新型冠状病毒疑似感染病例下呼吸道病原谱分析

顾琳 宋衍燕 张士尧 郝民 李丽 李倩

顾琳, 宋衍燕, 张士尧, 郝民, 李丽, 李倩. 新型冠状病毒疑似感染病例下呼吸道病原谱分析[J]. 疾病监测. doi: 10.3784/jbjc.202012230431
引用本文: 顾琳, 宋衍燕, 张士尧, 郝民, 李丽, 李倩. 新型冠状病毒疑似感染病例下呼吸道病原谱分析[J]. 疾病监测. doi: 10.3784/jbjc.202012230431
Gu Lin, Song Yanyan, Zhang Shiyao, Hao Min, Li Li, Li Qian. Pathogen spectrum in lower respiratory tracts of suspected case infected with SARS-CoV-2[J]. Disease Surveillance. doi: 10.3784/jbjc.202012230431
Citation: Gu Lin, Song Yanyan, Zhang Shiyao, Hao Min, Li Li, Li Qian. Pathogen spectrum in lower respiratory tracts of suspected case infected with SARS-CoV-2[J]. Disease Surveillance. doi: 10.3784/jbjc.202012230431

新型冠状病毒疑似感染病例下呼吸道病原谱分析

doi: 10.3784/jbjc.202012230431
详细信息
    作者简介:

    顾琳,女,山东省烟台市人,硕士,主管技师,主要从事病原微生物检验工作

    通讯作者:

    孙灵利,Tel: 010–67773698,Email: sheguansun@126.com

  • 中图分类号: R211;R51

Pathogen spectrum in lower respiratory tracts of suspected case infected with SARS-CoV-2

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  • 摘要:   目的  了解2020年1 — 3月北京市朝阳区100例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)疑似感染病例的下呼吸道病原谱。  方法  采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time PCR)技术检测疑似病例痰标本中28种呼吸道病原,包括 14种病毒、11种细菌、肺炎支原体、肺炎衣原体、真菌。  结果  100份SARS-CoV-2疑似感染病例痰标本中,所检测病原核酸阳性率为72.00%(72/100),SARS-CoV-2阳性率为15.00%(15/100),革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌、肺炎支原体、肺炎衣原体的阳性率分别为32.00%(32/100)、24.00%(24/100)、39.00%(39/100)、6.00%(6/100)、3.00%(3/100),甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒均有检出。 混合感染(同时检出≥2种病原)的检出率为35.00%(35/100)。 15份SARS-CoV-2阳性标本中混合感染标本13份。  结论  北京市朝阳区2020年1 — 3月的100例SARS-CoV-2疑似感染病例的下呼吸道病原谱多样,以真菌、SARS-CoV-2、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌为主,SARS-CoV-2阳性病例下呼吸道混合感染以金黄色葡萄球菌合并真菌为主。
  • 表  1  100例新型冠状病毒疑似病例的病原检出情况

    Table  1.   Detection of pathogens in 100 suspected cases of COVID-19

     特征病例数(例)阳性病例数(例)
    SARS-CoV-2革兰阳性菌革兰阴性菌真菌非典型肺炎病原体
    性别
     男性6191619233
     女性396813165
     χ20.0070.4260.0520.1102.019
     P0.930.510.820.740.16
    年龄组(岁)
      5~401110
     15~402130
     25~62111719246
     60~73304411112
     χ254.53264.547
     P<0.05a<0.05 a<0.05<0.05<0.05 a
     合计100152432398
      注:–. 无相应值;a. 采用Fisher确切概率法计算
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    表  2  不同病原在100份痰标本中的检出情况

    Table  2.   Pathogens detected in 100 sputum samples

      病原体数量(份)检出率(%)
    病毒2424.00
     SARS-CoV-21515.00
     甲型流感病毒22.00
     乙型流感病毒33.00
     腺病毒11.00
     呼吸道合胞病毒11.00
     鼻病毒22.00
    细菌5656.00
     流感嗜血杆菌1212.00
     肺炎克雷伯菌77.00
     阴沟肠杆菌66.00
     百日咳杆菌11.00
     大肠埃希菌11.00
     铜绿假单胞菌22.00
     鲍曼不动杆菌33.00
     溶血性链球菌11.00
     金黄色葡萄球菌2020.00
     肺炎链球菌33.00
    真菌3939.00
    非典型肺炎病原体99.00
     肺炎支原体66.00
     肺炎衣原体33.00
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    表  3  新型冠状病毒阳性病例中病原体的混合感染情况

    Table  3.   Co-infection of pathogens in SARS-CoV-2 positive cases

      混合感染病原体例数构成比
    (%)a
    金黄色葡萄球菌16.67
    鲍曼不动杆菌16.67
    肺炎克雷伯菌16.67
    真菌533.33
    金黄色葡萄球菌+真菌16.67
    流感嗜血杆菌+真菌16.67
    百日咳杆菌+支原体16.67
    金黄色葡萄球菌+肺炎链球菌+流感嗜血杆菌16.67
    鼻病毒16.67
      注:a. 新型冠状病毒阳性病例混合感染例数/新型冠状病毒阳性病例数×100%
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  • 收稿日期:  2020-12-23
  • 网络出版日期:  2021-04-26

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