2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠市住院患儿呼吸道人腺病毒感染情况及基因特征分析

王璐璐, 宗可鑫, 程迁, 陈鑫玥, 段婷, 宫悦, 宋芹芹, 宋娟, 韩俊, 杜海军, 陆国玉

王璐璐, 宗可鑫, 程迁, 陈鑫玥, 段婷, 宫悦, 宋芹芹, 宋娟, 韩俊, 杜海军, 陆国玉. 2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠市住院患儿呼吸道人腺病毒感染情况及基因特征分析[J]. 疾病监测, 2024, 39(9): 1127-1134. DOI: 10.3784/jbjc.202310230554
引用本文: 王璐璐, 宗可鑫, 程迁, 陈鑫玥, 段婷, 宫悦, 宋芹芹, 宋娟, 韩俊, 杜海军, 陆国玉. 2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠市住院患儿呼吸道人腺病毒感染情况及基因特征分析[J]. 疾病监测, 2024, 39(9): 1127-1134. DOI: 10.3784/jbjc.202310230554
Wang Lulu, Zong Kexin, Cheng Qian, Chen Xinyue, Duan Ting, Gong Yue, Song Qinqin, Song Juan, Han Jun, Du Haijun, Lu Guoyu. Infection status and genetic characteristics of respiratory human adenovirus in hospitalized children in Bengbu, Anhui, October 2022−June 2023[J]. Disease Surveillance, 2024, 39(9): 1127-1134. DOI: 10.3784/jbjc.202310230554
Citation: Wang Lulu, Zong Kexin, Cheng Qian, Chen Xinyue, Duan Ting, Gong Yue, Song Qinqin, Song Juan, Han Jun, Du Haijun, Lu Guoyu. Infection status and genetic characteristics of respiratory human adenovirus in hospitalized children in Bengbu, Anhui, October 2022−June 2023[J]. Disease Surveillance, 2024, 39(9): 1127-1134. DOI: 10.3784/jbjc.202310230554

2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠市住院患儿呼吸道人腺病毒感染情况及基因特征分析

基金项目: 国家重点研发计划(No. 2022YFC2602402);国家病原微生物资源库(No. NPRC-32);传染病预防控制国家重点实验室发展基金(No. 2011SKLID104)
详细信息
    作者简介:

    王璐璐,女,河南省周口市人,硕士研究生,主要从事呼吸道病毒研究工作,Email:272158913@qq.com

    通讯作者:

    杜海军,Tel:13520576124,Email:duhj@ivdc.chinacdc.cn

    陆国玉,Tel:13033013637,Email:1359112431@qq.com

  • 中图分类号: R211;R373.1

Infection status and genetic characteristics of respiratory human adenovirus in hospitalized children in Bengbu, Anhui, October 2022−June 2023

Funds: This study was supported by the National Key Research and Development Program of China (No. 2022YFC2602402), National Pathogen Resource Center (No. NPRC-32) and State Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control Development Grant (No. 2011SKLID104)
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  • 摘要:
    目的 

    研究2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠市儿童急性呼吸道感染中人腺病毒(HAdV)感染情况和基因进化分析,为呼吸道病毒感染性疾病的防控提供基础数据和科学依据。

    方法 

    以2022年10月至2023年6月蚌埠市某三甲医院收集的589份急性儿童呼吸道感染住院的儿童病例为研究对象,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)方法对15种呼吸道病毒进行检测。 使用Hep-2细胞对HAdV阳性样本进行病毒分离。 使用普通PCR方法扩增HAdV的Hexon基因Loop2高变区域,初步鉴定HAdV分离株的型别;再扩增Hexon基因和Fiber基因,进行基因组进化特征分析。

    结果 

    589份急性呼吸道感染病例咽拭子样本中共检出病毒阳性184份,检出率为31.24%。 HAdV核酸阳性80份(13.58%),其中单一感染63份(78.75%),双重感染16份(20.00%),三重感染1份(1.25%)。 80例HAdV阳性病例中,男女性别差异无统计学意义;在不同年龄组中,检出率最高的年龄组为6月龄至2岁组(21.67%)。 HAdV阳性患者中临床诊断为肺炎的占56.25%(重症肺炎占22.50%),其次为上呼吸道感染(30.00%)。 分离的30株HAdV毒株以HAdV-C1型为主,共24株,HAdV-C2型3株,HAdV-C57型2株,HAdV-C5型1株。

    结论 

    HAdV是引起2022年10月至2023年6月蚌埠市儿童呼吸道感染的重要病原体,6月龄至2岁婴幼儿为主要感染人群,临床诊断以肺炎为主,应加强对HAdV的监测和防治。

    Abstract:
    Objective 

    To analyze the infection status and genetic evolution of human adenovirus (HAdV) in children with acute respiratory tract infections in Bengbu, Anhui province, from October 2022 to June 2023, and provide basic data and scientific evidence for the prevention and control of respiratory tract viral diseases.

    Methods 

    A total of 589 throat swab were collected from hospitalized children with acute respiratory infection in a grade Ⅲ hospital in Bengbu from October 2022 to June 2023 for the detections of 15 common respiratory viruses by quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), and Hep-2 cells was used for HAdV isolation in HAdV positive samples. The Loop2 hypervariable region of HAdV Hexon gene was amplified by PCR to identify the type of HAdV isolates. Hexon gene and Fiber gene were amplified to analyze the characteristics of genome evolution of HAdV.

    Results 

    A total of 184 virus-positive samples were detected in 589 throat swabs from acute respiratory infection cases, and the detection rate was 31.24%. HAdV nucleic acid was detected in in 80 positive samples (13.58%), including 63 samples which were only positive for HAdV (78.75%), 16 samples which were positive for HAdV and other 1 virus (20.00%) and 1 sample which was positive for HAdV and other 2 viruses (1.25%). There was no significant difference in HAdV positive rate between boys and girls. In the different age groups, the highest detection rate was in age group 6 months - 2 years (21.67%). The main clinical diagnosis was pneumonia (56.25%), and severe pneumonia accounted for 22.50%, followed by upper respiratory tract infection (30.00%). In 30 HAdV isolates, 24 were HAdV-C1, 3 were HAdV-C2, 2 were HAdV-C57 and 1 was HAdV-C5.

    Conclusion 

    HAdV is an important pathogen of acute respiratory tract infection in children in Bengbu from October 2022 to June 2023, and the infection cases were mainly infants or young children aged 6 months - 2 years. Pneumonia was mainly diagnosed. The surveillance and prevention of HAdV infection should be strengthened.

  • 急性呼吸道感染是全球范围内儿童及婴幼儿发病和死亡的主要原因,80%的急性呼吸道感染可由病毒引起1。其中人腺病毒(human adenovirus,HAdV)是儿童呼吸道感染的重要病原体之一,HAdV可侵犯儿童上、下呼吸道,引起扁桃体炎、喉炎、支气管炎和肺炎等呼吸道疾病2,常见的临床表现为发热、咳嗽、流涕和胸闷不适等,严重者可导致患儿呼吸衰竭进而危及性命。据报道HAdV感染占儿童呼吸道疾病的2.00%~5.00%,占儿童肺炎的4.00%~10.00%3,可在全球范围内传播,并引起暴发疫情。在国内外都有HAdV相关的疫情报道47,引起人们的广泛关注。

    HAdV是一种无包膜的线性双链DNA病毒,基因组全长在26 kb~45 kb之间,衣壳呈正二十面体对称结构8,最早于1953年由Rowe等9发现。HAdV衣壳上含有六联体蛋白(Hexon)、纤维蛋白(Fiber)、五联体蛋白(Penton)以及一些小分子蛋白。Hexon是HAdV衣壳上的主要组成蛋白10,它的高变结构环(Loop1和Loop2)含有特异性的血清抗原决定簇,因此可通过测定此高变区进行HAdV的初步鉴定及分型11。Fiber蛋白具有血凝特性和可决定HAdV型别的特异性抗原表位,在HAdV分型中起着重要的作用12。由于HAdV易发生重组,通常通过扩增Hexon和Fiber基因序列的全长,进一步确定HAdV的型别10。迄今为止,根据其生物学特性和遗传特征将HAdV分为A~G共7个亚属13。既往研究表明,各血清型的HAdV由于不同的组织噬性,可感染机体各类组织细胞,从而引起多系统疾病14,导致相应的临床症状。B、C和E亚属最常引起呼吸道疾病,D亚属型别多,可引起角膜和结膜感染,以及泌尿系统感染15,A、F和G亚属通常可引起以腹泻为主的胃肠道症状16。人群对HAdV普遍易感,多数免疫功能正常的患者常表现为轻中度自限性疾病,但对于婴幼儿及免疫功能低下的患儿,可能危及生命17。因此,本研究通过分析2022-2023年安徽省蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童病毒感染情况、临床特征及HAdV的基因特征,为儿童呼吸道病毒感染性疾病防控提供数据支持和科学参考。

    本研究选取2022年10月至2023年6月安徽省蚌埠医学院第一附属医院因急性呼吸道感染住院的儿童病例作为研究对象,包括上呼吸道感染和下呼吸道感染病例,以上病例均为新型冠状病毒核酸阴性。依据研究方案设置以下纳入标准:①患者年龄≤16岁;②符合急性感染的症状(至少符合下列中的一项):发热,寒战,白细胞分布或计数异常(升高或降低);③呼吸道临床症状(至少符合下列中的一项):咳嗽咳痰,流涕,咽、喉水肿或发痛,呼吸音异常(干湿啰音、喘鸣音、支气管呼吸音),胸闷胸痛等。同时进行病例样本人口学信息、流行病学信息和临床信息的采集。

    本研究使用鲲鹏全自动核酸提取仪器(鲲鹏科技有限公司)及Baypure通用型磁珠法病毒快速提取试剂盒(湾区生物科技有限公司)提取咽拭子样本核酸,将提取好的核酸分装后置−80 ℃冰箱保存。根据文献[18]合成检测15种呼吸道病毒的探针、引物,包括12种RNA病毒:呼吸道合胞病毒、鼻病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型)、偏肺病毒、冠状病毒(OC43、NL63、229E和HKU1);3种DNA病毒:HAdV、博卡病毒和B19病毒。分别使用GoldStar Probe One Step RT-qPCR Kit和GoldStar Probe Mixture(均为康为世纪生物有限公司)对呼吸道RNA病毒和DNA病毒进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测,以上操作过程均严格按照说明书步骤进行。

    本研究使用Hep-2细胞进行HAdV的分离培养。将上述采用qPCR方法筛选出的HAdV阳性咽拭子样本,经12 000 r/min 10 min离心处理后,取150 µL咽拭子上清液接种在长成80%~90%的单层Hep-2细胞的细胞培养试管内,置于37 ℃ 5% CO2的孵箱中培养,每日观察细胞病变。病变的细胞将会变大变圆,相邻的细胞之间出现空隙,细胞聚集成团如葡萄状。当80%~100%的细胞出现病变效应时及时收获,未出现病变的样本在放置5~7 d或大面积细胞脱落后收取,反复冻融三次后盲传三代,最后将第三次病毒分离液再次进行qPCR检测。反应条件:95 ℃ 10 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40个循环。

    根据参考文献[19]合成引物,使用PCR方法对HAdV分离株的Hexon基因Loop2区域进行扩增,反应条件:94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35个循环;72 ℃ 10 min。扩增产物长度为613 bp。将测序结果在美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)上经过局部序列比对算法搜索工具(Basic Local Aligment Search Tool,BLAST)对比后,初步确定HAdV型别。根据参考文献[2021]合成引物,分别扩增HAdV分离株的Hexon和Fiber靶基因序列全长,进一步确定HAdV型别。反应条件:94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35个循环;72 ℃ 10 min。上述1.4步骤中实验所用试剂为2XEs Taq MasterMix(Dye)(康为世纪生物有限公司),扩增产物均送至北京擎科生物有限公司进行测序。

    使用Sequencher5软件进行序列拼接,从GenBank中下载HAdV各型别原始株和国内外流行株的参考序列,构建HAdV序列数据库。使用MEGA 7.0软件以邻接法和Kimura2-parameter 核苷酸替代模型构建系统进化发育树,将bootstrap值设为1 000,以评价其可靠性。采用BioEdit软件对HAdV分离株Loop2区域的核苷酸和氨基酸序列进行一致性分析。

    使用EpiData 3.1软件录入患者基本人口学信息和病例信息。根据HAdV感染儿童人口学信息对病例进行年龄分组,共分为<6月龄、6月龄至2岁、2~5岁、≥5岁组。使用SPSS 23.0软件进行统计分析,例数和检出率的组间比较用χ2检验,P<0.05为差异有统计学意义。

    2022年10月至2023年6月共收集589份儿童急性呼吸道感染病例样本。病例年龄为0~16岁,中位年龄为2岁。男童有354例,女童有235例,男女性别比为1.51∶1。经qPCR检测,共184份样本检测出一种或一种以上病毒,检出率为31.24%(184/589)。检出率居前3位的病毒分别是HAdV(13.58%,80/589)、呼吸道合胞病毒(10.01%,59/589)和甲型流感病毒(7.97%,47/589)。184份阳性样本中,单一病毒感染164份,双重病毒感染19份,三重病毒感染1份,各种病毒检测结果见表1

    表  1  2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童呼吸道病毒检出情况
    Table  1.  Respiratory virus detection in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023
    感染类型 病毒种类 病例数
    (例)
    检出率
    (%)
    单一感染 腺病毒 63 10.70
    呼吸道合胞病毒 49 8.32
    甲型流感病毒 37 6.28
    乙型流感病毒 6 1.02
    鼻病毒 4 0.68
    冠状病毒OC43 3 0.51
    Ⅰ型副流感病毒 1 0.17
    Ⅲ型副流感病毒 1 0.17
    双重感染 腺病毒+甲型流感病毒 8 1.36
    腺病毒+呼吸道合胞病毒 6 1.02
    腺病毒+鼻病毒 2 0.34
    呼吸道合胞病毒+鼻病毒 1 0.17
    甲型流感病毒+呼吸道合胞病毒 1 0.17
    甲型流感病毒+乙型流感病毒 1 0.17
    三重感染 腺病毒+呼吸道合胞病毒+鼻病毒 1 0.17
     合计 184 31.24
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    在80例HAdV阳性病例中,男童47例,女童33例,不同性别之间的HAdV检出率差异无统计学意义(χ2=0.071,P=0.791)。在各年龄组中,以6月龄至2岁组患儿的检出率最高(21.67%),其次为2~5岁组(13.46%)、≥5岁组(11.33%)、<6月龄组(9.09%),各年龄组HAdV检出率的差异有统计学意义(χ2=9.452,P=0.024)。各年龄组间两两比较显示:<6月龄组和6月龄至2岁组之间差异有统计学意义(χ2=6.875,P=0.009);6月龄至2岁组和≥5岁组间差异有统计学意义(χ2=6.262,P=0.012)(表2)。不同月份中,HAdV检出率居前3位的是6月(25.00%)、2月(20.97%)和5月(20.63%)(图1)。

    表  2  2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例的性别和年龄比较
    Table  2.  Gender and age distributions of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023
     变量 病例数
    (例)
    腺病毒阳性数
    (例)
    检出率
    (%)
    χ2 P
    性别 0.071 0.791
     男性 354 47 13.28
     女性 235 33 14.04
    年龄组 9.452 0.024
     <6月龄 110 10 9.09
     6月龄~2岁 120 26 21.67
     2岁~5岁 156 21 13.46
     ≥5岁 203 23 11.33    
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    图  1  2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例月份分布
    注:HAdV. 人腺病毒。
    Figure  1.  Monthly distribution of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023

    80例HAdV阳性病例中有24例为上呼吸道感染,52例下呼吸道感染,其他诊断4例。其中下呼吸道感染主要包括:肺炎45例(重症肺炎18例),支气管炎7例。在63例HAdV单一感染病例中,19例表现为上呼吸道感染,40例表现为下呼吸道感染,4例为其他诊断。在17例HAdV混合感染病例中,5例表现为上呼吸道感染,12例表现为下呼吸道感染。HAdV单一感染和混合感染所导致的不同临床症状病例数间差异无统计学意义(χ2=8.887,P=0.064)(表3)。在80例HAdV感染患儿中,HAdV感染常见的症状主要有发热(80.00%)、咽部充血(47.50%)、咳嗽(42.50%),最常见的并发症为呼吸衰竭(11.25%)和心肌损害(8.75%)。患儿住院时长为3~17 d,住院天数中位数为7 d(表3)。

    表  3  2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例临床症状分析
    Table  3.  Clinical symptoms of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023
     项目 症状 病例数(例) 占比(%)
    临床诊断 上呼吸道感染 24 30.00
    下呼吸道感染 52 65.00
    其他 4 5.00
    症状和体征 发热 64 80.00
    咽部充血 38 47.50
    咳嗽 34 42.50
    抽搐 16 20.00
    咳痰 13 16.25
    扁桃体肿大 12 15.00
    三凹征 12 15.00
    喘息 10 12.50
    流涕 7 8.75
    呕吐 6 7.50
    腹泻 2 2.50
    并发症 呼吸衰竭 9 11.25
    心肌损害 7 8.75
    心力衰竭 4 5.00
    贫血 3 3.75
    中毒性脑病 2 2.50
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    对80份HAdV阳性样本进行病毒分离,成功分离得到30株HAdV毒株,分离率为37.50%(30/80)。通过PCR方法扩增Hexon基因的Loop2区域并经过BLAST对比,初步确定30株HAdV分离株均属于C亚属,涉及4个血清型,分别为HAdV-C1型24株(分离株编号分别为HAdV-Bengbu/2022-161、162,HAdV-Bengbu/2023-206、253、266、290、307、311、326、354、389、513、515、530、547、549、551、554、559、562、563、566和588),占80.00%,HAdV-C2型3株(分别为HAdV-Bengbu/2023-428、429和430)、HAdV-C57型2株(分别为HAdV-Bengbu/2023-257、387)和HAdV-C5型1株(HAdV-Bengbu/2023-243)(图2)。30株HAdV的序列在各型别内的核苷酸和氨基酸一致性均为100.00%。对30株HAdV进行型别间一致性分析,发现核苷酸一致性为76.90%~100.00%,氨基酸一致性为66.60%~100.00%。

    图  2  2022年10月至2023年6月蚌埠市30株人腺病毒分离株Hexon基因Loop2区域序列进化树
    注:★. 本研究HAdV分离株。
    Figure  2.  Phylogenetic tree of Loop2 region of Hexon gene of 30 human adenovirus strains isolated in Bengbu, October 2022−June 2023

    依据HAdV初步分型结果,分别扩增Hexon和Fiber基因,进一步确定30株HAdV分离株型别。靶基因扩增长度分别为2 872 bp(Hexon)和1 634 bp(Fiber)。从NCBI数据库下载国内外流行株和HAdV-C型各原始株的2个靶基因参考序列,分别构建系统发育树以研究本实验分离株和HAdV-C亚属毒株间的遗传关系。

    基于HAdV-C型毒株Hexon和Fiber基因进化树,结果显示30株HAdV分离株在2基因上聚类模式均一致。表明所有病毒株在2基因上并未发生重组事件。其中,在Hexon基因上,24株HAdV-1型分离株与该型原始株(HAdV-C1-AF534906)核苷酸一致性为99.70%~99.80%,氨基酸一致性为99.40%~99.60%。3株HAdV-2型分离株与该型原始株(HAdV-C2-AC000007)核苷酸一致性为98.50%,氨基酸一致性为97.80%。2株HAdV-57型分离株在Hexon基因上该型原始株(HAdV-C57-HQ003817)核苷酸一致性为99.20%,氨基酸一致性为99.30%。1株HAdV-5型分离株与该型原始株(HAdV-C5-AC000008)核苷酸一致性为98.70%,氨基酸一致性为98.10%(图3)。

    图  3  2022年10月至2023年6月蚌埠市30株人腺病毒分离株的Hexon(A)和Fiber(B)基因系统分析进化树
    注:▲. 本研究HAdV分离株;●. HAdV-C原始株;其余为HAdV-C流行株。
    Figure  3.  Phylogenetic analysis tree of Hexon (A) and Fiber (B) genes of 30 human adenovirus strains isolated in Bengbu, October 2022−June 2023

    在Fiber基因上,24株HAdV-1型分离株与该型原始株(HAdV-C1-AF534906)核苷酸一致性为98.90%~99.70%,氨基酸一致性为97.50%~99.20%。3株HAdV-2型分离株与该型原始株(HAdV-C2-AC000007)核苷酸和氨基酸一致性均为99.70%。2株HAdV-57型分离株与HAdV-6型原始株(HAdV-C6-FJ349096)同源性最高,核苷酸一致性为96.80%,氨基酸一致性为94.00%。1株HAdV-5型分离株与该型原始株(HAdV-C5-AC000008)核苷酸一致性为99.70%,氨基酸一致性为99.50%。

    本研究对589份新型冠状病毒阴性的儿童急性呼吸道感染病例咽拭子样本进行分析,结果显示:15种呼吸道病毒的总检出率为31.24%,其中检出率最高的为HAdV(13.58%),与国内外其他地区差异较明显2224。本研究结果显示6月HAdV检出率最高,而2022年10月至次年1月检出率较低,这与天津市25冬季HAdV检出率低相似,但与北京市26冬春季为HAdV高发期不一致。综上所述,HAdV检出率以及流行期的差异可能与检测方法、研究人群、研究年份和地理位置不同有关27。同时,由于本研究的监测周期相对较短,不能全面反映HAdV在蚌埠地区的流行规律。

    本研究中,6月龄至2岁组患儿的检出率最高(21.67%),其次为2~5岁组、≥5岁组、<6月龄组。低于6月龄婴儿HAdV检出率低可能是由于体内有从母体获得的保护性抗体,且与外界接触较少,降低了HAdV感染的机率28。6月龄至2岁婴儿从母亲体内获得的抗体逐渐减少,并且免疫防御系统发育不完全,增加了HAdV感染的风险。随着年龄的增加,儿童机体防御机制逐渐完善,自我调节能力增强,对HAdV的易感性可能降低29。本研究并未发现HAdV感染的性别差异,这与其他地区报道一致30

    本研究中HAdV感染患儿的主要临床表现为发热、咳嗽伴随咽部充血,还可引起咳痰、抽搐等症状,少数病例表现出呕吐、腹泻等症状。65.00%的患儿可发展为下呼吸道感染,且以肺炎为主。重症肺炎患者易出现呼吸衰竭和心肌损害等并发症,加重患儿呼吸和循环负荷。因此对于诊疗过程中患儿出现呼吸困难及心肌缺氧缺血等症状,应高度重视重症肺炎的发生,以免造成多脏器的损害。在本研究80例HAdV感染病例中,有17例(21.25%)合并感染其他呼吸道病原体。此外,本研究发现HAdV的单一感染和混合感染均能引起患儿上、下呼吸道感染,但两种感染类型在不同病例人数上的差异并无统计学意义。

    本研究分离的30株毒株均属于C亚属,分别为HAdVC-1型24株,HAdVC-2型3株,HAdVC-57型2株,HAdVC-5型1株。HAdVC-1型为优势毒株,与2020-2021年浙江省杭州市31报道的结果一致。但既往研究显示,我国其他地区以B亚属(HAdV-3、HAdV-7)流行为主3235,说明HAdV基因型流行具有一定的地域差异性。但由于本研究部分样本病毒载量较低导致病毒分离率仅占37.50%,这可能对该地区HAdV型别流行的分析造成一定的偏倚,后续需进一步完善研究。有研究表示HAdVC-57型的Fiber基因与HAdVC-6型高度相似36,一般认定二者共享Fiber基因,且以HAdVC-6型的形式展现,HAdVC-57型分离株与HAdVC-6型在同一分支,且同源性最高。HAdV-C亚属各型别之间核苷酸一致性为76.90%~100.00%,氨基酸一致性为66.60%~100.00%。说明各型别序列之间有一定的保守性,但是存在变异和重组的可能,提示还需加强对HAdV各型别的监测。

    本研究旨在通过对2022-2023年蚌埠市儿童急性呼吸道病例进行病毒病原谱的检测,并对HAdV致病特征及分子学特征分析。研究表明该地区住院儿童HAdV感染以6月龄至2岁年龄儿童为主,且HAdV感染患儿中肺炎发生率较高,提示应加强对HAdV的监测和防控措施,以防止HAdV感染引起儿童呼吸道重症病例发生。但是本研究还存在一定的局限性,比如样本来源单一、监测时间较短等,对研究结果的分析可能会造成偏差。因此,想要更全面地了解HAdV感染的流行趋势及基因特征还需进行持续监测。

    利益冲突 所有作者均声明不存在利益冲突

  • 图  1   2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例月份分布

    注:HAdV. 人腺病毒。

    Figure  1.   Monthly distribution of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023

    图  2   2022年10月至2023年6月蚌埠市30株人腺病毒分离株Hexon基因Loop2区域序列进化树

    注:★. 本研究HAdV分离株。

    Figure  2.   Phylogenetic tree of Loop2 region of Hexon gene of 30 human adenovirus strains isolated in Bengbu, October 2022−June 2023

    图  3   2022年10月至2023年6月蚌埠市30株人腺病毒分离株的Hexon(A)和Fiber(B)基因系统分析进化树

    注:▲. 本研究HAdV分离株;●. HAdV-C原始株;其余为HAdV-C流行株。

    Figure  3.   Phylogenetic analysis tree of Hexon (A) and Fiber (B) genes of 30 human adenovirus strains isolated in Bengbu, October 2022−June 2023

    表  1   2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童呼吸道病毒检出情况

    Table  1   Respiratory virus detection in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023

    感染类型 病毒种类 病例数
    (例)
    检出率
    (%)
    单一感染 腺病毒 63 10.70
    呼吸道合胞病毒 49 8.32
    甲型流感病毒 37 6.28
    乙型流感病毒 6 1.02
    鼻病毒 4 0.68
    冠状病毒OC43 3 0.51
    Ⅰ型副流感病毒 1 0.17
    Ⅲ型副流感病毒 1 0.17
    双重感染 腺病毒+甲型流感病毒 8 1.36
    腺病毒+呼吸道合胞病毒 6 1.02
    腺病毒+鼻病毒 2 0.34
    呼吸道合胞病毒+鼻病毒 1 0.17
    甲型流感病毒+呼吸道合胞病毒 1 0.17
    甲型流感病毒+乙型流感病毒 1 0.17
    三重感染 腺病毒+呼吸道合胞病毒+鼻病毒 1 0.17
     合计 184 31.24
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    表  2   2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例的性别和年龄比较

    Table  2   Gender and age distributions of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023

     变量 病例数
    (例)
    腺病毒阳性数
    (例)
    检出率
    (%)
    χ2 P
    性别 0.071 0.791
     男性 354 47 13.28
     女性 235 33 14.04
    年龄组 9.452 0.024
     <6月龄 110 10 9.09
     6月龄~2岁 120 26 21.67
     2岁~5岁 156 21 13.46
     ≥5岁 203 23 11.33    
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    表  3   2022年10月至2023年6月蚌埠市急性呼吸道感染住院儿童中人腺病毒阳性病例临床症状分析

    Table  3   Clinical symptoms of human adenovirus positive cases in hospitalized children with acute respiratory infection in Bengbu, October 2022−June 2023

     项目 症状 病例数(例) 占比(%)
    临床诊断 上呼吸道感染 24 30.00
    下呼吸道感染 52 65.00
    其他 4 5.00
    症状和体征 发热 64 80.00
    咽部充血 38 47.50
    咳嗽 34 42.50
    抽搐 16 20.00
    咳痰 13 16.25
    扁桃体肿大 12 15.00
    三凹征 12 15.00
    喘息 10 12.50
    流涕 7 8.75
    呕吐 6 7.50
    腹泻 2 2.50
    并发症 呼吸衰竭 9 11.25
    心肌损害 7 8.75
    心力衰竭 4 5.00
    贫血 3 3.75
    中毒性脑病 2 2.50
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出版历程
  • 收稿日期:  2023-10-22
  • 网络出版日期:  2024-08-18
  • 发布日期:  2024-03-19
  • 刊出日期:  2024-09-29

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