中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征

赵盼 朱兵清 张艾煜 徐丽 高源 余建兴 邵祝军

引用本文: 赵盼, 朱兵清, 张艾煜, 徐丽, 高源, 余建兴, 邵祝军. 中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征[J]. 疾病监测. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.06.011 shu
Citation:  Pan Zhao, Bingqing Zhu, Aiyu Zhang, Li Xu, Yuan Gao, Jianxing Yu and Zhujun Shao. Distribution characteristics of capsule locus of Neisseria meningitidis clonal complex 4821 in China[J]. Disease Surveillance. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.06.011 shu

中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征

    作者简介: 赵盼,女,山西省临汾市人,在读博士研究生,主要从事脑膜炎奈瑟菌的研究工作,Email:zhaopanzg@163.com;
    通信作者: 邵祝军, shaozhujun@icdc.cn
  • 基金项目: 国家科技重大专项(No.2018ZX10101002-001);国家自然科学基金(No. 81602903)

摘要: 目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。 D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。 荚膜基因簇存在基因反转现象。结论Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。

English

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  • 图 1  脑膜炎奈瑟菌CC4821荚膜基因簇ACE区序列差异

    Figure 1.  Nucleotide divergence among the regions ACE of the cps of CC4821 N.meningitidis strains

    图 2  脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇重组事件示意图

    Figure 2.  Recombination of capsular locus of N. meningitidis strains

    图 3  脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇及附近基因排布

    Figure 3.  Gene array of the cps and flanking sequence of N. meningitidis strains

    表 1  脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇D和D′区差异性分析

    Table 1.  Divergence within region D and D′ of capsular locus of N. meningitidis strains

    菌株
    编号
    D区(bp)D′区(bp)长度(bp)重复区核苷酸差异(%)
    起点a终点起点终点
    FAM18 87 338118738220323294 0.9
    231003 46 342417927213053379 0.2
    341216 3882 722121803251423339 1.4
    441301 3882 708722625258303205 1.7
    210713b120121342332526339371411 0.4
    134201454331272323951123 7.0
    14777151953072031138 41818.2
    360624c13594137193400234127 12513.6
    14019141943353333708 17514.3
    14475150893264833262 61418.2
    15561160903162732156 529 9.5
      注:a. 参考菌株FAM18的2个重复区分别位于全基因组的56 138~59 432 bp和74 789~78 083 bp;b. 重复区间序列差异分别为100.0%和62.7%;c. 重复区间序列差异分别为30.8%、52.3%和31.5%
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  • 通信作者:  邵祝军, shaozhujun@icdc.cn
  • 收稿日期:  2020-04-24
  • 网络出版日期:  2020-06-11
  • 刊出日期:  2020-06-01
通信作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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