐药有关外,还可能与地域等因素有关。本研究资料中还对这13株确证产AmpC酶菌株应用多重PCR技术简化质粒DNA基因检测,采用5对引物进行PCR扩增检测基因型,结果13株肺炎克雷伯菌均扩增出约405 bp的条带,扩增产物经过双向测序以及和GenBank数据库比对,发现和DHA-1型酶基因序列100% 同源。显示我地区AmpC酶基因型流行主要为DHA-1型。同时,本研究结果发现所分离的肺炎克雷伯菌以单产ESBLs为主,同产ESBLs和AmpC酶占6.19%。
目前CLSI仍未出台关于产AmpC酶检测的标准,但所推荐的利用头孢西丁敏感试验的方法虽操作简单,但往往存在有一定的假阳性。本研究中,从耐头孢西丁的17株肺炎克雷伯菌中,经三维试验有4株阴性,说明对头孢西丁不敏感的原因不一定是AmpC酶所致,有可能与菌细胞对药物的通透性降低有关[11],也有可能这种现象已转入了AmpR基因呈诱导型表达,也有可能是由于所产生的AmpC酶量活力低,而三维试验灵敏度不够有关,有待进一步研究。
药敏试验结果可以看出,非产酶株对20种常用抗菌药物均显示较好的敏感性,产酶株对碳青霉烯类抗菌药物美洛培南、亚胺培南具有很高的敏感性,对第四代头孢菌素、左氧氟沙星和阿米卡星亦具有较高的敏感性。本研究结果还表明,从酶抑制复合剂对单产AmpC酶和单产ESBLs菌株来看,前者耐药率高于后者,说明酶抑制剂可以抑制ESBLs,但对AmpC酶抑制不十分明显,而且他唑巴坦和舒巴坦对AmpC酶和ESBLs呈现不同的抑制作用,他唑巴坦的抗菌活性明显强于舒巴坦。因此临床实验室应加强对产β-内酰胺酶菌株的常规检测,及时掌握耐药动态,指导临床合理使用抗菌药物,控制耐药菌株的蔓延。
参考文献
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