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文章信息
- 陈小英, 张义, 刘峰, 王林江, 李广智, 陈飒
- CHEN Xiao-ying, ZHANG Yi, LIU Feng, WANG Lin-jiang, LI Guang-zhi, CHEN Sa
- ARIMA模型在宝鸡市手足口病预警预测中的应用
- Application of ARIMA model in prediction of hand foot and mouth disease in Baoji City
- 疾病监测, 2016, 31(6): 492-497
- Disease Surveillance, 2016, 31(6): 492-497
- 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.06.012
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文章历史
- 收稿日期:2015-09-16
2. 陕西省疾病预防控制中心现场流行病学培训项目, 陕西 西安 710054
2. Field Epidemiology Training Project, Shaanxi Provincial Center for Disease Control and Prevention, Xi'an 710054, Shaanxi, China
手足口病(HFMD)是一种以柯萨奇病毒A 组16 型和肠道病毒71 型为主感染所引起的病毒性急性传染病,以发热、口腔炎和手足、臀部皮疹为主要症状,多发生于5 岁以下的婴幼儿,夏秋季易流行。该病可引起脑炎、脑脊髓炎、脑膜炎、循环衰竭等严重并发症,导致儿童死亡。此病传染性强,传播途径复杂,在短时间内即可造成暴发及流行[1]。2008 年3月我国安徽省阜阳市暴发大规模手足口病疫情并出现死亡病例[2],之后全国多个城市相继出现手足口病暴发[3-4]。2008 年5 月2 日,我国将手足口病纳入丙类法定报告传染病管理。近年来全国各地的手足口病疫情形势严峻,报告病例数呈不断上升的趋势[5],已经成为我国突出的公共卫生问题之一[6]。宝鸡市自手足口病纳入丙类传染病报告以来,手足口病报告数呈现逐年上升趋势,自2010年起发病率始终位居丙类传染病发病数前2位,防控形势严峻。
传染病预测是根据传染病发生、发展规律及有关因素,用分析判断和数学模型等方法对传染病的发生、发展和流行趋势作出预测,是制定预防和控制传染病的长期或近期应对策略的前提[7]。本研究以宝鸡市手足口病的月发病数为基础,应用时间序列分析法对其发病情况建模,并预测其发病趋势,为早期发现手足口病的流行并制定相关防治策略提供依据。
1 资料与方法 1.1 资料来源2008年5月1 日至2015年6 月30 日手足口病监测数据: 来源于“中国疾病预防控制信息系统”中的“疾病监测信息报告管理系统”(“传染病疫情信息网络直报系统”),以发病日期为标准日期,以月为基本时间统计单位计算各年手足口病发病数。
1.2 方法 1.2.1 基本思想ARIMA模型即自回归滑动平均模型,是由Box 和Jenkings 于20世纪70 年代初提出的著名时间序列预测方法,故又称Box-Jenkings 模型[8-9]。该方法可以用时间序列的过去和现在预测值预测未来值[10-11]。标准的ARIMA 模型为ARIMA(p,d,q)(P,D,Q)s,其中p、q 分别表示自相关函数(ACF)和偏自相关函数(PACF)的阶,d 表示差分的次数,P、Q、D 分别表示季节性自相关函数和偏自相关函数的阶和差分的次数,s 表示季节性的周期即循环长度[12-14]。
1.2.2 建模过程①数据预处理:首先判断原序列是否平稳,若为非平稳序列,则变换为平稳序列,根据变换后序列的自相关和偏自相关图,确定非季节差分阶数d 和季节差分阶数D。②模型参数估计:根据变换后平稳时间序列的自相关和偏自相关图,估计模型的p、P、q、Q 值,采用最大似然估计或最小二乘法估计等对初步估计模型进行检验。③模型诊断检验:模型参数估计后,对模型残差是否为白噪声进行检验,若残差序列不是白噪声序列,意味着残差序列还存在有未被提取的信息,需要进一步改进模型。④模型的筛选:为了得到最佳模型,可借助拟合优度统计量来比较各个模型的优劣,最常用的是调整后的决定系数、AIC 和SC 统计量。⑤模型的预测:运用模型预测2015年16月手足口病发病情况。
1.3 统计学分析数据存储和数据管理采用Excel 2010、SPSS 22.0软件; 并对资料进行统计学分析。
2 结果 2.1 手足口病流行趋势分析绘制宝鸡市2008年5月1日至2014年12月31日的手足口病发病数曲线图(图 1)。发现手足口病全年各月均有发病,从2010 年开始,发病数基本呈现上升趋势。每年发病数从4月开始上升,56 月出现高峰,具有明显的季节性和长期趋势,呈现非平稳性特征。
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图 1 2008-2014年宝鸡市手足口病月发病数曲线 Figure 1 Incidence curve of HFMD in Baoji 2008-2014 |
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对原始数据采取自然对数转换、一阶差分和一次季节差分,消除序列的长期趋势和季节效应,差分后的时间序列图较平稳(图 2),从ACF和PACF(图 3~4)可以看出,除了延迟2、12阶的自相关系数在2倍标准差范围之外,其他阶数的自相关系数都在2倍标准差范围内波动,可以判断该序列具有短期相关性,进一步判定序列平稳,初步确定ARIMA(p,d,q) × (P,D,Q)12中的d和D分别为1和1。对于参数p,q 的识别,通过观察差分后序列的ACF 图和PACF 图,初步确定p=1,q=1。参数P,Q 的判断较为困难,但根据文献,参数P,Q超过2 阶的情况很少见,采取从低阶到高阶逐个进行尝试的办法[15],根据模型的拟合优度、残差情况以及系数间的相关性进行综合判断。
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图 2 2009-2015年宝鸡市手足口病月发病数经自然对数转换和1 阶12 步差分后序列图 Figure 2 Sequence chart of incidence of HFMD in Baoji after logarithmic transformation and 1 stage and 12 step difference,2009-2015 |
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图 3 2008-2014年宝鸡市手足口病月发病数经平稳化后的ACF 函数图 Figure 3 AFP function graph of incidence of HFMD in Baoji after smooth processing,2008-2014 |
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图 4 20082014年宝鸡市手足口病月发病数经平稳化后的PACF 函数图 Figure 4 PAFP function graph of incidence of HFMD in Baoji after smooth processing,2008-2014 |
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参数估计、模型拟合优度统计量指标选取标准化BIC值最小和R2 最大进行评价,最终选择模型ARIMA(1,1,1) (0,1,1)12模型为最佳模型,标准化的BIC=10.507,R2=0.820,常数项为870.402(t=-0.792,P=0.431),自回归参数ARl=0.357(t=2.619,P=0.011),MAl=-0.764 (t=7.581,P <0.001),季节移动平均参数SMAl=0.769(t=3.741,P<0.001)。采用Ljung-Box 方法检验残差白噪声,结果显示,Ljung-Box统计量为Q=4.631,P=0.995,提示残差序列为白噪声。图 5 显示,残差序列ACF 值和PACF 值均落入随机区间内,提示模型信息提取比较充分,时间序列各项之间没有相关性。
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图 5 模型ARIMA(1,1,1) × (0,1,1)12残差序列ACF、PACF 函数图 Figure 5 AFP and PAFP function graphs of 12 residual series of ARIMA(1,1,1) (0,1,1)12 model |
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最优模型为ARIMA(1,1,1)(0,1,1)12:lnYt=0.357lnYt-1-0.764lnYt-1+0.769lnYt-12+0.82。运用模型ARIMA(1,1,1)(0,l,1)12拟合2015年16月某病逐月发病数,并预测2015 年16月的手足口病发病数,图 6显示了该模型对2015年16月的月发病数预测值及其95%可信区间,其动态趋势与实际发病基本一致。2015年16月手足口病发病数与预测值相差较小,实际值与预测值绝对误差的绝对值最大为84,最小为48,相对误差率仅为2.34%。可见模型对实际值进行了较好的拟合,见表 1。
月份 | 实际值(例) | 预测值(例) | 发病数预测值(95%CI) | 相对误差(%) |
1 | 23 | 73 | 1~214 | 2.17 |
2 | 6 | 69 | 12~280 | 10.50 |
3 | 53 | 108 | 2~378 | 1.04 |
4 | 340 | 388 | 72~868 | 0.14 |
5 | 897 | 981 | 416~1711 | 0.09 |
6 | 968 | 1043 | 457~1793 | 0.08 |
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图 6 2015年16月宝鸡市手足口病发病率预测结果(/10 万) Figure 6 Prediction of HFMD incidence in Baoji,January-June,2015(/lakh) |
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ARIMA 模型是目前应用较多的时间序列预测方法之一,其综合考虑疾病的季节性、周期性、随机性等可能影响序列平稳性的因素,提高了模型的拟合和预测效果,同时借助模型的参数进行了量化表达,在传染病预测中具有广泛的适用性[16]。ARIMA 预测模型既有传统回归分析的优点又发挥了移动平均的长处,具有适用范围广,实用性强、预测误差小的特点,是一种预测精确度较高的短期预测方法[17]。近年来,该方法已广泛应用于传染病的预测研究[18-19]。
手足口病具有传染性强,传播途径多,病原学复杂,患者可多次重复感染等特点,容易在短时间造成大面积流行[20]。本研究利用2008年5月至2014年12月宝鸡市手足口病发病资料,通过识别、估计、诊断等过程拟合建立ARIMA 模型预测其发病趋势,探讨此种预测方法的可行性。分析结果显示模型ARIMA(1,1,1) (0,1,1)12的各月手足口病发病数预测值与实际值基本一致,实际值均落入95%可信区间内,并对宝鸡市2015年16月的手足口病发病数进行预测,显现出较好的适用效果,提示ARIMA 模型对宝鸡市手足口病月发病数进行预测具有可行性。但因手足口病的发病率受到诸多未知随机因素的影响[21],在实际应用中,应尽可能的收集时间序列足够长的序列数据,对已建立的模型采用新的观测值进行验证,并不断加入新的观测值,以修正或重新拟合更能反映实际情况的手足口病预测模型,以期得到最满意的预测效果[22]。
预测手足口病流行趋势是采取预防措施和评估干预效果的重要内容[23]。在疫情监测工作中,根据预测数据的可信区间,可以判断实际发病率是否在正常范围波动,传染病的发病是否为散发、是否按照既往的规律发生变化。如果实际发病率在预测值95%可信区间内波动,则表明疫情基本正常;如果超出,则表明疫情已不同于以往流行规律,应警惕传染病暴发或流行的可能性[24]。本研究显示ARIMA 模型能较好地用于手足口病发病的短期预测,根据预测数据有针对性地开展防治工作,有助于提高疾病预防控制工作的能力[25]。根据预测结果,2015年56月宝鸡市手足口病的发病率将呈现高峰。
不同的传染病有着不同的发病模式,不同的预测模型也有着不同的数学理论基础和适用条件。尽管ARIMA 模型的建立已有一套明确的规则,适用于各种复杂的模式[26],但在实际运用中仍存在弊端。没有一种数学模型可以实现对一段时间历史数据的完全拟合和预测,所以要在实际工作中不断发现问题、总结经验,以提高监测数据的质量;同时加强对数学模型的研究,分析采用何种方法和模型进行预测效果更好[27-28]。这样才能为传染病防控工作提供更为可靠的数据和建议。
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