浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析

陈寅 茅海燕 周敏 李榛 严菊英 张严峻 卢亦愚

陈寅, 茅海燕, 周敏, 李榛, 严菊英, 张严峻, 卢亦愚. 浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析[J]. 疾病监测, 2013, 28(10): 811-814. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007
引用本文: 陈寅, 茅海燕, 周敏, 李榛, 严菊英, 张严峻, 卢亦愚. 浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析[J]. 疾病监测, 2013, 28(10): 811-814. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007
CHEN Yin, MAO Hai-yan, ZHOU Min, LI Zhen, YAN Ju-ying, ZHANG Yan-jun, LU Yi-yu. Sequence analysis of neuraminidase gene of influenza A (H1N1) pdm09 viruses in Zhejiang[J]. Disease Surveillance, 2013, 28(10): 811-814. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007
Citation: CHEN Yin, MAO Hai-yan, ZHOU Min, LI Zhen, YAN Ju-ying, ZHANG Yan-jun, LU Yi-yu. Sequence analysis of neuraminidase gene of influenza A (H1N1) pdm09 viruses in Zhejiang[J]. Disease Surveillance, 2013, 28(10): 811-814. doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007

浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析

doi: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007
基金项目: 

浙江省重点科技创新团队计划(No.2011R50021)

浙江省医药卫生科技计划(No.2013KYB054)

浙江省公共卫生检验检测重点学科群资助(No.XKQ-009-003)

Sequence analysis of neuraminidase gene of influenza A (H1N1) pdm09 viruses in Zhejiang

Funds: 

This study was supported by the funds from Program for Zhejiang Leading Team of Science and Technology Innovation (No.2011R50021)

Zhejiang Medical Scientific Research Project (No.2013KYB054) and Zhejiang Key Medical Subjects Construction Project (No.XKQ-009-003)

  • 摘要: 目的 分析浙江省2009 2013年初甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因(NA)序列进化特征。 方法 提取浙江省2009 2013年初29株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NA基因,测序并拼接出ORF。以浙江省不同年份与地域15份代表性毒株NA序列和GenBank数据库中选取的22株2009 2012年国内外甲型H1N1流感病毒NA基因序列,采用MEGA 5.1软件对其进行序列比对并构建种系发生树。 结果 扩增并测序获得29株甲型H1N1流感病毒的NA基因ORF的全长序列,与国内外甲型H1N1流感病毒NA序列比对后显示序列的同源性较高,浙江省毒株与北美早期甲型H1N1流感病毒典型代表株A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.20%~99.50%,其中采集于2012年末和2013年初的4份病毒NA与A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.63%~99.14%。在1株采集于2010年1月的甲型H1N1流感病毒NA的基因序列中发现可导致奥司他韦耐药的H275Y突变基因型。 结论 虽然浙江省后期的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因累积了更多的变异,但所有毒株之间基因同源性仍然较高,所有毒株的神经氨酸酶基因同源性达到98.20%及以上,序列分析结果证实1份毒株携带奥司他韦耐药基因型突变。
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-08-02
  • 刊出日期:  2013-10-20

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