C群脑膜炎奈瑟菌部分蛋白表型特征分析
胡源, 卲祝军, 闫笑梅, 李波清, 赵飞, 肖迪, 任军, 郑明寰, 樊春祥, 何利华, 徐丽, 顾一心, 姜海, 郭凤华, 李马超, 陆美娟, 陈霞, 邹清华, 孟凡亮, 张建中
2006,21(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2006.8.428
目的以蛋白质组学研究为基础,分析2003~2005年间我国流脑暴发流行期间C群脑膜炎奈瑟菌菌株分布特征。方法利用双向电泳技术获得66株2003~2005年流脑流行期内分离的C群脑膜炎奈瑟菌菌株及2株参考菌株的2-DE电泳图谱,并结合质谱分析的结果进行部分外膜蛋白和sucD蛋白表型分析。结果根据外膜蛋白和sucD蛋白将实验菌株共分为9型,其中安徽菌株分型结果显示出了高度的一致性,而其他地区菌株分型分布则显示出高度的多态性。结论安徽已经有优势菌型形成,但优势菌型还没在全国范围内出现,此类菌型分布和变迁的检测可能对认识流脑的流行规律和有效进行流脑疾病控制具有重要意义。
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, 外膜蛋白, sucD蛋白, 2-DE
中国El Tor生物型霍乱弧菌流行株中非溶血变异菌株分布及进化特征
范宇峰, 赵林, 卢昕, 李旭, 孙惠惠, 王嘉正, 刘鸣, 李杰, 逄波, 阚飙
2019,34(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2019.06.005
目的分析第7次霍乱大流行期间中国O1群El Tor型霍乱弧菌流行菌株中非溶血变异菌株的流行分布特征以及进化特征。方法选择1961年以来不同霍乱流行期的O1群El Tor型产毒菌株,测定溶血表型并分析其时间分布特点。 比较菌株溶血素基因hlyA的序列变异及不同序列型的分布,构建这些菌株的核心基因组进化树,分析非溶血株在进化分支中的分布及克隆化特征。结果在第7次霍乱大流行的中国霍乱流行中,溶血素基因hlyA在第1次流行高峰期后,出现了明显的序列型转换。 非溶血株主要出现在始于20世纪70年代的第2次流行中,并成为多见的变异型。 非溶血菌株分布在不同流行期和流行克隆中,没有形成单一的克隆化。 但部分非溶血菌株克隆引起数年的流行扩散。结论O1群El Tor型菌株的非溶血变异独立于基因组逐年累积的克隆进化,很可能是一种随机性较强的变异。
关键词: 霍乱弧菌, 霍乱溶血素, hlyA基因, 生物型, 序列型, 单核苷酸多态性分析
49株脑膜炎奈瑟菌体外抗菌药物敏感性检测
李马超, 徐丽, 黄鑫, 高源, 李艺星, 尹尊栋, 李军宏, 邵祝军
2008,23(2) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2008.2.76
目的 了解2005-2006年中国脑膜奈瑟菌分离株(Neisseria meningitides,Nm)的抗菌药物敏感性变化趋势,为选择抗菌药物对流行性脑脊髓膜炎(流脑)患者进行治疗提供参考.方法 采用肉汤稀释检测最低抑菌浓度(MICs)方法、药敏纸片扩散(K-)法和E-test试纸条检测方法对本实验室收集的49株(16株A群、33株C群)2005-2006年分离的患者Nm菌株进行体外抗菌药物敏感性检测.结果 16株A群Nm菌株对复方新诺明、四环素、左氧氟沙星、萘啶酸4种抗菌药物耐药,对环丙沙星耐药或中度敏感.33株C群Nm菌株对复方新诺明耐药,31株(93.9%)C群菌株对萘啶酸耐 药,20株(60.6%)C群菌株对左氧氟沙星耐药,17株(51.5%)C群菌株对环丙沙星耐药.分别发现对青霉素不敏感的4株A群和1株C群Nm菌株.结论 2005-2006年,中国的A群和C群Nm菌株对磺胺类药物和喹诺酮类药物普遍耐药,此两类药物不适合中国流脑的临床用药及人群预防性给药.K-药敏纸片和肉汤稀释MICs及E-test方法具有较高的一致性.
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, 药敏, MICs, K-β, E-test
中国脑膜炎奈瑟菌penA基因及PBP2蛋白多态性研究
李马超, 郑玉红, 徐丽, 任红宇, 高源, 朱兵清, 田国忠, 邵祝军
2010,25(2) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2010.02.014
目的 掌握中国脑膜炎奈瑟菌对青霉素类抗生素敏感性的变化情况,探讨脑膜炎奈瑟菌菌株对青霉素敏感性降低的机制、敏感性变化与penA基因及PBP2蛋白多态性之间的关系。 方法 采用MIC肉汤稀释法和E-test药敏纸条法检测脑膜炎奈瑟菌菌株对青霉素的敏感性,并对penA基因进行扩增、测序,分析penA以及PBP2蛋白与菌株的青霉素敏感性变化的关系。 结果 通过肉汤稀释法和E-test法检测出4株对青霉素中介敏感菌株,未发现对青霉素耐药菌株;菌株的药物敏感性变化情况与penA及PBP2蛋白的多态性无明显关系,所检测菌株的PBP2高度保守。 结论 应该继续对流脑菌的青霉素敏感性变化情况开展基因水平监测,及时发现高耐药性菌株,防止耐药菌株克隆在人群间扩散。
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, 敏感性, penA测序
2009-2010年中国流行性脑脊髓膜炎流行病学特征分析
王萌, 李艺星, 李军宏, 尹遵栋, 宁桂军, 邵祝军, 徐丽, 高源, 李马超
2012,27(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.6.006
目的 分析中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)流行性脑脊髓膜炎(流脑)流行病学特征,为流脑预防控制提供参考依据。 方法 运用描述流行病学方法分析2009-2010年(2009年10月1日至2010年9月30日)全国法定传染病报告系统流脑疫情。 结果 2009-2010年与2008-2009年相比,发病率降低50.98%。病例相对集中于5个省,其发病数占全国病例总数的45.10%;0~14岁病例占病例总数的62.61%,其中<2岁婴幼儿发病率最高。 结论 在近年来全国流脑报告发病水平持续下降的形势下,在监测点应持续开展急性脑炎脑膜炎症候群监测;应加强<2岁儿童的流脑基础免疫工作;不推荐磺胺类和喹诺酮类药物作为流脑的预防性药物。
关键词: 流行性脑脊髓膜炎, 流行病学特征, 药物敏感试验
不可分群脑膜炎奈瑟菌PCR基因分型研究
张艳亭, 徐丽, 高源, 杨慧芳, 刘宝莲, 芦晶, 李海清
2009,24(10) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.10.018
目的对自健康人群鼻咽拭子中分离的74株表型特征为不可分群的脑膜炎奈瑟菌,利用PCR基因分型技术进行基因特征分析。方法用PCR方法扩增脑膜炎奈瑟菌种属特异性基因crgA和A、B、C、W135、Y、Z、X以及29E不同群的特异性基因片段,确定不同菌株的基因型。结果以脑膜炎奈瑟菌crgA基因为靶基因进行PCR扩增,74株不可分群脑膜炎奈瑟菌中,66株脑膜炎奈瑟菌crgA基因扩增阳性,检出率89.19%。66株菌株进行不同血清群的PCR分群鉴定,40株菌株(60.61%)可检测为不同的血清群基因型,B群27株,29E群7株,X、Y群各2株,C、W135各1株。结论不可分群脑膜炎奈瑟菌进行PCR基因分型研究对脑膜炎奈瑟菌的研究具有重要的流行病学意义。
关键词: 不可分群, 脑膜炎奈瑟菌, PCR
中国脑膜炎奈瑟菌nadA基因多态性分析
孙晓芳, 杨郝亮, 周海健, 朱兵清, 徐丽, 高源, 邵祝军
2012,27(11) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.11.003
目的 了解我国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)主要黏附蛋白(Neisseria adhesion A,NadA)编码基因nadA的多态性特征,以期研究我国主要流行Nm菌株NadA蛋白的流行病学意义及NadA蛋白作为脑膜炎球菌蛋白疫苗候选蛋白研发的可行性。 方法 选取我国26个省(市、自治区)1963-2012年间不同血清群代表性Nm菌株230株,采用多位点序列分型(muliti-locus sequence typing,MLST)、PCR、斑点杂交、基因测序等方法,检测Nm菌株基因型特征、nadA基因分布的多态性及其基因序列特征,利用BioEdit、Mega 4.0等软件对nadA基因序列进行比对分析。 结果 我国230株不同血清群的Nm菌株中,nadA+菌株55株,仅存在于ST-5 complex(序列群)的A群和ST-11 complex 的W135群Nm菌株中,B、C及其他血清群Nm菌株nadA-。nadA+菌株基因型以variant 3(V3)型为主(54/55),包括5种亚型(NadA V3.1~3.5),同源性高达99%以上。 结论 我国Nm菌株中,仅ST-5 complex的A群和ST-11 complex的W135群菌株存在NadA黏附蛋白,型别以variant 3型为主。B群菌株不含有NadA蛋白,variant 3型NadA蛋白不适合作为我国B群Nm(B meningococci,MenB)蛋白疫苗的候选蛋白。
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, nadA, 黏附蛋白, 疫苗
中国侵袭性肺炎链球菌19A、19F血清型的基因分型分析
严彩芳, 赵红庆, 高源, 朱兵清, 徐丽, 高朝辉, 邵祝军
2018,33(2) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2018.02.012
目的 研究中国侵袭性肺炎链球菌19A、19F血清型菌株的基因型特征。方法 采用多位点序列分型(MLST)法,对来自全国各疾病预防控制中心细菌性疫苗可预防疾病监测网络实验室的57株侵袭性肺炎链球菌进行ST序列分型,利用BioNumerics软件处理分型数据并进行ST型聚类分析。结果 35株侵袭性肺炎链球菌19A血清型菌株共分为6个ST型,其中ST320型29株,占82.9%,为优势基因型。其他6株分别为ST876(2株,5.7%)、ST4560(1株,2.9%)、ST9230(1株,2.9%)、ST7759(1株,2.9%)和ST6429(1株,2.9%)。22株侵袭性肺炎链球菌19F血清型菌株包括7个ST型,其中ST271型14株,占64%,为优势基因型。其余8株分别为ST236(1株,4.5%)、ST320(2株,9.1%)、ST1937(2株,9.1%)、ST6993(1株,4.5%)、ST9236(1株,4.5%)和ST9240(1株,4.5%)。结论 我国侵袭性肺炎链球菌19A血清型菌株主要基因型为ST320型,19F血清型菌株主要基因型为ST271型,ST320型为19A和19F菌株共有的基因型。
关键词: 肺炎链球菌, 19A, 19F血清型, 多位点序列分型
中国不可分群脑膜炎奈瑟菌的分子分型分析
徐征, 朱兵清, 高源, 徐丽, 邵祝军
2014,29(9) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2014.09.005
目的 了解我国血清不可分群(non-serogroupable,NG)脑膜炎奈瑟菌分子分型特征。 方法 选取我国2005-2011年分离的104株血清不可分群脑膜炎奈瑟菌作为研究对象,采用多位点序列分型(MLST)和聚合酶链反应(PCR)基因分群(A、B、C、W、E、X、Y、Z、H、I、L、K、cnl)方法,检测其ST序列群及基因群。 结果 104株不可分群脑膜炎奈瑟菌中,基因群分布为荚膜基因缺失菌株(capsule null locus,cnl)(36株)、B群(20株)、C群(14株)、W群(9株)、E群(9株)、X群(3株)和Y群(3株),余下10株未鉴定出基因群;未发现其他基因群菌株。MLST分型将104株NG菌株分为45种ST型,其中14种为新的ST型;17种ST型可归为7个序列群(65株);cnl菌株全属于ST-198序列群,B群和C群菌株以ST-4821为优势序列群,W群以ST-11和ST-174序列群为主。 结论 我国NG脑膜炎奈瑟菌具有基因多态性,其中ST-198序列群全部为cnl菌株。
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, 不可分群, 多位点序列分型, 基因群
2003-2012年中国部分地区脑膜炎奈瑟菌体外抗生素敏感性分析
徐丽, 朱兵清, 徐征, 高源, 邵祝军
2015,30(4) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.04.017
目的 了解我国脑膜炎奈瑟菌对抗生素敏感性的变化趋势. 方法 对2003-2012年本研究室收集的脑膜炎奈瑟菌菌株,根据分离年份、血清群和来源(患者或健康携带者)选择487株,采用微量肉汤稀释法和E-test浓度梯度扩散法,对其进行体外12种抗生素敏感性检测和分析. 结果 所有菌株对头孢噻肟、头孢曲松、阿奇霉素、美洛培南、氯霉素和米诺环素均敏感;对青霉素和氨苄西林不敏感的菌株分别是4.9%(24/487)和3.5%(17/487),75.6%(368/487)的菌株对萘啶酸耐药,87.1%(424/487)对复方新诺明耐药,48.9%(238/487)对环丙沙星耐药.从2005年开始出现对环丙沙星耐药的菌株23.8%(24/101),从2006年开始出现对青霉素类药物不敏感菌株2.4%(2/82).患者和健康携带者来源的菌株对萘啶酸、复方新诺明和环丙沙星3种药物显现不同的耐药率. 结论 我国流脑菌株对磺胺类和喹诺酮类药物具有较高的耐药性,对青霉素类药物不敏感的菌株也逐渐增多.这种耐药性与菌株分离年份、血清群和菌株来源具有相关性.
关键词: 脑膜炎奈瑟菌, 药敏, E-test
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