2009-2012年浙江省湖州市甲3亚型流行株基因特性分析

徐德顺 纪蕾 陈莉萍 吴晓芳

引用本文: 徐德顺, 纪蕾, 陈莉萍, 吴晓芳. 2009-2012年浙江省湖州市甲3亚型流行株基因特性分析[J]. 疾病监测, 2013, 28(1): 20-24. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.1.007 shu
Citation:  XU De-shun, JI Lei, CHEN Li-ping and WU Xiao-fang. Genetic characteristics of influenza A3 virus circulated in Huzhou, 2009-2012[J]. Disease Surveillance, 2013, 28(1): 20-24. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.1.007 shu

2009-2012年浙江省湖州市甲3亚型流行株基因特性分析

摘要: 目的 分析2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒主要抗原基因血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子变异特征。 方法 选择浙江省湖州市2009-2012年流感流行期间分离的甲3亚型代表株11株,提取病毒RNA,扩增HA1和NA基因,进行序列测定,用MegAlign软件分析处理。 结果 湖州市近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987 bp,编码329个氨基酸;在NA区的核苷酸长度为1362 bp,编码454个氨基酸。2009-2012年甲3亚型流感病毒分离株HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在94.7%~99.9%与96.2%~100.0%之间,HA1区的变异较NA区更大。4个流感流行期分离的甲3亚型流感毒株相比HA和NA发生了多个氨基酸位点的替换。此外,近几年来世界卫生组织推荐的甲3亚型流感疫苗株与当年的流感流行株之间存在一定的差异。 结论 2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒流行株发生明显变异,基因重配和抗原漂移是病毒发生变异的主要机制。

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  • 收稿日期:  2012-08-30
  • 刊出日期:  2013-01-20
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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