浙江省丽水市男男性行为人群HIV-1基因亚型和传播特征研究
叶灵, 王晓光, 张佳峰, 陈秀英, 范钦, 叶碧峰, 丛迎, 黄晓蒙
2019,34(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.08.009
目的了解浙江省丽水市男男性行为人群(MSM)人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)基因亚型和传播特征。方法收集丽水市2015-2018年新确证且未经抗病毒治疗MSM HIV-1感染样本,扩增pol基因并测序,构建系统进化树分析基因亚型及成簇特征,通过CPR 6.0在线软件分析耐药情况。结果105例样本成功获得89例合格序列,优势亚型为CRF01_AE(49.4%,44/89)和CRF07_BC(37.1%,33/89),其他包括B和CRF55_01B各3例,CRF08_BC、CRF59_01B和独特重组型 (01_AE/BC)各2例。 发现8个传播簇,总成簇比例为21.3%(19/89),其中7个传播簇与现住址为丽水市莲都区的病例有关(87.5%,7/8)。 发现3例样本存在1个监测性耐药突变,分别为M46I、V106A、K103N,传播性耐药率为3.4%(3/89)。结论丽水市7种MSM HIV-1亚型共存,呈现多元化趋势,莲都区发挥关键传播作用,应加强监测并重点对传播簇病例开展靶向干预。 耐药传播率处于低流行水平。
关键词: 人类免疫缺陷病毒1型, 亚型, 男男性行为人群, 传播特征
2014-2018年浙江省江山市中老年HIV/AIDS的HIV-1亚型和分子簇特征研究
陈旭富, 游佳玲, 张佳峰, 范钦, 姚佳明, 吕磊, 王炜, 王萍, 吴奇
2020,35(8) .
目的 了解浙江省江山市中老年人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者(HIV/AIDS)的HIV亚型分布情况和分子传播簇特征,为该市HIV流行趋势分析和疫情防控提供技术支持。 方法 对江山市2014 — 2018年新诊断的中老年HIV/AIDS开展分子流行病学研究,从94例感染者(含3例暗娼)血浆中提取RNA,通过反转录–聚合酶链式反应和巢式PCR扩增 pol区基因并进行核酸测序,运用MEGA 6.0软件构建Neighbor-Joining系统进化树分析亚型,利用Cytoscape 3.6.0软件对遗传距离≤0.01的序列构建HIV分子簇。 结果 HIV毒株序列成功获得率为86.2%(81/94),毒株亚型以CRF01_AE为主(93.8%,76/81),其余分别为CRF07_BC型3例(3.7%)和B亚型2例(2.5%);共发现3个分子传播簇,均由CRF01_AE亚型构成,总成簇比例为84.0%(68/81),大簇包含64例病例(含1例阳性暗娼),2个小簇均由2例病例组成。 结论 江山市中老年HIV/AIDS亚型以CRF01_AE为主且种类较为单一,存在与阳性暗娼紧密关联的传播簇,应加强对簇内病例的流行病学调查,以便实施有针对性的公共卫生干预。
关键词: 人类免疫缺陷病毒, 毒株亚型, 分子传播簇

在线交流