一起甲型病毒性肝炎暴发疫情的病原学诊断与基因分析

高红 董红军 傅燕 胡逢蛟 方挺 张姝

引用本文: 高红, 董红军, 傅燕, 胡逢蛟, 方挺, 张姝. 一起甲型病毒性肝炎暴发疫情的病原学诊断与基因分析[J]. 疾病监测, 2008, 23(9): 545-548. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.9.545 shu
Citation:  GAO Hong, DONG Hong jun, FU Yan, HU Feng jiao, FANG Ting and ZHANG Shu. Etiological diagnosis and genotyping analysis of an outbreak of hepatitis A[J]. Disease Surveillance, 2008, 23(9): 545-548. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.9.545 shu

一起甲型病毒性肝炎暴发疫情的病原学诊断与基因分析

摘要: 目的 查明引起2004年宁波局部地区甲型病毒性肝炎(甲肝)暴发疫情的病原并分析其基因特征。 方法 用酶联免疫吸附试验检测血清中的甲肝病毒IgM抗体(HAV IgM)和戊型肝炎病毒IgM抗体(HEV IgM),利用逆转录-聚合酶链反应(RT PCR)检测粪便样品中的HAV核酸(RNA)并扩增VP1基因,测序结果利用DNA star软件进行比对分析。 结果 172份血清样品中HAV IgM均为阳性,HEV IgM均为阴性。172份粪便样品中共检测到HAV RNA阳性样品74份,占43.0%。选择5份样品进行HAV VP1基因扩增并测序,测序结果经过比对后发现4株宁波株(NB2004-10、NB2004-11、 NB2004-51和 NB2004-71)的VP1基因是完全一致的;NB2004-75与以上4株的核苷酸的同源性为99.9%,氨基酸的同源性为99.7%;宁波株与HAV各基因型标准株比较, 与IA亚型毒株AH2的核苷酸和氨基酸的同源性最高, 分别为98.9%和99.7%~100.0%;与中国其他地区流行株比较,核苷酸和氨基酸的同源性波动于89.4%~96.7%和97.0%~100.0%。结论 引起这次肝炎暴发疫情的病原是甲肝病毒,其基因型为IA亚型,与日本株AH2、AH3亲缘关系最近,与中国其他地区流行株处于不同的进化簇上。

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  • 收稿日期:  2007-09-02
  • 刊出日期:  2008-09-30
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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