可变数目串联重复序列在宁波地区结核分枝杆菌基因分型研究中的应用

车洋 于梅 纪威

引用本文: 车洋, 于梅, 纪威. 可变数目串联重复序列在宁波地区结核分枝杆菌基因分型研究中的应用[J]. 疾病监测, 2012, 27(7): 569-572. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.7.020 shu
Citation:  CHE Yang, YU Mei and JI Wei. Application of variable number tandem repeats in genotyping of Mycobacterium tuberculosis strains in Ningbo[J]. Disease Surveillance, 2012, 27(7): 569-572. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.7.020 shu

可变数目串联重复序列在宁波地区结核分枝杆菌基因分型研究中的应用

摘要: 目的 应用可变数目串联重复序列(VNTR)分子分型技术,对宁波地区138株肺结核临床分离株进行分型研究,探讨宁波地区结核菌株DNA多态性和基因型特征。 方法 根据文献选取7个分型效果较好的VNTR基因位点,应用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,分析结核分枝杆菌DNA多态性。 结果 共对138株结核分枝杆菌的7个VNTR位点进行了检测,共产生7个基因簇和123个独立基因型,成簇率为5.8%,VNTR-7位点基因分型技术分辨率指数(HGI)为0.9991,VNTR-3820位点的多态性最高。 结论 宁波地区的结核分枝杆菌存在较高的基因多态性,且VNTR-7位点基因分型技术有较高的分辨力,适用于宁波地区结核病分子流行病学研究。

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  • 收稿日期:  2012-05-14
  • 刊出日期:  2012-07-20
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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