儿童脑膜炎大肠埃希菌毒力基因ibeC的分布研究
刘莎, 金东, 王艺婷, 王怡婷, 杨晶, 周娟, 许彦梅, 白向宁, 濮吉, 兰瑞廷, 熊衍文, 徐建国
2015,30(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.05.009
目的 对GenBank的1620株大肠埃希菌基因组中儿童脑膜炎大肠埃希菌毒力基因ibeC的分布进行研究. 方法 下载GenBank现存并公开释放的1620株大肠埃希菌基因组数据,构建数据库,通过序列比对程序BLAST查找分析各菌株携带ibeC情况,使用Clustal X1.83软件对大肠埃希菌代表菌株的ibeC基因序列进行多序列比对.同时应用多位点序列分型方法(multi locus sequence typing, MLST)对1620株大肠埃希菌菌株的分布特点进行分析.用BioNumerics V4.0软件,对342株不同来源、不同致病性代表菌株及MLST数据库中已经明确分群的72株大肠埃希菌菌株的不同ST型别构建最小生成树,分析菌株之间的种群结构. 结果 1620株大肠埃希菌基因组中全部携带ibeC基因,ibeC序列平均相似值为98.21%,MLST将1620株大肠埃希菌菌株分成261个已知ST型,ECOR菌株共有49个ST型别,菌株ST型别与菌株来源关联性不强,不同来源、不同致病型别的菌株分布在不同家系. 结论 ibeC基因广泛分布在各类大肠埃希菌中,脑膜炎相关大肠埃希菌与其他致病型大肠埃希菌所携带ibeC基因差异微小,菌株MLST聚类分析显示所有菌株分布广泛,来源复杂,进一步说明ibeC基因非常保守.
关键词: ibeC, 基因分布, 大肠埃希菌, 多位点序列分型方法
喜马拉雅旱獭源鹑鸡肠球菌的分离及其耐药性检测
王怡婷, 金东, 杨晶, 卢珊, 濮吉, 孟祥莉, 张桂, 徐建国
2016,31(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.05.008
目的 了解青藏高原喜马拉雅旱獭携带院内感染病原菌鹑鸡肠球菌情况,并检测其对临床常用抗菌药物的耐药性。方法 选择性培养基、革兰染色、生化反应和16S rRNA基因序列分析方法对细菌进行分离和鉴定;K-B纸片法检测菌株对15种抗菌药物的耐药情况,并应用PCR方法检测毒力基因和耐药基因。结果 79份喜马拉雅旱獭肠道样本中共分离到3株鹑鸡肠球菌,其中1株对利福平中介,3株均对奎奴普丁中介,对其他被检抗菌药物均敏感;未检测到常见肠球菌毒力基因(asa1、esp、hyl、gelE和cylA)和相关耐药基因。结论 首次在青藏高原旱獭粪便中分离到鹑鸡肠球菌,常见的毒力基因检测阴性,对常见抗菌药物敏感。
关键词: 喜马拉雅旱獭, 鹑鸡肠球菌, 耐药性, 毒力基因
脉冲场凝胶电泳技术对一起痢疾暴发的分型研究
李振军, 秦彩明, 王丽丽, 叶长芸, 崔志刚, 金东, 徐建国
2005,20(9) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2005.9.460
目的运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对痢疾暴发进行分析。方法对辽宁省某市暴发痢疾进行血清学鉴定后,进行PFGE分析,观察引起暴发的菌型是否为同一个分子分型。结果7株暴发菌株的PFGE型别相同。结论此次痢疾的暴发流行为同一菌株引起,PFGE可以作为暴发流行中对细菌进行鉴定的分析技术。
关键词: 痢疾, 脉冲场凝胶电泳(PFGE), 鉴定
安徽省马鞍山市分离的枸橼酸杆菌的分子分型
刘丽云, 汪永禄, 金东, LAN Rui Ting, 原方芳, 叶长芸, 徐建国
2016,31(12) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.12.006
目的 了解中国安徽省马鞍山市分离到的枸橼酸杆菌的分子流行病学特征。方法 2007-2011年从安徽省马鞍山市的腹泻患者粪便、食品和食品加工者肛拭分离到62株枸橼酸杆菌,包括13株弗氏枸橼酸杆菌、41株杨氏枸橼酸杆菌和8株布氏枸橼酸杆菌。所有菌株用Xba Ⅰ酶切进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和扩增7个管家基因的多位点序列分型(MLST)分析。结果 PFGE将62株枸橼酸杆菌分成43个带型(PTs),MLST将其分成53个ST型别(STs)。CITX01.CN0039是PFGE的优势带型,由2007-2008年间从食品和腹泻患者粪便分离的7株杨氏枸橼酸杆菌组成。53个ST型别分成5个ST序列群,ST序列群39个优势菌株来自腹泻患者粪便、食品和食品加工者肛拭分离的枸橼酸杆菌。从腹泻患者粪便、食品和食品加工者肛拭分离得到的枸橼酸杆菌具有相同的PTs和STs。结论 在食品和人群中监测枸橼酸杆菌对预防和控制枸橼酸杆菌引起的腹泻是必要的。
关键词: 枸橼酸杆菌, 马鞍山, 脉冲场凝胶电泳, 多位点序列分型
1999-2006年江苏省徐州市肠出血性大肠埃希菌O157:H7感染状况的流行病学研究
刘加彬, 杨晋川, 景怀琦, 徐建国,
2007,22(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2007.8.516
目的 探讨徐州市肠出血性大肠埃希菌(EHEC)O157:H7(以下简称O157:H7)感染的流行特征,系统观察腹泻患者、宿主动物携带O157:H7的状况及其与发病的关系,为制定防制策略提供科学依据.方法 采用描述流行病学方法对徐州市近8年来O157:H7感染状况与流行特征进行分析.结果 1999-2006年徐州共累计报告O157:H7引起的感染性腹泻并发肾衰竭(HUS)131例,病死率87.79%.徐州市丰县、铜山县发病最多,占全市发病的77.10%.6~9月份为发病高峰,占发病的77.10%.年龄以60岁以上老人为主,占发病总数的74.81%,职业以农民为主,占91.60%.男女性别比例为1:1.34.腹泻患者、宿主动物带菌率连续性监测结果证实了其与O157:H7感染关系.不同年份O157:H7毒力基因发生了变化.结论 O157:H7感染自1999、2000年爆发流行后,徐州市疫情一直稳定.尽管疫情发生原因复杂,传播机制不清,但与腹泻患者带菌率、宿主动物带菌率及菌株毒力基因阳性率、毒力基因变迁有关.腹泻患者带菌率、宿主动物带菌率可作为爆发疫情预警监测指标.
关键词: 大肠杆菌O157:H7, 腹泻病, 动物, 带菌率, 预警监测
枸橼酸杆菌对β-内酰胺类抗生素的耐药机制
余燕, 徐建国, 熊衍文, 叶长芸
2008,23(3) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.3.180
枸橼酸杆菌(Citrobacter)是一种条件致病菌,近年来在临床上造成的感染越来越多,随之而来的是枸橼酸杆菌对常用抗生素(如-内酰胺类、氨基糖甙类和喹诺酮类等药物)的耐药性日益突出.枸橼酸杆菌对-内酰胺类抗生素的耐药机制主要是产生特异性的-内酰胺酶,而且不同种枸橼酸杆菌对抗生素的敏感性不同.因此,了解枸橼酸杆菌的耐药机制及进展,对预防和治疗由该属细菌引起的感染以及控制耐药性的蔓延有重要意义.
关键词: 枸橼酸杆菌, 耐药性, β-内酰胺酶
传染性非典型肺炎临床诊断病例血清标本不同非典型肺炎病原体抗体检测
邵祝军, 任红宇, 朱兵清, 李马超, 徐建国
2005,20(9) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2005.9.457
目的研究传染性非典型肺炎(SARS)临床诊断病例血清标本中常见的不同非典型肺炎病原体感染抗体分布情况。方法选取2003年SARS流行期间90份SARS临床确诊病例血清标本和40份健康志愿者血清标本进行血清抗体检测。结果90份临床诊断的传染性非典型肺炎(SARS)病例急性期血清标本中,21.1%(19/90)标本SARS抗体阳性,79.9%(71/90)标本SARS抗体阴性。肺炎支原体、呼吸道合胞病毒、腺病毒、军团菌、肺炎衣原体等抗体检测呈现不同的分布。结论2003年SARS流行期间,SARS抗体阴性的传染性非典型肺炎临床确诊病例可能存在或合并其它病原体感染。
关键词: 传染性非典型肺炎, 临床诊断病例, 抗体检测
猪链球菌的药物敏感性及耐药基因检测
白雪梅, 叶长芸, 张少敏, 赵爱兰, 徐建国
2009,24(12) . doi: DOI 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.12.005
目的 探讨猪链球菌对各类药物的耐药性及其耐药基因的检测。方法 我们对2005-2007年分离自四川、广西、贵州、广东等地的56株猪链球菌用api-strep生化鉴定条进行生化鉴定,采用微量稀释法进行药物敏感性分析,PCR检测耐药基因。 结果 在所检测的13种抗生素中,56株猪链球菌对青霉素、氨苄西林、头孢噻肟、头孢曲松、头孢吡肟、美罗培南、左旋氟沙星、氯霉素、红霉素、阿齐霉素、克林霉素、万古霉素均敏感,但均对四环素耐药。使用PCR方法检测了编码四环素耐药的tet(K)、tet(L)、tet(M)、tet(O)、tet(Q)等基因,发现所有检测的菌株均携带tet(M)基因。 结论 猪链球菌可能在进化过程中获得了tet(M)基因,而tet(M)的扩散可能和在饲养过程中大量使用四环素类药物添加剂有关。
关键词: 猪链球菌, 微量稀释法, tet(M) 耐药基因
胶体金标记免疫层析法检测大肠杆菌O157
刁琳琪, 王伟, 徐建国, 廖兴广, 王芸
2007,22(7) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2007.7.438
目的 应用抗大肠杆菌O157(E.coli O157)单克隆抗体,制备一种简便快速的胶体金标记免疫层析(GICA)条用于检测标本中E.coli O157.方法 采用柠檬酸三钠还原法制备胶体金颗粒,标记抗E.coli O157单克隆抗体,以硝酸纤维膜作为抗E.coli O157单克隆抗体的包被载体,制成GICA检测条.标本中E.coli O157与检测条上金标记抗体(Au-Ab)结合后,利用硝酸纤维膜的层析作用移动,与膜上的固相抗体结合形成可见的红色条带.结果 GICA检测条灵敏度可达105 cfu/ml.用GICA检测了1750份不同食品和人畜粪便标本中E.coli O157,GICA检测条阳性份数43份,后经分离培养检出29株大肠杆菌O157;另14份标本经鉴定,其中12份标本可疑为弗劳地枸橼酸杆菌.结论 GICA条检测标本的E.coli O157,特异性较高,不需任何仪器设备,较简便快速,易于判断结果,故可对标本进行快速筛查,适合各级疾控中心和临床检验部门使用.
关键词: 大肠杆菌O157, 胶体金, 免疫层析
致泻性大肠埃希菌诱发细胞肌动蛋白聚集的研究
白莉(综述), 徐建国(指导)
2009,24(4) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.04.022
人类重要的肠道致病菌,肠致病性大肠埃希菌(EPEC)和肠出血性大肠埃希菌(EHEC), 在细菌黏附细胞周围形成肌动蛋白聚集的杯垫样结构来黏附并定植到肠道黏膜上,完成侵入宿主细胞的第一步。同时,被感染的肠道黏膜上皮细胞刷状缘脱落并失去微绒毛,这种特殊的病理损伤过程,称为黏附抹平效应(A/E效应)。通过细胞培养感染模型对典型菌株的研究显示,尽管EHEC和EPEC都能激活下游N-WASP蛋白,Arp2/3蛋白,最终引起有效肌动蛋白的聚集,但是它们却采取了不同的途径引起肌动蛋白的聚集。EPEC运用Tir-Nck途径,而EHEC运用是Tir-TccP途径来激活N-WASP蛋白。最近通过细胞培养感染模型研究发现,EHEC和EPEC菌株存在一种既不依赖TccP也不依赖Nck但能引起微弱肌动蛋白聚集的途径。在体内实验(in vivo)和体外组织实验(ex vivo)中,黏膜组织感染也显示不依赖TccP或Nck同样能产生典型的A/E损伤。
关键词: 肌动蛋白聚集, 黏附抹平效应, 大肠埃希菌
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