沙门菌监测点汤卜逊沙门菌分离株的分子分型和耐药性分析
梁未丽, 王洪霞, 周海健, 李志锋, 许学斌3, 李勤2, 张代涛, 陈春霞, 于礼, 闫梅英, 章丽娟, 冉陆, 阚飙
2009,24(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.06.014
目的应用分子分型技术对2007年上海和重庆市沙门菌监测点的50株汤卜逊沙门菌进行分子流行病学分析和抗生素敏感性测定,了解上海和重庆两地菌株的分子分型特征和药物敏感性特征。方法抗生素敏感性测定采用微量肉汤稀释法,分子分型方法包括脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点串联重复序列分析(MLVA)。结果药敏试验显示78%的菌株存在多重耐药,其中磺胺甲恶唑和四环素的耐药率最高,其次是甲氧苄胺嘧啶;对头孢类抗生素(头孢噻肟、头孢三嗪、头孢他啶、头孢噻呋)均未产生耐药性。PFGE将50株菌分为15个带型,30株重庆分离株间有较高的相似性;MLVA分析显示除Sal16位点外,其余检测位点在所有待检菌株中没有差别。结论分子分型支持汤卜逊沙门菌引起的暴发以及散发。目前MLVA分型应用于汤卜逊沙门菌分子分型时,分型能力低于PFGE,需要进一步优化。
关键词: 汤卜逊沙门菌, 脉冲场凝胶电泳, 多位点串联重复序列分析, 分子分型
2006-2012年上海市基于网络实验室的肠炎沙门菌耐药监测
倪佳琳, 许浩, 胡雪明, 钟海明, 张静, 金汇明, 肖文佳, 许学斌, 冉陆, 阚飚, 史贤明, 崔志刚
2013,28(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.5.011
目的 建立区域性网络实验室监测和分析肠炎沙门菌的耐药特征变化为科学防治提供参考依据。 方法 2006-2012年,上海市8个区域公共卫生实验室和24家临床实验室依据标化方法分离184株肠炎沙门菌食源环境菌株与1146株肠炎沙门菌腹泻病例菌株,使用纸片扩散法(K-B法)检测菌株对16种抗生素的耐药性,应用WHONET软件建立耐药数据库。 结果 历年中肠炎沙门菌在禽肉中污染率最高(155/184);实验室诊断病例主要分布在5岁以下和18~59岁、1~4岁病例明显高于1岁以下、60岁以上病例呈逐年上升趋势。所有肠炎沙门菌对萘啶酸耐药率均超过90%;多重耐药株(对氨苄西林-氯霉素-链霉素-磺胺异噁唑-四环素耐药型,ACSSuT)存在于鸡肉和2009年的1例食物中毒暴发病例中;耐头孢吡肟食源和腹泻株分别出现在2011年和2008年;腹泻株对环丙沙星和头孢噻肟的耐药率高于食源株;低年龄组病例对三代头孢和环丙沙星耐药的菌株分别约占2/3和1/2。 结论 上海市肠炎沙门菌腹泻病例存在社区内获得和食源性感染等不同因素,肠炎沙门菌多重耐药型ACSSuT可能是潜在的高致病性流行株。提高临床实验室常规诊断能力,优化和减少老年人和婴幼儿对抗生素暴露,重视多重耐药菌株导致的疾病负担。
关键词: 网络实验室, 肠炎沙门菌, 禽肉, 多重耐药型, 暴发, 疾病负担
上海市蒙得维的亚沙门菌流行特征研究
李勇, 王春, 唐海丰, 王爱敏, 黄峥, 石维敏, 胡雪明, 顾宝柯, 曾玫, 史贤明, 阚飙, 许学斌
2016,31(7) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.07.004
目的 研究蒙得维的亚沙门菌的耐药及分子流行病学特征。方法 基于上海市针对人群和食源、环境沙门菌的监测基线,分析蒙得维的亚腹泻和食源环境株的耐药表型和分子型特征。结果 蒙得维的亚在本地区的人源和食源沙门菌型数据库中列第24位(32株)和32位(13株)。经实验室确诊的28例蒙得维的亚病例均符合食源性感染特征,易感人群为5岁以下儿童和20~60岁男性,城郊地区高发。人源和食源株均发现对三代头孢(头孢他啶)耐药株,近5年中食源株的多重耐药(MDR)明显增多,28.1%的人源株对环丙沙星处于耐药临界值,来自境外动物制品的蒙得维的亚菌株对抗生素多数敏感。32株人源和13株食源株的分型聚类提示存在优势克隆簇,包括3起经回顾性鉴别诊断的蒙得维的亚的成人暴发,其中2起为多重耐药(MDR-ACSSuT)的克隆暴发。MDR-ACSSuT的人源流行株与甲鱼株之间存在高度的遗传同源性,与境外输入菌株间的耐药和分子型特征差异较大,2个不同克隆簇之间存在遗传进化关系。结论 蒙得维的亚尚未在本地区成为优势种型,但其已通过贸易等方式不断输入国内,逐渐定殖于沿海地区的甲鱼养殖产业链和人群的消费食物链中,最终进化成稳定的MDR和非MDR克隆容易形成分散而隐蔽的食源性暴发。
关键词: 蒙得维的亚沙门菌, 分子分型, 多重耐药, 食源性暴发
25株副溶血性弧菌分子流行病学特征分析
苗艳芳, 崔志刚, 王晓影, 王多春, 刁保卫, 黄薇, 孟建彤, 刘红宏, 黎明, 李涛, 阚飙
2010,25(9) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2010.09.008
目的 运用荧光PCR技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对成都市2009年分离的25株副溶血性弧菌进行毒素基因检测和分子分型,分析感染来源。 方法 利用PCR检测副溶血性弧菌分离株耐热直接溶血素(tdh)基因和耐热相关溶血素(trh)基因。用PFGE对菌株进行分型,所得结果用BioNumerics V 4.0软件UPGMA方法进行聚类分析。 结果 所试25株分离菌tdh基因阳性有20株,1株为trh阳性。以SfiⅠ酶切后PFGE分型,25株菌被分成了16个带型,环境分离株菌型分散。 结论 成都市副溶血性弧菌暴发的感染来源复杂,PFGE技术可以对暴发流行中的细菌进行分析鉴定。
关键词: 副溶血性弧菌, 脉冲场凝胶电泳, 分子流行病学
广东省霍乱病例与环境来源霍乱弧菌的
李柏生, 谭海玲, 王多春, 邓小玲, 陈经雕, 王晓梅, 钟豪杰, 柯碧霞, 柯昌文, 阚飙
2009,24(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.05.005
目的比较分析广东省霍乱病例及环境来源O1/O139群霍乱弧菌抗生素敏感性和分子分型特征。方法选取2006-2007年广东省霍乱病例及相关来源、环境(珠江水体和海水产品)来源的O1/O139群霍乱弧菌。采用血清学、药物敏感性试验和分子生物学方法,研究不同来源的霍乱弧菌在菌型分布、药物敏感性、毒素基因携带以及分子分型方面的异同。结果2006-2007年,广东省共分离各类来源O1/O139群霍乱弧菌170株。其中,病例及相关来源菌株37株,环境来源菌株133株(海水产品来源37株、珠江水体96株)。两种来源菌株的菌型构成均以O1群El Tor稻叶型为主;病例及相关来源菌株以产毒株为主,ctxA毒素基因携带率(83.8%)显著高于环境菌株(4.5%);药物敏感性试验显示,以产毒株为主的病例及相关来源菌株对萘啶酸和复方新诺明的耐药率(78.8%,78.8%)高于以非产毒株为主的环境来源菌株(50.6%,13.9%,P0.05)。环境来源菌株对多西环素的耐药率(17.7%)高于病例及相关来源菌株(0%,P0.05)。O139群菌株对氨苄西林的耐药率(70%)高于稻叶型和小川型菌株(8.9%,0%,P0.01)。脉冲场凝胶电泳(PFGE)聚类分析显示,O139群霍乱弧菌产毒株之间,O1群霍乱弧菌流行株之间以及其他的O1/O139群霍乱弧菌之间,PFGE型别表现为明显的遗传多样性。结论广东省O1/O139群霍乱弧菌来源复杂多样,霍乱防控形势严峻,需要密切注意菌株型别变异情况及菌株变异趋势。
关键词: 霍乱弧菌, 药物敏感性试验, 分子分型, ctxA毒素基因, 脉冲场凝胶电泳
沙门菌监测基于细菌学技术的关键点研究和控制
赵冰, 杨兰萍, 黄峥, 陈俊, 钟海明, 金汇明, 肖文佳, 许学斌, 冉陆, 阚飙
2010,25(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2010.06.009
目的 研究和控制沙门菌分离方法的技术关键点,评价监测效果。 方法 用库存菌株和粪便肛拭、食品增菌标本比较5种沙门菌选择性平板分别与3种选择性增菌液配伍检测沙门菌的敏感性;将亚硒酸煌绿增菌液(SBG)与木糖赖氨酸脱氧胆酸盐琼脂平板(XLD)和CHROMagarTM沙门菌显色琼脂平板(CAS)配伍作为方法1在上海市4个疾病预防控制中心(CDC)实验室用于沙门菌监测(GSS);8个临床医院实验室使用SBG-XLD组合的方法2和CDC实验室进行平行检测。 结果 CAS和XLD菌株测试的敏感性为100.0%和85.7%,肛拭标本经SBG增菌后使用CAS和XLD分离的敏感性为94.4%和89.7%。2006 - 2009年GSS监测阳性率在2.6%~3.8%;阳性峰值在5%~7%。临床实验室检测敏感性达到CDC的78.7%,最高为88.9%。 结论 有效增菌是沙门菌分离技术的关键点,强化实验室人员培训和使用统一的分离材料是控制沙门菌监测实施的关键点。方法1适用所有沙门菌的检测;方法2适用非伤寒沙门菌的检测,模块化、可选择的分离组合能兼顾效率和成本。
关键词: 沙门菌, 监测, 细菌学技术, 敏感性, 有效增菌
脉冲场凝胶电泳技术对海南省两起奇异变形杆菌引起的食物中毒分析
吴捷, 刁保卫, 黄昌和, 华德, 符振华, 王帅, 崔志刚, 阚飙
2008,23(10) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.10.646
目的 对2007年7月19和22日发生的两起食物中毒事件中分离到的奇异变形杆菌进行分析,判断暴发原因。方法 对患者和食物样品进行常规分离培养鉴定,分离到的菌株进行PFGE分型比较。结果 自海南定安县食物中毒中采集的患者和食物51份标本分离出14株奇异变形杆菌,澄迈县食物中毒调查中采集的5份患者标本分离出3株奇异变形杆菌。这些菌株经PFGE聚类分析得到8种带型,相似性百分比在28.1%~100.0%之间。定安县分离的14株菌株中有9株菌带型一致,澄迈县暴发分离株中有2株菌带型一致。结论 这两起食物中毒中分别分离的具有相同带型特征的奇异变形杆菌应是引起暴发的原因。
关键词: 脉冲场凝胶电泳, 食物中毒, 奇异变形杆菌
云南省玉溪市甲型副伤寒沙门菌PFGE数据库的建立及其应用
姚颖波, 曾丽萍, 王树坤, 阚飙, 刁保卫, 崔志刚, 吴强, 杨汝松, 刘红雁
2009,24(10) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.10.015
目的建立云南省玉溪市甲型副伤寒沙门菌(SPA)分离株脉冲场凝胶电泳(PFGE)数据库,分析玉溪市各分子型别SPA的流行和分布情况,为本市SPA的监测和疫情的应急处理提供科学依据。方法采用Spe Ⅰ 和 Xba Ⅰ消化细菌染色体,对来自玉溪市6县1区194株SPA分离株进行PFGE分型和聚类分析。结果194株SPA中, Xba Ⅰ带型共有7种,分别为Xba Ⅰ 01、Xba Ⅰ 02、Xba Ⅰ 06、Xba Ⅰ 07、Xba Ⅰ 09、Xba Ⅰ 10、Xba Ⅰ 19,其中Xba Ⅰ 01为优势带型,占93.81%(182/194);Spe Ⅰ带型共有10种,分别为Spe Ⅰ01~10,其中Spe Ⅰ 01、Spe Ⅰ 02为优势带型,各占46.39%(90/194) 和 43.30%(84/194)。比较分析Xba Ⅰ带型和Spe Ⅰ 带型,Spe Ⅰ 酶切比Xba Ⅰ酶切具有更多的带型,主要是Xba Ⅰ 01带型和Xba Ⅰ 02带型可以分为更多的Spe Ⅰ带型,Spe Ⅰ 01和Spe Ⅰ 02带型均来自于Xba Ⅰ 01带型。但是,也有不同的Xba Ⅰ带型归属于相同的Spe Ⅰ带型。结论建立了玉溪市SPA PFGE数据库,Spe Ⅰ酶切数据库与Xba Ⅰ酶切数据库具有较好的一致性。Spe Ⅰ 01和Spe Ⅰ 02或Xba Ⅰ 01是玉溪流行的主要克隆,同时也不容忽视其他分子型别的危害。
关键词: 甲型副伤寒沙门菌, 脉冲场凝胶电泳, 地区分布
阿贡纳沙门菌引起的聚集性腹泻病例监测及分析
曲梅, 张新, 王小莉, 黄瑛, 钱海坤, 刘桂荣, 李伟, 阚飙, 王全意
2013,28(3) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.3.007
目的 应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型技术分析时间上高度集中的散发腹泻病例,发现可能的聚集性,并进行流行病学调查和追溯。 方法 利用已建立的北京市肠道多病原分子分型监测系统,采集腹泻病例粪便标本进行病原菌分离培养、生化鉴定、血清凝集、药敏试验及PFGE分子分型。 结果 2012年5月2-7日连续一周内,从北京市某区(县)肠道门诊采集的22份腹泻病例粪便标本中分离到9株沙门菌,血清学鉴定为阿贡纳沙门菌。XbaⅠ 酶切的PFGE带型一致,与中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络(PulseNet China)中心数据库及各地区网络实验室数据比对分析后,确认该带型为一新的图谱带型,编码为JABX01.CN0072。 结论 9 例阿贡纳沙门菌感染病例的发病时间和地理分布高度集中,且PFGE带型聚集成簇,提示感染菌株具有同一克隆来源。随后的流行病学调查和感染来源分析,虽并未发现共同暴露因素,但说明PFGE技术的应用可以提高监测的敏感性,应长期持续的进行病原菌分子分型监测,进一步完善PulseNet网络和运行机制。
关键词: 脉冲场凝胶电泳, 阿贡纳沙门菌, 监测, 中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络
PulseNetChina网络实验室能力考核结果评价与分析
崔晶花, 杜小莉, 崔志刚, 刁保卫, 娄静, 周海健, 阚飙, 李伟
2011,26(10) .
目的 为促进中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络PulseNet China网络实验室执行技术标准,实现监测技术的统一化、标准化、规模化。 方法 PulseNet China对19个具有脉冲场凝胶电泳(PFGE)设备的省(市)疾病预防控制中心相关实验室开展了分子分型技术考核。 结果 被考核单位中有78.9%的单位通过评价考核,递送的图谱带型经过软件分析得到相似度为100%。 结论 说明这些实验室PFGE技术条件和技术能力已经达到PulseNet China实验室网络化监测的要求。对PFGE考核谱图存在的问题分析了相应原因,提供了可能的解决方案。
关键词: 分子分型, 监测, 实验室网络, 脉冲场凝胶电泳, 实验室能力考核
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