Population division and prevention and control situation of rabies virus in Hunan Province
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摘要:
目的 更新湖南省流行的狂犬病病毒（RABV）种群类型及进化特征，分析研判湖南省狂犬病疫情防控形势。 方法 对湖南省2012—2017年收集的犬脑组织标本采用直接免疫荧光法或者反转录聚合酶链式反应法进行检测，对阳性标本进行N基因全序列（1 353 bp）测定及序列同源性分析，并与我国7个RABV种群的代表株一起进行系统发育分析。 结果 新测的25株湖南省RABV毒株的N基因核苷酸同源性为91.9%～100%，氨基酸同源性为83.6%～100%；种群划分结果显示其中84%（21/25）的毒株为China Ⅰ群，4株为China Ⅱ群，未监测到2010年前在湖南流行的China Ⅲ群和China V群。 结论 湖南省RABV流行种群类型未增加，且局限于我国两个主要的犬源种群。 切实加强犬的管理，尤其是农村犬的管理和免疫工作，才能进一步控制湖南省狂犬病疫情。 Abstract:Objective To update the population types and evolutionary characteristics of rabies virus (RABV) circulating in Hunan Province, and to analyze and judge the situation of rabies epidemic prevention and control in Hunan Province. Methods The canine brain tissue specimens collected in Hunan Province from 2012 to 2017 were detected by direct immunofluorescence and reverse transcription polymerase chain reaction. The positive specimens were tested for the full sequence of N gene (1 353 bp) and sequence homology. Analyze and conduct phylogenetic analysis together with the representative strains of 7 RABV populations in China. Results The N gene nucleotide homology of the 25 newly tested RABV strains in Hunan Province was 91.9%–100%, and the amino acid homology was 83.6%–100%; the results of population division showed that 84% (21/25) of the virus strains are ChinaⅠgroup, 4 strains are China Ⅱgroup, China Ⅲ group and China V group prevalent in Hunan before 2010 have not been detected. Conclusion The type of rabies virus epidemic population in Hunan Province has not increased, and it is limited to the two main canine populations in China. Only by effectively strengthening dog management, especially the management and immunization of rural dogs, can the rabies epidemic in Hunan Province be further controlled. -
Key words:
- Rabies /
- Rabies virus /
- Hunan /
- Molecular epidemiology /
- Lineage
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图 1 湖南省狂犬病病毒种群地域分布
注：该图基于国家测绘地理信息局标准地图服务网站下载的标准地图制作，底图无修改。审图号湘S（2020）037号
Figure 1. Geographic distribution of rabies virus lineages in Hunan Province
图 2 湖南省狂犬病病毒株及中国不同种群毒株 N 基因种系发生树
注： Δ. 种群代表株，名称由“GenBank号 毒株编号”组成。新测毒株信息由“毒株编号/省 市”组成
Figure 2. Phylogenetic tree based on N genes of rabies virus strains from Hunan and in different lineages in China
表 1 湖南省25份阳性犬脑标本背景和种群信息
Table 1. Background and lineages information of 25 positive dog brain specimens in Hunan Province
序号 检测编号 地区 城区/农村 种群 年份 来源（伤人犬） 1 CHN1201D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2012 是 2 CHN1210D 常德市汉寿县 农村 China Ⅰ 2012 不详 3 CHN1301D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2013 是 4 CHN1302D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2013 是 5 CHN1303D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2013 是 6 CHN1305D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2013 是 7 CHN1307D 益阳市安化县 农村 China Ⅰ 2013 是 8 CHN1308D 益阳市安化县 农村 China Ⅱ 2013 是 9 CHN1309D 湘西自治州凤凰县 农村 China Ⅰ 2013 是 10 CHN1311D 娄底市双峰县 农村 China Ⅱ 2013 是 11 CHN1313D 邵阳市邵东县 农村 China Ⅱ 2013 是 12 CHN1314D 株洲市茶陵县 农村 China Ⅰ 2013 是 13 CHN1402D 常德市汉寿县 农村 China Ⅰ 2014 是 14 CHN1403D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2014 是 15 CHN1410D 怀化市溆浦县 农村 China Ⅰ 2014 是 16 CHN1501D 张家界市桑植县 农村 China Ⅰ 2014 不详 17 CHN1506D 永州市江永县 农村 China Ⅰ 2015 否 18 CHN1604D 湘西自治州泸溪县 农村 China Ⅰ 2016 是 19 CHN1609D 衡阳市横山县 农村 China Ⅰ 2016 是 20 CHN1702D 郴州市嘉禾县 农村 China Ⅱ 2017 是 21 CHN1703D 长沙市望城区 城区 China Ⅰ 2017 是 22 CHN1704D 娄底涟源市 城区 China Ⅰ 2017 是 23 CHN1706D 长沙浏阳市 城区 China Ⅰ 2017 是 24 CHN1707D 长沙浏阳市 城区 China Ⅰ 2017 是 25 CHN1709D 岳阳市岳阳县 农村 China Ⅰ 2017 是 
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