疾病监测  2017, Vol. 32 Issue (3): 247-251

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李东迅, 彭华, 闻艳红, 徐代庆, 吴杨, 庄鹏, 舒高林
LI Dong-xun, PENG Hua, WEN Yan-hong, XU Dai-qing, WU Yang, ZHUANG Peng, SHU Gao-lin
2015年北京市昌平区致泻性大肠埃希菌耐药性及脉冲场凝胶电泳分型研究
Antibiotic resistance and pulsed-field gel electophoresis molecular type of diarrhoeagenic Escherichia coli isolated in Changping district of Beijing, 2015
疾病监测, 2017, 32(3): 247-251
Disease Surveillance, 2017, 32(3): 247-251
10.3784/j.issn.1003-9961.2017.03.018

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收稿日期:2016-07-27
2015年北京市昌平区致泻性大肠埃希菌耐药性及脉冲场凝胶电泳分型研究
李东迅, 彭华, 闻艳红, 徐代庆, 吴杨, 庄鹏, 舒高林     
北京市昌平区疾病预防控制中心, 北京 102200
摘要目的 了解2015年北京市昌平区致泻性大肠埃希菌耐药状况并对其进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究。方法 药敏实验按照美国临床实验室标准化协会(CLSI)推荐的K-B纸片法进行24种抗生素的敏感性分析;PFGE实验参照PulseNet PFGE实验方法。结果 药敏结果显示,致泻性大肠埃希菌对头孢比肟、亚胺培南完全敏感;对阿米卡星、妥布霉素、米诺环素耐药率极高,分别为94.6%、97.3%和97.3%。耐药谱分析显示,致泻性大肠埃希菌同时耐受抗生素种类为2~7种。PFGE分析发现,33株致泻性大肠埃希菌具有31种PFGE带型,菌株之间的相似系数为68.0%~100.0%,其中2株ETEC和2株EPEC有一致的PFGE带型。结论 昌平区引起腹泻的致泻性大肠埃希菌耐受抗生素的种类多、多重耐药严重且PFGE带型呈高度多态性。
关键词致泻性大肠埃希菌    耐药性    脉冲场凝胶电泳    
Antibiotic resistance and pulsed-field gel electophoresis molecular type of diarrhoeagenic Escherichia coli isolated in Changping district of Beijing, 2015
LI Dong-xun, PENG Hua, WEN Yan-hong, XU Dai-qing, WU Yang, ZHUANG Peng, SHU Gao-lin     
Changping District Center for Disease Control and Prevention, Beijing, Beijing 102200, China
Corresponding author: SHU Gao-lin, Email: bjcpcdc@163.com.
Abstract: Objective To understand the pulsed-field gel electophoresis (PFGE) molecular type and antibiotic resistances of diarrhoeagenic Escherichia coli isolated in Changping district of Beijing in 2015. Methods K-B method recommended by Clinical and Laboratory Standards Institute was used to test the drug susceptibility of the diarrhoeagenic E. coli strains. PFGE was performed according to the PulseNet protocol. Results According to the drug susceptibility test results, the diarrhoeagenic E. coli strains were completely sensitive to cefepime and imipenem, and the resistant rates toamikacin, tobramycin and minocycline were 94.6%, 97.3% and 97.3%, respectively. Multidrug resistance was more serious, most strains were resistant to 2-7 kinds of antibiotics. 31 PFGE patterns were found in 33 diarrhoeagenic E. coli strains with the similarity coefficient of 68%-100%, and two Enterotoxigenic E.coli (ETEC) strains and two Enteropathogenic E.coli (EPEC) strains respectively belonged to the same pattern. Conclusion Multidrug resistance of diarrhoeagenic E.coli strains was serious in Changping, and the PFGE patterns were with highly polymorphism.
Key words: Diarrhoeagenic Escherichia coli     Drug resistance     Pulsed-field gel electrophoresis    

致泻性大肠埃希菌 (Diarrhoeagenic Escherichia coli,DEC) 是引起腹泻的重要病原菌之一,易在温暖潮湿的环境中生长,主要通过饮水和食物进行传播,根据其毒力因子、致病机制、临床表现和流行病学特征分为5类,即肠致病性大肠埃希菌 (Enteropathogenic E.coli,EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌 (Enterotoxigenic E.coli,ETEC)、肠侵袭性大肠埃希菌 (Enteroinvasive E.coli,EIEC)、肠出血性大肠埃希菌 (Enterohemorrhagic E.coli,EHEC) 和肠集聚性大肠埃希菌 (Enteroaggregative E.coli,EAEC)[1-2]。尽管在细菌性腹泻的治疗上取得了进步,但由于抗生素的广泛使用,DEC菌株耐药率日益增高、多重耐药现象严重,DEC仍然是威胁人类健康的病原菌之一[3-4]。根据北京市昌平区腹泻病原菌监测显示,2015年引起感染性腹泻的病原菌中DEC居首位,但本地区对感染状况缺乏相关数据分析。为此,将2015年昌平区分离到的DEC进行脉冲场凝胶电泳 (pulsed-field gel electrophoresis,PFGE) 分型及耐药性分析,旨在了解昌平区DEC的PFGE型别特征,分析其耐药规律和特点,为临床用药和制定有效防控措施提供指导和依据。

1 材料与方法 1.1 标本来源

403份粪便标本采自昌平区中医院肠道门诊2015年1 12月腹泻患者。患者临床表现为:每日排便≥3次,粪便性状改变 (呈稀便、水样便、黏脓便或脓血便等)。用无菌棉签采集标本后,保存于Cary-Blair运送培养基,按生物安全要求于采样当天送至监测实验室。

1.2 试剂与仪器

EC肉汤、TSI培养基、大肠埃希菌显色培养基 (均购自英国OXOID);Seakem Gold琼脂糖 (美国Cambrex Bio Science Rockland);Premix Ex TaqTM(Probe qPCR) 购自大连宝生物公司;7对特异性基因 (eaestx1、stx2、ltstipaHaggR) 引物及探针由北京市疾病预防控制中心 (CDC) 下发;VITEK全自动生化分析仪、VITEK GN鉴定卡 (法国生物梅里埃);蛋白酶K (德国Merck);限制性内切酶XbaⅠ (美国New England Biolabs);药敏纸片Ampicillin (10 μg)、Amoxicillin/clavulanic acid (20 μg/10 μg)、Cefazolin (30 μg)、Cefoxitin (30 μg)、Cefuroxime sodium (30 μg)、Cefamandole (30 μg)、Cefotaxime (30 μg)、Ceftazidime (30 μg)、Cefepime (30 μg)、Cefaclor (30 μg)、Ciprofloxacin (5 μg)、Levofloxacin (5 μg)、Norfloxacin (10 μg)、Ofloxacin (5 μg)、Nalidixic acid (30 μg)、Imipenem (10 μg)、Trimethoprim/sulfa (25 μg)、Gentamicin (10 μg)、Kamycine (30 μg)、Amikacin (30 μg)、Netilmicin (30 μg)、Tobramycin (10 μg)、Doxycycline (30 μg)、Minocycline (30 μg)(均购自英国OXOID);生物安全柜 (美国Baker);恒温培养箱 (日本SANYO);浊度仪 (法国生物梅里埃);SW22型水浴摇床 (德国Julabo);凝胶成像系统和PFGE及配套设备 (美国Bio-Rad公司)。

1.3 DEC检测、分离及鉴定

参照《感染性腹泻诊断标准WS 271 2007》:标本接种于EC肉汤、37 ℃培养18~24 h;取1 ml培养液,用水煮法提取基因组DNA后,进行7种特异性基因荧光定量PCR反应 (反应体系:2×缓冲液10 μl,上游引物0.4 μl,下游引物0.4 μl,探针0.4 μl,模板DNA 2 μl,H2O 6.8 μl; 反应条件:95 ℃ 30 s,95 ℃ 5 s,60 ℃ 34 s,进行40个循环),检测5种DEC;阳性样品 (EPEC:eae阳性;EHEC:eaestx1和stx2阳性,或eaestx1阳性,或eaestx2阳性;ETEC:ltst阳性,或lt阳性,或st阳性;EIEC:ipaH阳性;EAEC:aggR阳性),取一环培养液接种于大肠显色培养基,挑取5个可疑菌进行TSI、生化 (VITEK全自动生化分析仪) 及特异性基因 (荧光定量PCR) 确证实验。

1.4 药敏实验

对33株DEC进行24种抗生素的药敏检测,方法按照美国临床实验室标准化协会 (CLSI) 推荐的K-B纸片法进行,判断标准参照CLSI 2012年颁布的标准。质控菌株为大肠埃希菌ATCC 25922。

1.5 PFGE分型

按照美国CDC PulseNet制定的非O157大肠埃希菌的PFGE标准,沙门菌标准株H9812作为分子质量标记,选用限制性内切酶XbaⅠ进行酶切。主要实验参数为电压梯度6 V/cm,电场夹角120°,脉冲时间6.76~35.38 s,电泳时间18~19 h。PFGE图像用BioNumerics (Version 5.0) 软件根据UPGMA (Unweighted Pair Group Method using Arithmetic averages) 方法进行聚类分析。

2 结果 2.1 DEC检出情况

在403份感染性腹泻患者粪便标本中,检出33株DEC,检出率为8.2%,主要为EPEC (18株),其次为ETEC (8株) 和EAEC (7株)。

2.2 药敏结果

33株DEC对24种抗生素的药敏结果见表 1。DEC对头孢比肟 (CPM)、亚胺培南 (IMP) 完全敏感;对阿米卡星 (AK)、妥布霉素 (TOB)、米诺环素 (MH) 耐药率极高,分别为94.6%、97.3%和97.3%;多数菌株对氨苄西林 (AMP)、萘啶酸 (NAL)、奈替米星 (NET)、强力霉素 (DO) 耐药或中介,耐药率和中介率分别为 (59.5%、10.8%,51.4%、16.2%,62.2%、29.7%,62.2%、35.1%);对其他抗生素大部分菌株敏感。

表 1 致泻性大肠埃希菌对抗菌药物的敏感性 Table 1 Antibiotic susceptibility of diarrhoeagenic E. coli strains
抗生素耐药率
(%)
中介率
(%)
敏感率
(%)
氨苄西林 (AMP)59.510.829.7
阿莫西林/克拉维酸钾 (AMC)8.18.183.8
头孢唑林 (CFZ)18.90.081.1
头孢西丁 (FOX)2.72.794.6
头孢呋辛钠 (CXM)10.85.483.8
头孢孟多 (MA)13.52.783.8
头孢噻肟 (CTX)8.18.183.8
头孢他啶 (CAZ)0.02.797.3
头孢比肟 (CPM)0.00.0100.0
头孢克罗 (CEC)24.30.075.7
环丙沙星 (CIP)2.78.189.2
左旋氧氟沙星 (LEV)5.40.094.6
诺氟沙星 (NOR)2.75.491.9
氧氟沙星 (OFX)2.70.097.3
萘啶酸 (NAL)51.416.232.4
亚胺培南 (IPM)0.00.0100.0
复方新诺明 (SXT)40.50.059.5
庆大霉素 (GEN)5.48.186.5
卡那霉素 (K)2.724.373.0
阿米卡星 (AK)94.65.40.0
奈替米星 (NET)62.229.78.1
妥布霉素 (TOB)97.32.70.0
强力霉素 (DO)62.235.12.7
米诺环素 (MH)97.32.70.0

耐药谱分析见图 1,DEC同时耐受抗生素种类为2~7种。从DEC致病类型分析,EPEC、EAEC、ETEC对AMP的耐药率分别为50.0%(9/18)、85.7%(6/7)、37.5%(3/8),对NAL的耐药率分别为33.4%(6/18)、71.4%(5/7)、62.5%(5/8),对SXT的耐药率分别为44.4%(8/18)、57.1%(4/7)、25.0%(2/8);对头孢烯类抗生素 (CTX、CEC、CFZ、MA) EPEC、ETEC出现少量耐药菌株;对氟喹诺酮类抗生素 (NOR、OFX、LEV)、氨基糖苷类抗生素 (K、GEN) EPEC出现少量耐药菌株。

图 1 33株致泻性大肠埃希菌的PFGE聚类图及耐药谱 Figure 1 PFGE patterns and antibiotic resistance of 33 diarrheagenic E. coli strains 注:本研究将耐药率>90%视为完全耐药,完全耐药的抗生素不在图中出现,即TOB (97.3%)、AK (94.6%) 和MH (97.3%)。
2.3 PFGE结果

33株DEC被分为31种PFGE带型 (图 1),带型相似性68%~100%,其中除了2株ETEC和2株EPEC有一致的PFGE带型外,其他每个带型仅有1株菌。PFGE分型结果表明北京市昌平区2015年分离的DEC呈高度多态性。值得注意的是2株PFGE型别一致的ETEC菌株具有相同的耐药谱 (图 1中A),2株EPEC的PFGE型别一致但是耐药谱存在差异 (图 1中B)。另外还有3株耐药谱相似的EAEC菌株带型相似性高于90%,聚成一簇 (图 1中C)。

3 讨论

近年来,随着广谱抗生素的滥用,DEC耐药性问题日益严重,多重耐药菌株大量出现[5-6]。本次药敏实验结果发现,昌平区DEC对氨苄西林耐药率较高,对亚胺培南高度敏感,与北京地区结果一致;2005-2014年CHINET大肠埃希菌耐药性监测显示,北京地区大肠埃希菌对CXM、CTX、CPM等头孢烯类抗生素耐药,而昌平区的DEC菌测对这三种头孢烯类抗生素敏感;2014-2015年北京协和医院细菌耐药性监测显示,大肠埃希菌对GEN敏感、对AK耐药,而本地区的DEC菌则对GEN耐药、对AK敏感[4, 7-8]。上述结果表明,北京昌平区DEC菌对头孢烯类、氨基糖苷类抗生素具有自己的耐药特性,因此在治疗由DEC引起的腹泻中,应结合《抗菌药物临床应用指导原则 (2015年版)》和本地区DEC菌耐药特点进行药物选择[4-13]。另外,本研究发现昌平区DEC菌多重耐药严重,耐受抗生素种类高达7类,提示临床用药合理具有针对性,以减少耐药株的产生。

33株DEC菌出现31种PFGE带型,表明昌平区DEC菌PFGE带型呈现高度多态性,这与其他地区情况一致[14-15]。PFGE带型中存在耐药谱相近且PFGE带型一致或者相似性很高的同一类型DEC菌株,提示这些菌株有引起小规模暴发流行的可能。但是对于这些耐药谱相近且PFGE带型一致或者相似性很高的同一类型DEC菌株的直接关系,还需要根据流行病学资料进行进一步的分析。由于本次研究中分离的DEC菌株数目较少,DEC的耐药性与PFGE带型之间的相关性还需要更多的数据支持。

本研究通过药敏实验和PFGE建立本地区的DEC基础数据库,为本地区临床用药、DEC分子流行病学调查以及溯源提供数据支撑。但由于菌株量少,不能得出DEC的分子流行趋势,需继续丰富本地区DEC数据库,为DEC的防控提供更多依据。

作者贡献:

李东迅  ORCID:0000-0001-5403-3850

李东迅:文章撰写,实验主要执行者

彭华、闻艳红、徐代庆、庄鹏:实验菌株分离

吴杨:参与PFGE实验

舒高林:修改论文

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