2021年  第36卷  第5期

封面
2021-05期封面
2021, 36(5): 0-0.
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摘要:
目录
2021-05期目录
2021, 36(5): 1-3.
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摘要:
疫情快报
 2021年4月中国甲乙丙类传染病疫情动态简介National Data of Class A, B and C Communicable Diseases in April 2021
2021, 36(5): 397-397. DOI: 10.3784/jbjc.202105180271
[摘要](161) [HTML全文] (61) [PDF 429KB](27) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
2021年4月中国甲乙丙类传染病疫情动态概要
2021, 36(5): 398-399. DOI: 10.3784/jbjc.202105180272
[摘要](232) [HTML全文] (36) [PDF 409KB](18) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
2021年4月全球传染病疫情概要
韩辉, 伍波, 张瑾, 吴海磊, 贾娇娇
2021, 36(5): 400-402. DOI: 10.3784/jbjc.202105190277
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摘要:
2021年4月全球共监测到传染病66种,涉及225个国家和地区。 除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒肺炎(COVID-19, 225 个)、登革热(33个)、麻疹(26个)、脊髓灰质炎(10个)和肺炎球菌病(7个)。 病死率位于前5位的传染病分别为埃博拉病毒病(51.4%)、黄热病(33.3%)、拉沙热(20.5%)、白喉(7.0%)和流行性脑脊髓膜炎(5.4%)。 死亡病例数位于前5位的传染病分别为COVID-19、霍乱、麻疹、登革热和拉沙热。 亚洲主要流行COVID-19和登革热;非洲主要流行COVID-19、埃博拉病毒病、霍乱、黄热病、拉沙热和裂谷热;美洲主要流行COVID-19和登革热;欧洲主要流行COVID-19。
风险评估
2021年5月中国大陆需关注的突发公共卫生事件风险评估
王平, 涂文校, 陈秋兰, 王霄晔, 冯晔囡, 孟玲, 魏依侬, 向妮娟, 施国庆
2021, 36(5): 403-405. DOI: 10.3784/jbjc.202105120261
[摘要](238) [HTML全文] (46) [PDF 2435KB](47) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  评估2021年5月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。  方法  根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。  结果  预计5月突发公共卫生事件的报告数将超过新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疫情大流行前5年的平均水平。 我国境内发生新冠病毒境外输入及续发本地传播风险持续存在,在我国防控策略未改变的情况下,随着疫苗接种加速和气温回升,5月面临疫情输入造成本地传播的风险可能与4月类似(或有所降低)。 全国布鲁氏菌病高于2020年以及前5年平均水平,预计5月将进一步升高。 5月将进入食物中毒事件高发月份,预计以微生物性事件为主,死亡原因则以有毒动植物及毒蘑菇中毒为主。  结论  特别关注新冠肺炎,重点关注布病,一般关注食物中毒。
2021年4月全球新型冠状病毒肺炎疫情风险评估
纪瀚然, 武洁雯, 杨昕娉, 梁作如, 赵青, 房元圣, 张荣娜, 庞眀樊, 戚晓鹏
2021, 36(5): 406-410. DOI: 10.3784/jbjc.202105190278
[摘要](291) [HTML全文] (33) [PDF 4036KB](46) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  评估2021年4月新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情全球流行情况及对我国的输入风险。  方法  根据美国约翰斯·霍普金斯大学公开发布的每日COVID-19疫情数据,结合牛津大学发布的政策严格性指数,采用流行病学描述方法,通过总体概述、WHO各区及重点国家疫情趋势综合评估和周边十四国疫情与防控政策综合分析,对全球COVID-19疫情风险进行综合、全面与及时的评估。 对于各国评估结果,用“全球重点关注国家”、“各WHO分区一般关注国家”和“周边特别关注国家”予以表示。  结果  相较2021年3月,全球月新增确诊病例增加了52.88%,全球月新增死亡病例增加了28.77%。 东南亚区的新增确诊和死亡病例呈现指数性增长,应重点关注。 有多个国家4月新增确诊增长率超过了100%。 印度是我国陆地接壤十四国中特别关注国家。  结论  进入4月后,全球COVID-19疫情加重,除非洲区外,其他各区4月新增确诊病例均有不同程度上升,其中东南亚区、西太平洋区和东地中海区的新增确诊和死亡病例增长率均较高,4月中旬后,东南亚区和西太平洋区疫情持续加重,其他各分区疫情好转。 对于全球重点关注区域和国家要持续进行监测,关注其疫情和防控政策变化,并与相关的机构建立沟通机制,及时预警。
传染病监测
2019-2020年塞拉利昂弗里敦市旱季冈比亚按蚊复合体的分子鉴定和传疟作用
赵宁, 赵嘉欣, 宋秀平, 王君, 吴海霞, 刘小波, 岳玉娟, 任东升, 刘起勇, 鲁亮
2021, 36(5): 411-416. DOI: 10.3784/jbjc.202102200082
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摘要:
  目的  通过疟疾主要传播媒介冈比亚按蚊复合体在弗里敦市的分布和疟原虫感染率的调查,为制定有效的防疟措施提供流行病学依据。  方法  2019年12月至2020年3月在塞拉利昂首都弗里敦市10个监测点利用诱蚊灯法进行蚊媒监测研究。 将冈比亚按蚊的胸部和腹部分开,分别提取基因组DNA,通过多重PCR鉴定蚊种,利用巢式PCR检测按蚊感染疟原虫的情况,应用Excel 2019和SPSS 21.0软件对结果进行统计分析。  结果  2019年12月至2020年3月,共捕获按蚊349只,平均诱捕按蚊密度为0.83只/(灯·晚)。 西部农村诱捕按蚊324只,占捕蚊总数的92.84%,平均诱捕按蚊密度为2.00只/(灯·晚)。 对192只冈比亚按蚊复合体进行的分子鉴定结果显示,冈比亚按蚊(狭义)S-型84只,占43.75%;冈比亚按蚊(狭义)M-型108只,占56.25%。冈比亚按蚊(狭义)中仅检测到恶性疟原虫,未检出间日疟原虫、三日疟原虫和卵形疟原虫。 恶性疟子孢子和卵囊阳性率分别为3.13%和6.77%。 2019年12月到2020年3月期间的月恶性疟子孢子和卵囊感染率差异无统计学意义。 108只冈比亚按蚊(狭义)M-型中子孢子和卵囊阳性率分别为3.70%和7.41%;84只冈比亚按蚊(狭义)S-型中子孢子和卵囊阳性率分别为2.38%和5.95%。 冈比亚按蚊(狭义)M-型中子孢子和卵囊阳性率高于S-型,差异无统计学意义。  结论  弗里敦市的优势按蚊蚊种为冈比亚按蚊(狭义)(M-型和S-型),监测到的其他按蚊有催命按蚊和 An. coustani。 西部农村按蚊密度远高于西部城区,具有较高的疟疾感染风险。 在旱季不同月份,野外诱捕冈比亚按蚊(狭义)的卵囊阳性率均为子孢子阳性率的2倍,而其旱季每月的传疟作用较稳定。 本研究将为塞拉利昂疟疾防控策略的制定提供理论依据。
2020 年天津市宁河区急性胃肠炎聚集疫情病原体轮状病毒全基因组序列分析
雷玥, 庄志超, 田宏, 董兴华, 李晓燕
2021, 36(5): 417-422. DOI: 10.3784/jbjc.202012020407
[摘要](208) [HTML全文] (38) [PDF 3178KB](30) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  分析2020年天津市宁河区一起急性胃肠炎聚集疫情的病原A组轮状病毒(RVA)的全基因组序列,调查原因及防控措施。  方法  对送检轮状病毒阳性粪便标本核酸进行提取,经real-time PCR进一步确证;构建DNA测序文库,采用二代测序法进行测序,合格序列拼接为11条基因片段。 对轮状病毒重要VP7、VP4和NSP4等序列进行系统进化和重要抗原表位变异分析。  结果  经确认4份样本为RVA阳性,二代测序成功获得4株轮状病毒全基因序列。 4株RVA相似性为99%以上,所获毒株均为Wa-like基因组群,G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1。 亲缘关系树分析所有毒株的VP7基因属于G9-Ⅵ,VP4基因属于P[8]-3亚型。 基因序列进一步揭示了VP7和VP4抗原表位存在氨基酸位点替代现象。 并且在非结构蛋白NSP4基因的Ⅰ型和Ⅱ型抗原表位上存在氨基酸位点的改变。 其余结构蛋白和非结构蛋白均相对保守。  结论  G9-Ⅵ亚型、P[8]-3亚型RVA是本次疫情的病原体,本次所获得的4株轮状病毒与现流行毒株变异较小,但应加强轮状病毒全基因组的进化监测,为掌握其流行趋势的变化和开展有效的疫情防控提供科学数据。
2017-2019年度上海市松江区A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征分析
吴佳瑾, 刘玲, 赵雪, 盛峰松, 乔雪飞
2021, 36(5): 423-430. DOI: 10.3784/jbjc.202102200078
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摘要:
  目的  分析上海市松江区2017 — 2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征。  方法  对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎那米韦敏感性监测。  结果   A(H1N1)pdm09流感病毒属于6B.1A分支且进化出了6B.1A2、6B.1A5A和6B.1A6进化簇。 核苷酸序列分析显示,HA和NA基因与WHO推荐的2019 — 2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的亲缘关系较为接近,同源性分别为98.6%~99.4%和99.1%~99.7%。 氨基酸序列分析显示,HA1蛋白共有23个位点发生氨基酸序列变异,43.48%病毒发生位于抗原决定簇Cb、Sa和Sb区的S74R、S164T、T185I共同突变,提示病毒发生抗原漂移。 鸡胚适应性分析发现HA蛋白D187V、Q223R和E224K位点的适应性突变。 NA蛋白共有25个位点发生变异,存在酶活性中心E119K(2/46)突变。 神经氨酸酶抑制实验显示,所测流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感。  结论  A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因及其编码的氨基酸持续变异,因此应持续监测流感病毒,为科学防控提供依据。
2015-2019年浙江省发热伴血小板减少综合征流行特征分析
施旭光, 孙继民, 刘营, 张蓉, 任江萍, 郭颂, 凌锋
2021, 36(5): 431-435. DOI: 10.3784/jbjc.202101070014
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摘要:
  目的  对浙江省发热伴血小板减少综合征(SFTS)的流行病学特征进行分析,为SFTS的防控工作提供依据。  方法  从国家疾病监测信息报告管理系统中获取2015 — 2019年浙江省SFTS疫情资料,采用描述性流行病学方法分析SFTS病例的时间、人群、地区分布特征。 使用ArcGIS 10.2软件进行空间地图绘制,采用SPSS 16.0软件进行统计学检验。  结果  2015 — 2019年浙江省累计报告SFTS病例337例,年均报告发病率为0.12/10万(0.08/10万~0.15/10万),其中男性163例,女性174例,男女性别比为0.94∶1;死亡35例,病死率10.39%。 病例集中在4 — 10月,夏季为发病高峰。 45岁以上中老年人为高发人群(94.66%,319/337),职业以农民为主(59.94%,202/337)。 发病数居前3位的地区分别为台州市(143例)、舟山市(83例)和宁波市(33例),占病例总数的76.85%。 每年波及县(区)数分别为13、17、19、24和18个。 2018年绍兴市上虞区报告一起家庭聚集性疫情,共报告4例病例,血液、分泌物或排泄物可能是重要传播因子。  结论  SFTS在浙江省的分布范围不断扩大,主要发生在丘陵山区的中老年人,呈现明显的季节分布特征,应着重在高发地区、重点人群中开展宣传教育、监测及培训等防控措施。
云南省保山市人兽布鲁氏菌病疫情调查分析
李艳萍, 马强, 黄东升, 赵明, 马云良, 唐咸艳
2021, 36(5): 436-439. DOI: 10.3784/jbjc.212101070013
[摘要](225) [HTML全文] (68) [PDF 2020KB](40) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的   分析云南省保山市布鲁氏菌病(布病)突发公共卫生事件特征,为布病疫情调查处置提供科学参考。   方法   采用描述性流行病学方法对全市布病突发公共卫生事件调查处置资料进行分析。   结果   2017年以来保山市报告2起布病疫情。 第一起为由梅花鹿引起的布病感染事件,具体为从事梅花鹿饲养人员因不明原因持续发热、四肢乏力等,检测布鲁氏菌抗体滴度1∶400++,经血培养检出羊种布鲁菌。 同时采集梅花鹿血样10份,检出2份抗体阳性。 第二起为由肉牛引起的布病感染事件,具体为对龙陵县MR镇10名肉牛饲养员和6名兽医开展布鲁氏菌感染监测,检出2人血清抗体阳性,19头肉牛抗体阳性。   结论   保山市报告的2起人和动物布病疫情,通过及时调查和处置,疫情得到有效控制,建议养殖经济动物要严格落实引入动物检疫措施,加强人员及动物间疫情监测。
2013-2020年我国急性出血性结膜炎流行特征及暴发疫情分析
胡停停, 赵鹤鹤, 段晓健, 黄晓霞, 王晓芳, 王英
2021, 36(5): 440-444. DOI: 10.3784/jbjc.202011130385
[摘要](177) [HTML全文] (69) [PDF 3643KB](35) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  对于2013年以来我国急性出血性结膜炎(AHC)流行特征及暴发疫情情况进行汇总分析,为完善我国AHC监测和科学制定防控措施提供依据及建议。  方法  疫情数据来自全国疾病监测和突发公共卫生事件信息报告管理系统。 利用SPSS、ArcGIS等统计分析方法对全国疫情进行回顾性流行病学分析及统计学检验,并对暴发疫情特征及原因进行汇总分析。  结果  2013 — 2020年我国共报道AHC病例289 518例,年均发病率为2.63/10万。 2014年与2019年出现2次发病小高峰,2014年较2013年报告发病率上升19.11%,2019年较2018年报告发病率上升8.00%。 每年6—10月为高发季节,0~9岁年龄组为高发组,但50岁及以上年龄组的发病例数占比近年有所上升。 男女性别比为1.18∶1,发病数居前7位的是广西壮族自治区、广东省、安徽省、湖北省、云南省、河南省和河北省,7省报告病例数占全国总数66.13%。 2013年以来我国共报告AHC突发疫情38起,其中35起发生在学校,2起发生在村庄,1起发生在城镇社区,以云南省报告起数最多(13起)。  结论  近年来我国AHC疫情稳中有降,仍呈现每隔3~5年一次发病高峰的态势,2014年与2019年出现2次发病小高峰,2020年因新型冠状病毒肺炎疫情防控措施,报告病例数显著大幅下降。 学校等人群高度聚集地易发生AHC暴发疫情,仍是今后防控工作的重点;而中老年人发病数占比呈上升的趋势,也提示AHC传播随社会发展呈现新特点,需持续重视农村、学校以及病原检测等疫情监控措施。
2017-2019年广西钦州市部分新报告HIV/AIDS感染者病毒亚型及细胞嗜性研究
沈建洋, 曹志强, 陈欢欢, 沈智勇, 王卫军, 林兆森, 黄荣叶, 李梅, 陈锦妹, 赵慧华, 蒋丽萍, 吴福宝, 冯毅, 阮玉华, 邢辉, 廖玲洁, 李剑军
2021, 36(5): 445-451. DOI: 10.3784/jbjc.202012170426
[摘要](477) [HTML全文] (57) [PDF 3159KB](21) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的   了解2017 — 2019年广西壮族自治区(广西)钦州市新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病患者(AIDS)中病毒基因亚型、耐药及细胞嗜性情况。   方法   选取2017 — 2019年钦州市部分新报告HIV/AIDS,检测CD4+T淋巴细胞数量,并对HIV的polenv基因区进行扩增、测序,构建系统进化树判定基因亚型。 利用斯坦福耐药数据库判定新报告感染者的耐药情况,利用Geno2pheno判定嗜性,并采用非参数Wilcoxon或Kruskal-Wallis检验分析不同亚型、不同嗜性之间CD4+T淋巴细胞数量的差异。   结果   764例新报告感染者中,CRF01_AE、CRF08_BC、CRF07_BC分别占比50.1%(383/764)、31.2%(238/764)、10.9%(83/764)。CRF01_AE中第1簇(Cluster1)、第2簇(Cluster2)分别占18.3%(70/383)、72.3%(277/383)。 48例新报告感染者发生治疗前耐药,耐药率为6.3%;CD4+T淋巴细胞数量<200个/μL的占51.4%;CRF01_AE、CRF08_BC与CRF07_BC 3种基因型之间CD4+T淋巴细胞中位数M(P25,P75)分别为205(41,303)、238(105,336)、308(179,394)且计数水平不全相等(P<0.0001);辅助受体利用预测有108例为CXCR4(X4),656例为CCR5(R5);X4嗜性的CD4+T淋巴细胞数量显著低于R5嗜性的CD4+T淋巴细胞数量。   结论   2017 — 2019年钦州市新报告HIV/AIDS中存在多种病毒亚型,耐药水平较高,病毒嗜性预测分析将有助于采取针对性的防治措施。
2012-2019年上海市男男性行为哨点人群HIV-1感染情况及影响因素分析
吴健, 张佳玉, 王旭婷, 舒伟萍, 徐元, 秦晓云, 宁镇
2021, 36(5): 452-456. DOI: 10.3784/jbjc.202110300371
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摘要:
  目的  了解2012 — 2019年上海市男男性行为人群(MSM)的人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)感染和相关行为情况,探索MSM HIV感染的影响因素,为制定MSM的艾滋病防治措施提供依据。  方法  2012 — 2019年对上海市MSM开展哨点监测,采集研究对象静脉血进行HIV、HCV及梅毒抗体检测,用logistic回归模型分析MSM HIV感染的影响因素。  结果  2012 — 2019年共检测MSM 3 207人,以25~34岁、未婚、非本市户籍、本地居住时间超过2年、大专及以上文化程度为主,预防艾滋病服务措施覆盖率中位数86.3%,艾滋病相关知识知晓率中位数94.6%。 HIV抗体阳性检出率中位数为6.5%,总体呈上升趋势(P<0.001)。 85.2%调查对象最近 6 个月与同性发生过肛交性行为,其中坚持使用安全套的比例为 79.3%。 最近6个月与同性肛交性行为、商业性行为或异性性行为时使用安全套均呈上升趋势(P<0.05)。 多因素分析显示,文化程度高中及以下(OR=1.506,95%CI:1.067~2.126,P=0.020)、每次同性肛交性行为都未使用安全套(OR=1.379,95%CI:1.005~1.891,P=0.047)、吸毒(OR=3.688,95%CI:1.412~9.634,P=0.008)及感染梅毒(OR=5.872,95%CI:3.784~9.111,P<0.001)为HIV感染的危险因素。  结论  上海市MSM HIV抗体阳性率持续保持较高水平,艾滋病相关危险行为仍然存在,须进一步探索针对性的有效干预模式,减少艾滋病相关危险行为发生和传播。
基于基因组序列的副溶血弧菌两种分型方法比较研究
张景山, 赵文轩, 陈美玲, 杜小莉, 赵林, 王紫鉴, 肖文静, 张巍巍, 赵宏群, 李杰, 刁保卫, 阚飙, 逄波
2021, 36(5): 457-461. DOI: 10.3784/jbjc.202011050373
[摘要](302) [HTML全文] (75) [PDF 7943KB](16) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  比较基于全基因组测序(WGS)SNP的分型方案和多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方案用于我国副溶血弧菌分子分型的能力,并分析两种方法的优缺点及适用情况。  方法  选取我国分离的56株副溶血弧菌,使用6个数目可变串联重复序列(VNTR)位点的MLVA方案和基于全基因组序列SNP的方案对这些菌株进行分子分型分析,通过量化指标评价这两种方法对我国分离的副溶血弧菌的分型能力。  结果  56株副溶血弧菌经MLVA分型,获得31种MLVA型,D值为0.949。 对56株副溶血弧菌进行全基因组测序,获得33个差异明显的基因型,D值为0.967。 两种分型方法对菌株的分辨能力十分接近,分型结果高度一致。  结论  6位点的MLVA分型方案与基于全基因组测序SNP的分型方案具有相似的分型能力,其分型能力稍弱。
技术与方法
肠球菌菌种鉴定方法的探索
白一波, 徐明超, 焦一帆, 周娟, 张思慧, 杨晶, 刘丽云, 徐建国
2021, 36(5): 462-467. DOI: 10.3784/jbjc.202102210083
[摘要](117) [HTML全文] (94) [PDF 2008KB](27) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  选择一种能将肠球菌属鉴定到种水平的快速准确的方法。  方法  分别使用生化鉴定方法、16S rRNA基因测序技术、rpoA基因测序技术、基因组杂交技术(DNA–DNA hybridization,DDH)和平均核苷酸相似度(Average nucleotide identity,ANI)对12株肠球菌进行种水平鉴定,并比较生化鉴定方法、16S rRNA基因测序技术和rpoA基因测序技术和DDH/ANI结果的一致性。  结果  经过DDH和ANI鉴定,分离自高原野生岩羊粪便的12株肠球菌中有5株屎肠球菌,4株海氏肠球菌,1株蒙氏肠球菌,1株鹑鸡肠球菌和1株疑似肠球菌属内新种,rpoA基因序列比对结果与DDH/ANI结果高度一致,生化鉴定和16S rRNA基因测序技术与DDH/ANI结果不完全相符。  结论  rpoA基因序列比对可以方便快捷准确的将肠球菌鉴定到种水平。
基于基因组序列的3种沙门菌分子血清分型方法比较研究
陈丹妮, 韩营营, 李杰, 李臻鹏, 闫梅英
2021, 36(5): 468-474. DOI: 10.3784/jbjc.202002050063
[摘要](259) [HTML全文] (88) [PDF 2035KB](29) 审稿意见 相关文献 分享
摘要:
  目的  比较3种沙门菌分子血清分型方法,获得一种准确度较高的方法用来替代传统的血清凝集技术用于沙门菌血清型判定。  方法  对覆盖50个血清型的509株沙门菌提取核酸进行全基因组测序,根据全基因组序列分别利用多位点序列分型(MLST)、SalmonSeroPredicition以及SISTR(Salmonella in silico typing resource)3种方法在线预测获得每株菌的血清型,然后与传统血清凝集获得的血清型进行一致性比较分析,评估每种方法血清型预测的准确度。  结果  SISTR、MLST以及SalmonSeroPredicition预测血清型的准确率分别为96.67%、93.52%、69.16%。 常见沙门菌血清型印第安纳沙门菌和鼠伤寒沙门菌血清型预测正确率最高,为100%,德尔卑沙门菌、肠炎沙门菌血清型预测正确率分别为99.17%、95.74%。 3种方法均预测错误的血清型有肠炎沙门菌、德尔卑沙门菌和沙门菌的萨拉姆亚种、亚利桑那亚种和双相亚利桑那亚种等;预测错误原因主要是基因序列丢失和鞭毛抗原基因未表达。  结论  基于基因组序列的SISTR血清型预测方法具有较高的血清型预测准确度,在传统血清凝集难以开展或沙门菌鞭毛基因不表达的情况下,可以替代血清凝集试验进行沙门菌血清型判定。
实验研究
截短的BabA蛋白结合区(C51)具有促进幽门螺杆菌AGS细胞黏附作用
韩秀瑞, 范如岳, 何利华, 宫雅楠, 薛志静, 翟康乐, 杨雅名, 孙路, 尤元海, 赵飞, 范冬洁, 张建中
2021, 36(5): 475-480. DOI: 10.3784/jbjc.202102260091
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摘要:
  目的   获得能与Lewis b结合的截短的BabA结合域,并评价其对幽门螺杆菌黏附人胃腺癌上皮细胞系(AGS细胞)的影响。   方法   采用Swiss Model分析蛋白截短后的结构变化,克隆表达截短的BabA结合区蛋白,命名为C51,用Native-PAGE蛋白电泳法检测其是否为多聚体。 用流式细胞术检测C51蛋白对J99和M523两株幽门螺杆菌黏附AGS细胞的影响,并用革兰染色观察C51蛋白对幽门螺杆菌聚集的影响。   结果   体外表达的C51蛋白以多聚体形式存在,该蛋白促进了J99和M523的聚集并使其与AGS的黏附分别增加了12%(t=8.211,P=0.001)和22%(t=4.402,P=0.012)。   结论   C51蛋白仍保持了与黏附相关的空间结构,并促进了幽门螺杆菌和AGS细胞的结合。
河弧菌AL536_RS29525基因功能研究
张安冉, 刘笑舒, 黄元铭, 韩雨, 刘平, 李杰, 阚飙, 梁未丽
2021, 36(5): 481-488. DOI: 10.3784/jbjc.202101250043
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摘要:
  目的  探讨河弧菌基因组中VflT6SS2核心基因簇上游paar基因簇中AL536_RS29525的序列特征、对VflT6SS2分泌功能和杀菌活性的影响以及可能的调控机制。  方法  利用Muscle、GeneDoc软件进行AL536_RS29525基因编码产物的序列特征分析;同源重组技术构建AL536_RS29525的缺失株,PCR扩增AL536_RS29525编码序列克隆于pSRKTc获得回补质粒pSR-29525,继而导入∆AL536_RS29525得到回补株;Western Blot (WB)检测相应菌株中VflT6SS2 Hcp蛋白的表达和分泌,以大肠埃希菌为prey的细菌竞争/杀菌实验检测VflT6SS2介导的菌株杀菌能力;基于Lux报告基因的启动子融合系统冷光检测确定AL536_RS29525缺失对VflT6SS2核心基因簇启动子和hcp启动子活性的影响;荧光定量反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测hcptssD2)和vipAtssB2) mRNA的相对表达水平。  结果  AL536_RS29525同源基因编码蛋白的结构和功能较为保守;缺失AL536_RS29525负性影响VflT6SS2 Hcp蛋白的表达及分泌,降低VflT6SS2介导的菌株杀菌能力,回补AL536_RS29525可恢复缺失株 Hcp 的表达、分泌和杀菌能力;缺失株∆AL536_RS29525中hcptssD2)和vipAtssB2)的mRNA表达量均低于野生株;而VflT6SS2的核心基因簇启动子和hcp启动子活性在∆AL536_RS29525缺失株和野生株之间无显著差异。  结论  河弧菌AL536_RS29525基因较为保守,与霍乱弧菌以及弗尼斯弧菌的同源基因均具有较高的同源性。 AL536_RS29525基因是河弧菌VflT6SS2的重要组成部分,为其Hcp效应子的正常表达、分泌功能以及VflT6SS2介导的杀菌活性所必需。AL536_RS29525可能转录后水平影响VflT6SS2的功能表达。
耐药监测
tdh+tdh副溶血弧菌耐药表型与基因型差异分析
肖文静, 陈美玲, 赵文轩, 李臻鹏, 张天姿, 卢盼, 李杰, 阚飙, 逄波
2021, 36(5): 489-494. DOI: 10.3784/jbjc.202103080104
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摘要:
  目的  描述tdh+tdh副溶血弧菌表型与基因型耐药差异,分析耐药基因型与耐药表型之间的关系。  方法  采用K-B纸片法检测208株tdh+与73株tdh副溶血弧菌对临床及水产养殖中常用的7类16种抗生素的敏感性,使用新一代测序技术获得实验菌株的全基因序列,通过序列比对分析基因组中耐药基因及耐药相关基因突变情况。 分析耐药表型与基因型之间的关系。  结果  tdh+菌株和tdh菌株对亚胺培南均100%敏感。 tdh+菌株对头孢吡肟、阿奇霉素耐药率(0.48%、8.65%)高于tdh菌株(0.00%、4.11%);tdh菌株对氨苄西林、头孢西汀、头孢曲松、环丙沙星、萘啶酸、链霉素、卡那霉素、庆大霉素、磺胺甲恶唑、复方新诺明、四环素、多西环素、氯霉素耐药率均高于tdh+菌株。 tdh菌株的多重耐药率(34.25%)高于tdh+菌株(19.23%)。 耐药基因共检出5类7种,其中β-内酰胺类blaCARB基因在所有的tdh+菌株和tdh菌株均检出;四环素类tet(34)基因在tdh+tdh菌株基因携带率分别为99.52%、98.63%;喹诺酮类耐药基因qnrS5 仅在tdh+菌株中检出;tdh菌株中叶酸代谢抑制类(sul2)、四环素类[tet(35)、tet(59)苯丙醇类(floR)耐药基因检出率高于tdh+菌株。 共在14株(tdh+9株,tdh5株)细菌中检索出6种耐药基因点突变方式,均为编码16S rRNA的rrs基因突变。  结论  tdh副溶血弧菌耐药现象较tdh+副溶血弧菌更为严重; 16S rRNA的rrs基因突变是除aph(3'')-Ibaac(3)-Ⅱaac(6’) -Iaph(3'')-Id等耐药基因外副溶血弧菌对氨基糖胺类药物耐药的主要机制之一;副溶血弧菌中,可用blaCARB耐药基因存在情况预测副溶血弧菌氨苄西林耐药表型;除此之外其余抗生素耐药表型与其对应耐药基因之间未见明确的对应的关系。
2016-2018年中国西部地区结核分枝杆菌耐药率及影响因素分析
杜巧丽, 杜昌廷, 杨健, 王晓平, 王朝才, 闫双群, 王胜芬, 赵雁林
2021, 36(5): 495-500. DOI: 10.3784/jbjc.202010290446
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摘要:
  目的  了解中国西部地区2016 — 2018年结核分枝杆菌耐药情况及对产生耐药结核病的影响因素进行分析,为制定耐药结核病防控措施提供科学的依据。  方法  选取2016 — 2018年重庆市丰都县、重庆市奉节县、陕西省未央区、云南省通海县、青海省海西格尔木市、宁夏海原县6个国家耐药监测点收集的843例涂阳肺结核患者为研究对象,采用生化方法对患者分离菌株进行菌种鉴定,结核分枝杆菌复合群菌株采用比例法进行药物敏感性试验,分析不同监测点、时间耐药率的差异。 采用统一的调查问卷获得人口学、患者类型等信息,通过单因素和多因素分析耐药结核病产生的危险因素,单因素分析采用χ2检验,多因素分析采用二项logistic回归模型。  结果  843株结核分枝杆菌对6种抗结核药的总耐药率和耐多药率分别是23.13%和6.17%。 各抗结核药物的任一耐药顺位由高到低依次为链霉素(SM,13.29%)、异烟肼(INH,13.05%)、利福平(RFP,9.37%)、氧氟沙星(OFX,5.69%)、乙胺丁醇(EMB,4.39%)、卡那霉素(KM,1.42%),不同年份之间结核分枝杆菌株的总耐药率(2016年为22.41%;2017年为26.69%;2018年为20.59%)差异均无统计学意义(P>0.05)。根据西部6个监测点任一耐药率比较结果显示,陕西省未央区对INH、RFP、SM、OFX耐药率都最高,分别为22.29%、20.57%、23.43%和12.00%;青海省海西格尔木市对EMB的耐药率最高,耐药率为10.91%,云南省通海县对KM的耐药率最高地区,耐药率为5.66%,差异均有统计学意义(P<0.05)。单因素分析结果显示,患者类型(χ2=7.736,P=0.005)、性别(χ2=4.149,P=0.042)、现住址(χ2=9.112,P=0.03)、文化程度(χ2=15.182,P=0.004)为患者耐药的危险因素,纳入多因素logistic回归模型,结果显示,男性、复治、陕西省未央区监测点是耐药发生的危险因素(P<0.05)。  结论  西部地区,特别是陕西省未央区耐药情况较为严峻,应加强结核病耐药性监测,以指导临床用药和预防控制耐药结核病的发生和流行。
广东省多重耐药沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的耐药性及分子流行特征分析
黄静敏, 柯碧霞, 李柏生, 何冬梅, 刘哲, 李振翠, 邓小玲
2021, 36(5): 501-508. DOI: 10.3784/jbjc.202012020405
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摘要:
  目的  多重耐药沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的耐药形势日趋严峻,耐药克隆株的广泛传播已成为全球重点关注的公共卫生问题。 了解广东省多重耐药沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的耐药特征及遗传背景,为该血清型的耐药监测及食源性疾病暴发与防控预警提供证据支持。  方法  以广东省腹泻病原体监测哨点医院收集的92株沙门菌1,4,[5],12∶i∶-为研究对象,采用微量肉汤稀释法测定菌株对27种抗菌药物的最小抑菌浓度,采用全基因组测序技术进行耐药相关分子特征研究。 利用多位点序列分型和全基因组单核苷酸多态性两种方法进行菌株种群结构以及与国际流行克隆株之间的系统发育进化关系分析。  结果  本研究沙门菌1,4,[5],12∶i∶-菌株多重耐药情况严重,对四环素、氨苄西林和磺胺异噁唑呈高水平耐药,对氨基糖苷类、头孢菌素及喹诺酮类呈中度耐药,对喹诺酮类中介敏感率较高。 耐药基因与耐药表型整体相符,携带率高且种类多样,以IncHI2/IncHI2A、IncQ型质粒及插入序列等可移动遗传元件介导的耐药基因传播为本地区沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的主要耐药机制。 ST34为本地区沙门菌1,4,[5],12∶i∶-的优势克隆,与全球的流行株属于同一进化分支,具有较近的遗传进化关系。  结论  广东地区沙门菌1,4,[5],12∶i∶-菌株多重耐药谱广泛,耐药机制较复杂,以获得性耐药为主。 流行菌群具有明确的系统发育分支,以ST34多重耐药克隆为主,与全球流行趋势一致。
海外动态
2019年全球霍乱流行概况
龚震宇(摘译)
2021, 36(5): 509-510. DOI: 10.3784/jbjc.202010260366
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