内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析

苏云开 余琴 吕冰 马岩 连璐璐 杨晓敏 董海燕 刘耀 赵秀芹 吴移谋 万康林

引用本文: 苏云开, 余琴, 吕冰, 马岩, 连璐璐, 杨晓敏, 董海燕, 刘耀, 赵秀芹, 吴移谋, 万康林. 内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析[J]. 疾病监测, 2013, 28(4): 260-264. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.4.004 shu
Citation:  SU Yun-kai, YU Qin, LV Bing, MA Yan, LIAN Lu-lu, YANG Xiao-min, DONG Hai-yan, LIU Yao, ZHAO Xiu-qin, WU Yi-mou and WAN Kang-lin. Polymorphism of variable number tandem repeat gene of Mycobacterium tuberculosis isolates from Inner Mongolia[J]. Disease Surveillance, 2013, 28(4): 260-264. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.4.004 shu

内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析

摘要: 目的 了解内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株的串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)基因多态性和VNTR基因型构成,及不同VNTR位点在该地区结核分枝杆菌基因分型中的应用。 方法 从内蒙古自治区结核病防治研究所收集临床分离的结核分枝杆菌菌株及其病例背景资料,采用多位点串联重复序列分析(MLVA)对收集的菌株进行22个VNTR 位点分析,计算Hunter-Gaston 指数(HGDI),分析各个位点的分辨率, 同时用BioNumerics 软件对VNTR结果进行聚类分析。且统计学分析民族与主要基因型间的关系。 结果 372株菌共分为308个基因型,47簇,261个独特基因型,成簇率为17.20%。22个VNTR位点的基因多态性存在较大的差异,位点VNTR3820(HGDI 0.838)的分型分辨能力最高,MIRU23(HGDI 0.068)和MIRU27(HGDI 0.083)分型分辨能力较差。随着VNTR 位点的增加,分型的分辨能力也有所提高。Ⅰ群基因型菌株与民族易感性的分析表明,汉族与蒙古族间Ⅰ群基因型菌株分布差异无统计学意义(χ2=0.337, P=0.561>0.05)。 结论 内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,不同VNTR位点在内蒙古地区结核分枝杆菌中具有不同的分辨能力。且Ⅰ群基因型为该地区主要流行株,而Ⅰ群基因型菌株与民族易感性间无关联。

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  • 收稿日期:  2013-01-09
  • 刊出日期:  2013-04-20
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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