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2019年浙江省岱山县首起海岛登革热本地暴发疫情流行病学调查
叶凌, 谭启龙, 易波, 虞吉寅, 管临福, 张浙恩, 李世波, 王秋景, 任宜, 舒纪为, 任江萍
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目的调查分析浙江省海岛地区首起登革热本地暴发疫情流行病学特征,为有效开展岛屿登革热防控提供依据。方法对江南岛和医疗单位进行病例搜索,对发现的病例进行流行学调查处置;采集病例血清检测登革热核酸和抗体,对病毒核酸扩增E基因序列测序并构建进化树,追溯可能传染源。结果该起暴发疫情共报告9例病例,均为登革病毒1型,无重症和死亡病例。疫情共持续15 d,男女性别比1:8,年龄最大77岁,最小25岁;DENV-1E基因序列与2017年分离自越南的四株序列(LC428079,LC428073,LC428062,LC428059)相似度99.81%,与2019年3月由柬埔寨输入至河南的序列(MK905537)相似度99.75%,与2016年分离自新加坡的序列(MF033254)相似度99.68%及与2019年6月由柬埔寨输入至浙江省丽水市的序列(MN444624)相似度99.62%。结论本次疫情是由登革病毒1型引起的本地暴发疫情,调查结果提示相关部门应大力开展清除蚊媒滋生地,降低蚊媒密度的爱国卫生运动,以及加强临床医生对登革热临床鉴别诊断培训。
一起在泰国公共公园被猴子咬伤,可能暴露乙型疱疹病毒的处置情况
龚震宇(摘译), 龚训良(审校)
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广东省广州市某幼儿园一起GII.4型诺如病毒感染性腹泻暴发调查分析
曾凤梅, 汪慧, 张家儿, 杨芬, 李美霞, 李意兰, 罗雷
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目的通过调查广东省广州市某幼儿园诺如病毒感染性腹泻暴发疫情,探索暴发的可能传播途径及危险因素,制定疫情防控措施。方法2019年10月24日,制定病例定义并进行病例搜索,开展病例个案调查和现场流行病学调查,自制问卷收集相关信息进行病例对照研究,采集病例及相关人员肛拭子标本,用荧光定量聚合酶链反应法检测诺如病毒核酸。结果2019年10月13-24日,该幼儿园共报告感染性腹泻病例25例,罹患率为9.80%(25/255),无重症和死亡病例;病例临床表现以呕吐(96.00%)为主;流行曲线提示为点源暴露后人-人传播增殖模式;病例主要集中在教学楼二楼的中一班,不同楼层、不同班级间罹患率差异均有统计学意义(P<0.05);病例均为幼儿,男性发病11例,罹患率为9.56%,女性14例,罹患率为10.20%,男女性罹患率差异无统计学意义(x2=0.343,P=0.558);发病前3 d接触过患者(OR=8.308,95%CI=1.831~37.698)、暴露在患者呕吐物1 m内(OR=6.429,95%CI=1.368~30.209)和疫情期间使用过园内大型玩具(OR=57.255,95% CI=8.390 ~ 390.718)是发病的危险因素。24份肛拭子标本检出GII.4型诺如病毒。结论本次暴发疫情由GII.4型诺如病毒引起,人际传播是主要传播途径。建议托幼机构加强教职员工传染病知识培训,加强通风、卫生消毒措施,落实晨、午检和因病缺勤登记制度,预防和控制诺如病毒胃肠炎等疾病在托幼机构中的发生,保证儿童的健康。
2009-2018年西藏自治区手足口病流行特征分析
达珍, 次旦, 白玛次旺, 次仁顿珠, 次仁德吉, 才绕曲珍, 潘浩
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目的了解西藏自治区(西藏)手足口病的流行病学特征和病原学特点,为西藏手足口病的防控提供科学依据。方法收集国家疾病监测信息报告管理系统的2009—2018年西藏手足口病疫情及其病原学监测数据,进行描述性流行病学分析。结果2009—2018年西藏累计报告手足口病病例14 500例,年均发病率46.62/10万,重症23例,无死亡病例报告;10年间发病率呈隔年高发特征。报告发病率居前3位为拉萨市(148.17/10万)、林芝市(96.39/10万)和阿里地区(76.89/10万);发病高峰为春夏季5~7月和秋季9月份;男女性别比为1.29:1;发病年龄高峰集中在1~4岁年龄组,占67.18%;全区发生暴发疫情57起,病例主要分布在托幼机构及小学,占暴发疫情总数的90.18%。病原体以柯萨奇病毒A16(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)型为主,分别占44.01%和36.07%。结论2009—2018年西藏手足口病发病率呈现隔年高发的周期性特点,有明显的地区、季节和人群特征。西藏手足口病防控应将春夏季和秋季作为重点时段,将学龄前儿童作为重点人群,将城市作为重点地区;提高EV71疫苗接种的宣传,预防重症病例的发生。
一起人星状病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情调查
陈亿雄, 罗莉, 冉陆, 连怡遥, 高志勇, 刘娜, 靳淼, 李苑
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目的探讨2017年深圳市宝安区一起学校急性胃肠炎暴发疫情的病原体和传播危险因素。方法2017年10—11月,按照定义搜索深圳市宝安区某学校一起急性胃肠炎暴发疫情病例,采用描述性流行病学方法进行分析,并选择罹患率较高的5个班级作为调查对象,采用回顾性队列研究方法,调查269名学生的病例接触史、就餐、饮水习惯等暴露情况,用逻辑回归分析其流行因素。采集患者的粪便或肛拭子,以及直饮机水、桶装水、厕所洗手水等水样,运用试剂盒检测病毒核酸。结果2017年10月20日至11月17日,共搜集病例98例,总罹患率为3.21%(98/3 052),男、女性罹患率分别为3.59%(61/1 698)和2.73(37/1 354),差异无统计学意义(χ2=1.782,P=0.181)。第三教学楼学生罹患率最高,为3.94%(6/152),其次是主教学楼学生,罹患率为3.62%(84/2 319)。各教学楼学生罹患率差异有统计学意义(χ2=7.837,P=0.049),主教学楼不同楼层学生罹患率的差异无统计学意义(χ2=1.861,P=0.713)。回顾性队列研究共调查269人,饮直饮水(RR=6.975,95% CI为1.871~26.027)和接触病例(RR=6.514,95%CI为2.314~18.358)是危险因素。粪便和肛拭子样本星状病毒核酸检测总阳性率为28.00%(7/25),水样本均阴性。结论结合现场流行病学调查和实验室检测结果,判断为一起主要通过接触传播引起的人星状病毒感染暴发疫情,建议学校早发现、早隔离、早报告,尽可能减少健康学生接触病例。
一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学调查
苏通, 刘莹莹, 赵文娜, 于秋丽, 谢赟, 齐顺祥, 李琦
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[摘要](199) [HTML全文](96) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解2018年河北省一起诺如病毒暴发疫情的流行特点及暴发原因,探讨疫情处置经验。方法采用现场流行病学方法,收集2018年河北省一起疫情发生学校的基本情况,搜索病例并进行回顾性问卷调查,描述疾病流行特征,开展病例对照研究及危险因素探索,同时采集患者粪便或肛拭子、食物和水等环境标本进行肠道病毒及肠道致病菌的检测。结果本次疫情持续6 d,累计发病55例,涉及16个班,罹患率1.60%。其中男性34例,女性21例,男女比例为1.62∶1,年龄为6~37岁,平均年龄9.13岁。患者症状以呕吐(92.73%)、腹泻(65.45%)为主,无重症死亡病例,病程1~2 d。危险因素调查显示,高发病班级与无病例班级学生饮食及饮水构成比差异无统计学意义。本次调查共采集病例标本19份,11份标本GⅡ组诺如病毒阳性,1份标本星状病毒阳性。采集食品及水样本41份,检测肠道病毒均阴性,细菌学指标亦在正常范围内。结论该起暴发疫情由GⅡ组诺如病毒感染引起,人-人接触或呕吐物形成的气溶胶传播在疫情中起关键作用,首发病例发现、隔离不及时,及呕吐物处理消毒不规范是导致疫情扩展蔓延并最终暴发的促发因素。
引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征分析
邹林, 佟玲, 张冲, 甄博珺, 郗璐, 杨艳娜, 王艳春, 李洪军, 张铁钢, 高翔, 张国峰
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[摘要](301) [HTML全文](109) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征。方法2019年10月,北京市通州区某小学出现发热疫情,采集病例的咽拭子标本,提取标本核酸作为模板,利用实时荧光PCR方法检测32种呼吸道病毒和细菌。对于腺病毒检测阳性的标本核酸,利用腺病毒特异性引物扩增3个基因(FiberHexonPenton)的片段并测序,采用局部序列比对基本检索工具(BLAST)比对序列,进行进化关系分析。结果采集的6份病例标本中,腺病毒全部阳性,其他检测的呼吸道病毒和细菌均为阴性。FiberHexonPenton基因序列比对结果显示,6份标本中的腺病毒均为4a基因型。进化分析显示该病毒与近年来美国流行的4a型腺病毒高度同源。结论人腺病毒4a型在北京市可以引起呼吸道发热疫情。
2020-03期封面
2020,35(3)   
[摘要](42) [PDF 11625KB](3) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
2020-03期目录
2020,35(3)   
[摘要](47) [HTML全文](34) [PDF 0KB](4) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
疫情快报
2020年2月中国甲乙丙类传染病疫情动态简介National Data of Class A, B and C Communicable Diseases in February 2020
2020,35(3) : 185-185    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.001
[摘要](175) [HTML全文](71) [PDF 313KB](6) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
2020年2月中国甲乙丙类传染病疫情动态概要
2020,35(3) : 186-187    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.002
[摘要](173) [HTML全文](84) [PDF 307KB](1) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
2020年2月全球传染病疫情概要
韩辉, 伍波, 贾娇娇, 宋亚京
2020,35(3) : 188-190    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.003
[摘要](181) [HTML全文](82) [PDF 787KB](2) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
2020年2月全球共监测到传染病61种,涉及82个国家和地区。 除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒肺炎(40个)、登革热(28个)、麻疹(13个)、军团菌病(8个)和疟疾(7个)。 病死率位于前4位的传染病分别为埃博拉病毒病(65.7%)、中东呼吸综合征(34.2%)、拉沙热(17.1%)和新型冠状病毒肺炎(3.4%)。 死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒肺炎、麻疹、登革热、拉沙热和埃博拉病毒病。 亚洲主要流行新型冠状病毒肺炎、中东呼吸综合征和登革热;非洲主要流行埃博拉病毒病、霍乱、黄热病、拉沙热和麻疹;美洲主要流行登革热和新型冠状病毒肺炎;欧洲主要流行新型冠状病毒肺炎。
虫媒病毒监测专题
导 读
王环宇, 李樊
2020,35(3) : 191-191   
[摘要](176) [HTML全文](73) [PDF 2760KB](1) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
塔希纳病毒的重组酶介导扩增快速检测方法
李樊, 郭晓芳, 殷启凯, 申辛欣, 付士红, 许松涛, 雷雯雯, 周红宁, 马学军, 王环宇
2020,35(3) : 192-196    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.004
[摘要](1059) [HTML全文](311) [PDF 3847KB](11) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的采用反转录重组酶介导核酸扩增(RT-RAA)方法建立塔希纳病毒(TAHV)检测方法。方法在TAHV S节段保守区设计引物和探针。 用构建含检测目的基因片段的质粒和病毒细胞培养物对TAHV 的RT-RAA检测方法的灵敏性进行评价,通过检测黄病毒属、甲病毒属、正布尼亚病毒属和东南亚十二节段病毒属共7种病毒验证方法的特异性。 并选用2018年采集自宁夏回族自治区的30批次蚊虫样本来评价该检测方法。结果该方法对构建的质粒标准品的检测下线为100拷贝/反应,病毒培养物最低检出限为10空斑形成单位/反应, 与其他7种虫媒病毒无交叉反应。 在检测蚊虫样本时,该方法与实时定量PCR方法检测结果的一致性为100%。结论建立了快速、特异以及灵敏的TAHV的RT-RAA检测方法,并适用于标本中TAHV核酸的现场检测。
Koutango病毒TaqMan反转录聚合酶链式反应方法的建立
殷启凯, 陈晓菁, 付士红, 刘文婧, 李樊, 雷雯雯, 何英, 许松涛, 梁国栋, 聂凯, 王环宇
2020,35(3) : 197-201    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.005
[摘要](810) [HTML全文](292) [PDF 4037KB](7) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的建立Koutango病毒(KOUTV)的实时荧光定量TaqMan 反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测方法。方法从GenBank中下载KOUTV基因序列,进行多序列比对分析,针对NS5基因中的高保守序列片段设计KOUTV的特异引物与探针,用4科9种病毒进行检测方法特异性验证,通过平行重复实验验证检测方法稳定性,利用体外转录的RNA标准品建立了KOUTV 的NS5基因拷贝数的绝对定量分析模型。结果引物与探针工作特异性良好,同一样品重复检测循环阈值(Ct)的变异系数均小于1.5%,定量分析模型灵敏度达到1.0×102拷贝/反应。 通过本研究建立的快速检测方法对新疆采集的112批,6 328只蚊虫进行了测定,结果均为阴性。结论成功建立了KOUTV的高特异性、高敏感性的TaqMan RT-PCR检测方法,可应用于实验室和临床诊断。
2019 年河南省一例输入性基孔肯雅热病例的发现与处置
李幸乐, 金湘东, 马建敏, 李东晓, 傅瑞娟, 王海峰, 李海梅, 苏佳, 黄学勇, 郭万申
2020,35(3) : 202-205    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.006
[摘要](1285) [HTML全文](384) [PDF 2974KB](13) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的诊断输入性疑似基孔肯雅热(CHIK)病例,处置输入性CHIK疫情,防止出现本地感染病例。方法2019年8月河南省新乡市辉县发生一起疑似输入性CHIK疫情。 采用荧光定量反转录聚合酶链式反应、病毒分离方法检测病例、共同暴露者、接触者血清样本和蚊虫媒介样本,采用Clustal X和MEGA 7.0软件分析基孔肯雅病毒(CHIKV)E1基因序列;根据《基孔肯雅热预防控制技术指南(2012版)》开展流行病学调查、采取相应的预防控制措施。结果病例血清样本CHIKV核酸阳性、CHIKV分离阳性。 分离株属于ECSA基因型,在E1基因区段与2017年中国浙江省输入株MG912993核苷酸/氨基酸同源性为100%,与河南省既往输入株MG925665核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4%和99.8%。 流行病学调查显示,病例共同暴露者1人、接触者3人,均无相应临床表现;以病例居住地为疫点进行媒介控制和蚊媒应急监测,疫点布雷图指数由首次监测的9.5降至第3次监测的3.2并一直维持在较低水平,蚊虫媒介CHIKV核酸阴性。结论河南省新乡市辉县输入性CHIK病例由ECSA基因型CHIKV导致,未引起本地疫情扩散。
传染病监测
2017-2019年广州市禽类市场H9N2禽流感病毒全基因组遗传进化特征分析
曹蓝, 李魁彪, 夏丹, 刘艳慧, 陈艺韵, 陆剑云, 张周斌, 狄飚
2020,35(3) : 206-211    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.007
[摘要](313) [HTML全文](118) [PDF 3408KB](3) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的对H9N2禽流感病毒分离株进行全基因进化特征分析,为禽流感的防控提供研究数据。方法对24株2017—2019年广州市禽类市场H9N2禽流感毒株进行测序,通过生物信息学软件,分析全基因组遗传进化特点。结果24株H9N2病毒核苷酸同源性为86.20%~100.00%,核苷酸进化距离为0.00~1.54,其中HA基因的核苷酸和氨基酸进化距离变化最大,其次为PB2基因。 遗传进化分析显示,所有毒株各基因在系统发生树上聚为一簇,属于G57基因型。 分子特征分析显示,所有毒株属于低致病性禽流感病毒,在HA蛋白受体结合位点均发生Q226L突变,提示H9N2更容易识别人源受体。 在HA-N166D、PB2-L89V/292V、PB1-I368V、L473V、PA-K356R、S409N、M1-N30D、T215A、NS1-P42S等致病性相关位点上,大部分毒株发生致病性增强突变。 耐药性上,所有毒株对神经氨酸酶抑制剂敏感,对烷胺类药物耐药。结论2017—2019年期间广州市禽类市场H9N2禽流感病毒为G57基因型,该基因型病毒普遍发生与人受体结合能力增强的稳定变异,且大部分毒株发生致病性增强的突变,需加强监测。
基于方法学评估与检测基线预测广西玉林市从业人员沙门菌带菌水平
庞晓泸, 顾桂敏, 刘玥, 罗铭, 王芳, 梁雯, 王鸣柳, 施春雷, 史贤明, 刘义威, 许学斌
2020,35(3) : 212-217    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.008
[摘要](177) [HTML全文](65) [PDF 4288KB](5) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的基于沙门菌筛检流程的方法评价和检测基线,预测广西壮族自治区(广西)玉林市从业人员沙门菌的带菌水平。方法以沙门菌选择性增菌液(SBG)和3种选择性平板(CAS、XLD、DHL)构建沙门菌筛选和检定流程,通过测试菌株和408份从业者粪便样品实测获得统计参数,据此评估不同组合流程(SBG-CAS/XLD/DHL)筛检沙门菌的敏感性、特异性和阳性预测值;基于SBG-DHL分离沙门菌的敏感性校准和预测2014—2017年玉林市从业人员的带菌水平。结果CAS、XLD、DHL对测试菌株的敏感性和特异性分别为100.00%和96.67%、100.00%和83.33%、83.33%和50.00%;应用组合流程筛检408份从业人员粪便,共分离沙门菌22株,带菌率为5.39%;敏感性和阳性预测值分别为95.45%和89.23%(CAS)、86.36%和27.72%(XLD)、68.18%和16.15%(DHL)、100.00%和29.27%(CAS+XLD);CAS+XLD组合发现1例兼有硫化氢阴性和阳性的罗森沙门菌的无症状带菌者;校准和预测2014 — 2017年玉林市从业人员的平均年度带菌率为3.35%,以实测人数评估地区从业人员的带菌水平约为3 350 /10万。结论沙门菌检测敏感性和阳性预测值可作为检测质量和方法学的评价指标,大数据证实华南地区从业人员中沙门菌的高比例持留,公共卫生机构应加强沙门菌带菌者的防控,降低食源性病原菌的隐性扩散风险。
20世纪80年代我国142份成年人腹泻粪便标本中常见致腹泻相关病毒筛查
杨柳, 徐亚陇, 李金松, 段招军, 马超锋
2020,35(3) : 218-221    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.009
[摘要](670) [HTML全文](220) [PDF 2771KB](4) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解我国142份成年人腹泻粪便标本中常见腹泻相关病毒性病原谱。方法采用聚合酶链式反应(PCR)检测方法筛查中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所毒种库保存的20世纪80年代142份成年人腹泻粪便标本中轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒和星状病毒等,并测序确定病毒的型别。结果120份(84.51%,120/142)粪便标本检出至少1种病毒,其中B组轮状病毒检出率为42.96%(61/142),未检出A组和C组轮状病毒;诺如病毒检出率为0.70%(1/142);肠道腺病毒检出率为4.23%(6/142),其中4型2份,7型2份,40型和41型各1份;星状病毒全部为5型,检出率为34.51%(49/142);猪肠道病毒检出率为1.41%(2/142);柯萨奇病毒检出率为0.70%(1/142);混合感染检出率为24.65%(35/142);脊髓灰质炎病毒未检出。结论本批成年人腹泻标本中以B组轮状病毒为主,与星状病毒混合感染率较高,达21.13%(30/142),与标准成年人腹泻B组轮状病毒株核苷酸序列同源性为94.67%~96.52%;其他几种病毒与现有病毒的相似度较高。 从粪便中检出猪肠道病毒,考虑当时的居住环境所致,不能排除标本污染。
艾滋病感染者分类管理策略实施前后传播风险的流行病学特征分析
史宏博, 洪航, 董红军, 姜海波, 顾晓敏
2020,35(3) : 222-226    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.010
[摘要](545) [HTML全文](232) [PDF 1976KB](11) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解浙江省宁波市艾滋病病毒感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)分类管理策略实施前后传播风险的流行病学特征。方法2017年11月底,对现住址在宁波市的在访HIV/AIDS进行为期1年的随访研究,定期开展传播风险评估,针对传播风险不同实施分类管理策略,分析人口学特征、风险评估结果、行为学特征、性病感染情况以及抗病毒治疗情况等数据。结果共有2 905例HIV/AIDS纳入研究。 经过1年的分类管理策略实施,HIV/AIDS高传播风险比例从11.74%降低至5.23%(χ2=66.786,P<0.05)。 除20岁以下年龄组、小学以下文化程度和吸毒传播的HIV/AIDS高传播风险比例无明显下降外(P>0.05),其他人群的高传播风险比例均显著下降(P<0.05)。 通过分类管理策略的实施,高传播风险的HIV/AIDS发生性行为比例、多性伴的比例和未使用安全套比例显著降低(P<0.05),梅毒阳性比例显著降低(P<0.05),未接受抗病毒治疗比例和病毒载量≥400拷贝/ml比例显著降低(P<0.05)。结论宁波市分类管理策略能够有效减少高传播风险HIV/AIDS的比例,降低高传播风险HIV/AIDS的多性伴高危性行为和性病感染比例。 应进一步加强HIV/AIDS的随访管理工作以及高传播风险的HIV/AIDS抗病毒治疗动员和转介工作,减少传播。
云南省褐家鼠中鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义
袁月, 钟佑宏, 张海鹏, 苏超, 杨丽华, 杨丰义, 吴鹤松, 王鹏
2020,35(3) : 227-230    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.011
[摘要](342) [HTML全文](161) [PDF 2758KB](6) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的调查云南省鼠疫宿主动物褐家鼠中携带鼠疫噬菌体的情况,并探讨其流行病学意义。方法2015 — 2018年在云南省10个县(市)25个点进行采样,取捕获的褐家鼠肠道标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离肠道标本中的鼠疫噬菌体;同时对肠道标本进行鼠疫菌特异基因caf1检测。结果共采集344份褐家鼠标本,从中分离到15株鼠疫噬菌体,总分离率为4.36%;从采样点看,10个点中分离到鼠疫噬菌体,玉溪市红塔区的春和街及玉带街分离率最高(分别为28.57%和16.67%);不同性别、年龄和生境鼠疫噬菌体的分离率差异无统计学意义;所分离的鼠疫噬菌体中有4株为肌尾型;所有标本caf1检测阴性。结论云南省褐家鼠中存在一定数量的鼠疫噬菌体,且鼠疫历史疫区、近史流行区、复燃疫区及现疫区中均有分布;历史疫区及城区褐家鼠中鼠疫噬菌体携带率较高,其微生态意义值得进一步探讨。
青藏高原藏原羚携带海氏肠球菌的特征研究
蒙家嘉, 董魁, 周娟, 杨晶, 徐建国
2020,35(3) : 231-236    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.012
[摘要](309) [HTML全文](125) [PDF 2758KB](3) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的研究青藏高原野生动物藏原羚携带的海氏肠球菌特征。方法分离细菌,采用16S rRNA、rpoA基因序列比对方法鉴定藏原羚携带的海氏肠球菌。 采用K-B纸片法进行药敏试验;使用COGs、SwissProt、CARD和VFDB等数据库对基因组进行分析;采用MUMmer和TreeBest软件构建单核苷酸多态性系统进化树图。结果从15份藏原羚粪便样品分离到2株海氏肠球菌。 生化分析、16S rRNA和rpoA基因序列分析支持其为海氏肠球菌的鉴定。 基因组分析发现其携带荚膜多糖基因簇。 系统进化树分析提示2株藏原羚源海氏肠球菌分别属于不同的进化分支,且都与动物源性菌株进化关系更近。 2株菌对多种常用抗生素敏感。结论青藏高原藏原羚携带的病原菌海氏肠球菌基因组中存在荚膜多糖基因簇,利于其抵抗不利环境因素,提示YL69可能具备在人群中传播的潜力。
耐药监测
浙江省宁波市耐多药结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药特征及与二线抗结核药物耐药关系
车洋, 杨天池, 林相, 薄丁旖
2020,35(3) : 237-241    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.013
[摘要](301) [HTML全文](231) [PDF 1928KB](1) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的研究结核分枝杆菌(MTB)对吡嗪酰胺耐药特征及其与二线抗结核药物耐药相关性。方法以2015 — 2017年浙江省宁波地区结核病耐药监测收集的110例耐多药结核病(MDR-TB)病例作为研究对象,采用1%比例法对其进行5种二线抗结核药物(氧氟沙星、左氧氟沙星、卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素)的耐药检测。 同时应用BACTEC MGIT 960 系统检测所有MDR-MTB的吡嗪酰胺耐药性,采用PCR DNA直接测序法检测MDR-MTB的pncA基因突变特征。结果110株MDR-MTB中吡嗪酰胺耐药率为59.09%(65/110),pncA基因突变率为50.91%(56/110)。 吡嗪酰胺耐药株中的基因突变率83.08%(54/65)与吡嗪酰胺敏感株中的基因突变率4.44%(2/45)比较,差异有统计学意义(χ2=65.787, P<0.001)。 pncA基因突变类型为42种,以点突变类型为主92.86%(39/42)。 耐链霉素、耐乙胺丁醇、耐氧氟沙星、耐左氧氟沙星及准广泛耐药(Pre-XDR)与MDR-MTB耐吡嗪酰胺相关。结论本地区MDR-MTB耐吡嗪酰胺形势较为严峻,MDR-MTB耐吡嗪酰胺与二线抗结核药物氧氟沙星、左氧氟沙星及Pre-XDR的耐药相关。
2013-2018年浙江省丽水市结核病患者一线抗结核药物耐药分析
陈秀英, 徐丽霞, 柳付明, 武劼, 邱理杨, 凡鹏飞, 李秋华
2020,35(3) : 242-245    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.014
[摘要](561) [HTML全文](207) [PDF 1916KB](5) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解2013 — 2018年浙江省丽水市结核病患者对一线抗结核药物的耐药情况,为结核病疫情控制提供参考依据。方法收集2013—2018年浙江省丽水市结核病病例,分离菌株并进行菌型鉴定,测定结核分枝杆菌对异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇4 种一线抗结核药物敏感性。结果共测定1 883株结核分枝杆菌的耐药性,其中初治肺结核患者1 770株,复治肺结核患者113株,总耐药率为17.15%,耐多药率为5.74%。 初始耐药率是15.42%(273/1 770),低于获得性耐药率的44.25%(50/113);初治肺结核患者耐药顺位链霉素>异烟肼>利福平>乙胺丁醇;复治患者耐药顺位为异烟肼>利福平>链霉素>乙胺丁醇。结论丽水市肺结核患者总的耐药率和耐多药率低于全省及全国耐药基线调查及丽水市上一轮的监测数据,但是耐多药形势仍较为严峻。
技术与方法
巢式聚合酶链式反应检测布鲁氏菌核酸DNA方法的建立
田国忠
2020,35(3) : 246-250    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.015
[摘要](651) [HTML全文](238) [PDF 2354KB](8) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的建立一种具有灵敏性高,特异性强的巢式聚合酶链式反应(PCR)方法检测血液标本中布鲁氏菌核酸DNA。方法使用细菌基因组提取试剂盒提取纯菌核酸DNA;使用血液等组织基因组核酸DNA提取试剂盒提取血液标本核酸DNA,对提取的核酸DNA先行常规PCR预扩增,以扩增的PCR产物为模板进行荧光定量PCR第二次扩增(即巢式PCR)。 对纯菌提取的核酸DNA进行灵敏度和和特异性测试,构建巢式PCR的Ct值与核酸DNA拷贝数之关系曲线;检测临床血液标本核酸DNA,同时比较常规两种PCR方法检测结果。结果常规PCR检测的灵敏度为512个核酸DNA拷贝数;巢氏PCR检测有效范围为921.6 ng/μl~6.8 fg/μl,对应的Ct值为12.04~37.50,其指数关系为:y=(e−0.695x)×1012R2=0.998 6,巢式PCR扩增效率为2.28×109倍,检测限为2个布鲁氏核酸DNA拷贝数。 巢式PCR的灵敏度为91.67%,特异度为93.10%,阳性预测值为91.67%,阴性预测值为93.10%。 对一起羊养殖场采集的25份血液标本应用巢式PCR方法检测,结果阳性率为92.00%(23/25);27份健康人群血液标本没有检测出(无Ct值)。结论巢式PCR具有较好的灵敏性和特异性,特别适合于血液标本布鲁氏菌核酸DNA的检测。
实验研究
肺部相关疾病外周血T淋巴细胞表面标志物表达分析
吕秋琼, 柳红梅, 许文芳, 王琼, 陈于蓝, 尉理梁
2020,35(3) : 251-255    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.016
[摘要](314) [HTML全文](132) [PDF 2267KB](1) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的观察肺部相关疾病外周血T淋巴细胞表面标志物的表达,从细胞免疫水平探究肺部相关疾病发病机制。方法选择 2016年1—12月于浙江省绍兴市立医院呼吸科就诊的肺部疾病患者84例,根据诊断结果分为肺结核组(n=34)、肺癌组(n=25)及非结核性肺炎组(n=25),同时设立健康对照组(n=35)。 检测各组外周血T细胞表面表达CD3CD4、CD3CD8、CD3CD45RA/ CD45RO、CD3HLA-DR、CD8HLA-DR、CD4CD25的百分比,采用t检验对结果进行统计分析。结果肺结核组、肺癌组、非结核性肺炎组外周血T淋巴细胞表面标志物CD4/CD8比值(1.01±0.48、1.17±0.39、1.35±0.55)低于健康对照组(1.48±0.52,t=2.562,t=2.341,t=2.112,P<0.05);肺结核组、肺癌组、非结核性肺炎组表达CD3CD45RO的T细胞占总淋巴细胞百分比(65.20%±12.63%、56.70%±9.98%、55.90%±9.29%)高于健康对照组(49.60%±11.52%,t=3.422, t=2.647, t=2.084,P<0.05),且肺结核组高于肺癌和非结核性肺炎组(t=2.153,t=3.112,P<0.05);肺结核组、肺癌组表达CD3HLA-DR的T细胞占总淋巴细胞百分比(19.59%±7.01%、21.7%±7.34%)高于健康对照组(11.40%±5.33%,t=2.383,t=2.533,P<0.05);肺结核组表达CD8HLA-DRT细胞占总淋巴细胞百分比(11.26%±4.88%)高于健康对照组(7.10%±3.07%,t=2.244,P<0.05);肺结核组和肺癌组表达CD4CD25的T细胞占总淋巴细胞百分比(10.70%±3.06%、10.40%±2.33%)高于健康对照组(8.20%±2.79%,t=2.647,t=2.662,P<0.05)。结论肺结核、肺癌和肺炎患者外周血T淋巴细胞表面标志表达改变,尤以肺结核患者改变最显著,可能与肺结核独特的发病机制有关。
水苏糖对艰难梭菌在小鼠肠道内定植与菌群的影响
康颖, 李先平, 宋利琼, 肖玉春, 黄元铭, 任志鸿
2020,35(3) : 256-263    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.017
[摘要](326) [HTML全文](134) [PDF 5376KB](1) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的利用艰难梭菌感染(CDI)小鼠模型,评价水苏糖是否具有抑制小鼠肠道内艰难梭菌定植的作用,并分析其对肠道菌群结构的影响。方法将C57BL/6雌鼠随机分为3组,其中不做任何处理的设定为空白对照组,水苏糖干预组和磷酸盐缓冲液(PBS)模型组在建立CDI小鼠模型后分别连续10 d每日给予水苏糖和PBS灌胃处理。 利用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测感染后第10 d各组小鼠粪便中艰难梭菌的含量,并利用16S rRNA基因测序分析各组小鼠肠道菌群结构的变化。结果水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中艰难梭菌含量显著降低。 水苏糖干预组小鼠粪便的菌群丰富度显著高于PBS模型组,但没有恢复到空白对照组的水平。 在门水平上,水苏糖干预可导致CDI小鼠粪便的拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰富度显著增高,变形菌门(Proteobacteria)的相对丰富度显著降低。 在种水平上,水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中格氏副拟杆菌(Parabacteroides goldsteinii)、汉森氏布氏菌(Blautia hansenii)、多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相对丰度显著增高;Parasutterella excrementihominis、狄氏副拟杆菌(Parabacteroides distasonis)的相对丰度显著降低。结论水苏糖干预可有效降低CDI小鼠肠道内艰难梭菌定植量,增加CDI小鼠肠道微生物丰富度,特异性地改变多形拟杆菌和格氏副拟杆菌等菌种的相对丰度。
案例分析
一起诺如病毒感染混合金黄色葡萄球菌肠毒素中毒相关急性胃肠炎暴发事件的实验室检测分析
甄国新, 李颖, 冀国强, 张爽, 王园园, 张彦春, 王苗, 荆红波, 马晓晨, 张茂俊
2020,35(3) : 264-268    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.018
[摘要](343) [HTML全文](135) [PDF 3142KB](8) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的对一起诺如病毒感染混合金黄色葡萄球菌肠毒素中毒相关急性胃肠炎暴发事件的实验室检测结果进行分析。方法采用实时荧光PCR方法检测6份病例呕吐物中的诺如病毒和8种常见致病菌。 从呕吐物样本增菌液中分离培养金黄色葡萄球菌,采用PCR方法检测增菌液的金黄色葡萄球菌肠毒素基因。 利用酶联免疫吸附试验检测5株金黄色葡萄球菌分离株的肠毒素、利用PCR方法检测其肠毒素基因并进行spa分型分析。结果共采集到6份呕吐物标本,其中5份诺如病毒阳性,2份金黄色葡萄球菌耐热核酸酶基因nuc阳性。 其中5份呕吐物增菌液nuc基因阳性,4份seb基因阳性,1份sea基因阳性。 共分离到5株金黄色葡萄球菌,分为3种spa型(t701、t437和t4209)。 金黄色葡萄球菌肠毒素的基因PCR检测结果和酶联免疫吸附试验结果存在差别。结论本次急性胃肠炎暴发事件可能由诺如病毒感染混合金黄色葡萄球菌肠毒素中毒共同导致。
2018年甘肃省兰州市诺如病毒G胃肠炎暴发疫情病原学分析
康倩, 陈建华, 汪鹏, 张慧敏, 王雪莹, 张慧, 于德山
2020,35(3) : 269-273    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.019
[摘要](627) [HTML全文](218) [PDF 2792KB](12) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:
目的了解2018年5—6月甘肃省兰州市发生的2起学校急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒分子特征,并进行溯源分析。方法采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应对标本进行诺如病毒检测,对阳性标本聚合酶区–衣壳蛋白区核苷酸进行测序和同源性分析,采用 MEGA 6.0 软件进行遗传进化分析。结果2起学校胃肠炎疫情均为诺如病毒GⅠ引起,5月28日至6月4日的一起疫情发病50例,罹患率为3.24%。 6月1—13日的疫情发病35例,罹患率为4.76%;流行病学调查提示,2起疫情均与小饭桌就餐和密切接触相关。 33份标本中检出诺如病毒GⅠ核酸阳性标本13份。 对阳性样本的RdRP和VP1区的部分基因片段进行测序和比对,第1起疫情为诺如病毒 GⅠ.3[P13] 基因型,第2起疫情为GⅠ.6[P11]基因型。结论兰州市城关区2起学校急性胃肠炎疫情分别由 GⅠ.3[P13]型和GⅠ.6[P11]型诺如病毒引起,应加强诺如病毒监测,强化中小学附近小饭桌等集中就餐场所的管理。
海外动态
2000-2017年世界各地区麻疹消除的进展趋势
龚震宇(摘译), 龚训良(审校)
2020,35(3) : 274-276    DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.020
[摘要](272) [HTML全文](124) [PDF 1881KB](2) 审稿意见 相关文献 引证文献 (0) 分享
摘要:

1986年创刊 月刊

CN 11-2928/R

ISSN 1003-9961

主管:国家卫生健康委员会

主办:中国疾病预防控制中心

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