2013年8月全国突发公共卫生事件及需关注的传染病风险评估
涂文校, 丁凡, 谢荣恒, 周升, 常昭瑞, 李昱, 刘凤凤, 闫梅英, 周蕾, 刘波, 任婧寰, 夏志贵, 胡伟江, 李湉湉, 孟玲, 洪志恒, 金连梅
2013,28(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.8.003
目的 评估2013年8月中国(未包括香港、澳门和台湾地区,以下同)突发公共卫生事件及需要关注的传染病风险。 方法 根据全国突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种监测资料和部门通报信息,采用专家会商法进行评估。 结果 既往监测显示,8月是全年报告突发公共卫生事件数最低的月份之一;2013年1-7月全国突发公共卫生事件报告趋势和往年类似,各月事件数与2012年同期基本持平,7月报告事件数比6月下降。肠道传染病(如霍乱、伤寒副伤寒、痢疾等)和虫媒传染病(如登革热等)已进入流行季节。食物中毒事件的发生仍将维持在较高水平。目前中东呼吸综合征的疫情虽然不足以构成国际关注的突发公共卫生事件,但中东地区新发病例持续发生。7月我国多地持续发生高温天气且造成较多的中暑病例和死亡,气象部门预测8月部分地区高温天气仍将持续一段时间。近期有地震、台风、洪涝和干旱等自然灾害发生,可能导致的次生公共卫生风险。 结论 预计2013年8月我国的突发公共卫生事件及传染病疫情发生态势与往年类似,处于较低水平;需重点关注中东呼吸综合征、食物中毒和高温中暑。
关键词: 突发公共卫生事件, 传染病疫情, 风险评估
沙门菌监测点汤卜逊沙门菌分离株的分子分型和耐药性分析
梁未丽, 王洪霞, 周海健, 李志锋, 许学斌3, 李勤2, 张代涛, 陈春霞, 于礼, 闫梅英, 章丽娟, 冉陆, 阚飙
2009,24(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2009.06.014
目的应用分子分型技术对2007年上海和重庆市沙门菌监测点的50株汤卜逊沙门菌进行分子流行病学分析和抗生素敏感性测定,了解上海和重庆两地菌株的分子分型特征和药物敏感性特征。方法抗生素敏感性测定采用微量肉汤稀释法,分子分型方法包括脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点串联重复序列分析(MLVA)。结果药敏试验显示78%的菌株存在多重耐药,其中磺胺甲恶唑和四环素的耐药率最高,其次是甲氧苄胺嘧啶;对头孢类抗生素(头孢噻肟、头孢三嗪、头孢他啶、头孢噻呋)均未产生耐药性。PFGE将50株菌分为15个带型,30株重庆分离株间有较高的相似性;MLVA分析显示除Sal16位点外,其余检测位点在所有待检菌株中没有差别。结论分子分型支持汤卜逊沙门菌引起的暴发以及散发。目前MLVA分型应用于汤卜逊沙门菌分子分型时,分型能力低于PFGE,需要进一步优化。
关键词: 汤卜逊沙门菌, 脉冲场凝胶电泳, 多位点串联重复序列分析, 分子分型
婴幼儿腹泻感染的非伤寒沙门菌分子分型和耐药情况研究
崔志刚, 王爱敏, 王鸣柳, 许学斌, 崔晶花, 杜小莉, 闫梅英, 卢珊
2014,29(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.004
目的 研究婴幼儿感染的非伤寒沙门菌的分子流行病学特点和耐药情况。 方法 收集上海地区腹泻婴幼儿粪便标本,进行沙门菌的分离培养,生化鉴定,血清型分型,分子分型和药物敏感性检测实验。 结果 583份婴幼儿粪便中分离出沙门菌共19株,主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型相似度较高(88.7%),且主要带型为上海近年流行的优势带型。药物敏感性实验结果显示,菌株对测试的15种抗生素的总体耐药率为78.95%(15/19),对萘啶酸(68.42%)和氨苄西林(63.20%)的耐药率较高,对环丙沙星(10.53%)和庆大霉素(10.53%)的耐药率较低,对三代头孢类抗生素的耐药率较高(40%)。菌株耐药谱分布广泛,发现多重耐药菌株13株。 结论 本研究中,婴幼儿感染的非伤寒沙门菌耐药情况比较严重;不同血清型和分子分型的菌株耐药性差异无统计学意义。
关键词: 婴幼儿腹泻, 非伤寒沙门菌, 血清型, 分子分型, 耐药
脉冲场凝胶电泳和多位点串联重复序列分析 应用于中国鼠伤寒沙门菌分型能力的评价
张京云, 聂艳妮, 陈春霞, 刁保卫, 娄静, 阚飙, 闫梅英
2011,26(4) .
目的 比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和两种国际多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方法用于我国鼠伤寒沙门菌分子分型的能力,并初步确定适用于我国鼠伤寒沙门菌MLVA分型中的VNTR位点。 方法 根据国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案、MLVA分型方案(包含7个VNTR位点,简称MLVA_PN)及欧洲食源性疾病监测网公布的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方案(包含5个VNTR位点, 简称MLVA_EU),对来自我国5个省(直辖市)的175株鼠伤寒沙门菌进行分子分型分析,并结合流行病学资料,评价这三种分型方法对我国分离的鼠伤寒沙门菌的分型能力。 结果 175株鼠伤寒沙门菌经XbaⅠ酶切,PFGE后,获得56种带型,其分辨能力(D值)为0.8823。对其中的主优势带型JPXX01.CN0001菌株55株进一步用第二种内切酶BlnⅠ酶切后,获得6种带型。用MLVA_EU分型,获得96种型别,D值为0.9758。应用MLVA_PN分析,获得98种型别, D值为0.9763。 两种MLVA分型方法对菌株的分辨能力几乎相同,且分型结果具有较高的一致性。对流行病学调查显示为鼠伤寒沙门菌暴发患者和食物来源的菌株进行PFGE双酶切及MLVA分型,三种分型方法获得一致性结果,均显示这些菌株具有明显的聚集性。 结论 两种MLVA分型方法的分辨能力均高于PFGE,在确认鼠伤寒沙门菌引起的暴发事件时,采用需时较短,操作更方便的5个VNTR位点的MLVA分型方法可满足菌株聚集性分析。
关键词: 鼠伤寒沙门菌, 脉冲场凝胶电泳, 多位点串联重复序列分析, 分子分型
全血中伤寒沙门菌RT-LAMP检测方法的建立
樊粉霞, 王淑京, 娄静, 陈建才, 聂艳妮, 阚飙, 闫梅英
2012,27(4) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.4.022
目的 建立反转录-环介导等温核酸扩增(RT-LAMP)方法特异检测伤寒沙门菌。 方法 针对伤寒沙门菌 fliC-d 基因设计6条特异性引物,通过优化反应条件,建立检测该靶基因的RT-LAMP方法,利用48个血清型的纯培养伤寒和非伤寒沙门菌菌株、常见非沙门致腹泻病原菌以及发热为主要症状的8种常见病原菌RNA评价该方法的特异性及敏感性,同时对伤寒沙门菌全血模拟标本进行敏感性检测,并与rRT-PCR方法的敏感性进行比较。 结果 等温65 ℃条件下,30~60 min内可完成RT-LAMP检测反应,利用该方法检测44株伤寒沙门菌均阳性,除4种少见的非伤寒沙门菌血清型扩增阳性外,其余30种非伤寒沙门菌血清型、致腹泻的其他5种肠道致病菌以及发热为主要症状的8种常见非沙门菌也均扩增阴性。在对纯菌总RNA检测中,RT-LAMP的最低检测限为0.5 pg/反应,即97个拷贝/反应。在以全血模拟样品提取核酸为模板的检测中,敏感性达1 cfu/ml,比rRT-PCR检测低限高100倍。 结论 建立了敏感性高、特异性好的RT-LAMP检测血液中伤寒沙门菌的方法,为伤寒沙门菌感染的快速诊断及不明原因发热症状的病原初步鉴别提供了简便的手段,可用于对伤寒的早期诊断、预防控制及临床治疗。
关键词: 伤寒沙门菌, 反转录-环介导等温核酸扩增技术, 伤寒
中国非伤寒沙门菌主要血清型临床分离株耐药特征分析
刘力彰, 卢珊, 赵素莲, 肖燕, 聂艳妮, 阚飙, 闫梅英
2013,28(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.6.011
目的 了解我国临床非伤寒沙门菌主要致病血清型菌株对常用药物的敏感情况、耐药特征及耐药变迁,为临床用药提供参考,为沙门菌感染的预防控制决策提供依据。 方法 利用肉汤微量稀释法测定我国2006-2011年219株包含阿贡纳、韦太夫雷登、山夫登堡3种主要沙门菌血清型临床分离株对14种抗生素的最小抑菌浓度(MIC),依据CLSI 2012版敏感判定标准,判定这些沙门菌对抗生素的敏感及耐药情况。 结果 所有菌株对第四代头孢类抗生素头孢吡肟的敏感率均为100%。对第三代头孢菌素(头孢噻肟、头孢他啶)及氨苄西林、甲氧苄氨嘧啶、复方新诺明、四环素、氯霉素、庆大霉素、环丙沙星的敏感率为97%~99%,对链霉素的敏感率为93.61%, 对萘啶酸的敏感率为91.32%,对磺胺甲恶唑的敏感率最低,为85.39%。受试菌株中对3种及3种以上抗生素耐药菌株8株(耐药率为3.65%),其中阿贡纳沙门菌6株。发现同时对氨苄西林、氯霉素、链霉素、磺胺甲恶唑及四环素(ACSSuT)耐药菌株2株,产超广谱内酰胺酶(ESBLs)菌株1株,均为阿贡纳沙门菌。3种沙门菌对磺胺类药物耐药程度明显不同:阿贡纳沙门菌对磺胺甲恶唑耐药率最高,达35.09%,山夫登堡沙门菌对磺胺甲恶唑的耐药率为14%,而韦太夫雷登沙门菌对磺胺甲恶唑则全部敏感。 结论 3种临床常见非伤寒沙门菌血清型对14种抗生素的敏感性不同,不同血清型沙门菌存在不同程度的耐药及多重耐药现象,但总体上对临床常用抗生素敏感性较高,若临床发生此3种血清型沙门菌急性感染时,可以考虑使用除磺胺甲恶唑外的药物进行前期经验性治疗。
关键词: 沙门菌, 最小抑菌浓度, 抗生素敏感性, 耐药谱
1995-2004年全国伤寒副伤寒的流行分析
闫梅英, 梁未丽, 李伟, 阚飙
2005,20(8) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2005.8.401
目的分析1995-2004年全国伤寒副伤寒流行特征和趋势,为制定防治措施提供依据。方法利用近10年的全国伤寒副伤寒疫情资料,用SPSS10.0软件,并根据开展的疾病控制工作,分析了近10年伤寒副伤寒在我国的发病情况。结果全国报告例数、发病率和病死率在逐年下降,地区分布上仍表现为相对集中趋势,发病季节性、发病人群构成比无明显变化。甲型副伤寒在我国已流行并在继续扩展,在一些地区超过伤寒的流行,但当前存在诊断欠明确、报告病例数不确切的问题。结论伤寒疫情仍然严峻,副伤寒发病呈流行上升趋势,对此需要进一步调查分析;还需要改进伤寒副伤寒的检测方法、明确伤寒副伤寒发病构成、监测疫情发展、分析流行因素,并在高发区开展综合的控制措施。
关键词: 伤寒, 副伤寒, 流行特征, 防治措施
利用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应方法检测血液中伤寒沙门菌
樊粉霞, 娄静, 陈建才, 聂艳妮, 阚飙, 闫梅英
2012,27(6) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.6.016
目的 建立实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(real time fluorescent quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, rRT-PCR)方法检测伤寒沙门菌。 方法 针对伤寒沙门菌STY1631基因设计特异性引物,通过优化反应条件,建立检测该靶基因的rRT-PCR方法,利用51个血清型的纯培养伤寒和非伤寒沙门菌菌株、常见非沙门致腹泻病原菌以及发热为主要症状的8种常见病原菌核糖核酸(RNA)评价该方法的特异性及敏感性,同时对伤寒沙门菌全血模拟标本进行敏感性检测。 结果 利用该方法检测48株伤寒沙门菌均阳性,其余33种非伤寒沙门菌血清型、致腹泻的其他5种肠道致病菌以及发热为主要症状的8种常见非沙门菌也均扩增阴性。在对纯菌总RNA检测中,rRT-PCR的最低检测限为1 pg/反应,即194个拷贝/反应。以全血模拟样品提取核酸为模板的检测中,敏感性达1102 cfu/ml。 结论 建立了敏感性高、特异性好的rRT-PCR检测血液中伤寒沙门菌的方法,为伤寒沙门菌感染的快速诊断及不明原因发热症状的病原初步鉴别提供了简便的手段,可用于对伤寒的早期诊断、预防控制及临床治疗。
关键词: 伤寒沙门菌, 实时荧光定量反转录-聚合酶链反应, 检测
聚合酶链反应扩增STY3671基因鉴别伤寒与甲型副伤寒沙门菌
张力, 樊粉霞, 闫梅英, 阚飙
2012,27(3) .
目的 评价伤寒沙门菌基因STY3671用于特异性检测该血清型沙门菌的可能性。 方法 根据伤寒沙门菌与甲型副伤寒沙门菌外膜蛋白质组比较得到的伤寒沙门菌特异性蛋白点编码基因STY3671的序列设计引物,提取伤寒沙门菌、甲型副伤寒沙门菌以及其他非伤寒沙门菌血清型菌株的基因组DNA进行PCR检测, 对引物特异性和灵敏性进行分析。 结果 检测的184株伤寒沙门菌均得到807 bp长度片段,部分菌株扩增产物测序结果与伤寒沙门菌标准株CT-18一致。146株甲型副伤寒沙门菌以及其余163株其他血清型沙门菌均未扩增出该片段。 结论 STY3671基因能够作为特异性检测伤寒沙门菌的靶标,能够区别于甲型副伤寒沙门菌及其他常见非伤寒沙门菌血清型,在发热患者的伤寒沙门菌感染诊断、尤其使用血液标本检测中具有良好的潜在价值。
关键词: 伤寒沙门菌, 检测, 聚合酶链反应
我国省级疾病预防控制系统实验室主要腹泻病原菌检测能力调查分析
娄静, 李杰, 阚飙, 闫梅英
2012,27(5) . doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2012.5.003
目的 了解我国省级疾病预防控制系统实验室针对主要腹泻病原菌的检测条件和能力,为促进以实验室为基础的腹泻病监测工作提出建议。 方法 以调查表的形式调查了27个省级疾病预防控制中心(CDC)实验室在细菌分离鉴定、血清分型及耐药性监测方面的实验条件、分子生物学技术能力以及实验储备情况和需求。 结果 27个省级CDC实验室完成了本次调查,针对主要腹泻病原,具备了基本实验室分离培养、生化鉴定、血清分型的能力;分离菌株耐药性检测仍以集中时段的实验为主;一些分子生物学检测和分子分型方法部分实验室仍未建立付诸应用;实验室人员不足。 结论 目前我国省级CDC系统实验室能够完成常见致病菌基本的培养鉴定,但在腹泻病原菌检测方面的能力尚显不足,表现在实验室专业技术人员不足,培训缺乏。需要在基于分子生物学的快速检测、分子分型技术方面加强力量,并促进腹泻病原监测的实验室网络化发展。
关键词: 疾控系统实验室, 腹泻病原菌, 实验条件
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