2020年  第35卷  第1期

2020-01期封面
2020, 35(1).
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摘要:
2020-01-ml 目录
2020, 35(1): 1-3.
[摘要](1619) [HTML全文] (582) [PDF 876KB](49) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
《疾病监测》杂志稿约
2020, 35(1): 92-92.
[摘要](1425) [HTML全文] (511) [PDF 264KB](14) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
疫情快报
2019年12月中国甲乙丙类传染病疫情动态简介National Data of Class A, B and C Communicable Diseases in December 2019
2020, 35(1): 1-1. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.001
[摘要](2190) [HTML全文] (830) [PDF 313KB](105) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
2019年12月中国甲乙丙类传染病疫情动态概要
2020, 35(1): 2-2. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.002
[摘要](2592) [HTML全文] (2478) [PDF 285KB](56) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
2019年12月全球传染病疫情概要
韩辉, 伍波, 宋亚京, 贾娇娇
2020, 35(1): 3-5. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.003
[摘要](3823) [HTML全文] (1076) [PDF 2066KB](53) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
2019年12月全球共监测到传染病64种,涉及82个国家和地区。 除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为麻疹(49个)、登革热(26个)、基孔肯雅热(8个)、脊髓灰质炎(8个)和流行性脑脊髓膜炎(8个)。 病死率位于前4位的传染病分别为埃博拉病毒病(66.0%)、中东呼吸综合征(34.4%)、拉沙热(20.8%)和鼠疫(16.0%)。 死亡病例数位于前5位的传染病分别为麻疹、疟疾、登革热、霍乱和埃博拉病毒病。 非洲流行的传染病主要为埃博拉病毒病、鼠疫、霍乱、黄热病、拉沙热和麻疹;亚洲流行的传染病主要为登革热和中东呼吸综合征;美洲流行的传染病主要为登革热;欧洲流行的传染病主要为麻疹。
风险评估
2020年1月中国大陆需关注的突发公共卫生事件风险评估
周丰波, 王大燕, 李静欣, 王哲, 李昀, 涂文校, 向妮娟, 施国庆
2020, 35(1): 6-9. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.004
[摘要](2708) [HTML全文] (1938) [PDF 1395KB](204) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的评估2020年1月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。结果预计2020年1月突发公共卫生事件的报告数将较2019年12月下降,事件数可能低于前3年水平,报告事件以流行性感冒(流感)、水痘、诺如病毒病、非职业性一氧化碳中毒为主。 需要密切关注湖北省武汉市2019新型冠状病毒疫情的病因、临床和流行特征调查进展,动态评估其可能造成的公共卫生风险。 流感将于1月底达到流行高峰,诺如病毒引发的感染性腹泻病疫情将维持较高水平,非职业性一氧化碳中毒事件仍将保持较高水平。 春节期间我国公民在境内需重点预防季节性流感、人感染禽流感、诺如病毒感染性腹泻等传染病,以及食物中毒和非职业性一氧化碳中毒;出境旅游需预防埃博拉病毒病、霍乱、登革热、黄热病、寨卡病毒病、中东呼吸综合征等,同时注意饮食卫生。结论需要对武汉市2019新型冠状病毒疫情、季节性流感予以重点关注,对诺如病毒感染性腹泻、非职业性一氧化碳中毒和春节假期旅行卫生予以一般关注。
食源性弯曲菌监测专题
导 读
张茂俊
2020, 35(1): 10-10.
[摘要](1692) [HTML全文] (595) [PDF 1701KB](18) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
空肠弯曲菌脂寡糖核心区合成相关基因簇遗传多样性研究
王佳奇, 顾一心, 周贵兰, 梁昊, 张建中, 张茂俊
2020, 35(1): 11-15. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.005
[摘要](2523) [HTML全文] (829) [PDF 2918KB](49) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的分析我国空肠弯曲菌脂寡糖(LOS)核心区合成相关基因簇的序列特征,获得LOS核心区合成相关基因簇的特异DNA序列特征。方法选择132株空肠弯曲菌的全基因组序列,采用OrthoMCL软件,进行LOS核心区合成相关基因簇DNA的同源性分析并以特异型别基因簇的特异序列为靶位点,建立PCR方法,根据特异引物序列以及扩增产物大小,识别菌株LOS核心区合成相关基因簇的主要型别。结果在132株菌中,105株菌的LOS核心区合成相关基因簇的DNA序列属于14个已确定的LOS型别,27株菌为新型LOS,根据DNA的同源性可分为10个新型别,分别命名为CDC1~10。 LOS合成相关基因序列中存在大量的多聚A/T、多聚G/C结构以及碱基的插入、缺失等突变,部分突变有可能导致LOS相关合成酶及转移酶的氨基酸序列发生改变,影响其抗原性。 针对A、B、C、CDC8型LOS的特异DNA序列建立的PCR鉴定方法可在50株测序菌株的基因组中得到验证。结论10种LOS新型别的发现有利于更准确地鉴定空肠弯曲菌,解释LOS的抗原多样性特征。 空肠弯曲菌的LOS核心区合成相关基因簇序列多样丰富,存在大量多聚结构和DNA序列的突变,是潜在的导致LOS抗原多样性的原因。 主要LOS分型的PCR法可用于快速筛查5种特异LOS型,但仍需要更多菌株的验证。
深圳市南山区腹泻患者弯曲菌感染及病原学特征分析
刘敏, 鞠长燕, 马艳萍, 段永翔, 俞慕华, 张茂俊, 王国庆
2020, 35(1): 16-20. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.006
[摘要](3063) [HTML全文] (979) [PDF 2549KB](41) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9 — 11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行菌种鉴定。 应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)对分离菌株进行分子分型,应用琼脂稀释法获得菌株对11种抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。 根据菌株的序列分型(ST)结果,结合既往菌株分型数据进行本地区菌株的遗传聚类分析。结果共采集腹泻患者粪便标本150份,其中男性患者74例,女性患者76例,年龄在1~86岁之间。 150份粪便标本中共分离到弯曲菌18株,检出率为12.00%(18/150)。 菌种鉴定发现,空肠弯曲菌占77.78%(14/18),结肠弯曲菌占22.22%(4/18)。 14株空肠弯曲菌可分为11种PFGE带型,8个ST型别,以ST9763最多(35.71%,5/14),是本研究新发现ST型别。 14株空肠弯曲菌对四环素全部耐药,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、庆大霉素、链霉素及克林霉素100.00%敏感。 ST型别最小生成树聚类分析结果表明,不同宿主来源菌株没有显著聚集性,腹泻患者分离菌株分布在不同来源的组群中。结论采用双孔滤膜法提高了腹泻患者中弯曲菌的检出率。本地区弯曲菌的感染仍以空肠弯曲菌为主, 分离菌株对四环素类、喹诺酮类抗生素呈现较高的耐药特征,分离的空肠弯曲菌ST呈弥散分布特点。
2016-2018年北京市顺义区成年人腹泻患者弯曲菌感染监测及病原学特征分析
李颖, 贾巧玲, 周贵兰, 马红梅, 王园园, 张爽, 李印东, 张茂俊
2020, 35(1): 21-28. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.007
[摘要](2552) [HTML全文] (935) [PDF 5245KB](77) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的综合分析北京市顺义区3年期间基于过滤法从成年人腹泻患者分离的弯曲菌菌株的分型特征、耐药特点及分布特征,为我国弯曲菌感染的防控及风险评估提供基础数据。方法连续3年(2016 — 2018年)收集腹泻监测项目中的腹泻患者粪便标本,应用增强过滤法分离弯曲菌并进行菌种鉴定。 应用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)2种方法进行细菌分子分型。 采用琼脂稀释法进行分离菌株的抗生素敏感性分析。结果2016 — 2018年,腹泻病例中弯曲菌的检出率分别为5.65%(17/301)、10.51%(39/371)和7.75%(29/374)。 共分离弯曲菌87株,空肠弯曲菌占87.36%(76/87),结肠弯曲菌占12.64%(11/87)。 76株空肠弯曲菌被分为55种序列分型(ST),11株结肠弯曲菌被分为9种ST型别。 病例发病时间聚集且分离的弯曲菌为相同ST型别的情况出现了6次,通过PFGE分析,5次聚集病例分离的菌株均呈现单一PFGE带型。 76株空肠弯曲菌的多重耐药率为55.26%(42/76),11株结肠弯曲菌的多重耐药率为90.91%(10/11)。结论弯曲菌是北京市顺义区成年人腹泻患者的重要病原菌,过滤法可作为弯曲菌分离培养的有效技术方法。 从顺义区腹泻患者分离的结肠弯曲菌多重耐药严重,应引起公共卫生、临床等多部门的关注。
2017-2018年山东省青岛地区畜禽源弯曲菌耐药性调查
刘晓, 李星, 翟卫帅, 沈张奇, 汪洋, 刘德俊
2020, 35(1): 29-33. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.008
[摘要](2478) [HTML全文] (895) [PDF 1973KB](46) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的调查2017 — 2018年山东省青岛地区畜禽源弯曲菌的流行与耐药现状。方法2017 — 2018年,从青岛地区的猪/鸡养殖场、屠宰场、农贸超市等场所采集畜禽泄殖腔(肛门)、盲肠、肉等样本,分离弯曲菌,对分离株进行种属鉴定和药敏试验,运用PCR方法检测大环内酯类基因erm(B)与增强型耐药外排泵基因RE-cmeABC结果共采集畜禽源样本730份,分离到235株(34.66%)弯曲菌,包括空肠弯曲菌131株(55.74%)、结肠弯曲菌104株(44.26%)。 其中鸡源菌株147株,分离率为29.40%(147/500);鸭源菌株80株,分离率为47.06%(80/170);猪源菌株8株,分离率为13.33%(8/60)。 药敏试验结果显示,结肠弯曲菌对环丙沙星、四环素、卡那霉素、红霉素、庆大霉素、克林霉素和氟苯尼考的耐药性较为严重,耐药率分别为 100.00%、99.04%、96.15%、92.31%、92.31%、87.50%、53.85%。空肠弯曲菌对四环素、环丙沙星、卡那霉素和氟苯尼考的药性较为严重,耐药率分别为100.00%、98.47%、70.99%、61.83%。 PCR方法检测到12株(5.11%)erm(B)基因阳性菌株,125株(53.19%)RE-cmeABC基因阳性菌株。结论本研究提示应持续监测青岛地区畜禽源弯曲菌的耐药现状与耐药机制,为控制耐药弯曲菌的流行提供理论基础。
2016-2018年湖南省株洲市弯曲菌的流行特征及耐药性分析
龙奇志, 贾华云, 何礼, 王岚, 胡世雄, 高立冬, 李俊华
2020, 35(1): 34-38. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.009
[摘要](2920) [HTML全文] (1012) [PDF 3516KB](38) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的了解湖南省株洲市弯曲菌的流行病学现状和耐药特征。方法2016年7月至2018年6月,在株洲市对腹泻病例和无腹泻症状儿童开展流行病学调查,并采集粪便标本进行弯曲菌的分离培养和耐药性分析。结果共调查人群粪便标本450份,弯曲菌的检出率为6.44%(29/450),其中无腹泻症状儿童的检出率为1.00%(1/100),腹泻病例的检出率为8.00%(28/350)。 弯曲菌感染的临床症状以腹泻、腹痛、黏液便、粪便镜检均有红、白细胞为主;5~岁组检出率较高,为19.44%(7/36);学生的检出率最高,为17.65%(6/34);男、女性患者的检出率差异无统计学意义(χ2=1.354,P=0.245);春秋季弯曲菌的检出率高于夏冬季。 29株弯曲菌中24株为空肠弯曲菌,5株为结肠弯曲菌,其中41.38%的菌株为多重耐药菌株,菌株对萘啶酸、环丙沙星和四环素的耐药性较强,分别为96.15%、88.46%、76.92%。结论空肠弯曲菌、结肠弯曲菌感染已成为株洲市感染性腹泻的重要病原菌之一,耐药性严重并存在多重耐药现象,应加强弯曲菌的监测和防控。
动物源弯曲菌流行及耐药性现状
刘德俊, 刘晓, 李星, 沈张奇, 汪洋
2020, 35(1): 39-45. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.010
[摘要](2383) [HTML全文] (812) [PDF 2020KB](49) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
弯曲菌是重要的食源性、人畜共患致病菌,近年来因其流行率与耐药率的不断上升而受到全球人医和兽医临床的高度关注。 欧洲、美国及我国均建立了人医和兽医领域的弯曲菌耐药性监控网络,此外,相关学者也开展了一系列的流行病学调查研究。 动物是弯曲菌的主要来源之一,动物源弯曲菌可经由食物链传播给人,带来潜在风险。 因此本文以动物源弯曲菌为对象做一综述,以深入了解近几年该菌在欧洲、美国、中国等国家的流行与耐药性现状。
传染病监测
527株肉鸡源大肠埃希菌的药物敏感性特征研究
陈霞, 赵晓菲, 车洁, 张云飞, 袁敏, 白雪梅, 李娟
2020, 35(1): 46-51. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.011
[摘要](2336) [HTML全文] (745) [PDF 2004KB](25) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的研究河北省肉鸡养殖场分离的大肠埃希菌对常见抗菌药物的耐药情况。方法2017年3月,在河北省某2处大型肉鸡养殖场中选择38日龄的待宰肉鸡作为采样对象。 将鸡舍分为5个区域采用单纯随机方法进行肉鸡泄殖腔拭子样品的采集,共得到样本273份。 采用选择性培养基进行菌株分离,用VITEK®-2型全自动微生物分析仪进行大肠埃希菌的鉴定和对10类18种常见抗菌药物的敏感性测试,并同时进行产超广谱β内酰胺酶(ESBL)的检测。结果经分离共得到菌落形态及生化特性不同的非重复的大肠埃希菌527株,产ESBL菌株占90.13%(475/527),对碳青霉烯类的厄他培南、美罗培南和亚胺培南的敏感率均为99.43%,对阿莫西林的耐药率最高,为99.24%。 对四环素、环丙沙星、哌拉西林、氨曲南、左氧氟沙星的耐药率分别为94.88%、78.94%、78.37%、77.80%、70.40%。 527株大肠埃希菌的多重耐药率为98.10%,且多重耐药菌株均产ESBL。 耐受6类抗菌药物的菌株最多,占35.86%(189/527)。 经分析共得到58种耐药谱,耐受青霉素类–头孢菌素类–氨曲南–氨基糖苷类–氟喹诺酮类–四环素–复方新诺明的菌株比重最高,占15.40%。结论肉鸡源大肠埃希菌对常见抗菌药物的耐药程度较高,多重耐药情况普遍存在,应加强对动物源菌株耐药性的监测和合理的轮换用药策略。
普通变形杆菌KM-19的培养鉴定及相关机制研究
贾琴妹, 杨传莲, 黄艳梅
2020, 35(1): 52-56. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.012
[摘要](2348) [HTML全文] (632) [PDF 2801KB](9) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的分析研究自中段尿培养中分离鉴定出的无迁徙性生长β溶血普通变形杆菌KM-19的生物学特性、耐药机制及基因组特点,为临床合理用药提供指导。方法常规方法分离培养菌株;采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析仪进行菌种鉴定和体外药物敏感性试验;利用鞭毛染色和半固体动力试验观察鞭毛缺失情况;采用高通量测序技术对该菌全基因组测序,采用生物信息学方法进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘菌株的表型机制及耐药机制相关基因簇信息。结果VITEK-2 Compact鉴定结果为普通变形杆菌。 全基因组测序结果显示基因组组装共得48个重叠群,基因总长度3 319 152 bp,平均长度904.89 bp,占基因组全长的85.50%,无重复序列,鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)(G+C)含量为38%。 该菌比对到普通变形杆菌可信度最高,也验证了VITEK-2 Compact鉴定结果准确。 该菌对一二代头孢菌素、氨苄西林、呋喃妥因、复方新诺明、替加环素耐药,其余均敏感。 鞭毛染色油镜下未见鞭毛结构,半固体动力试验阴性;基因组测序序列与VFDB数据库比对结果显示细菌鞭毛基因及相关基因未缺失,但鞭毛基因序列中发现可接受甲基化的趋化性蛋白基因Ⅲ/Ⅰ位点和甲基转移酶基因,还有溶血素基因(hlyB)。基因组序列与CARD数据库比对结果显示存在OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因。结论该株菌无迁徙性生长现象,其主要机制可能是鞭毛基因或相关基因被甲基化,使细菌不能有效表达菌体外鞭毛蛋白,丧失迁徙生长能力;β溶血表型可能由外源性溶血素基因(hlyB)插入细菌基因组中并有效表达。 该菌体外耐药情况与OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因密切相关。
2009-2018年内蒙古自治区鄂尔多斯市猩红热流行特征分析
赵益樊, 徐乐, 王雨杨, 林鹤
2020, 35(1): 57-59. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.013
[摘要](2384) [HTML全文] (712) [PDF 1898KB](30) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的了解内蒙古自治区鄂尔多斯市猩红热发病趋势及流行特征,为防控工作提供参考依据。方法利用描述流行病学方法分析鄂尔多斯市2009 — 2018年猩红热疫情资料。结果2009 — 2018年鄂尔多斯市共报告病例3 150例,年平均发病率为16.50/10万,男性发病率为女性的1.58倍。 发病率呈现一定的季节性,第一个高峰出现在5 — 7月,第二个高峰出现在10月至次年1月。 病例以3 ~ 10岁年龄组高发,占病例总数的94.16%(2 966/3 150)。 幼托儿童、学生、散居儿童报告发病数分别占全部报告发病数的60.32%(1 900例)、28.22%(889例)和10.67%(336例)。结论近10年来鄂尔多斯市猩红热报告发病率整体呈上升趋势,以春末夏初和冬季高发,男性发病率高于女性。
2011-2018年中国西部四省少数民族健康扶贫重点地区结核病疫情特征分析
杨丽佳, 李涛, 陈伟
2020, 35(1): 60-64. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.014
[摘要](2274) [HTML全文] (702) [PDF 1937KB](49) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的分析中国西部的青海、四川、云南、甘肃省少数民族健康扶贫重点地区结核病疫情特征和流行变化规律,为采取有针对性的防控策略和措施提供依据。方法利用传染病网络直报系统报告的肺结核疫情资料,描述2011 — 2018年中国西部4省少数民族健康扶贫重点地区肺结核的流行特征,明确防治的重点地区和重点人群。结果2011 — 2018年,西部4省少数民族健康扶贫地区总的结核病报告发病率呈缓慢上升的趋势,从2011年的114.41/10万上升到2018年的140.90/10万,上升了23.16%。 青海省少数民族健康扶贫地区的报告发病率最高。 2018年,西部4省少数民族健康扶贫地区男性肺结核报告发病率为166.43/10万,女性为118.19/10万;15~24岁组患者数最多,共报告5 242例,占28.59%。 青海、四川省少数民族健康扶贫地区15~24岁组肺结核发病率高,分别为487.41/10万和245.41/10万,青海、甘肃省少数民族健康扶贫地区≥65岁老年人报告发病率高,分别为451.96/10万和314.26/10万。结论中国西部4省少数民族健康扶贫重点地区结核病疫情重,要高度重视结核病防控工作,青海、四川省少数民族地区要重视青少年结核病防治工作,青海、云南省少数民族地区要重视老年结核病的防治工作。
网络直报
2013-2018年天津市乙型肝炎疫情报告删卡情况分析
张国平, 魏兆飞, 何海艳, 赵莹, 吴伟慎
2020, 35(1): 65-69. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.015
[摘要](2250) [HTML全文] (752) [PDF 2007KB](22) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的了解2013 — 2018年天津市乙型肝炎(乙肝)报告卡删除原因填写情况,发现存在的问题,为规范乙肝病例报告工作提供参考依据。方法按报告地区天津、终审时间为2013年1月1日至2018年12月31日,从传染病报告信息管理系统中导出全部乙肝报告病例信息。 通过描述性流行病学统计分析乙肝报告卡的删卡率、删卡原因以及删卡原因在不同医院、乙肝分类和删卡单位中的分布情况。结果2013 — 2018年天津市共报告卡17 983例,删卡2 429例,删卡率为13.51%;删卡原因中重卡的占比最高(47.06%),其次依次为不符合诊断标准(30.34%)、不符合报告标准(15.31%)和其他原因(7.29%);未分类乙肝报告卡中重卡率、不符合报告标准率和不符合报告标准率均明显高于急性和慢性乙肝(P<0.05);报告卡医院删卡原因中不符合报告标准率和其他原因填写率,均明显高于3种疾控相关删卡单位(P<0.001)。结论天津市乙肝疫情报告卡删卡主要原因为重卡、不符合报告标准和不符合诊断标准,但也存在少量删卡原因填写不规范的情况,应进一步规范乙肝的诊断报告和删卡原因填写,提高监测质量。
2014-2018年江苏省苏州市乙型肝炎重复报告分析
杨洋, 刘成, 陈立凌, 金连梅, 马会来, 刘慧慧
2020, 35(1): 70-74. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.016
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摘要:
目的了解2014 — 2018年江苏省苏州市乙型肝炎(乙肝)重复报告情况,为今后研究提供数据支持。方法利用传染病报告信息管理系统收集的2014 — 2018年苏州市乙肝报告病例进行个案查重,计算乙肝重复报告率,并进行统计学分析。结果共累计报告乙肝病例12 823例,其中有731例重复报告病例,重复报告率为5.70%,年度间重复报告率(4.32%)高于年度内重复报告率(1.44%)。 报告地区的重复报告构成比为0.55%~32.42%,重复报告率为1.46%~11.20%。 各年龄组的重复报告率为3.59%~6.40%(χ2=21.518,P=0.001),高年龄组的重复报告率高于低年龄组;省、市、县、乡级医疗机构均有重复报告病例,重复报告率为3.23%~7.69%(χ2=62.272,P<0.001)。结论苏州市乙肝报告存在重复上报情况,可能原因为国家传染病报告信息系统无法实现跨年度重复报卡查询以及病例基本信息缺失、变更、错误导致系统无法识别。 昆山市、姑苏区、外地机构上报对全市重复报告影响较大,应强化对该地区医疗机构乙肝报告查重工作;省、县级医疗机构重复报告率高于地市级、乡级医疗机构。
技术与方法
麦氏弧菌多位点序列分型方法的建立与应用
黄振洲, 于可艺, 代航, 蔡红艳, 徐潇, 王多春
2020, 35(1): 75-80. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.017
[摘要](2314) [HTML全文] (697) [PDF 3235KB](24) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的建立针对麦氏弧菌的多位点序列分型(MLST)方法,评价该方法的分型效果,并对收集的麦氏弧菌进行MLST分析。方法筛选出7个管家基因(ftsZgapAmreBgyrBpurMrecAropA),设计特异引物,在17株麦氏弧菌中PCR扩增管家基因序列。 用DnaSP 6.12.03软件和Split tree 4.0软件评价基因多态性、中性进化和基因重组情况;根据7个管家基因的序列差异获得对应的序列分型(ST)型别,用BioNumerics 7.1软件对不同ST型别构建最小生成树和聚类图,并用eBURST 3.0软件计算克隆复合体(CCs)。结果所选的管家基因具有足够多的等位基因位点、序列差异和足够高的分辨率;7个管家基因的Split tree对所有麦氏弧菌的聚类一致;中性试验结果显示,7个管家基因在进化过程中受遗传漂变的影响较小。 MLST将17株麦氏弧菌分成14个ST型别,大多数菌株(64.70%)均单独形成一个ST型别,其中ST007形成了可能的优势克隆群。 这些菌株之间存在相对较远的遗传距离,在垂直传播上呈现出潜在的地域聚集性。结论本研究建立的麦氏弧菌的MLST方法能分析麦氏弧菌的种群结构和遗传进化关系。
案例分析
单增李斯特菌感染一例患者的病因溯源
封会茹, 石婧, 陈倩, 尉秀霞, 余红, 颜涛, 王兆娥, 秦萌, 张志敏, 董晓根
2020, 35(1): 81-85. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.018
[摘要](3622) [HTML全文] (1180) [PDF 3166KB](35) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的对一例单增李斯特菌感染患者的致病因素进行调查和溯源分析。方法在现场流行病学调查的基础上,对患者、患者家庭食品、厨房用具等进行样本采集并进行单增李斯特菌的菌株分离鉴定。对分离菌株的6个毒力基因(prfAplcBhlyactAiapinlA)进行检测,使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)技术进行分子分型分析,对分离菌株进行同源性分析。结果19份样本中共分离出6株单增李斯特菌,1株来自患者,2株来自厨房环境用具样本(冰箱冷藏室内壁涂抹1份和小号菜板涂抹1份),3株来自患者家庭中食物(分别是猪肝1份、甜玉米粒罐头1份和红焖牛肉罐头1份)。除冰箱冷藏室内壁涂抹和甜玉米粒罐头2个样本检出的菌株plcB毒力基因阴性外,另外5个毒力及其他菌株的所有毒力基因全部为阳性。分离菌株均为ST121型,PFGE带型100%一致。结论患者家庭厨房食用食物和环境皆被单增李斯特菌污染,引起交叉感染,致使患者感染发病。
一起诺如病毒GⅠ、GⅡ组混合感染聚集性疫情分析
陈财荣, 张慧芬, 梁鸿镖
2020, 35(1): 86-89. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.019
[摘要](2245) [HTML全文] (812) [PDF 2183KB](55) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
目的调查2018年11月浙江省台州市一起诺如病毒聚集性疫情,查找病原和传播因素,为类似疫情调查处置提供依据。方法搜索病例,开展个案调查、现场卫生学调查,通过病例对照研究分析危险因素;采集病例粪便标本,利用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应方法进行诺如病毒核酸检测。结果共搜索到确认病例16例,罹患率为5.82%(16/275),病例均为学生,无教职工患病,无重症和死亡病例;病例起病急,临床表现为呕吐(100.0%)、恶心(100.0%)、腹痛(62.5%)、发热(25.0%);16份粪便样本检出诺如病毒阳性标本13份,其中GⅠ、GⅡ组诺如病毒混合阳性2份,GⅠ组诺如病毒阳性2份、GⅡ组诺如病毒阳性9份;在校外寄宿(OR=154,95%CI:19.82~1 196.45)和在呕吐现场围观是发病的危险因素(OR=143,95%CI:18.31~1 116.71)。结论该疫情为诺如病毒聚集性疫情,可能原因为通过吸入首例病例呕吐物气溶胶传播。
海外动态
2019年全球中东呼吸综合征疫情概况
龚震宇(摘译), 龚训良(审校)
2020, 35(1): 90-91. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.020
[摘要](3984) [HTML全文] (1124) [PDF 1825KB](47) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:

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