浙江省湖州市柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区序列测定及系统进化分析

纪蕾 吴晓芳 陈莉萍 徐德顺 沈月华 查赟峰 朱晓娟

纪蕾, 吴晓芳, 陈莉萍, 徐德顺, 沈月华, 查赟峰, 朱晓娟. 浙江省湖州市柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区序列测定及系统进化分析[J]. 疾病监测, 2014, 29(6): 441-444. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.007
引用本文: 纪蕾, 吴晓芳, 陈莉萍, 徐德顺, 沈月华, 查赟峰, 朱晓娟. 浙江省湖州市柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区序列测定及系统进化分析[J]. 疾病监测, 2014, 29(6): 441-444. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.007
JI Lei, WU Xiao-fang, CHEN Li-ping, XU De-shun, SHEN Yue-hua, ZHA Yun-feng, ZHU Xiao-juan. Genetic characteristics of VP1 region of coxsakievirus A16 strains isolated in Huzhou, Zhejiang, 2011-2012[J]. Disease Surveillance, 2014, 29(6): 441-444. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.007
Citation: JI Lei, WU Xiao-fang, CHEN Li-ping, XU De-shun, SHEN Yue-hua, ZHA Yun-feng, ZHU Xiao-juan. Genetic characteristics of VP1 region of coxsakievirus A16 strains isolated in Huzhou, Zhejiang, 2011-2012[J]. Disease Surveillance, 2014, 29(6): 441-444. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.007

浙江省湖州市柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区序列测定及系统进化分析

doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.201.06.007

Genetic characteristics of VP1 region of coxsakievirus A16 strains isolated in Huzhou, Zhejiang, 2011-2012

  • 摘要: 目的 了解浙江省湖州市引起手足口病(HFMD)的柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)分离株的VP1区基因特征。 方法 采用荧光定量反转录聚合酶链反应方法,对2011-2012年湖州市538份HFMD临床标本进行肠道病毒核酸检测;采用RD、Hep2细胞对Cox A16核酸阳性的标本进行病毒分离。选取17株具有代表性的Cox A16分离株进行VP1区的序列测定和分析。 结果 2011-2012年湖州市HFMD的主要病原为Cox A16和肠道病毒71型(EV71);湖州地区Cox A16分离株VP1区的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.5%~100%和99.3%~100%。与Cox A16的B1基因亚型代表株核苷酸同源性最高,在系统进化树上与B1亚型代表株相聚在一起,并且同时存在B1a 和B1b 两个进化分支。 结论 湖州市的Cox A16分离株与国内其他地区类似,同属于B1基因亚型,并且有B1a 和B1b 两个进化分支共同进化和循环。
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  • 收稿日期:  2013-12-30
  • 刊出日期:  2014-06-20

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