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目的对2017年一起奶牛场布鲁氏菌病（布病）暴发原因和感染危险因素进行调查。 方法采用自制调查问卷，对该厂所有在职职工进行面对面方式询问，实验室进行试管凝集试验（SAT）。 对布病感染危险因素进行分析。 结果共调查99人，挤奶人员中布病感染率最高，为25.00%（5/20）；12例SAT阳性，其中9例为确诊病例，年龄在23 ~ 55岁之间，以关节、肌肉痛和乏力为主，无发热病例；3例隐性感染者，抗体滴度均为1∶100++。 接触过流产物（RR＝3.73，95%CI：1.07 ~ 7.27）、接触过病牛（RR＝4.07，95%CI：1.07 ~ 7.33）、给牲畜免疫（RR＝9.11，95%CI：1.37 ~ 21.22）、重复使用手套（RR＝5.09，95%CI：1.16 ~ 14.63）是布病感染的可能危险因素。 结论接触过流产物、给牲畜免疫、重复使用手套是影响从业人员感染布病的主要因素。 相关部门应该加强畜间疫情防控，对从事养殖行业的职业人群加强布病相关知识和防护相关培训，尤其是从业过程中的监管。
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目的了解全国传染病报告信息管理系统中法定传染病报告卡重复报告（重卡）现状，分析重卡原因，提出解决方法，进一步规范报告管理，提高数据质量。 方法基于Hadoop和Spark为核心的大数据分析平台，利用Python和Jupyter notebook，按照查重条件对2005－2017年全国法定传染病报告卡分别统计分析年度内重卡、累计重卡和跨年度重卡，并利用Python包matplotlib绘图展示统计结果。 结果2005 — 2017年年度内重卡率平均为7.65/万，累计重卡数1 141 539张，累计重卡率133.47/万，重卡数居前3位的疾病是乙型肝炎、手足口病和肺结核，占比分别为30.23%、28.01%和12.96%。 其中2017年年度内重卡率为11.19/万，年内重卡数8 497张，跨年度重卡累计276 194张。 结论法定传染病年度内卡片重复报告依然有待加强管理，跨年度重卡和累计重卡逐年增多，严重影响数据分析，需要尽快采取相应的数据管理和分析对策。
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目的利用侧流层析–重组酶聚合酶扩增（LF-RPA）技术建立快速、敏感、特异的土拉弗朗西斯菌（土拉菌）检测方法。 方法基于土拉菌特异性基因（tul4）设计重组聚合酶恒温扩增方法的引物及探针，优化反应时间和温度，同时评价该方法的灵敏度及特异性，并通过模拟血液样品评估此方法的实用性。 结果该方法最佳反应条件是40 ℃，20 min，可检测核酸浓度最低为20 fg/μl，与实时荧光定量PCR（qPCR）方法相近，且不与7种非土拉菌发生交叉反应。 土拉菌模拟样本最低检测浓度为460 CFU/ml。 结论该检测方法操作简单，特异性良好，敏感度高且无需大型精密实验设备，在临床及野外检测土拉菌中具有很大应用前景。
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目的分析2014－2017年浙江省余姚市居民死因构成和减寿情况，为制定疾病防治策略提供依据。 方法收集2014－2017年余姚市户籍居民死亡监测资料，死因按照国际疾病分类标准（ICD-10）进行编码，计算死亡率、标化死亡率、潜在减寿年数（PYLL）、平均减寿年数（AYLL）和PYLL率（PYLLR）等指标。 结果2014－2017年余姚市年均死亡率为739.95/10万，标化死亡率为435.49/10万；男性年均粗死亡率为832.53/10万，标化死亡率484.60/10万，女性年均粗死亡率为649.51/10万，标化死亡率386.28/10万，男性整体死亡率高于女性（χ2＝381.589，P＜0.001）；死因前5位依次为恶性肿瘤（234.41/10万）、呼吸系统疾病（136.09/10万）、脑血管病（99.82/10万）、心脏病（90.47/10万）和伤害（74.33/10万），前5位死因合计占总死因的85.84%；前5位死因PYLL为79 305.00人年，AYLL为13.01人年，PYLLR为24.49‰，其中伤害对寿命损失最大。 结论余姚市居民死亡以恶性肿瘤为主，男性死亡率高于女性，需要制定针对不同人群的综合性防制措施。
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目的探索气象因素对甘肃省流行性感冒（流感）流行强度的影响，为流感防控关口前移提供科学依据。 方法本研究选择白银、天水、酒泉3个地区监测点的病原学监测数据及气象资料，通过交互相关分析确定各气象因素对流感发病效应的滞后时间，运用分类回归树模型遴选出对流感流行强度影响最大的气象因素。 结果气象因素相关性研究显示，温度、湿度与流感流行强度呈负相关。 天水市最高温度的3周移动平均低于19.11 ℃时流感流行强度升高1.89倍；酒泉市平均温度的3周移动平均低于8.03 ℃时流行强度升高2.01倍；白银市平均温度的3周移动平均低于8.68 ℃且相对湿度的14周移动平均低于61.04%时流行强度升高2.24倍。 结论流感的流行受气象因素影响，寒冷干燥的气象条件有利于流感在人群中传播。
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目的探讨NRAMP1、Sp110基因多态性与蒙古族人群结核病易患性的关系。 方法采用病例－对照研究，选取蒙古族结核病患者180例，正常体检者184例，应用聚合酶链式反应–限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测NRAMP1、Sp110的基因型，计算各基因型在病例组和对照组的频率，采用χ2检验、logistic回归分析基因多态性与结核病易患性的关系。 结果单因素χ2检验发现除体质指数（BMI）外其他因素在两组中分布均衡；NRAMP1rs17235409、NRAMP1rs17235416和Sp110rs3948464位点基因多态性均与结核易患性相关，3个位点突变基因型GA＋AA、TGTG/（－）＋（－）/（－）、CC结核病易患的危险度分别是未突变基因型GG、TGTG/TGTG、TT的1.784、4.745和3.061倍；BMI＜18.5是结核病易患的危险因素，其结核病易患的危险度是BMI≥18.5个体的4.350倍。 结论NRAMP1rs17235409、NRAMP1rs17235416和Sp110rs3948464位点基因多态性与结核病易患有关。
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目的调查云南省西双版纳傣族自治州（西双版纳州）2017年登革热暴发疫情的流行病学特征和登革病毒（DENV）流行株血清型和遗传进化特征。 方法收集登革热病例资料，采集登革热患者急性期血清标本，用反转录–聚合酶链式反应扩增DENV C/PrM和E基因核苷酸序列，用MEGA 5.0软件构建系统发生树。 结果2017年西双版纳州共确诊登革热1 348例，包括本地感染病例1 231例和输入性病例117例。 景洪市、勐腊县和勐海县均有来自老挝和缅甸的输入性病例，其中景洪和勐腊发生本地流行，病例数分别为1 030例和201例。 流行期为5 — 12月，病例年龄以20 ~ 54岁为主，男女性别比为1∶1.16。 从患者血清中获得48株DENV的C/PrM区基因核苷酸序列进化分析结果表明，其中46株为登革1型病毒（DENV-1；景洪市33株、勐腊县10株和勐海县3株），2株为登革2型病毒（DENV-2；勐腊县和勐海县各1株）。 2017年西双版纳州的老挝输入病例和本地感染病例的DENV -1流行株间高度同源，与近几年德宏州瑞丽市和临沧市耿马县及东南亚国家的DENV-1流行株具有较近的遗传进化关系。 DENV-1的E基因进化分析结果与C/PrM一致。 结论DENV-1是引起2017年西双版纳州登革热暴发疫情的主要病原。 来自老挝的登革热输入性病例是导致2017年西双版纳州本地登革热流行的主要原因，应加强中国−老挝和中国−缅甸边境地区登革热跨境传播的防控。
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目的分析2005 — 2017年广东省猩红热的流行特征，为防控猩红热提供科学依据。 方法应用描述性流行病学方法分析国家疾病监测信息报告管理系统中2005 — 2017年广东省猩红热病例时间、地区和人群分布特征；应用Joinpoint软件估计发病率平均年度变化百分比（AAPC），分析猩红热发病趋势；对2017年分离的66株A群溶血性链球菌（GAS）进行emm基因分型和抗生素敏感性分析。 结果2005 — 2017年广东省共报告猩红热病例20 157例，年均发病率为1.46/10万，无死亡病例。 发病呈夏、冬两季高发特点；报告发病率高的地区为珠江三角洲地区，病例数占全省的95.79%；病例主要集中在3 ~ 7岁，以托幼儿童、散居儿童和学生为主。 广东省猩红热发病水平总体呈上升趋势，AAPC为26.4%（95%CI：16.9% ~ 36.7%）。 GAS菌株emm基因型别以emm12型为主（65.12%），emm1型次之（32.56%）；菌株对红霉素、克林霉素、四环素耐药；对青霉素、头孢噻肟和左旋氧氟沙星均敏感。 结论2005 — 2017年广东省猩红热发病水平总体呈上升趋势，三间分布特征未见明显变化；当前GAS菌株流行基因型为emm12和emm1，且菌株对青霉素敏感。
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目的了解上海市2017年百日咳流行病学特征，为上海市的百日咳防控工作提供参考依据。 方法利用上海市2017年的百日咳监测数据，包括通过中国疾病预防控制信息系统获得的百日咳确诊病例的个案信息以及区疾病预防控制中心上报的确诊病例以及监测病例的个案调查资料。 运用描述性方法进行分析。 结果2017年，全市6家监测点医院共报告258例百日咳监测病例。 发病高峰出现在8 — 9月；＜18月龄占50.00%，≥20岁占41.47%；男女性别比为1∶1.28；上海市户籍与外地户籍比例为1∶1.29；全市75%的区有病例报告；5月龄至14岁的病例中50%以上的儿童已接种至少3剂含百日咳成分的疫苗。 咳后吐、咳时青紫、鸡鸣回声等百日咳典型症状的占比较低，均＜30%。 有咳嗽症状的密切接触者中≥20岁成年人占71.88%。 病例的鼻咽拭子PCR检测阳性率为30.50%；血清PT-IgG抗体检测阳性率为41.07%。 结论2017年，上海市通过建立百日咳监测点医院大幅提高了监测敏感性。 监测病例中百日咳典型症状出现占比较低、有免疫史的占比较高，建议调整百日咳诊断标准中百日咳疑似病例的病例定义，并逐步规范临床医生的诊断意识。
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目的分析2010 — 2017年北京市昌平区结核病患者登记情况及其流行变化趋势与原因。 方法从结核病信息管理系统和北京区域统计年鉴收集结核病患者登记数据及人口、经济等相关数据，通过构建Probit回归模型对数据进行拟合与分析。 结果2010 — 2017年年份与活动性肺结核患者登记率近似存在二项式关系。 剔除≥65岁常住人口比例和常住外来人口比例后，以年份平方项、年份、国内生产总值（GDP）作为自变量拟合Probit回归模型，模型适合该数据（Pearson χ2＝6.510，P＝0.164；对数似然比χ2＝6.613，P＝0.158）。 Probit回归模型拟合结果显示，2010 — 2012年结核病登记率呈现下降趋势；2012 — 2017年结核病登记率呈上升趋势（Wald χ2 ＝1.994×107，P＜0.001）。 排除年份因素对活动性患者登记率的影响后，GDP与活动性结核病患病率的回归系数为−0.001 5，活动性结核病患者登记率随着昌平区GDP的增加而降低（Wald χ2＝56.620, P＜0.001）。 昌平地区活动性结核病登记率与常住外来人口比例差异无统计学意义。 结论2012年后北京市昌平区活动性结核病登记率整体上呈上升趋势；2017年结核病患者登记率较2016年略微下降，提示可能从2017年开始昌平区活动性结核病登记率将逐渐接近平稳状态。
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目的分析江西省南昌市重症肺炎病例的流行病学特征，为重症肺炎病例的临床防治提供依据。 方法收集2013年4月至2018年3月南昌市重症肺炎病例的呼吸道样本和病例资料，进行病原学和流行病学分析。 结果来自17家南昌市医疗机构的261例重症肺炎病例，检出流感病毒核酸阳性81例，阳性检出率为31.03%。 其中包括新甲H1（43例）、季H3（13例）、人感染H7N9禽流感（18例）、人感染H10N8禽流感（3例）和乙型流感（4例）。 重症肺炎病例主要集中在冬春季（12月至次年5月），男女性别比为1.69∶1。 病例年龄最小为1月龄，最大为95岁。 21例人感染H7N9/H10N8禽流感病例，病死率33.33%。 90.48%（19/21）的病例通过不明原因肺炎监测发现，年龄中位数为69岁，大部分病例有基础性疾病和明确禽类接触史。 结论南昌地区重症肺炎病例流感病毒以新甲H1流感病毒流行为主；及时发现新型流感病毒，坚持监测工作常态化，做好传染病防控工作。
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目的了解咽拭子标本以及支气管肺泡灌洗液（BALF）标本在肺炎支原体（MP）临床核酸检测、细菌定量以及实验室分离培养中的效果，初步评估咽拭子作为核酸检测及分离培养标本的意义，并评估MP肺炎患儿的同期咽拭子的MP核酸载量能否准确预测出BALF的MP核酸载量。 方法采集29例MP肺炎住院患儿的同期咽拭子及BALF，利用人源性β-globin内参基因质控所有标本采集及核酸提取质量，合格标本使用MP荧光定量PCR对同一患儿同期咽拭子及BALF标本中MP进行定量分析，计算两种标本的MP核酸载量。 并对所有标本进行MP培养，比较两类标本的MP阳性培养率、细菌污染率。 结果标本的β-globin内参基因检测阳性率为100%，咽拭子和BALF标本荧光PCR检测阳性率均为86.2%（25/29），其中咽拭子MP核酸定量范围是3.2×102 拷贝/ml ~ 1.8×107 拷贝/ml，BALF为6.8×102 拷贝/ml ~ 5.4×108 拷贝/ml。 两种方法检测结果一致率为93.1%（27/29）。 按照BALF标本MP载量递增排序后，阳性标本的咽拭子载量没有显示出类似的伴随升高趋势。 BALF标本培养阳性率为65.5%（19/29），标本污染率为6.9%（2/29）；咽拭子标本的MP培养阳性率为51.7%（15/29），标本污染率为51.7%（15/29）。 结论咽拭子可以作为MP荧光PCR定性检测标本使用，但其不适合用于MP的定量研究，这说明咽拭子的MP核酸载量与BALF中载量不存在明显的相关性；BALF相比咽拭子标本培养率高、污染率低，更适合MP分离培养研究。
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目的了解济南市A族β溶血性链球菌（GAS)的emm分型特点，为猩红热病原学监测提供数据。 方法收集2012 — 2018年济南市GAS菌株，应用PCR方法扩增emm基因，扩增产物经测序、比对，获得菌株emm基因型。 结果共获得GAS菌株143株，检测到5个emm基因型，其中emm12占55.2%（79/143），emm1占42.0%（60/143），其他emm基因型占2.8%（4/143）。 2015年和2016年仅分到11株菌，均为emm12。 患者分离菌株116株，分为4种emm基因型，emm1（46株）和emm12（67株）共占97.4%（113/116），emm22（1株）和emm75（2株）共占2.6%（3/116）。 143株GAS菌株中，菌株数量排在前3位的分别为市中区（85株）、槐荫区（35株）和历城区（9株）。 结论2012 — 2018年济南市GAS菌株优势基因型为emm12和emm1。 2013年和2014年以emm1为主，其余年份以emm12为主。
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目的分析浙江省温州市流动人口围产儿死亡发生情况，为降低围产儿死亡率提供依据。 方法收集2007－2016年温州市围产儿死亡监测资料及非户籍儿童与孕产妇健康状况报表进行汇总统计，分析死亡趋势、特征及死因。 结果流动人口围产儿死亡率明显高于本地人口（χ2＝143.832，P＜0.001）；流动人口保健意识和接受围产期保健的服务率明显低于本地人口（χ2＝538.904，P＜0.001）；流动人口死亡的围产儿中出生缺陷的发生率明显低于本地人口（χ2＝53.291，P＜0.001）；在死胎、死产及新生儿死亡中，流动人口妊娠高血压疾病发生率高于本地人口（χ2＝25.441、15.104、13.415，P＜0.001）；死胎和新生儿死亡中，流动人口胎盘早剥发生率高于本地人口（χ2＝65.146，P＜0.001；χ2＝7.657，P＜0.01）；死产中脐带脱垂的发生率，流动人口高于本地人口（χ2＝21.466，P＜0.001）；新生儿死亡中，流动人口早产及低体质量发生率较本地人口高（χ2＝147.932，P＜0.001)。 结论2007－2016年，温州市流动人口围产儿死亡率呈下降趋势，应通过加强宣教，规范孕期产检，强化高危管理，增强多学科协作等干预措施，降低流动人口围产儿死亡率，提高出生人口素质。
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目的对霍乱弧菌O1血清群产毒株基因组中重复基因数量分布、多样性及两种生物型中重复基因的差异进行分析。 方法选择300株引起第6次和第7次大流行的O1群古典型和埃尔托型生物型菌株，使用BLAST和MCL等软件分析重复基因数量分布及两种生物型差异的重复基因；使用序列两两平均距离作为多样性的度量方法分析重复基因的遗传多样性以及在两种生物型差异之间存在遗传多样性的重复基因。 结果每株菌平均包含242.63个同源基因簇，其中每株埃尔托型和古典型菌株分别平均包含244.85和209.74个。筛选到13个在埃尔托生物型与古典生物型之间拷贝数存在显著差异同源基因簇，功能主要包括阴离子、氨基酸等物质的转运、定位、跨膜转运等。对存在重复基因的同源基因簇的遗传多样性分析，发现在两种生物型之间多样性存在差异的同源基因簇50个，这些基因簇的功能主要包括阴离子、氨基酸、有机底物等转运、定植、底物特异的跨膜转运活性等。 结论霍乱弧菌重复基因的进化有一定的功能倾向性，其特征解析对于理解其基因组适应性进化、菌株多样性及两种生物型基因组差异进化提供了新依据。
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目的了解浙江省丽水市男男性行为人群（MSM）人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)基因亚型和传播特征。 方法收集丽水市2015－2018年新确证且未经抗病毒治疗MSM HIV-1感染样本，扩增pol基因并测序，构建系统进化树分析基因亚型及成簇特征，通过CPR 6.0在线软件分析耐药情况。 结果105例样本成功获得89例合格序列，优势亚型为CRF01_AE (49.4%，44/89)和CRF07_BC (37.1%，33/89)，其他包括B和CRF55_01B各3例，CRF08_BC、CRF59_01B和独特重组型 (01_AE/BC)各2例。发现8个传播簇，总成簇比例为21.3%（19/89），其中7个传播簇与现住址为丽水市莲都区的病例有关（87.5%，7/8）。发现3例样本存在1个监测性耐药突变，分别为M46I，V106A，K103N，传播性耐药率为3.4%(3/89)。 结论丽水市7种MSM HIV-1亚型共存，呈现多元化趋势，莲都区发挥关键传播作用，应加强监测并重点对传播簇病例开展靶向干预。耐药传播率处于低流行水平。
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目的追踪2018年上海市一起输入性麻疹暴发的来源，并分析其病毒分子流行病学特征。 方法直接从临床咽拭子标本中提取病毒核酸，采用一步法反转录聚合酶链反应，扩增麻疹病毒核蛋白基因COOH末端676个核苷酸，然后对扩增产物进行核苷酸序列测定，并分析其同源性，以确定病毒基因型及其可能的来源。 结果本次暴发病例来自于同一家庭，且2例成人病例在发病前21 d内有共同的出境旅游史；导致此次暴发的麻疹病毒为D8基因型。 结论结合流行病学调查和实验室检测结果，推断此次疫情为一起D8基因型麻疹病毒引起的输入性麻疹暴发。
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目的分析1株人源奇异变形杆菌CA151922的两个耐药相关基因岛SGI1和SXT/R391的基因结构和耐药基因。 方法聚合酶链式反应（PCR）检测SGI1和SXT/R391基因岛特异性整合酶基因，采用二代测序方法测定CA151922基因组。分别以SGI1和SXT/R391基因岛的参考序列，从基因组序列中提取基因岛片段并组装。在线预测并注释开放读码框（ORFs）。基因岛的同源序列通过在线工具BLASTn获得，采用cd-hit获得非冗余的同源基因，利用R语言构建同源基因的聚类进化关系树。利用微量肉汤稀释法进行耐药表型检测。 结果奇异变形杆菌CA151922同时含有SGI1(SGI1-B)和SXT/R391(ICEPmiJpn1)两个耐药相关基因岛。SGI1-B和ICEPmiJpn1与已知序列相似性分别为97% ~ 99%和96% ~ 99%。与各自典型序列相比，SGI1-B和ICEPmiJpn1携带的耐药基因种类有所差异，但两者携带不同的编码β-内酰胺酶的基因。CA151922为多耐药菌株，耐药达18种，与基因岛耐药基因有关的耐药表型为氨苄西林和磺胺类药物，提示菌株耐药表型不完全由该耐药岛内的耐药基因决定。 结论首次在奇异变形杆菌中，发现同时携带SGI1和SXT/R391耐药相关基因岛。增加了菌株耐药的复杂性和严重性，提示应加强对多耐药菌株耐药相关基因岛的监测。
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目的了解北京地区水痘-带状疱疹病毒毒株类型及优势流行亚型，为水痘暴发疫情的防治提供依据。 方法收集2017年北京地区水痘暴发疫情病例的疱疹液标本。采用实时荧光PCR方法，进行水痘-带状疱疹病毒及野毒株和疫苗株鉴定，根据水痘-带状疱疹病毒第22个开放阅读框基因片段序列，确定北京地区的水痘-带状疱疹病毒进化关系。 结果2017年共收集到水痘病例标本316份，水痘-带状疱疹病毒核酸阳性271份，阳性率为85.76%，均为野毒株。共获得240份水痘-带状疱疹病毒基因片段，其中234株毒株是clade2型，占97.50%，3株clade1型和3株clade4型，分别占1.25%。其中clade2型分布在北京地区16个区（县），clade1型和clade4型分别分布在西城区和大兴区。 结论2017年北京地区水痘病例主要由clade2型水痘-带状疱疹病毒引起，同时对新出现的clade1型和clade4型要加强监测。
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目的通过流行病学调查与病原菌鉴定，并结合既往相关菌株资料，对2016年6月上海市腹泻病综合监测中报告的1例肠出血性大肠埃希菌（EHEC）O157:H7感染病例进行病原学分析。 方法对患者开展流行病学调查。采集标本后进行菌株分离培养、生化鉴定并确定血清型；利用聚合酶链式反应（PCR）检测所携带的毒力基因；采用微量肉汤稀释法进行药敏试验；应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术进行分子分型；通过全基因组测序获取序列信息进行多位点序列分型（MLST）及单核苷酸多态性（SNP）分析。 结果流行病学调查未发现可疑传染源。患者样本分离出EHEC O157:H7；携带eae、stx2基因；对进行试验的16种抗生素均敏感；菌株图谱带型与以往监测中分离菌株带型均不相同；MLST分型为ST11型，与以往分离菌株核心基因组差异较大。 结论上海市较长时间没有检出EHEC O157:H7菌株的病例记录，通过对此次分离的菌株的全面检测，确定了其毒力基因、耐药性和MLST型别，并发现新的PFGE带型，其核心基因组与以往菌株呈现出一定差异，值得进一步关注。
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目的对2017年北京市丰台区一起由人博卡病毒（HBoV）引起的聚集性发热疫情进行调查分析。了解其流行情况及HBoV毒株的进化情况，为今后HBoV发热疫情的防治提供科学依据。 方法2017年对13例发热患儿展开流行病学调查，采集咽拭子标本，并采用实时荧光PCR法进行呼吸道病毒核酸检测。对HBoV阳性标本进行VP1基因区特异性扩增和测序，通过DNAStar 7.1、Bioedit v7.0.9、MEGA 6.0.6软件等生物信息学软件对扩增序列进行基因离散率和系统进化树分析。 结果发病患儿临床症状以发热、咳嗽等呼吸道症状为主。患儿具有明显聚集性。10份样本中共检出3份HBoV阳性。基因离散率和进化树显示，3份样本均为HBoV-1型，核苷酸序列同源性100%，与北京株311-BJ07等流行株高度同源。 结论此次聚集性发热疫情是由1型HBoV引起的，证实该型HBoV已在我国广泛存在。提示HBoV-1呼吸道感染形势严峻，应加强关注和研究，制定防治措施。
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目的探究基于电子病例直推的区域卫生信息平台的数据交换与管理模式。 方法以区域平台为介质，通过智能提醒插件方式、后台基于标准化接口和页面报告3种数据交换方式，将传染病相关信息从医疗机构推送至国家传染病报告系统。 结果通过平台逐级推送的方式，完成基于电子病历的智能直报。2018年10月试运行结果显示，通过医院信息管理系统（HIS）和国家传染病网络直报系统（NDRS）728例传染病报告卡比对发现，两系统传报卡填写的完整率、及时率均为100%，传报卡的准确性分别为99.31%、97.39%，差异有统计学意义（χ2＝8.304，P＝0.004）；两系统的填卡时间中位数分别为1.23和2.82 min，差异有统计学意义（U＝186 809.500，P＝0.000）。 结论该智能模式完全采用区域平台与国家传染病报告系统进行数据交换，极大地提高了传染病报告效率，减轻了医务人员的工作量，实现了数据共享共通，填补了国内该领域的空白。
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目的描述浙江省舟山地区孕妇妊娠期糖尿病（GDM）的流行情况并分析其影响因素。 方法采用回顾性调查研究，对2014年1月至2018年6月舟山市妇幼保健院GDM筛查情况进行分析，并采用logistic回归模型分析GDM和GDM亚型的影响因素。 结果采用口服葡萄糖耐量试验（OGTT）筛查的10 802名孕妇中，GDM患病率为13.78%；其中，亚型A（单纯空腹型）占21.49%，亚型B（单纯餐后型）占66.15%，亚型C（空腹与餐后型）占12.36%。 多因素logistic回归分析显示，年龄较大、孕早期身体质量指数（BMI）高、孕早期血糖高、孕早期心率快、孕早期白蛋白高、OGTT筛查时间为冬春季和初产妇等因素增加GDM的发生风险，而文化程度与GDM无关。 不同亚型GDM多分类logistic回归分析显示，孕早期BMI高、孕早期血糖高、OGTT筛查时间为冬春季等因素增加GDM亚型A发生的风险；年龄较大、孕早期血糖高、孕早期心率快、孕早期白蛋白高、OGTT筛查时间为冬春季和高文化程度等因素增加GDM亚型B的发生风险，而经产妇则降低GDM亚型B的发生风险。 年龄较大、孕早期BMI高、孕早期血糖高、孕早期心率快、OGTT筛查时间为冬春季等因素增加GDM亚型C的发生风险，而文化程度高和经产妇则降低GDM亚型C的发生风险。 结论舟山地区GDM的发病率较高，年龄较大、孕早期BMI高、孕早期血糖高、孕早期心率快、孕早期白蛋白高、OGTT筛查时间为冬春季等因素与GDM的发病有关。 因此，应加强健康宣教，避免高龄妊娠。 同时，重视围产期保健和GDM筛查，控制孕前BMI，促进母婴健康。
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目的分析北京市严重急性呼吸道感染（SARI）确诊流行性感冒（流感）病例的流行病学和临床特征，探索疾病严重程度与流感感染型别的关系。 方法将北京市2016年8月至2018年7月SARI哨点监测系统纳入的实验室确诊的流感住院患者作为研究对象。按是否使用有创机械通气、重症监护室（ICU）治疗和死亡将患者分为重症组和轻症组，应用logistic回归模型探索重症与流感感染型别/亚型的关系。 结果746例流感住院患者中，甲型和乙型流感感染者分别为598例（80.2%）和148例（19.8%）。其中，6例（0.8%）使用了有创机械通气，17例（2.9%）经ICU治疗，4例（0.5%）死亡。危险因素分析显示，甲型流感患者出现重症的风险为乙型患者的1.3倍（95%CI：0.4 ~ 4.7，P＝0.655）。甲型H1N1流感患者出现重症的风险为乙型Yamagata系流感患者的2.1倍（95%CI：0.5 ~ 8.5，P＝0.295）。 结论流感住院病例以儿童和老年人为主；甲型流感的临床严重程度是否重于乙型流感有待进一步验证。
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目的了解我国学校（托幼机构）传染病突发公共卫生事件的发生规律和特点，为有效防控学校传染病突发公共卫生事件的发生提供参考依据。 方法对2014 — 2016年突发事件报告管理信息系统报告的全国各类学校传染病突发公共卫生事件进行描述性分析。 结果2014 — 2016年全国共报告学校传染病突发公共卫生事件3 491起，报告病例116 682例，死亡16例。 事件数居前5位的传染病分别是水痘、手足口病、流行性感冒、流行性腮腺炎和其他感染性腹泻病，占事件总数的94.41%。 呈春、冬季2个报告高峰。 呼吸道传染病春、冬季发病以水痘为主；肠道传染病春季以手足口病为主，冬季以其他感染性腹泻病为主。 小学、幼儿园、中学报告事件数最多的传染病分别是水痘、手足口病和流行性感冒。 结论呼吸道传染病是目前影响中国学校传染病突发公共卫生事件的首要因素。 在不同季节对不同级别学校开展有针对性的防控工作是降低学校传染病突发公共卫生事件的关键措施。
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目的建立针对A/B型肉毒梭菌毒素基因的实时荧光定量PCR检测方法，构建标准曲线，评价该方法的特异性、敏感性及检测下限，以提高肉毒梭菌检测的快速性、准确性。 方法根据肉毒梭菌A型及B型毒素基因设计特异性引物及探针，优化反应条件，建立实时荧光定量PCR反应体系。 用25种细菌评价该方法的特异性，使用含有A型及B型毒素基因特异性序列的重组质粒标准品构建标准曲线，模拟粪便标本，评价建立方法的灵敏度。 结果建立的Real-time PCR检测方法特异性好，携带A型及B型毒素基因的重组质粒均出现相应特异性扩增曲线，对其他25种细菌进行试验扩增时，均未见出现特异性扩增曲线。 根据重组质粒标准品构建的标准曲线可确定其对肉毒梭菌A型及B型毒素基因检测灵敏度分别为5.04×102拷贝/μl和6.91×102拷贝/μl。 模拟粪便标本中含有目的基因重组质粒的检测下限为A型1.71×103拷贝/μl，B型2.14×103拷贝/μl。 结论本研究成功建立了利用Real-time PCR技术检测毒素基因快速鉴定A/B型肉毒梭菌的方法。
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2018年7月28日，广东省深圳市妇幼保健院报告1名出现流感样症状孕妇的咽拭子样品检出H9N2禽流感病毒核酸阳性，病例立即转送至深圳市第三人民医院隔离治疗，患者样品送广东省疾病预防控制中心（CDC）进行复核，7月29日复核样品H9N2亚型禽流感核酸阳性，深圳市CDC和龙岗区CDC及时采取了一系列防控措施，密切接触者均无异常，病例经过治疗痊愈出院待产。 提示应继续加强禽类市场外环境监测，对高危人群加强排查，及时发现和救治禽流感病例。
2018年7月28日，广东省深圳市妇幼保健院报告1名出现流感样症状孕妇的咽拭子样品检出H9N2禽流感病毒核酸阳性，病例立即转送至深圳市第三人民医院隔离治疗，患者样品送广东省疾病预防控制中心（CDC）进行复核，7月29日复核样品H9N2亚型禽流感核酸阳性，深圳市CDC和龙岗区CDC及时采取了一系列防控措施，密切接触者均无异常，病例经过治疗痊愈出院待产。 提示应继续加强禽类市场外环境监测，对高危人群加强排查，及时发现和救治禽流感病例。
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目的了解北京地区疱疹性咽颊炎流行特征和病原学情况，为疱疹性咽颊炎的防控提供依据。 方法收集2017年在北京地区监测医院就诊治疗的疱疹性咽颊炎患者的基本信息及病原学监测资料，运用描述性流行病学方法进行分析。 结果共纳入符合条件的疱疹性咽颊炎病例6 922例，疾病流行高峰为6 — 9月，＜5岁儿童占86.04%。病原学监测阳性率53.42%（86/161）, 以其他肠道病毒为主（47/86，54.65%），其次为柯萨奇病毒A组16型（Cox A6）（28/86，32.56%），Cox A10（7/86，8.14%），肠道病毒71型（EV71）（3/86，3.49%）和Cox A16（1/86，1.16%）。 7月阳性率最高（76.92%），不同月份阳性率差异有统计学意义（χ2＝29.98，P＜0.05），夏秋季病例报告数较多同时肠道病毒阳性率也较高，两者间呈正相关有统计学意义（rs＝0.294，P＜0.05）。 结论疱疹性咽颊炎流行高峰为夏秋季，易感人群为＜5岁儿童，病原体主要为其他肠道病毒和Cox A6，引起疱疹性咽颊炎的部分肠道病毒（EV71、Cox A16、Cox A6）可同时引起手足口病，应重视疱疹性咽颊炎，参考手足口病进行疾病预防控制。
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目的了解2002 — 2018年浙江省舟山市剖宫产率变化趋势，并分析其影响因素。 方法利用该市电子医疗记录数据库，提取孕妇首次随访数据与分娩信息，采用多因素非条件logistic回归分析探讨剖宫产的影响因素。 结果研究共纳入舟山市2002 — 2018年共43 034名孕妇，该市剖宫产率总体为50.61%，从2013年开始呈现下降趋势，至2016年下降至40%左右。 孕妇年龄较高（OR＝1.115，95%CI：1.106 ~ 1.123）、孕前身体质量指数（BMI）较高（OR＝1.080，95%CI：1.070 ~ 1.090）、孕次为2次及以上（OR＝1.199，95%CI：1.145 ~ 1.256）、高危妊娠（OR＝1.407，95%CI：1.317 ~ 1.504）、胎儿出生体质量较大（OR＝1.730，95%CI：1.641 ~ 1.824）、非头位分娩（OR＝7.620，95%CI：7.037 ~ 8.251）更容易发生剖宫产。 根据年份分层，在2014年前文化程度较高是孕妇剖宫产的影响因素。 结论舟山市总剖宫产率较高，孕妇年龄、孕前BMI、孕次、是否高危妊娠、胎儿出生体质量以及分娩胎位是剖宫产的影响因素。
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目的分析2008 — 2017年甘肃省丙型肝炎（丙肝）的流行特征及规律，为进一步控制丙肝疫情提供科学依据。 方法采用描述流行病学方法分析丙肝病例流行病学特征，采用 SPSS 20.0 软件进行统计分析，率的比较采用 χ2检验。 结果共报告丙肝病例72 899例，发病总体呈上升趋势（χ2＝1 330.472, P＜0.01），2012年丙肝报告发病率达到高峰，为34.93/10万；男女性比为1.08~ 1.83∶1。 20 ~ 49岁年龄组累计报告病例数占42.94%，并逐年下降；≥50岁年龄组病例报告发病率总体呈上升趋势（χ2＝1 342.154，P＜0.05），且女性报告病例数所占比例呈上升趋势；农民35 919例，占49.27%，且病例数逐年上升；全年各月均有发病，发病率在1/10万 ~ 3/10万波动；兰州、武威市丙肝发病率高于其他地区。 结论甘肃省丙肝发病率总体呈上升趋势，无明显季节性波动，地区分布差异有统计学意义，发病率随年龄增加呈上升趋势，需加强对重点人群和地区的疫情监测。
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目的了解广东省中山市手足口病重症病例流行病学和病原学特征，为防控工作提供依据。 方法对2013 — 2017年中山市报告的手足口病重症病例开展个案调查和实验室检测，采用Excel 2007和SPSS 13.0软件进行数据整理和描述性分析，率的比较用χ2检验。 结果2013 — 2017年共报告手足口病重症病例209例，占手足口病病例的0.25%（209/84 021），年均发病率为1.31/10万，每年3 — 7月为检出高峰。 病例主要为1～3岁的散居儿童，占73.68%（154/209）；男性发病高于女性（χ2＝15.171，P＝0.000）；以农村的常住人口为主。 209例重症病例均有出疹，95.22%的病例有发热，皮疹类型以疱疹为主（71.29%）。 病例发病到初诊时间间隔＜3 d的占91.87%（192/209）；初次就诊时能被正确诊断为手足口病的占63.64%（133/209）；不同级别的医院手足口病诊断正确率差异具有统计学意义（χ2＝23.831，P＝0.000）。 203例手足口病重症病例采集了标本送检，阳性率为93.10%（189/203）。 病原体以肠道病毒71型（EV71）为主（118例，占58.13%），4 — 5月为检出高峰。 结论中山市重症手足口病有明显的时间、人群和地区分布特征, EV71是主要病原体。 应针对其特征落实综合性的防控措施，并提高EV71灭活疫苗的接种率，以降低手足口病重症的发生率。
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目的分析甘肃省甘南藏族自治州（甘南州）2012 — 2017年乙型肝炎（乙肝）发病的时空聚集性分布规律，为当地乙肝的预防控制提供理论依据。 方法利用2012 — 2017年甘南州乙肝报告发病率数据，计算其空间分布的全局、局部自相关系数，分析其空间聚集特征。 结果2012 — 2017年甘南州乙肝发病率存在空间相关性（P＜0.05）；局部自相关分析显示，“热点”区域主要分布于夏河县、碌曲县、玛曲县、卓尼县和合作市的部分乡镇；“冷点”区域主要分布于舟曲县、迭部县、卓尼县、临潭县和合作市的部分乡镇。 时空分析结果显示乙肝发病存在时空聚集性，最大可能聚集区覆盖夏河县和碌曲县的部分乡镇，聚集时间为2012 — 2014年（RR＝3.50，LLR＝219.24，P＜0.001）和2016年（RR＝6.91，LLR＝198.61，P＜0.001）；次级可能聚集区覆盖临潭县和卓尼县的部分乡镇，聚集时间为2012 — 2013年（RR＝1.79，LLR＝70.41，P＜0.001）。 结论甘南州乙肝发病率存在空间和时空聚集区域，应根据发病空间分布特点，制定相应的防控措施。
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目的探讨实时荧光定量PCR检测布鲁氏菌核酸DNA浓度的检测范围和检测健康人全血中核酸DNA的Ct本底值。 方法采用试剂盒提取纯菌、健康人和临床患者血液中的核酸DNA，应用实时荧光定量PCR进行检测。 结果经检测，40份健康人群血液标本Ct值平均值为37.0，标准差为1.9，Ct值95%置信区间为33.0 ~ 38.8。 将布鲁氏菌核酸DNA标准品倍比稀释（56.2 ng ~ 0.026 5 fg），实时荧光定量PCR检测灵敏度为6.7 fg。 结论实时荧光定量PCR检测纯菌核酸DNA的灵敏度相当于2个基因组DNA拷贝数，但用于检测血液标本尚待进一步研究。
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目的调查浙江省杭州市拱墅区登革热暴发疫情情况，分析原因，为今后开展登革热防控工作提供参考和依据。 方法通过对社区、医院进行主动搜索，对登革热病例进行流行病学个案调查，掌握病例的临床表现、流行病学资料，并对疫情暴发原因进行分析。 结果本次疫情共报告登革热病例327例，发病高峰为8月21日至9月15日，病例主要集中分布在运河沿线的4个街道，以＞50岁人员为主，占全部病例的61.16%，职业以离退人员（123例，占37.61%）及家务及待业（76例，占23.24%）为主。 病例发病到诊断时间间隔平均为5.20 d，其中住院病例为3 d（2 ~ 5 d），非住院病例为5 d（3 ~ 7 d），两者差异有统计学意义（Ζ＝6.383，P＜0.001）。 结论本次暴发疫情可能是由登革热输入病例或隐性感染者引起的本地传播，建议加强医疗机构登革热诊断水平，提高登革热监测敏感性，长效运行登革热“网格区域责任制”，确保及早发现和控制疫情。
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目的调查2013 — 2017 年青海省丙型肝炎（丙肝） 的流行特征。 方法运用描述流行病学方法对中国疾病监测信息报告管理系统中报告的丙肝病例进行分析，发病率的差异采用χ2检验。 结果累计报告丙肝病例10 989例，年均报告发病率为37.67/10万，男女性别比为1.18︰1；各年龄组均有发病，其中40 ~ 54岁年龄组病例占42.17%；报告病例主要集中在西宁市、海东市和玉树藏族自治州，病例诊断报告单位主要以省级医疗机构为主，占69.53%，全年均有发病，无明显季节性。 结论2013 — 2017年青海省丙肝疫情较平稳，但较全国和其他省份偏高，应加强丙肝的预防和控制。
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目的了解2012 — 2018年云南省大理白族自治州（大理州）人群麻疹抗体水平，为消除麻疹提供科学决策和依据。 方法采用分层整群抽样，每年采集8个年龄组健康人群血清，共28 459份，应用酶联免疫吸附试验测定血清中麻疹IgG抗体。 结果不同年度人群麻疹抗体阳性率差异有统计学意义，2016年最低（89.6%），2013年最高（97.3%），其余年份均＞90%。 不同年龄组间的抗体阳性率差异有统计学意义（P＜0.05），8 ~ 17月龄和25 ~ 34岁年龄组阳性率较低；接种含麻疹成分疫苗不同剂次的人群，抗体阳性率和抗体几何平均浓度（GMC）差异有统计学意义（P＜0.05），接种3剂次的GMC最高，可达到1 921.1 mIU/ml。 结论大理州基本形成预防麻疹的免疫屏障，发生麻疹暴发或流行的可能性较小，但要警惕成年人麻疹发病的潜在风险；加强成年人监测，有针对性地开展查漏补种或强化免疫等工作，提高抗体水平，降低麻疹发病率。
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目的分析2008 — 2017年湖北省荆州市手足口病时空分布特征，为手足口病防控工作提供依据。 方法在街道/乡镇尺度采用ArcGIS 10软件对手足口病发病数据空间聚集性进行全局和局部自相关分析，采用SaTScan 9.4软件对手足口病发病数据时空聚集性进行分析。 结果荆州市累计报告发病53 159例，年平均发病率91.59/10万。 空间自相关分析显示，发病率存在空间正相关，主聚集区域位于荆州市中心城区及周边县（市）与其接壤的乡镇，发病率存在明显时空聚集性特征。 结论在街道/乡镇尺度上掌握荆州市手足口病发病数据的空间分布、时空聚集等分布特征，对于合理配置公共卫生资源、有效预防和控制手足口病有重要公共卫生学意义。
2019,34(4)
摘要:
2019,34(4)
: 285-285
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.001
摘要:
2019,34(4)
: 286-286
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.002
摘要:
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2019,34(4)
: 287-289
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.003
摘要:
2019年3月全球共监测到传染病58种，涉及73个国家和地区，其中传染病数量位于前5位的为麻疹（35个）、登革热（34个）、基孔肯雅热（13个）、霍乱（9个）和寨卡病毒病（6个）。 病死率位于前4位的传染病为肺鼠疫（83.3%）、埃博拉出血热（62.4%）、中东呼吸综合征（34.4%）和拉沙热（23.0%）。 死亡病例数位于前5位的传染病为麻疹、埃博拉出血热、登革热、拉沙热和霍乱。 非洲流行的传染病主要为埃博拉出血热、霍乱、黄热病、拉沙热和麻疹；亚洲流行的传染病主要为中东呼吸综合征、登革热和麻疹；美洲流行的传染病主要为登革热和基孔肯雅热；欧洲流行的传染病主要为麻疹。
2019年3月全球共监测到传染病58种，涉及73个国家和地区，其中传染病数量位于前5位的为麻疹（35个）、登革热（34个）、基孔肯雅热（13个）、霍乱（9个）和寨卡病毒病（6个）。 病死率位于前4位的传染病为肺鼠疫（83.3%）、埃博拉出血热（62.4%）、中东呼吸综合征（34.4%）和拉沙热（23.0%）。 死亡病例数位于前5位的传染病为麻疹、埃博拉出血热、登革热、拉沙热和霍乱。 非洲流行的传染病主要为埃博拉出血热、霍乱、黄热病、拉沙热和麻疹；亚洲流行的传染病主要为中东呼吸综合征、登革热和麻疹；美洲流行的传染病主要为登革热和基孔肯雅热；欧洲流行的传染病主要为麻疹。
2019,34(4)
: 290-294
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.004
摘要:
目的评估2019年4月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。 方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息，采用专家会商法，并通过视频会议形式邀请省（自治区、直辖市）疾病预防控制中心专家参与评估。 结果预计4月突发公共卫生事件的报告数继续上升，可能以水痘、流行性腮腺炎、手足口病、风疹等学校传染病暴发常见。 手足口病在我国大部分省份尤其南部和东部省份报告病例数将持续上升，需关注肠道病毒优势血清型的转变、基因变异及新病原的出现导致病例增加以及重症和死亡增多的可能。 百日咳报告病例数也将保持上升趋势，需继续做好疫苗接种和病例诊治。 当前高考、中考体检期间是发现学校肺结核聚集性疫情高峰时间，需关注学校聚集性疫情及其发生后各项防控措施的协同落实。 危险化学品事故导致群体中毒风险常在，需关注日常中毒救治能力的建设，并确保事件发生后的正确救治。 刚果民主共和国埃博拉病毒病疫情仍将持续发生，但输入我国的风险仍然为低。 结论2019年4月我国大陆地区无特别关注和重点关注突发公共卫生事件风险；需要一般关注手足口病、百日咳、学校肺结核、危险化学品事故后急性中毒的公共卫生风险，以及刚果民主共和国埃博拉病毒病疫情的输入风险。
2019,34(4)
: 295-295
摘要:
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2019,34(4)
: 296-302
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.005
摘要:
目的了解2006 — 2016年我国畜禽动物来源沙门菌的血清型分布及其耐药特征，完善我国动物源性沙门菌耐药数据，为多重耐药沙门菌感染的预防控制决策提供依据。 方法利用传统血清凝集试验，对主要来源于鸡、猪的沙门菌进行血清分型；采用微量肉汤稀释法测定所有实验菌株对16种抗生素的最小抑菌浓度，依据美国临床和实验室标准协会 2017版进行药敏结果判读。 结果2006 — 2016年776株沙门菌分为49种血清型，以肠炎沙门菌（31.57%）、德尔卑沙门菌（17.53%）和鼠伤寒沙门菌（14.82%）为主。 猪和鸡源沙门菌的优势血清型分别为德尔卑沙门菌（39.15%）和肠炎沙门菌（51.62%）。 沙门菌对磺胺异恶唑、链霉素和萘啶酸的耐药率最高，分别为73.32%、70.88%、69.59%；对环丙沙星的耐药率为10.70%；对三代头孢的敏感性较高，达92.00%以上。 菌株多重耐药率达63.40%，鼠伤寒沙门菌多重耐药率最高（90.44%），次之为德尔卑沙门菌（63.24%）和肠炎沙门菌（58.78%）。 结论我国主要畜禽动物源性沙门菌的多重耐药现象较严重。 随着时间的推移，菌株对多数药物的耐药水平呈上升趋势，需密切关注并实时监测耐药性的变迁、播散及其对环境、人群的潜在威胁，同时加强养殖业抗菌药物的合理应用及监管。
2019,34(4)
: 303-306
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.006
摘要:
目的探索液相悬浮芯片技术对黑龙江省食品风险监测的沙门菌分离株的血清分型效果及适用性。 方法采用玻片凝集试验对分离的451株沙门菌进行分型，采用液相悬浮芯片技术——沙门菌血清型快速分型试剂盒（SSA）对其中256株沙门菌O抗原、H抗原、AT抗原基因进行分型鉴定。 结果249株分离株可以用SSA完整分型；液相悬浮芯片技术与传统方法血清分型的符合率超过96%。分离鉴定的44种血清型中有7种涉及到的O抗原或H抗原不在SSA检测范围内，其余37种能用SSA成功分型；利用SSA检测15株血清玻片凝集法不能分型的沙门菌，10株可成功分型。 结论液相芯片技术能对大部分黑龙江省食品源沙门菌进行血清分型，与传统血清分型方法的一致性较高，且比传统方法具有高通量、高速度、准确性高的特点，可考虑常规用于沙门菌血清分型，特别是在应对食源性沙门菌感染暴发及食品风险监测时优先选用该方法进行血清型别的快速判定。
2019,34(4)
: 307-311
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.007
摘要:
目的为快速检测、鉴定鸭沙门菌，避免血清型误判，提高鸭沙门菌暴发应对能力，建立一种实时荧光定量聚合酶链式反应（qPCR）检测方法。 方法随机挑选60株鸭沙门菌及238株肠道常见病原菌代表菌株，针对鸭沙门菌血清型特异基因AW58_15605设计引物并建立qPCR检测体系，通过纯菌菌株、模拟粪便样本及临床样本评价该体系的特异度、灵敏度及检测下限。 结果60株鸭沙门菌株及临床感染的50份样本扩增结果均为阳性，而对鸭沙门菌血清型以外的其他沙门菌及肠道菌的扩增均为阴性。 对鸭沙门菌纯菌DNA的最低检测下限为8拷贝/反应。 粪便模拟样本检测中，增菌后qPCR检测下限达59.10 cfu/g，明显低于分离培养及增菌前。 结论本研究建立的基于特异基因的鸭沙门菌分子检测方法具有可操作性强、特异度高、灵敏度高的特点，建议在应急情况下优先选择qPCR用于沙门菌暴发筛查、鉴别及诊断由其引起的腹泻性疾病。
2019,34(4)
: 312-315
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.008
摘要:
目的分析安徽省合肥市食源性疾病患者所分离沙门菌的血清型别以及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子型别特点。 方法对2013 — 2015年在合肥市2家哨点医院就诊的2 618例食源性疾病患者，进行沙门菌的分离鉴定以及血清学分析，并用Xba Ⅰ酶切进行PFGE分析其分子型别特征。 结果在2 618份患者标本中，共检测出76株沙门菌，总检出率为2.9%，共分为17种血清型，鼠伤寒沙门菌检出率最高，其次为肠炎沙门菌。 69株沙门菌经Xba Ⅰ酶切，共产生53种PFGE带型，每种带型包含1 ~ 5株沙门菌，其中鼠伤寒沙门菌共产生20种带型，肠炎沙门菌共产生10种带型。 结论初步了解合肥市食源性疾病沙门菌感染是一种以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主、多血清型长期共存的散发性感染，获得了本地区食源性疾病沙门菌感染的基线水平的血清型别和PFGE分子分型数据库，为后续暴发监测奠定了基础。
2019,34(4)
: 316-321
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.009
摘要:
目的研究福建省人源和食源性沙门菌血清型和耐药特征。 方法追溯1984 — 2016年福建省内临床、健康体检者和食源性沙门菌株，使用世界卫生组织推荐的沙门菌血清分型方法进行回顾性鉴定。 通过纸片扩散法测试菌株对10种抗生素的敏感性，使用χ2检验对结果进行分类统计。 结果复核人源和食源沙门菌1 406株，覆盖17个血清群（患者源16个、健康者携带源9个、食源性8个），确认伤寒、甲型副伤寒和猪霍乱沙门菌为肠道外感染的侵袭性血清型，确认除伤寒、甲型副伤寒和乙型副伤寒以外的非伤寒/副伤寒沙门菌65个血清型（患者源49个、健康者携带源46个、食源性27个），数量较多的前5位血清型分别为鼠伤寒、肠炎、德比、斯坦利和韦太夫雷登，临床感染优势血清型分别为鼠伤寒、肠炎、斯坦利、猪霍乱和德比，经验证和比对确认人源中5个和食品源中3个血清型为国内首次分离菌型。 健康人携带和食源性沙门菌的血清群、血清型分布和耐药谱接近，多重耐药（MDR）率显著低于患者来源株（χ2＝191.675，P＜0.001），患者源沙门菌对环丙沙星和三代头孢耐药率均低于10%，MDR率较高，占51.00%。 甲型副伤寒和鼠伤寒、肠炎沙门菌分别为伤寒/副伤寒、非伤寒/副伤寒沙门菌中耐药率较高和MDR率高的血清型。 结论福建省人源沙门菌较食源性沙门菌有更广泛的生物多样性，人源沙门菌耐药率高于食源性沙门菌。 建议加强对临床侵袭性感染病例和食品–环境–人群的整合行为生态传染病导致暴发疫情的防控。
2019,34(4)
: 322-326
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.010
摘要:
目的分析北京市朝阳区感染性腹泻样本中致泻性大肠埃希菌（DEC）流行特征及毒力基因携带情况。 方法收集2014 — 2017年北京市朝阳区哨点医院感染性腹泻样本，分离培养后应用real-time PCR方法检测DEC的主要毒力基因。 其中利用eae、stx1、stx2、lt、st、aggR和ipaH 7种毒力基因进行DEC的分型鉴定，此外，检测并分析bfpA、astA、escV、pic、perA、ehxA、pet和ipaBCD等重要的毒力基因分布情况。 结果从1 977份腹泻样本中共分离出94株DEC，检出率为4.75%。 DEC的检出率具有随年龄增加而升高的趋势。 0 ~ 5岁年龄组肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）构成比分别是59.62%、23.08%。 5岁以上年龄组肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）构成比是59.52%。 81.25%EPEC（13/16）未携带bfpA，为非典型EPEC（aEPEC）。 38株EAEC中astA、pic和pet的携带率分别为39.47%、68.42%和92.11%。 30株ETEC的st、lt和astA携带率分别是46.67%、56.67%和53.33%；仅1株（3.33%）ETEC同时含有st和lt。 4株EHEC全部携带 eae、escV和ehxA。 6株肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）中ipaBCD、astA携带率为16.67%和33.33%。 结论北京市朝阳区流行的DEC以EAEC、ETEC和EPEC为主，其中EPEC主要为aEPEC。 婴幼儿主要感染EAEC，成年人主要感染ETEC。 DEC中存在多种毒力基因，其中astA广泛存在于多种DEC中。
2019,34(4)
: 327-331
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.011
摘要:
目的了解北京市1例支气管肺炎患者感染肠道病毒D68型（EV-D68）的临床症状与体征及病原学特征。 方法收集该患者临床资料，进行病例病程及诊疗分析，采集患者的痰液标本，提取样本的核酸，进行18种常见呼吸道病原体核酸检测，对检测阳性病原体进行VP1区和全基因组测序，并对序列进行遗传进化分析。 结果该支气管肺炎患者以高热、咳嗽起病，高热消退后呼吸道症状加重，以喘息和咳嗽为主，抗哮喘药治疗后效果显著。 痰液标本病原学检测为EV-D68阳性，其他17种病原体均为阴性。 基于VP1区构建的系统进化树显示为EV-D68 B3基因亚型，全基因组同源性分析显示同源性最高的是2015年日本株（98.72% nt, 99.95% aa）、2015年香港株（98.61% nt，99.86% aa）和2016年美国株（98.24% nt，99.86% aa），与北京市报道的EV-D68同源性最高的是2014年“2014-R132”株（96.89% nt，99.45% aa）。 结论EV-D68是引起支气管肺炎的重要病原体，应该加强EV-D68的病原学监测，为临床诊疗及疾病控制提供基础数据。
2019,34(4)
: 332-337
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.012
摘要:
目的分析广东省深圳市龙岗区诺如病毒感染性腹泻聚集性疫情流行动力特征和传播途径，为其防控提供参考依据。 方法按流行季节对深圳市龙岗区2014年7月至2017年6月诺如病毒感染性腹泻聚集性疫情进行流行病学特征、病原学特征描述，对动力学特征、流行强度进行数理统计分析。 结果共报告诺如病毒聚集性疫情47起，病例635例，平均罹患率为12.92%。 发病季节以冬春季为主，12月至次年2月高发，以幼托儿童和学生发病为主。 生物样品平均检出率为33.33%，以诺如病毒GⅡ型为优势株。 疫情规模范围6～99人，首例发病–报告时间平均2.14 d，平均持续时间2.68 d，病例增长速度范围2～25人/d；基本再生数范围5.00～17.00，平均9.91。 幼儿园、学校和服务业场所疫情平均基本再生数分别为9.72（n＝39）、12.00（n＝5）和8.34（n＝2），差异无统计学意义（F＝1.209，P＝0.308）。 44起（93.62%，44/47）疫情传播途径为人传人，涉及厨卫工人感染的食源性传播3起，未发现水源性传播疫情。 2016年冬至2017年春流行强度明显高于前2个流行同期。 结论诺如病毒在聚集性疫情中具有很大的基本再生数，极易在幼托机构和学校引起大规模的暴发疫情，需在疫情早期对传染源、传播途径等关键环节采取各项防控措施。
2019,34(4)
: 338-343
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.013
摘要:
目的了解自贡市肺部感染分枝杆菌的菌种菌型特征，为临床分枝杆菌病的诊断和治疗及制定有效防控策略提供科学依据。 方法收集2011－2018年临床疑似结核病患者分离到的抗酸染色阳性培养物，经对硝基苯甲酸（PNB）和噻吩-2-羧酸肼（TCH）鉴别培养和多位点PCR鉴定为结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌（NTM），再经rpoB和hsp65序列分析对NTM进行种的鉴定。 结果2 751株分枝杆菌临床分离株经PNB/TCH鉴别培养基和多位点PCR鉴定，结核分枝杆菌2 647株，占96.22%，非洲分枝杆菌Ⅰ型32株，占1.16%，NTM 72株，占2.62%。 72株NTM鉴定出11个种。 结论自贡市分枝杆菌肺部感染主要为结核分枝杆菌所致，感染致病的NTM种类较多，以脓肿分枝杆菌、胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和鸟分枝杆菌为主。 外来分枝杆菌和奥巴涅分枝杆菌在国内为首次报道。
2019,34(4)
: 344-347
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.014
摘要:
目的了解2007 — 2017年四川省腹泻病例样本宋内志贺菌分离株耐药状况及脉冲场凝胶电泳（PFGE）型别分布。 方法将腹泻病例监测中经过生化和血清学鉴定的30株宋内志贺菌进行PFGE分型分析，采用微量肉汤稀释法测定菌株对14种药物的最低抑菌浓度。 结果宋内志贺菌分离株仅对头孢西丁敏感，多重耐药菌株占总数的96.67%。 对环丙沙星、阿奇霉素的耐药率超过10%，对包括头孢噻肟在内的7种常见药物耐药率达到50%以上。 分离株可分为16个PFGE型，有2个优势簇占总分离数的80%，其他型别占20%。 在优势簇I中的SCSN-1和SCSN-3中各检测到一起疑似暴发事件。 结论2007 — 2017年四川省腹泻病例宋内志贺菌分离株PFGE优势带型明显，且部分带型存在聚集。 菌株耐药情况严重，部分菌株对细菌性腹泻常用抗生素环丙沙星、阿奇霉素和三代头孢中的头孢噻肟耐受。
2019,34(4)
: 348-353
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.015
摘要:
目的探讨移动流行区间法在手足口病监测预警中的可行性。 方法采用移动流行区间法对荆州市2010 — 2017年第4 — 37周手足口病周发病率数据进行交叉验证，筛选适用于建模的历史数据。 筛选指标包括灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比、阴性似然比、马修相关系数和约登指数。 利用已筛选出的历史数据建立2018年第4 — 37周监测预警模型，评价2018年荆州市手足口病流行趋势。 结果交叉验证结果显示2011年和2013年拟合效果较差，予以剔除。 利用2010、2012、2014、2015、2016和2017年数据建模，最优参数\begin{document}$ \delta $\end{document} ![]()
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结论移动流行区间法能特异性识别手足口病流行，可用于制定荆州市手足口病春夏季流行阈值。
2019,34(4)
: 354-358
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.016
摘要:
目的了解2010 — 2016年天津市居民脑梗死发病特征及变化趋势，分析其在不同特征人群中的特点，为制定防控对策提供参考依据。 方法采用2010 — 2016年天津市脑梗死疾病新发病例监测数据，分析脑梗死发病率及其在不同年龄、性别、城乡之间的分布差异。 以2010年全国第六次人口普查为标准人口计算标化发病率。 率的比较采用χ2检验，发病率的时间趋势和年龄趋势分析采用趋势性χ2检验。 Joinpoint软件对7年发病率的变化进行分析，并预测2017 — 2020年发病情况。 结果脑梗死患者初始发病平均年龄为65.50岁，吸烟率为32.18%，发病2次以上的比例为34.01%。 2010 — 2016年间天津市居民脑梗死粗发病率为379.70/10万 ~ 583.64/10万；标化发病率为212.40/10万 ~ 291.52/10万，均呈逐年上升趋势（P＜0.001）。 农村上升趋势更加显著。 天津市居民男性脑梗死粗发病率在450.17/10万 ~ 698.82/10万，标化发病率在249.20/10万 ~ 350.34/10万；女性粗发病率为308.44/10万 ~ 467.87/10万，标化发病率为174.48/10万 ~ 232.85/10万，粗发病率和标化发病率男性均高于女性，且均呈上升趋势（P＜0.001），不同年龄组男性均高于女性（P＜0.001）。 根据预测，到2020年，天津市脑梗死发病率将达到808.58/10万，标化发病率为371.03/10万。 结论天津市脑梗死发病7年来一直呈上升趋势，未发现降低的拐点，农村地区和男性人群上升趋势更加明显，应加强关注该疾病并采取有针对性的措施进行人群干预，以减少发病。
2019,34(4)
: 359-364
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.017
摘要:
目的对分离的1株mcr-1阳性多重耐药宋内志贺菌进行鉴定和耐药性分析。 方法采用生化和血清凝集试验进行病原体鉴定；使用微量肉汤稀释法进行药敏试验，并用聚合酶链式反应方法检测耐药基因的存在情况；利用脉冲场凝胶电泳方法对菌株进行遗传多态性和质粒图谱分析并进行Southern杂交试验；用质粒接合转移试验验证mcr-1基因的水平转移能力。 结果在广西壮族自治区分离出1株mcr-1阳性的多重耐药宋内志贺菌，对萘啶酸、阿奇霉素、多粘菌素有较高耐药性。 mcr-1基因、mph(A)和blaCTX-M-14基因分别在两个不同的质粒上，且mcr-1基因能通过质粒介导水平转移。 结论加强志贺菌尤其是宋内志贺菌对头孢曲松和阿奇霉素共同耐药的监测及mcr-1传播的分子流行病学研究，为合理使用抗生素治疗细菌性痢疾提供依据。
2019,34(4)
: 365-370
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.018
摘要:
目的研究极低频电磁场对高强度暴露职业人群的神经行为损害，为预防职业病发生及进行相应的职业健康风险评估提供依据。 方法2016年对新疆维吾尔自治区2家火力发电厂进行职业卫生学调查，对7种工作区域或岗位进行电磁场强度检测，对88名暴露工人和57名非暴露工人进行职业健康检查、问卷调查和神经行为测试。 结果工作场所电场强度为0.001 ~ 10.363 kV/m，磁场强度为0.042 ~ 143.000 μT。 暴露组5项测试指标得分显著低于对照组，包括紧张–焦虑（50.9±10.8与54.3±7.6，P＜0.05）、有力–好动（47.9±9.8与51.8±9.9，P＜0.05）、困惑–迷茫（49.9±11.0与53.4±7.7，P＜0.05）、数字译码（48.3±10.0与52.7±9.6，P＜0.05）、数字跨度（47.5±9.7与53.8±9.4，P＜0.05）得分。 利用多元线性回归模型校正性别、吸烟、饮酒、年龄混杂因素影响后暴露组在紧张–焦虑、困惑–迷茫、数字译码、数字跨度项的得分依旧明显低于对照组。 将性别、吸烟、饮酒进行分层分析发现男性对于极低频电磁场更为敏感、吸烟和极低频电磁场对于引起短时记忆力减退具有协同作用、≤30岁人群对极低频电磁场较敏感。 结论在火力发电厂电场强度最高10.363 kV/m，磁场强度最高143.000 μT的条件下，职业暴露于极低频电磁场环境下会引起神经系统发生改变，尤其表现为短时记忆能力下降，同时吸烟可能会对极低频电磁场致短时记忆力损伤产生协同作用。
2019,34(4)
: 371-376
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.019
摘要:
目的分析3起由副溶血弧菌（VP）导致的食源性疾病暴发事件，利用国家致病菌识别网（China PIN）对其进行关联性分析。 方法收集2018年8月北京市顺义区3起食源性疾病暴发事件的流行病学资料，采集可疑食品、环境和病例样本48份，进行菌株分离和鉴定，对分离的VP菌株进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型，获得的指纹图谱通过致病菌识别网进行比对分析。 结果3起暴发事件中，共从12份病例样本和3份可疑食品样本中分离出15株O3：K6血清型VP，其种特异性基因和毒力基因检测结果为：toxR+/tdh+/trh-，根据PFGE指纹图谱可以将15株VP分成2个簇，每个簇中的指纹图谱相似度为100%。 2个指纹图谱簇之间的相似度为93.94%；且与2014 — 2017年本地区China PIN分子分型数据库中分离自腹泻病例的VP菌株带型不成簇。 结论VP引起的3起食源性疾病暴发事件由共同的传染源导致，China PIN在食源性疾病暴发识别、溯源和关联性分析中有良好的应用前景。
2019,34(4)
: 377-378
DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.04.020
摘要:
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1986年创刊 月刊
CN 11-2928/R
ISSN 1003-9961
主管：国家卫生健康委员会
主办：中国疾病预防控制中心
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