28株隐球菌ITS基因序列测定及其系统进化分析

吴媛 杜鹏程 卢金星

引用本文: 吴媛, 杜鹏程, 卢金星. 28株隐球菌ITS基因序列测定及其系统进化分析[J]. 疾病监测, 2011, 26(2): 92-95. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2011.02.004 shu
Citation:  WU Yuan, DU Peng-cheng and LU Jin-xing. Phylogenetic analysis of 28 Cryptococcus strains based on their ITS sequences[J]. Disease Surveillance, 2011, 26(2): 92-95. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2011.02.004 shu

28株隐球菌ITS基因序列测定及其系统进化分析

    作者简介: 吴媛,女,陕西省铜川市人,主要从事酵母菌研究工作;
    通信作者: 卢金星, lujinxing@icdc.cn
  • 基金项目: 国家科技重大专项(No.2009ZX1004-203)

摘要: 目的 测定28株鸽粪中分离的隐球菌的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,并根据ITS序列构建28株隐球菌和6株新生隐球菌的系统进化树。 方法 应用neighbor-joining(NJ)和maximum parsimony(MP)方法构建系统进化树,研究隐球菌属不同菌种间的亲缘和进化分化关系。 结果 两种聚类方法得到的进化树模型基本一致,所有菌株聚类为3个主要分支:6株分离到的新生隐球菌和6株参考菌株为一支;大部分DHP和XSQ菌株聚为一支, 除HP6外,所有的HP菌株和XSQ46-1及XSQ59-3,聚类为平行的第3个分支。从分化远近看,新生隐球菌分支、DHP和XSQ分支的分化年代没有显著差异。 结论 隐球菌属中,所有的新生隐球菌聚类为一支,其余的隐球菌菌种均分散在不同分支中,没有明显的种属聚集性,即呈现了隐球菌属不均一的特性。

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  • 通信作者:  卢金星, lujinxing@icdc.cn
  • 收稿日期:  2010-12-14
  • 刊出日期:  2011-02-25
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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