2015年北京一起鼠伤寒沙门菌暴发流行的病原学检测分析
吕冰, 贾蕾, 张新, 曲梅, 张海艳, 严寒秋, 黄瑛, 李洁, 林长缨, 高志勇, 梁志超, 王全意
2016,31(2) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.02.019
2015年5月北京一家大型企业发生聚集性腹泻疫情,流行病学调查后收集现场样本,经过实验室检测确认该次疫情为鼠伤寒沙门菌暴发流行。分离到的18株鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱带型一致,在北京市沙门菌PFGE数据库中未发现相同带型。药物敏感试验结果显示有一株菌株对12种抗生素耐药。这种耐药模式的出现提示需加强耐药监测。
关键词: 鼠伤寒沙门菌, 暴发, 脉冲场凝胶电泳, 耐药
2004-2013年北京市外环境及食品中霍乱弧菌监测结果分析
吴晓娜, 贾蕾, 霍达, 严寒秋, 窦相峰, 钱海坤, 李爽, 李洁, 王全意
2015,30(12) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.12.008
目的 了解北京市外环境及食品中霍乱弧菌污染状况,为人间霍乱疫情防控提供科学依据。方法 2004-2013年,每月均在全市的16个区(县)采集地表水、游泳池水、养殖池水、水产品、熟食、其他等6类样品,分别进行霍乱弧菌培养,对培养结果应用描述流行病学的方法进行分析。结果 2004-2013年养殖池水和其他类别样品的霍乱阳性率最高,分别为1.16%(44/3808)和1.48%(61/4135);游泳池水中未检出霍乱弧菌;外环境疫情在北京市集中在城近郊区,呈环形分布;牛蛙和甲鱼检测阳性率较高,霍乱毒素(cholera toxin, CT)阳性疫情较少,占检测总起数的9.09%(5/55),且均为水产品涂抹疫情。2007年以来,霍乱外环境疫情较少,O139群霍乱弧菌污染呈下降趋势,O1群稻叶型则有所增多。结论 北京市霍乱弧菌污染较轻,且检出菌株也以CT阴性菌株为主,对人体威胁较小。
关键词: 霍乱弧菌, 监测, 外环境, 食品
一起因食用西瓜疑似农药残留量食物中毒事件的调查报告
安军静, 肖贵勇, 张雪, 李洁, 王玉江, 王佳佳, 冯月明, 赵建忠
2014,29(3) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2014.03.018
2013年5月15-18日,陆续有16人因食用西瓜引起胃肠道及神经系统症状,部分患者前往医院就诊。经调查发现患者购买的西瓜多来自同一批发摊位,在部分患者血液及食用剩余西瓜中均检出甲苯、二甲苯。本次事件由食用西瓜引起,患者症状符合有机磷类或氨基甲酸酯类农药中毒症状,但具体由何种物质引起尚不能确证。
关键词: 西瓜, 食物中毒, 调查
2005-2015年浙江省绍兴市布鲁氏菌病流行病学分析
高华强, 孙奇峰, 王吉玲, 李杰, 陈奇峰, 朱茜, 卢巧玲
2017,32(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2017.08.007
目的 分析浙江省绍兴市布鲁氏菌病(布病)发病特征及流行规律,为制定防控策略提供参考依据。方法 根据绍兴市2005-2015年布病监测报告资料,收集确诊的布病病例个案调查表、年度报表等资料,对汇总的资料进行流行病学分析。结果 2005-2015年绍兴市共确诊报告布病病例132例,年报告发病率0.05/10万~0.54/10万之间,男性发病率显著高于女性(2=23.2,P0.01);41~60岁组发病最多,为86例(占65.15%);职业以农民、民工等从事羊屠宰、交易、养殖、运输和加工类人员为主,占80.30%;3-8月是发病高峰季节,发病例数占总病例数的71.21%;地区分布以小越、甘霖和崧夏3乡镇为主,占总病例数的77.27%;患者从出现症状到明确诊断所需时间平均为(50.525.07)d。结论 绍兴市布病疫情呈上升趋势,应加大对传染源的控制,重点开展对高危人群的健康教育宣传。
关键词: 布鲁氏菌病, 流行病学, 监测
我国省级疾病预防控制系统实验室主要腹泻病原菌检测能力调查分析
娄静, 李杰, 阚飙, 闫梅英
2012,27(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.5.003
目的 了解我国省级疾病预防控制系统实验室针对主要腹泻病原菌的检测条件和能力,为促进以实验室为基础的腹泻病监测工作提出建议。 方法 以调查表的形式调查了27个省级疾病预防控制中心(CDC)实验室在细菌分离鉴定、血清分型及耐药性监测方面的实验条件、分子生物学技术能力以及实验储备情况和需求。 结果 27个省级CDC实验室完成了本次调查,针对主要腹泻病原,具备了基本实验室分离培养、生化鉴定、血清分型的能力;分离菌株耐药性检测仍以集中时段的实验为主;一些分子生物学检测和分子分型方法部分实验室仍未建立付诸应用;实验室人员不足。 结论 目前我国省级CDC系统实验室能够完成常见致病菌基本的培养鉴定,但在腹泻病原菌检测方面的能力尚显不足,表现在实验室专业技术人员不足,培训缺乏。需要在基于分子生物学的快速检测、分子分型技术方面加强力量,并促进腹泻病原监测的实验室网络化发展。
关键词: 疾控系统实验室, 腹泻病原菌, 实验条件
利用双重TaqMan荧光定量聚合酶链反应技术鉴别诊断粪便标本中的伤寒和甲型副伤寒沙门菌
李杰, 肖燕, 樊粉霞, 阚飙, 闫梅英
2014,29(4) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2014.04.015
目的 建立针对粪便标本中伤寒沙门菌和甲型副伤寒沙门菌的检测方法,评价该方法的特异性、敏感性及检测下限,以提高感染人群粪便标本中两种病原的检出效率。方法 分别根据伤寒沙门菌特异基因STY1633及甲型副伤寒沙门菌特异基因SPA4289设计特异性引物及探针,优化反应条件,建立双重TaqMan荧光定量聚合酶链反应(dual taqman fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)体系。利用44株伤寒沙门菌、30株甲型副伤寒沙门菌、88株其他血清型沙门菌染色体DNA及引起发热的其他病原菌,评价该方法的特异性和灵敏性,并对伤寒沙门菌及甲型副伤寒沙门菌的粪便模拟标本进行检测下限评价,同时利用10份伤寒患者、20份甲型副伤寒患者及48份其他病原所致发热和/或伴腹泻的患者粪便标本进行特异性、敏感性验证。结果 利用本方法检测的伤寒、副伤寒沙门菌纯菌及伤寒、甲型副伤寒患者标本扩增阳性,其余的非伤寒沙门菌、致腹泻的其他5种肠道致病菌及引起发热症状的8种常见非肠道病原菌纯菌及相应患者标本均扩增阴性。在对纯伤寒沙门菌DNA及甲型副伤寒沙门菌DNA检测中,双重TaqMan荧光定量PCR法的最低检测限分别为1 pg/反应(194拷贝/反应)及2.5 pg/反应(485拷贝/反应)。以粪便模拟样品提取DNA为模板的检测中,增菌前伤寒沙门菌检测下限达102 cfu/g,增菌后可达1 cfu/g;增菌前甲型副伤寒沙门菌检测下限达104 cfu/g,增菌后可达10 cfu/g。结论 本研究建立了特异性好、灵敏度高的检测粪便中伤寒沙门菌及甲型副伤寒沙门菌的双重TaqMan荧光定量PCR方法,为伤寒及甲型副伤寒疾病的同时快速诊断及鉴别诊断、某些不明原因发热及腹泻症状的病原的初步鉴定提供了简易手段。
关键词: 伤寒沙门菌, 甲型副伤寒沙门菌, 双重TaqMan荧光定量聚合酶链反应
中国肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳分子分型数据库的分析
娄静, 刁保卫, 李杰, 阚飙, 闫梅英
2013,28(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.6.005
目的 了解近几年我国肠炎沙门菌临床分离株的流行病学及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特点,为以实验室为基础的食源性疾病暴发的发现及疫情控制提供依据。 方法 根据PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案,对2004-2012年分离自我国13个省(直辖市)的981株肠炎沙门菌进行流行病学及PFGE分子分型分析。 结果 981株肠炎沙门菌经XbaⅠ酶切,PFGE获得126种带型,其分辨能力(D值)为0.8336。优势带型为JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0002、JEGX01.CN0005和JEGX01.CN0016。暴发相关带型是JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0001和JEGX01.CN0150。肠炎沙门菌优势带型PFGE的共有条带分别为(0.8%)655、325、310、245、178和110 kbp。 结论 我国肠炎沙门菌临床分离株存在PFGE优势型别,PFGE对于肠炎沙门菌XbaⅠ单酶切分型能力有限,用于暴发确认或发现时需多种酶切联合使用,提高分辨能力。
关键词: 肠炎沙门菌, 流行病学, 脉冲场凝胶电泳
多位点串联重复序列分析应用于中国肠炎沙门菌分型能力的评价
刁保卫, 聂艳妮, 李杰, 娄静, 阚飙, 闫梅英
2013,28(12) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.12.017
目的 比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方法用于我国肠炎沙门菌分子分型的能力,建立我国肠炎沙门菌MLVA分型标准操作方法及数据库。方法 根据国际PulseNet公布的肠炎沙门菌PFGE和MLVA分型方案,对来自我国6个省(直辖市)的289株肠炎沙门菌进行分子分型分析,并结合流行病学资料,评价这两种分型方法对我国肠炎沙门菌分离株的分型能力。结果 289株肠炎沙门菌经XbaⅠ酶切,PFGE后获得55种带型,其分辨能力(D值)为0.8433。PFGE优势带型为JEGX01.CN0003及JEGX01.CN0001,带型频率分别为35.6%、25.6%,但二者仅表现两个条带的差异,其余型别均低于5%。采用MLVA分析,获得63种型别,分为2个群,D值为0.8608,说明MLVA分辨能力高于单酶切PFGE,但分型能力仍然有限。MLVA主要型别ST1包含了97株菌株,占37.5%,分布于各省及各年份。若联合PFGE及MLVA分型,则产生104种型别,D值为0.9058。对流行病学调查显示为肠炎沙门菌暴发病例菌株进行PFGE双酶切及MLVA分型,结果均显示这些菌株具有明显的聚集性,但不能与同期散发菌株完全区分开。结论 MLVA与PFGE分型方法的分辨能力在肠炎沙门菌中较低,在确认肠炎沙门菌引起的暴发事件时,需紧密结合流行病学调查资料,采用双酶切PFGE或MLVA进行分型分析。
关键词: 肠炎沙门菌, 脉冲场凝胶电泳, 多位点串联重复序列分析, 分子分型
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