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文章信息
- 曹栋卿, 何婷婷, 赵丹燕, 胡雪娜, 杨作凯, 傅利军
- CAO Dong-qing, HE Ting-ting, ZHAO Dan-yan, HU Xue-na, YANG Zuo-kai, FU Li-jun
- 浙江省绍兴市46例男男性行为者HIV感染基因特征分析及流行病相关因素分析
- Genotyping of HIV-1 detected in HIV infected men who have sex with men in Shaoxing, Zhejiang
- 疾病监测, 2015, 30(10): 841-845
- Disease Surveillance, 2015, 30(10): 841-845
- 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.10.012
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文章历史
- 收稿日期: 2015-04-13
艾滋病最早于1981年发现于美国的男男性行为者(men who have sex with men,MSM),男男同性行为传播人类免疫缺病毒(HIV)已成为中国目前重要的传播途径,中国MSM的人群估计数为50万~100万[1],2013年19月新发现的HIV感染者和患者中经性传播占89.9%,其中经同性传播占20.8%[2]。该人群的HIV高感染率持续不下,其高危行为已逐渐成为潜在的公共危害问题,对该人群的调查和干预已成为艾滋病防控的一项重要工作。笔者对绍兴市20132014年新确证的50例MSM HIV感染者的流行病学和基因特征进行分析研究,了解绍兴市MSM人群的行为学特征和HIV-1毒株亚型分布情况,建立本地区HIV分子生物学数据库,为防控工作提供依据与参考。
1 材料与方法 1.1 标本来源2013年1月至2014年7月新确证的50例MSM HIV/AIDS感染者血浆样本,均未进行抗病毒治疗。流行病学基本信息来自中国疾病预防控制信息系统。
1.2 主要试剂和仪器病毒RNA提取试剂盒采用Roche公司的 High Pure Viral RNA Kit,病毒反转录采用TaKaRa公司的TaKaRa One Step RNA PCR Kit(AMV)试剂盒,扩增使用TaKaRa公司的LA Taq酶。PCR扩增仪由美国ABI公司生产,凝胶成像仪为Alphalmagep EP。
1.3 核酸提取及目的片段的扩增提取200 μl血浆样品中HIV RNA,以提取的RNA为模板,采用反转录-聚合酶链反应 (reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和巢式-聚合酶链反应 (nest transcription-polymerase chain reaction,nest-PCR)方法扩增HIV-1的gag基因区全长1594 bp,pol基因区全长3097 bp,引物序列见表1,扩增条件见参考文献[3]。PCR扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳,经DNA Marker对照确认是否含目的片度,目标产物直接送至上海华大基因公司进行纯化并测序。
引物 | 引物序列(5′~3′) | 位置(HVB2) |
注:(1)为第二轮扩增引物。 | ||
GAG-1 | TGT GGA AAA TCT CTA GCA GTG G | 617~638 |
GAG-2 | TAA TGC TTT TAT TTT YTC YTC TGT CAA TGG C | 2681~2712 |
GAG-3 (1) | TGA CTA GCG GAG GCT AGA AGG | 763~783 |
GAG-4(1) | TTC CYC CTA TCA TTT TTG GTT TCC | 2377~2401 |
POL-1 | TGG AAA TGT GGA AAG GAA GGA C | 2029~2050 |
POL-2 | CCT GTA TGC AGA CCC CAA TAT GTT | 5241~5265 |
POL-3 (1) | ACT GAG AGA CAG GCT AAT TTT TTA GGG A | 2068~2095 |
POL-4 (1) | CTC CTA GTG GGA TRT GTA CTT CYG ARC TTA | 5221~5192 |
测序返回的序列使用Contig Express软件对序列进行编辑、拼接和校正,从HIV dabase(http://www.hiv.lanl.gov/components/sequence/HIV/search/search.html)下载各种亚型的标准序列作为参考株,应用Bio-edit软件对样本序列和标准序列进行比对和校正,用Mega 5.2软件构建Neighbor-Joining系统进化树分析,确定各区亚型,同时进行在线HIV-Blast亚型判断。重组样品用Simplot 3.51软件做断点分析。
2 结果 2.1 流行病学资料流行病学调查显示感染者均通过男男性行为感染,46例扩增成功的感染者平均年龄32.22岁,以20~39岁为主;学历在中学及以上的HIV /AIDS占95.65%(44/46);职业以农民/工人为主,占50%(23/46);本地户籍感染者占69.57%(32/46)。86.96%(40/46)的感染者有2个以上的性伴,平均性伴个数为4.78个,21例已婚或离异/丧偶,25例未婚,28例感染者表示曾与异性发生无保护的性行为,见表2。
特征 | 例数 | 构成比(%) |
年龄组(岁) | ||
< 20 | 2 | 4.35 |
20~ | 30 | 65.22 |
40~ | 14 | 30.43 |
≷ 60 | 0 | 0.00 |
文化程度 | ||
大学 | 16 | 34.78 |
中学 | 28 | 60.87 |
小学 | 2 | 4.35 |
户籍 | ||
本市 | 27 | 58.70 |
本省外市 | 5 | 10.87 |
外省 | 14 | 30.43 |
职业 | ||
商业服务 | 17 | 36.96 |
农民/工人 | 23 | 50.00 |
教师/学生 | 5 | 10.87 |
家务或无业 | 1 | 2.17 |
成功扩增46份样品,其中gag基因35份,扩增率70%,pol基因35份,扩增率70%。
2.3 亚型分析46份样品用Neighbor-Joining连接法对gag/pol基因序列分别构建进化树(图1、2),共发现CRF01_AE、CRF07_BC和B三种亚型,其中CRF01_AE亚型24人,占52.17%,CRF07_BC亚型18人,占39.13%(18/46),B亚型3人占6.52%(3/46),1份样品结果分型不一致,为重组样品,占2.17%。24份有2区结果的样品中23份2区结果的分型一致,其中CRF01_AE亚型13份,CRF07_BC亚型9份,B亚型1份;22份样品仅成功扩增1个基因区,其中gag基区11份,包含CRF01_AE亚型4份,CRF07_BC亚型5份,B亚型2份,pol基因区11份,包括CRF01_AE亚型7份,CRF07_BC亚型4份。各亚型通过拉莫斯国家实验室核酸序列库软件在线比对,显示CRF07_BC与云南及广西报告的病毒序列相近,B亚型与河南输血传播的病毒序列相近,CRF01_AE亚型与北京、辽宁在MSM人群中分离到的CRF01_AE相近。
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图 1 HIV-1 gag 区系统进化树 Figure 1 Phylogenic tree of HIV-1 gag gene |
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图 2 HIV-1 pol 区系统进化树 Figure 2 Phylogenic tree of HIV-1 pol gene |
本研究中1份样品为重组毒株,感染者为39岁已婚有配偶男性,职业经商,无吸毒史。在进化树上gag基因靠近CRF01_AE亚型,pol基因靠近CRF07_BC亚型,Simplot断点分析显示pol区基因为CRF01_AE和CRF07_BC亚型的重组,其两端为CRF01_AE亚型,中间插入了3段CRF07_BC亚型基因,其中660~1560 bp和1780~2260 bp插入了2段较大的CRF07_BC基因,编码了该毒株的反转录酶,该毒株的蛋白酶和整合酶由CRF01_AE亚型编码。Bootscan图谱分析见图3。
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图 3 20130212 HIV pol序列Bootscan分析 Figure 3 Bootscanning analyses of 20130212 HIV-1 pol gene sequence |
绍兴市MSM人群20122014年哨点监测HIV阳性率平均为3.42%,低于浙江省的平均水平[4],也低于其他地区的感染率[5,6] 。在本次调查中,绍兴市及浙江省户籍MSM占69.57%,表明HIV已经在本地区户籍的男同人群中广泛传播。2013年绍兴市MSM哨点监测的结果显示该人群的艾滋病知晓率为94.93%,而每次使用安全套的比例仅49.29%;感染者平均有4.78个性伴,60.87%(28/46)与异性有无保护性行为,表明该人群“知-行”分离、多性伴及双性行为的行为特点,是继外来务工人员后HIV传播的重要桥梁人群。相比欧美国家,我国MSM结婚比例较高,随年龄增长,MSM已婚比例迅速上升[7,8,9],本次调查的46名同性恋感染者中有21人已婚或者离异/丧偶,平均年龄40.24岁,明显高于25例未婚MSM的平均年龄(25.28岁),同性恋者在中国受到社会歧视与道德歧视较欧美国家更为严重,受到传统的“传宗接代”的思想的影响,因此随着年龄增长,以结婚的方式来掩饰其同性取向,部分婚后也与异性发生无保护性行为,导致异性性伴感染的风险[9,10]。
本次研究在MSM HIV感染人群中共发现CRF01_AE、CRF07_BC和B 3种主要亚型,与其他地区流行的主流亚型相同。在线序列比对显示CRF07_BC的序列接近于广西壮族自治区(广西)和云南省HIV序列,由于绍兴艾滋病散发期的HIV感染者主要来自广西(33.93%)、新疆(14.29%)和云南(8.93%)这3个省(自治区),因此结合流行历史CRF07_BC亚型可能直接由广西、云南省(自治区)的外来吸毒务工感染者引入并通过性接触引起在本地区广泛传播。B亚型在绍兴所占比例较少(6.42%),序列接近于河南毒株,估计因地域距离原因,绍兴不是河南及其周边地区劳动力流动的主要方向,因此来自河南有偿献血的B亚型在本地区的MSM中没有大量流行。CRF01_AE与辽宁省MSM人群中报道的序列相似性较高,辽宁省MSM人群中有2个独立来源的CRF01_AE亚型,其祖先为不同的泰国株,1种经由东南沿海传入北方地区,另1株经云南省传入[11]。绍兴市所在浙江省位于东南沿海,交通便利,我们推测MSM人群的CRF01_AE亚型由旅行者从泰国携带传入并在东南沿海传播的可能性比较大[12],但更直接的证据有待于进一步研究。CRF01_AE亚型在进化树上呈多系分支状,表明其感染源的多样化,可能来源于泰国不同时期、不同地区的不同菌株,由于这些菌株间很难重组,所以随着时间的推移,仍呈现多系分支状[13]。
虽然MSM人群中HIV流行毒株的多样性要低一些,但该人群的亚型正趋向复杂,本次研究中出现的 1例CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型,反映了HIV的高度变异性,这2种流行最广泛亚型的重组可能导致新亚型的出现和流行。由于引物特异性和样本浓度等问题导致22份样品仅扩增出1个基因区是本次研究的不足之处,可能导致样品部分重组情况被忽略。作为艾滋病传播的高危人群,对该人群进行及时有效的宣传、干预和亚型监测,是绍兴市今后艾滋病防治工作的重点。
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