内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析
苏云开, 余琴, 吕冰, 马岩, 连璐璐, 杨晓敏, 董海燕, 刘耀, 赵秀芹, 吴移谋, 万康林
2013,28(4) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.4.004
目的 了解内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株的串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)基因多态性和VNTR基因型构成,及不同VNTR位点在该地区结核分枝杆菌基因分型中的应用。 方法 从内蒙古自治区结核病防治研究所收集临床分离的结核分枝杆菌菌株及其病例背景资料,采用多位点串联重复序列分析(MLVA)对收集的菌株进行22个VNTR 位点分析,计算Hunter-Gaston 指数(HGDI),分析各个位点的分辨率, 同时用BioNumerics 软件对VNTR结果进行聚类分析。且统计学分析民族与主要基因型间的关系。 结果 372株菌共分为308个基因型,47簇,261个独特基因型,成簇率为17.20%。22个VNTR位点的基因多态性存在较大的差异,位点VNTR3820(HGDI 0.838)的分型分辨能力最高,MIRU23(HGDI 0.068)和MIRU27(HGDI 0.083)分型分辨能力较差。随着VNTR 位点的增加,分型的分辨能力也有所提高。Ⅰ群基因型菌株与民族易感性的分析表明,汉族与蒙古族间Ⅰ群基因型菌株分布差异无统计学意义(χ2=0.337, P=0.561>0.05)。 结论 内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,不同VNTR位点在内蒙古地区结核分枝杆菌中具有不同的分辨能力。且Ⅰ群基因型为该地区主要流行株,而Ⅰ群基因型菌株与民族易感性间无关联。
关键词: 结核分枝杆菌, 可变数目串联重复序列, 基因多态性, 多位点串联重复序列分析
新疆结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping基因型的初步研究
綦迎成, 刘洁, 鱼栓民, 李君莲, 赵秀芹, 王泉, 刘志广, 吕冰, 刘中华, 万康林
2010,25(12) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2010.12.007
目的 研究新疆结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型,初步了解其基因型多态性状况及主要流行株。 方法 在新疆维吾尔自治区胸科医院收集一个连续时间段的结核分枝杆菌临床分离菌株,采用比例法检测进行耐药性检测、间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法进行分型研究。基因聚类分析采用BioNumerics 5.0数据库软件,统计学分析采用2检验,P0.05为差异有统计学意义。 结果 共收集到结核分枝杆菌临床分离菌株175株,其中对利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇全敏感115株,耐药60株(包括单耐药31株和耐多药29株)。经Spoligotyping分型,这些菌株可分为4个基因群49种基因型,最大的1个基因群为北京家族,占68.57%(120/175)。北京家族中,敏感菌株63.87%(76/119),耐药菌株占36.13%(43/119);非北京家族中,敏感菌株68.52%(37/54),耐药菌株占31.48%(17/54),北京家族与非北京家族的耐药率之间差异无统计学意义(P=0.551)。 结论 新疆结核分枝杆菌临床菌株存在明显的基因多态性,主要流行菌株为北京基因型。北京基因型与耐药性无明显相关性。
关键词: 结核分枝杆菌, 基因分型, 间隔寡核苷酸分型, 北京基因型
400例莱姆病病例临床疾病类型及其治疗效果分析
金世文, 段建军, 田桢, 郝琴, 侯学霞, 耿震, 吕冰, 蒋毅, 万康林
2005,20(7) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2005.7.356
目的分析莱姆病临床表现及其治疗效果,为莱姆病的临床治疗探索优化的治疗方案。方法根据莱姆病暴露史、临床表现和实验室检查确诊莱姆病患者,对其不同临床类型疾病,分别进行口服治疗和静脉给药,比较两者的治疗效果。结果本次共确认莱姆病患者400例,其中关节炎94例、神经肌肉炎92例、心脏损害36例,慢性轻度脑膜炎32例,和慢性疲劳综合征146例。两种治疗方案均有显著疗效,治愈率分别为88.45%和79.17%。且不良反应较少。结论莱姆病临床疾病类型复杂多样,两种方法对莱姆病有较好的治疗效果。
关键词: 莱姆病, 临床类型, 治愈率
间隔区寡核苷酸分型法用于99株结核分枝杆菌杭州临床分离株的基因分型研究
王 勐, 刘志广, 赵秀琴, 董海燕, 刘洁, 张媛媛, 吕冰, 万康林
2008,23(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.5.300
目的 用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)鉴定杭州结核分枝杆菌临床分离株的基因分型种类和特征,为结核病防治研究提供基础科学依据。方法 收集结核分枝杆菌杭州临床分离株,应用Spoligotyping进行基因分型检测。基因聚类分析采用BioNumerics(Version 5.0)软件。结果 共在杭州市收集到99株结核分枝杆菌临床分离株,可分为2个基因群,即北京家族(Beijing family)和非北京家族(Non?鄄Beijing family),分别占64.65%(64/99)和35.35%(35/99),20种基因型,其中9株为独特类型,剩余90株分为11簇。北京家族菌株中,89.06%(57/64)为典型北京家族(Typical Beijing family),35株非北京家族菌株可分为16个基因型,10株为独特的基因型。结论 杭州结核分枝杆菌存在明显的基因多态性,北京家族菌株占优势,但非北京家族菌株基因多态性更显著。
关键词: 结核分枝杆菌, 间隔区寡核苷酸分型, 基因分型, 北京基因型

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