一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

康倩 王雪莹 吕彩霞 汪鹏 张慧敏 于德山

康倩, 王雪莹, 吕彩霞, 汪鹏, 张慧敏, 于德山. 一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析[J]. 疾病监测.
引用本文: 康倩, 王雪莹, 吕彩霞, 汪鹏, 张慧敏, 于德山. 一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析[J]. 疾病监测.
Kang Qian, Wang Xueying, Lyu Caixia, Wang Peng, Zhang Huimin, Yu Deshan. Molecular etiologic investigation of an acute gastroenteritis epidemic caused by multi genotype norovirus in a university in Gansu[J]. Disease Surveillance.
Citation: Kang Qian, Wang Xueying, Lyu Caixia, Wang Peng, Zhang Huimin, Yu Deshan. Molecular etiologic investigation of an acute gastroenteritis epidemic caused by multi genotype norovirus in a university in Gansu[J]. Disease Surveillance.

一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

基金项目: 省青年科技基金计划(No. 20JR5RA140);国家科技重大专项(No. 2017ZX10103006)
详细信息
    作者简介:

    康倩,女,甘肃省临夏市人,大学本科,主管技师,主要从事病原微生物检验,Email:kq1013@126.com

    王雪莹,女,甘肃省天水市人,大学本科,技师,主要从事病原微生物检验,Email:1146852957@qq.com

    通讯作者:

    于德山,Tel:0931-4675392,Email:gscdc123@163.com

  • 中图分类号: R211;R512.5

Molecular etiologic investigation of an acute gastroenteritis epidemic caused by multi genotype norovirus in a university in Gansu

Funds: This study was supported by fund for Youth Science and Technology Fund Scheme of Gansu Province (No.20JR5RA140), National Science and Technology Major Project (No.2017ZX10103006)
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  • 摘要:   目的   分析2020年一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒基因特征,为加强学校诺如病毒感染暴发疫情防控提供依据。  方法  收集2020年9月2-10日甘肃省某高校一起诺如病毒感染暴发疫情中有呕吐腹泻症状在校人员的232份粪便标本,初步采用实时荧光PCR法进行初筛和基因组鉴定,随后采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如阳性标本扩增,对Ct值小于37的扩增产物进行部分聚合酶区和衣壳区序列测定,采用MEGA-X 软件以邻接法构建系统进化树并进行遗传进化分析。  结果   2020年该高校急性胃肠炎暴发疫情涉及患者的症状体征以腹泻(92.55%)、腹痛(88.94%)、呕吐(87.66%)和恶心(78.09%)等为主,由诺如病毒GⅠ、GⅡ型混合感染引起,232份粪便标本中诺如病毒检出率77.59%(180/232),其中GⅠ检出率16.38%(38/232),GⅡ检出率44.83%(104/232),GⅠ、GⅡ混合感染16.38%(38/232)。截止2020年9月10日18:00,共有470名学生发病,就诊以轻症患者居多,其中33人入院观察治疗。测序结果显示该疫情基因型别为GI.3[P10]、GⅠ.3[P13]、GI.5[P4]、GII.10[P16]、GⅡ.17[P17]、GII.22[PNA5]、GIX.1[GII.P15]。  结论   该高校急性胃肠炎疫情中诺如病毒病原基因型呈现7个型别,前3位依次为GII.22[PNA5]、GⅠ.3[P13]、GIX.1[GII.P15],需进一步加强我省诺如病毒病原监测水平及基因型分析工作。
  • 图  1  2020 年兰州市A大学诺如病毒 G疫情病毒聚合酶区–衣壳区基因系统发生树

    注:▲. 病例样本 ●. 食堂从业人员样本 □甘肃省兰州市本地2018、2019年诺如病毒代表株

    Figure  1.  Phylogenetic analysis based on RdRp and VP1 region sequences of norovirus G strains in A university in Lanzhou, 2020

    图  2  2020 年兰州市A大学诺如病毒 G疫情病毒聚合酶区–衣壳区基因系统发生树

    注:▲. 病例样本 ●. 食堂从业人员样本 □甘肃省兰州市本地2018、2019年诺如病毒代表株

    Figure  2.  Phylogenetic analysis based on RdRp and VP1 region sequences of norovirus G strains in A university in Lanzhou, 2020

    表  1  2020年兰州市某大学一起诺如病毒引起急性胃肠炎疫情病原检测结果

    Table  1.   Pathogen detection results of acute gastroenteritis caused by norovirus in a University of Lanzhou in 2020

    采样
    时间(月—日)
    标本来源检测数阳性数阳性率(%)G1G2G1+G2
    阳性数构成比(%)阳性数构成比(%)阳性数构成比(%)
    9—8学生1616100.0 425.00 637.50 637.50
    9—10学生8972 80.411622.22 3852.781825.00
    9—10食堂4736 76.60 822.22 2055.56 822.22
    9—13食堂3825 65.79 832.00 1664.00 1 4.00
    9—21食堂3224 75.00 2 8.33 2083.34 2 8.33
    9—23食堂 2 2100.0 0 0.00 150.00 150.00
    9—28食堂 8 5 62.50 0 0.00 360.00 240.00
    合计232180 77.593821.1110457.783821.11
      注:食堂指食堂从业人员
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  • 收稿日期:  2021-04-29

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