疾病监测  2017, Vol. 32 Issue (5): 365-371

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曹阳, 遇晓杰, 韩营营, 李杰, 阚飙, 闫梅英
CAO Yang, YU Xiao-jie, HAN Ying-ying, LI Jie, KAN Biao, YAN Mei-ying
我国非伤寒沙门菌对多粘菌素的耐药现况及mcr-1基因携带概况
Polymyxin resistance and mcr-1 prevalence in non-typhoid Salmonella isolates in China
疾病监测, 2017, 32(5): 365-371
Disease Surveillance, 2017, 32(5): 365-371
10.3784/j.issn.1003-9961.2017.05.005

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收稿日期:2017-03-07
我国非伤寒沙门菌对多粘菌素的耐药现况及mcr-1基因携带概况
曹阳1, 遇晓杰2, 韩营营1, 李杰1, 阚飙1, 闫梅英1     
1. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所, 北京 102206;
2. 黑龙江省疾病预防控制中心, 黑龙江 哈尔滨 150000
摘要目的 初步探究我国非伤寒沙门菌对多粘菌素的耐药情况。方法 利用微量肉汤稀释法,测定不同来源404株非伤寒沙门菌对多粘菌素B及多粘菌素E的最小抑菌浓度(MIC),计算耐药率,推测野生沙门菌株的耐药阈值。同时利用聚合酶链式反应(PCR)方法检测菌株携带mcr-1基因的情况。结果 404株沙门菌对多粘菌素B及E的MIC范围为≤0.125 μg/ml至>16 μg/ml,对多粘菌素B的MIC50、MIC90分别为1 μg/ml和8 μg/ml;对多粘菌素E的MIC50、MIC90分别为2 μg/ml和8 μg/ml。优势血清型鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌及德尔卑沙门菌对多粘菌素B及E的MIC值分布不同。以8 μg/ml为耐药阈值判定折点,实验菌株对多粘菌素B及E的耐药率分别为10.89%和15.84%;其中食源性沙门菌、人源性沙门菌及动物源性沙门菌对多粘菌素B的耐药率分别为12.50%、17.16%和0.00%(P < 0.01);对多粘菌素E的耐药率分别为8.30%、27.94%和0.78%(P < 0.01)。发现7株同时耐多粘菌素及三代头孢的菌株。发现1株人源鼠伤寒沙门菌携带可转移的mcr-1基因,且该菌株产ESBLs。结论 发现我国人源产ESBLs的沙门菌携带mcr-1基因。根据体外药敏结果,非伤寒沙门菌对多粘菌素B及E的耐药折点设为8 μg/ml较宜。沙门菌对多粘菌素的耐药率尚处于低水平,应加强不同来源沙门菌对多粘菌素的耐药监测。
关键词多粘菌素    沙门菌    药物敏感性    mcr-1    
Polymyxin resistance and mcr-1 prevalence in non-typhoid Salmonella isolates in China
CAO Yang1, YU Xiao-jie2, HAN Ying-ying1, LI Jie1, KAN Biao1, YAN Mei-ying1     
1. National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China;
2. Heilongjiang Provincial Center for Disease Control and Prevention, Harbin 150000, Heilongjiang, China
This study was supported by the fund for National Key Basic Research Program of China (No. 2013CB127204)
Corresponding author: YAN Mei-ying, Email:yanmeiying@icdc.cn.
Abstract: Objective To investigate the prevalence of polymyxin (polymyxin B and polymyxin E) resistance in non-typhoid Salmonella strains in China. Methods Phenotypic antimicrobial susceptibility test was conducted by means of broth dilution to detect the prevalence of polymyxin resistance in 404 strains of non-typhoid Salmonella from different sources in China. The resistant breakpoints for polymyxin B and polymyxin E were set based on minimal inhibitory concentration (MIC) distribution data. The carriage of mcr-1 gene in polymyxin resistant Salmonella strains was detected with PCR. Results The polymyxin MICs ranged from ≤0.125 μg/ml to > 16 μg/ml. The MIC50 and MIC90 of polymyxin B were 1 μg/ml and 8 μg/ml, respectively. While the MIC50 and MIC90 of polymyxin E were 2 μg/ml and 8 μg/ml, respectively. The distributions of MICs for different predominant serotypes, including Salmonella Typhimurium, Salmonella Enteritidis and Salmonella Derby, were different. The resistant breakpoint MICs for polymyxin B and polymyxin E were set at 8 μg/ml based on their MIC frequency distribution. According to this criteria, the overall resistance rates to polymyxin B and polymyxin E were 10.89% and 15.84%, respectively. The resistance rates of Salmonella with different sources to polymyxin B differed significantly (food source 12.50%, human source 17.16% and animal source 0) (P < 0.01), so did the resistance rates of Salmonella with different sources to polymyxin E (food source 8.30%, human source 27.94% and animal source 0.78%) (P < 0.01). Importantly, seven Salmonella strains showed co-resistance to polymyxin and the third-generation cephalosporins. Moreover, one Salmonella Typhimurium strain producing ESBLs isolated from human stool was mcr-1 gene positive and this gene was carried by a transferable plasmid. Conclusion This is the first report to identify a human original Salmonella strain carrying the mcr-1 gene. Based on MIC distribution data in vitro, MIC of 8 μg/ml was recommended as the resistant breakpoints to polymyxin B and colistin for non-typhoid Salmonella in China. The prevalence of polymyxin resistance was low, but it is not negligible. The antimicrobial resistance surveillance for Salmonella from different sources should be strengthened.
Key words: Polymyxin     Salmonella     Antimicrobial susceptibility test     mcr-1    

早期多粘菌素应用因为其肾毒性和神经毒性受到限制[1]。近年来,因为其在治疗多重耐药革兰阴性菌引起的感染方面取得较好疗效[2],重新获得关注。现临床上常用的为多粘菌素B和E,多粘菌素E多应用于动物,多粘菌素B主要应用于人。然而,随着该药在临床上的应用,已经发现革兰阴性菌对多粘菌素产生耐药性[3]。最新研究发现,细菌对多粘菌素的抗性显著增加,并通过携带mcr-1基因的质粒介导,将其耐药性传递给其他菌株[4]。因此,加强对多粘菌素耐药性的监测对指导临床用药具有重要意义。目前,针对肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌对多粘菌素的耐药研究较多,沙门菌对多粘菌素的耐药研究多见于动物源性沙门菌对多粘菌素E的相关研究[5-6]。本研究对分离自食品、腹泻患者粪便、动物粪便或肠内容物的沙门菌进行多粘菌素的药物敏感性试验及mcr-1基因检测,初步探究沙门菌对多粘菌素的耐药情况,为临床使用多粘菌素治疗沙门菌,特别是多重耐药沙门菌感染提供一定的依据。

1 材料与方法 1.1 菌株来源

随机选取2011-2014年共404株沙门菌进行试验。其中,2011年4株(0.99%),2012年24株(5.94%),2013年344株(85.15%),2014年32株(7.92%)。菌株来自北京(108株)、云南(108株)、深圳(70株)、天津(31株)、内蒙古(44株)、厦门(13株)、河北(7株)、河南(6株)、贵州(5株)等12个省(直辖市、自治区)及国外(8株)。其中,分离自食品的沙门菌共72株(17.82%),除2株来源于厦门市,其余70株菌来自深圳市。分离自野生动物(红嘴鸥和鼠)的沙门菌共128株(31.68%),84株来源于云南省昆明市,44株来源于内蒙古自治区赤峰市。分离自腹泻患者粪便的沙门菌共204株(50.50%),来自于除深圳以外的各个省市,其中北京市最多,为86株。明确血清型的菌株共189株,包括鼠伤寒沙门菌、德尔卑沙门菌、肠炎沙门菌等38种血清型,见图 12。实验用菌株均来自中国疾病预防控制中心(CDC)传染病预防控制所腹泻病室,均采用API 20E试剂条及血清凝集试验进行了确认。沙门菌抗血清购自丹麦国家食品研究所并在有效期内使用。

图 1 分离自食物菌株血清型构成比 Figure 1 Proportion of serotypes of Salmonella from food samples 注:其他血清型,共包括26种血清型,每种血清型包含的菌株数均 < 3株
图 2 分离自人粪便菌株血清型构成比 Figure 2 Proportion of serotypes of Salmonella from human stool samples 注:其他血清型,共包括26种血清型,每种血清型包含的菌株数均 < 3株
1.2 药敏实验 1.2.1 对多粘菌素B和E的药物敏感性试验

采用微量肉汤稀释法测试404株沙门菌对多粘菌素B和E的敏感性。2种抗生素浓度范围为0.125、0.25、0.5、1、2、4、8、16 μg/ml。药敏板由上海星佰生物技术有限公司订制,实验步骤按照说明书进行,具体包括:(1) 制备菌悬液:挑取纯菌培养的新鲜菌落于2~3 ml灭菌生理盐水中,用0.5麦氏浊度比浊,调菌液浓度至1.5×108 CFU/ml;(2) 取15 μl上述菌悬液于3 ml营养肉汤培养液中,充分混匀;(3) 在各浓度对应的药敏板相应孔位加入100 μl上述稀释菌液;(4)35 ℃静置培养18~20 h;(5) 孵育后,人工判读各株菌对多粘菌素B及E的最低抑菌浓度(MIC)。大肠埃希菌ATCC25922作为药敏试验质控菌株确保结果的可靠性。

1.2.2 抗生素的药物敏感性试验

若菌株对多粘菌素B的最小抑菌浓度≥8 μg/ml,则同时进行16种抗生素(氨苄西林、阿莫西林-克拉维酸钾、萘啶酸、环丙沙星、氯霉素、链霉素、庆大霉素、阿奇霉素、头孢西丁、头孢曲松、头孢吡肟、亚胺培南、四环素、磺胺异恶唑、复方新诺明、强力霉素)的敏感性试验。药敏板购自上海星佰生物技术有限公司,实验步骤按照说明书进行。所得菌株MIC值,根据2016年美国临床和实验室标准协会(CLSI)制定的标准,获得相应敏感(S)、中度敏感(I)和耐药(R)结果。大肠埃希菌ATCC25922作为质控菌株确保药敏结果的可靠性。

1.3 mcr-1基因PCR筛查 1.3.1 模板制备

采用热裂解法制备模板。挑取单个纯菌培养的新鲜菌落于100 μl纯水中,制成悬浊液。100 ℃煮沸10 min,冰浴10 min,12 000 r/min离心5 min,取上清作为反应模板。-20 ℃保存以备用。

1.3.2 聚合酶链式反应(PCR)体系及条件

根据发表的mcr-1基因序列,设计引物进行mcr-1基因检测。mcr-1基因筛查引物序列:CST-partial-F:5′-CTT GGT CGG TCT GTA GGG-3′,CST-partial-R5′-CGG TCA GTC CGT TTG TTC-3′。引物由北京天一辉远生物科技有限公司合成。PCR反应总体积为2 μl,其中2×Taq PCR MasterMix (TaKaRa公司)12.5 μl,mcr-1上下游引物(10 μmol/L)各200 pmol,DNA模板1 μl。PCR反应程序:94 ℃预变性3 min,然后94 ℃ 30 s,55 ℃30 s,72 ℃ 30 s,进行30个循环,最后72 ℃延伸5 min。PCR扩增结束后,将产物上样于1.0%的琼脂糖凝胶中,在0.5×TBE电泳缓冲液中进行电泳,记录PCR扩增结果。预期PCR产物长度为309 bp,对PCR阳性产物的样本进行mcr-1全基因扩增,并将扩增阳性的PCR产物送北京天一辉远生物科技有限公司进行序列测定,获得的mcr-1基因序列经比对后提交GenBank数据库,获得序列号。mcr-1全基因PCR扩增引物为:mcr1_F:5′-GCG GAT GAA TGC GGT GCG-3′,mcr1_R:5′-ATG ATG CAG CAT ACT TCT GTG-3′。mcr-1全基因扩增长度为1 623 bp,扩增条件与mcr-1基因筛查时的条件,除扩增循环中72 ℃延伸1.5 min外,其余均相同。每次实验均平行设立阴性对照(去离子水为模板)及阳性对照(含mcr-1基因的质粒DNA为模板)保证结果的准确性、可靠性。

1.4 S1-脉冲场凝胶电泳(PFGE)

参照国际实验室分子分型监测网络PulseNet中沙门菌PFGE分型标准化方案进行操作。简述如下:将细菌悬于细胞悬液(100 mmol/L Tris-HCl:100 mmol/L EDTA,pH 8.0) 中,调整浊度至5.0左右。吸取400 μl菌悬液加入20 μl蛋白酶K混匀,再加入400 μl低溶点琼脂(含1% SDS,56 ℃)混匀,灌制胶块。胶块加5 ml细胞裂解液(50 mmol/L Tris:50 mmol/L EDTA,pH 8.0,加1%十二烷基肌氨酸钠)和25 μl蛋白酶K (终浓度0.1 mg /ml),54 ℃水浴摇床孵育2 h裂解细胞,然后用50 ℃预热的TE漂洗4次。切取2 mm胶块加入1 ml 10 mmol/L Tris-HCl (pH 7.5) 漂洗2次(每次15 min),将胶块置于200 μl S1酶切缓冲液(50 mmol/L氯化钠, 30 mmol/L醋酸钠,5 mmol/L硫酸锌)中,加入1 U S1核酸酶(Sigma公司),37 ℃酶切45 min[7]。将酶切后的胶块进行PFGE(脉冲时间2.2~63.8 s,电泳19 h)。电泳完毕后,利用Del Dox 2000成像仪(Bio-Rad公司)获取经GelRed染色的凝胶图像。利用BioNumerics软件分析凝胶条带,并与DNA分子质量标准Marker进行比对,获得菌株内质粒大小情况。

1.5 质粒接合转移实验

以携带mcr-1基因的菌株为供体菌,大肠埃希菌J53作为受体菌,单菌落37 ℃活化过夜,次日以1 : 50的比例转接至新鲜5 ml LB中,37 ℃振荡培养至对数生长期A600= 0.5~0.6,按1 : 1的比例在1.5 ml的离心管中混匀,低速离心集菌,弃上清。菌沉淀用新鲜LB洗2次后加200 μl LB重悬。将菌悬液加到0.45 μm滤膜上,37 ℃培养过夜。用1 ml LB将滤膜上的细菌洗下,离心沉淀,梯度稀释后分别涂布于含叠氮钠(100 μg/ml)的麦康凯培养基及同时含含叠氮钠(100 μg/ml)及多粘菌素B(2 μg/ml)双抗的麦康凯培养基上,37 ℃培养24 h。对长出的菌落分别进行计数,计算接合转移率(接合子数/受体菌数)。接合子为PCR扩增mcr-1阳性的大肠埃希菌。同时对这些接合子进行S1-PFGE分析,确定转移质粒大小。

1.6 统计学分析

运用SPSS 17.0软件包进行统计学分析。用χ2检验进行率的比较,P < 0.05为差异有统计学意义。

2 结果 2.1 沙门菌对多粘菌素的耐受情况

404株菌对多粘菌素B的MIC范围为≤0.125 μg/ml至 > 16 μg/ml,MIC50为1 μg/ml,MIC90为8 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共321株(79.46%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共360株(89.11%),≥8 μg/ml的共44株(10.89%),见图 3

图 3 多粘菌素B及E对沙门菌的最低抑菌浓度分布 Figure 3 MIC distributions of polymyxin B and E for Salmonella

404株菌对多粘菌素E的MIC范围为≤ 0.125 μg/ml至 > 16 μg/ml,MIC50为2 μg/ml,MIC90为8 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共291株(72.03%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共340株(84.16%),≥8 μg/ml的共64株(15.84%),见图 3

以8 μg/ml为判定耐药折点,实验菌株对多粘菌素B和E的耐药率分别为10.89%和15.84%。共13株菌株同时耐多粘菌素B及E,交叉耐药率为3.22%。

2.1.1 不同来源沙门菌对多粘菌素B的药敏结果

分离自食品的72株沙门菌,对多粘菌素B,MIC50为0.5 μg/ml,MIC90为 > 16 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共61株(84.72%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共63株(87.50%),≥8 μg/ml的共9株(12.50%),见表 1

表 1 不同来源沙门菌对多粘菌素的药敏结果 Table 1 Drug susceptibilities of Salmonella with different sources to polymyxin
最低抑菌浓度
(μg/ml)
多粘菌素B/Ea
食品
(n=72)
腹泻患者
(n=204)
动物
(n=128)
≤0.125 4/2 1/3 0/0
0.25 25/2 31/11 0/0
0.5 20/0 23/17 7/0
1 10/24 57/50 103/92
2 2/33 20/56 18/92
4 2/5 37/10 0/34
8 0/1 5/44 0/1
16 1/2 1/6 0/0
> 16 8/3 29/7 0/0
注:a一定最低抑菌浓度下,多粘菌素B及E的菌株数

分离自患者粪便的204株沙门菌,对多粘菌素B,MIC50为1 μg/ml,MIC90为 > 16 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共132株(64.71%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共169株(82.84%),≥8 μg/ml的共35株(17.16%)(表 1)。

分离自野生动物的128株沙门菌,对多粘菌素B,MIC50为1 μg/ml,MIC90为2 μg/ml。所有菌株对多粘菌素B的MIC值 < 4 μg/ml(表 1)。

以8 μg/ml为判定折点,食源性、人源性、动物源性沙门菌对多粘菌素B的耐药率分别为12.50%、17.16%和0.00%。不同来源沙门菌对多粘菌素B的耐药率差异有统计学意义(χ2=24.09,P < 0.01)。

2.1.2 不同来源沙门菌对多粘菌素E的药敏结果

分离自食品的72株沙门菌,对多粘菌素E,MIC50为2 μg/ml,MIC90为4 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共61株(84.72%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共66株(91.67%),≥8 μg/ml的共6株(8.33%)(表 1)。

分离自人粪便的204株沙门菌,对多粘菌素E,MIC50为2 μg/ml,MIC90为8 μg/ml。其中, < 4 μg/ml的共137株(67.16%),≤4 μg/ml或 < 8 μg/ml的共147株(72.06%),≥8 μg/ml的共57株(27.94%)(表 1)。

分离自动物的128株沙门菌,对多粘菌素E,MIC50为2 μg/ml,MIC90为4 μg/ml。所有菌株对多粘菌素E的MIC值均≤8 μg/ml(表 1)。

以8 μg/ml为判定折点,食源性、人源性、动物源性沙门菌对多粘菌素E的耐药率分别为8.30%、27.94%和0.78%。不同来源沙门菌对多粘菌素E的耐药率差异有统计学意义(χ2=47.22,P < 0.01)。

2.2 其他抗生素的敏感性结果

对多粘菌素B≥8 μg/ml的菌株(食源9株,人源35株)同时进行16种抗生素的敏感性试验。结果表示,44株多粘菌素B≥8 μg/ml的沙门菌株除对亚胺培南全部敏感外,不同来源的沙门菌对各类抗生素均有不同程度的耐药,见表 2。食源性沙门菌对氨苄西林的耐药率最高(88.89%),其次为阿奇霉素(55.66%)及萘啶酸、头孢西丁、四环素(均为44.44%),对头孢吡肟的耐药率为11.11%。人源性沙门菌对萘啶酸耐药率最高(77.14%),其次为链霉素(60.00%)、环丙沙星(45.71%),对头孢吡肟的耐药率为8.75%。

表 2 多粘菌素B≥8菌株对其他抗生素的耐药性结果 Table 2 Resistance prevalence of Salmonella with PMB≥8
抗生素 食品来源 患者来源
菌株数 耐药率
(%)
菌株数 耐药率
(%)
氨苄西林 8 88.89 13 37.14
阿莫西林-克拉维酸钾 2 22.22 3 8.57
萘啶酸 4 44.44 27 77.14
环丙沙星 1 11.11 16 45.71
氯霉素 2 22.22 9 25.71
链霉素 3 33.33 21 60.00
庆大霉素 2 22.22 6 17.41
阿奇霉素 5 55.56 4 11.43
头孢西丁 4 44.44 2 5.71
头孢曲松 2 22.22 3 8.57
头孢吡肟 1 11.11 2 5.71
亚胺培南 0 0.00 0 0.00
四环素 4 44.44 13 37.14
强力霉素 3 33.33 14 40.00
复方新诺明 2 22.22 7 20.00
磺胺异恶唑 3 33.33 14 40.00

44株多粘菌素B≥8的沙门菌中,仅有2株对多粘菌素E及16种抗生素均敏感(食源性沙门菌1株,人源性沙门菌1株),其余均为多重耐药菌株。同时耐受多粘菌素及三代头孢的菌株有7株,其中食源性沙门菌2株(分别为鼠伤寒沙门菌及肠炎沙门菌),人源性沙门菌5株(3株鼠伤寒沙门菌、1株汤普逊沙门菌、1株德尔卑沙门菌)。

2.3 多粘菌素耐药表型与血清型关系

对明确血清型的189株沙门菌进行分析,发现72株食源性沙门菌中,优势血清型为鼠伤寒沙门菌(S.Typhimurium,30.56%)及德尔卑(S.Derby,23.61%);117株人源性沙门菌中,优势血清型为肠炎沙门菌(S.Enteritidis,22.22%)及鼠伤寒沙门菌(S.Typhimurium,20.51%)。食源性鼠伤寒沙门菌及德尔卑沙门菌对多粘菌素B的MIC值均集中在0.25~0.5 μg/ml,对多粘菌素E的MIC值均集中在1~2 μg/ml。人源性肠炎沙门菌对多粘菌素B的MIC值于4 μg/ml及 > 16 μg/ml处分布较多,对多粘菌素E的MIC值大多 > 4 μg/ml。人源性鼠伤寒沙门菌对多粘菌素B的MIC值均集中在1~2 μg/ml,其次为 > 16 μg/ml。而对多粘菌素E的MIC值于1 μg/ml处分布最多, 见表 3

表 3 多粘菌素耐药表型在沙门菌优势血清型中的分布 Table 3 Proportion of polymyxin resistance in dominant Salmonella serotypes
最低抑菌浓度
(μg/ml)
食源性优势血清型
(多粘菌素B/E)a
人源性优势血清型
(多粘菌素B/E)a
S. Typhimurium S.Derby S. Enteritidis S. Typhimurium
0.25 9/1 8/0 1/0 3/1
0.5 6/0 6/0 4/2 2/4
1 3/9 3/5 2/3 6/12
2 1/8 0/11 1/4 4/3
4 0/2 0/1 9/3 2/0
8 0/0 0/0 2/6 2/3
16 0/0 0/0 0/4 1/0
> 16 3/1 0/0 7/4 4/0
合计 22 17 26 24
注:a多粘菌素B/E:一定最低抑菌浓度下,多粘菌素B及E的菌株数。
2.4 mcr-1基因检测

对404株沙门菌进行mcr-1 PCR检测,发现1株人源鼠伤寒沙门菌HLJ-Sa10131 mcr-1基因阳性,mcr-1基因总体携带率为0.25%,人源菌株携带率为0.49%。通过核酸BLAST比对,与已报道的mcr-1基因序列100%一致(基因号KY646314)。S1-PFGE结果显示,该菌株含有~80 kb、~120 kb、~250 kb大小3个质粒,见图 4。接合转移实验结果提示该菌株对多粘菌素的耐药性可以约4.50%的效率转移至受体菌E.coli J53中。接合子S1-PFGE显示可转移质粒大小为~ 240 kb(图 4)。综上所述及接合子mcr-1 PCR扩增阳性提示mcr-1基因位于大小为~240 kb的可转移质粒上。耐药表型结果显示:接合子对三代头孢菌素、多粘菌素B及E、氯霉素、链霉素、复方新诺明、庆大霉素等12种抗生素耐药,见表 4

图 4 S1-PFGE图谱 Figure 4 S1-PFGE electrophoretogram 注:M:DNA Marker; 1:供体菌HLJ-Sa10131; 2:受体菌E.coli J53; 3~5:接合子1, 2, 3
表 4 供体菌、受体菌及接合子耐药表型结果 Table 4 Antimicrobial phenotypes of donor strain, recipient strain and transconjugant
抗生素 HLJ-Sa10131 E.coli J53 接合子
氨苄西林 > 128 4 > 128
氯霉素 > 32 8 > 32
链霉素 > 32 4 32
磺胺异恶唑 > 512 ≤8 512
四环素 32 2 2
复方新诺明 > 8/152 ≤0.13/2.4 > 8/152
阿莫西林-克拉维酸钾 64/32 8/4 > 64/32
头孢曲松 > 16 0.5 16
头孢曲松-克拉维酸钾 4/4 0.12/4 4/4
头孢他啶 4 2 2
头孢他啶-克拉维酸钾 1/4 ≤0.12/4 2/4
萘啶酸 > 128 ≤8 16
环丙沙星 1 ≤0.03 0.12
头孢吡肟 32 ≤0.5 16
亚胺培南 ≤0.25 ≤0.25 ≤0.25
头孢西丁 4 16 8
氨曲南 16 ≤0.5 2
头孢噻呋 > 32 1 32
庆大霉素 > 32 ≤0.5 8
多粘菌素E 8 2 8
多粘菌素B 4 1 4
卡那霉素 > 64 ≤2 > 64
强力霉素 > 16 4 4
3 讨论

目前,不同抗菌药物组织委员会对多粘菌素敏感性折点的判定值不同[8]。沙门菌对多粘菌素B及E敏感性判定的标准目前尚无统一、明确的规定。SENTRY监测计划[9]按照MIC≥2 μg/ml作为判定沙门菌对多粘菌素B耐药的流行病学标准。按照这一折点标准,本试验中,沙门菌对多粘菌素B的耐药率为30.45%(123/404),略高于SENRY结果(24.00%)。根据本试验中沙门菌对多粘菌素B和E的MIC值分布特征,建议将多粘菌素B及E的临床耐药判定折点设为8 μg/ml(该折点尚需临床药物动力学数据的进一步验证)。按照这一判定标准,沙门菌对多粘菌素B和E的耐药率分别为10.89%和15.84%。且3种来源的沙门菌对多粘菌素B和E的耐药率存在差异,人源性沙门菌对多粘菌素的耐药率相对较高,提示应加强人源性耐药性沙门菌污染监测。

本研究表明多粘菌素B和E之间存在交叉耐药,对多粘菌素B耐药的细菌亦能通过同样的耐药机制对多粘菌素E耐药[8]。绝大多数人源性与食源性沙门菌为多重耐药菌,发现多株同时耐受多粘菌素与三代头孢菌素的沙门菌株,但均对亚胺培南敏感,这与目前临床常将多粘菌素与碳青霉烯类联用的方案相一致[10]。另外,多粘菌素耐药的沙门菌,其他测试的抗生素如头孢吡肟等,也存在敏感性,目前为止尚未检测到泛耐药沙门菌。发现相同来源,不同血清型沙门菌对多粘菌素的耐药性不同。另外,相同血清型,不同来源的沙门菌对多粘菌素的耐药性也不完全相同。沙门菌不同血清型对多粘菌素耐药表型差异的机制有待进一步研究。

最新研究发现,多粘菌素E的耐药性可通过携带mcr-1基因的质粒介导菌株间的水平转移[4]。目前全球发现携带mcr-1基因的致病菌主要包括大肠埃希菌、沙门菌、肺炎克雷伯菌及宋内志贺菌[11],发现mcr-1阳性人源沙门菌血清型主要包括鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、乙型副伤寒菌沙门菌爪哇变种、维尔肖沙门菌等。本研究在404株沙门菌中,发现1株腹泻患者来源的鼠伤寒沙门菌mrc-1阳性,且该基因位于高水平可转移的质粒上,提示该耐药基因可能通过质粒水平转移引起播散。但接合子中的质粒大小与供体菌中质粒大小存在差异,提示该质粒在沙门菌内可能处于活跃的复制重组状态,造成质粒大小的差异,具体机制有待进一步研究。此外,接合子耐药表型提示该质粒同时携带产ESBL(Extended-Spectrum β-Lactamases,超广谱β-内酰胺酶)相关基因及氯霉素-链霉素-磺胺异恶唑-卡那霉素耐药基因,说明该质粒为多重耐药大质粒。这是国内报道人源产ESBLs沙门菌携带mcr-1基因。有关该耐药质粒的来源、遗传背景与已报道的携带mcr-1基因的其他质粒的关系正在研究中。除mcr-1基因介导多粘菌素E抗性外,发现鼠伤寒沙门菌对多粘菌素耐药主要是通过pmrABphoPQ二元调控系统发生突变,从而激活arnBCADTEFpmrCAB操纵子,引起脂质A的修饰[12],导致菌株对多粘菌素耐受。mig-14基因亦参与其中[13]。本研究中对多粘菌素耐药的绝大多数沙门菌株不携带mcr-1基因,其具体耐药机制是否由上述基因变异或其他耐药机制引起,尚待进一步研究。

总之,本研究发现我国人源产ESBLs鼠伤寒沙门菌携带可转移的mcr-1基因,且mcr-1基因与产ESBLs基因位于同一个可转移的多重耐药大质粒上。发现多种人源及食物源性沙门菌同时耐多粘菌素及三代头孢菌素。食品及野生动物中多粘菌素耐药菌株的发现,特别是在野生动物中发现多粘菌素E耐药菌株,提示应加强不同来源沙门菌的联合耐药监测、特别是可转移耐药基因及元件的检测及监测,控制耐药播散。

作者贡献:

曹阳  ORCID:0000-0002-0731-2555

曹阳:实验操作,数据分析,论文写作

遇晓杰:实验指导,数据分析

韩营营:实验操作

李杰:实验指导

阚飙:课题指导

闫梅英:实验设计与指导,论文指导与写作

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