微生物在线生物信息分析系统的开发及应用

于伟文 杜鹏程 陈超 陈晨 吴一雷 张雯

引用本文: 于伟文, 杜鹏程, 陈超, 陈晨, 吴一雷, 张雯. 微生物在线生物信息分析系统的开发及应用[J]. 疾病监测, 2012, 27(4): 316-319. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.4.020 shu
Citation:  YU Wei-wen, DU Peng-cheng, CHEN Chao, CHEN Chen, WU Yi-lei and ZHANG Wen. Development and application of online bioinformatics analysis system for pathogenic microorganism[J]. Disease Surveillance, 2012, 27(4): 316-319. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.4.020 shu

微生物在线生物信息分析系统的开发及应用

摘要: 目的 基于浏览器/服务器模式构建微生物在线生物信息分析系统,应用于传染病预防控制工作。 方法 将目前在传染病病原微生物研究和传染病分子诊断、溯源中常用的基于客户端/服务器模式的一些开源的或免费提供使用的分析软件,采用远程桌面、分布式处理等"云计算"技术方案,构建成不需要在本地安装,以浏览器/服务器模式直接通过浏览器以点鼠标的方式使用的微生物在线生物信息分析系统。 结果 构建了包含引物设计、序列比对和进化树构建、数据统计、图形展示四类共15种常用生物信息分析功能的微生物在线生物信息分析系统,实现了通过浏览器进行病原微生物序列数据在线分析及疫情溯源。 结论 通过构建基于浏览器/服务器模式的微生物在线生物信息分析系统,可为疾病预防控制工作者提供方便快捷的生物信息分析服务,加快病原微生物序列数据的深度挖掘和疫情溯源,提高应对突发疫情的反应速度。

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  • 收稿日期:  2012-02-09
  • 刊出日期:  2012-04-20
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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